Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A2JNK8

Protein Details
Accession A0A0A2JNK8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
565-589GELLIPSKSEKRKKMKIALSRHELSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
575-578KRKK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11, cyto 5.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019313  Mediator_Med17  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF10156  Med17  
Amino Acid Sequences MADSFTLPLRPIPEKRDRPDTLPVEIAQINNQWGSFREVNEDVLRNKIVEEEEKDGLDEVDESDQDATDLDSTERLEQLYKRRAEITQFAMQAHMETMFALDFVSLLLSKQAPRQAETSMSAFLKQVAPLGSLNAEVVNPPPKPESTTKDISAVSRGWRIQNFNAAANKLLQAASRLETEVASETRYWNEVLAVKDKGWKVSRLPREKQALGVQYGFLEATPVFRDRGLASLSRAEDGALLLDEGLIPSKPRFVRVRVIQDGRLSGSSKPTRSTFNGDGSIEDRILQARDTVYEEELFHELVREARAIASFGVTTRQNLIQIPASDDLEILLDLVDTDEDTSEPEHHVSQQGTSLAEGLAHTIRILLAYAHRQNLRRRTLLPPPLTPKMRSVPEHHLIRPALAYIKHMSNVRWLQSLLNDLFGVLQSANLKPPAYTARVFSTGRRKQTSTAPAVETLVGEFLTPLLSTFNGKILTPLGSFSIAIHTNLSSPPFGTTFDVSFNMPKYQDLESPGKLYQREEVEAAITHLLLLDVVFTVSSNSGSSKSESDKDNAKHTWEAIYPQHGELLIPSKSEKRKKMKIALSRHELSLEIYTVRCIDGTGRGNWEKPSHHSMPHTWTSSPIAGSPQEPSLMDYVSKQVSQS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.62
3 0.69
4 0.69
5 0.67
6 0.71
7 0.67
8 0.6
9 0.55
10 0.48
11 0.43
12 0.4
13 0.36
14 0.29
15 0.27
16 0.24
17 0.21
18 0.21
19 0.17
20 0.17
21 0.24
22 0.24
23 0.22
24 0.26
25 0.27
26 0.31
27 0.35
28 0.38
29 0.31
30 0.33
31 0.33
32 0.27
33 0.26
34 0.25
35 0.23
36 0.24
37 0.27
38 0.28
39 0.29
40 0.29
41 0.29
42 0.26
43 0.23
44 0.18
45 0.14
46 0.1
47 0.1
48 0.1
49 0.1
50 0.1
51 0.1
52 0.09
53 0.09
54 0.08
55 0.07
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.11
60 0.12
61 0.13
62 0.13
63 0.16
64 0.2
65 0.29
66 0.36
67 0.37
68 0.38
69 0.41
70 0.43
71 0.45
72 0.46
73 0.43
74 0.41
75 0.4
76 0.38
77 0.36
78 0.33
79 0.28
80 0.22
81 0.16
82 0.09
83 0.07
84 0.08
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.05
89 0.04
90 0.04
91 0.05
92 0.04
93 0.05
94 0.07
95 0.09
96 0.1
97 0.15
98 0.2
99 0.2
100 0.23
101 0.25
102 0.25
103 0.26
104 0.28
105 0.26
106 0.25
107 0.24
108 0.22
109 0.2
110 0.2
111 0.19
112 0.16
113 0.17
114 0.13
115 0.15
116 0.14
117 0.15
118 0.13
119 0.12
120 0.12
121 0.1
122 0.09
123 0.07
124 0.1
125 0.14
126 0.14
127 0.16
128 0.18
129 0.18
130 0.23
131 0.29
132 0.33
133 0.34
134 0.39
135 0.38
136 0.4
137 0.4
138 0.36
139 0.34
140 0.3
141 0.26
142 0.26
143 0.27
144 0.27
145 0.3
146 0.33
147 0.32
148 0.38
149 0.37
150 0.36
151 0.38
152 0.34
153 0.31
154 0.28
155 0.26
156 0.19
157 0.18
158 0.13
159 0.12
160 0.13
161 0.13
162 0.13
163 0.13
164 0.12
165 0.12
166 0.12
167 0.13
168 0.12
169 0.12
170 0.11
171 0.12
172 0.13
173 0.14
174 0.13
175 0.1
176 0.12
177 0.15
178 0.16
179 0.19
180 0.19
181 0.19
182 0.24
183 0.25
184 0.29
185 0.28
186 0.28
187 0.31
188 0.39
189 0.49
190 0.52
191 0.56
192 0.58
193 0.62
194 0.6
195 0.58
196 0.54
197 0.48
198 0.4
199 0.37
200 0.29
201 0.22
202 0.21
203 0.17
204 0.11
205 0.08
206 0.06
207 0.06
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.11
213 0.1
214 0.13
215 0.13
216 0.13
217 0.13
218 0.17
219 0.17
220 0.16
221 0.16
222 0.13
223 0.12
224 0.1
225 0.09
226 0.05
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.03
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.11
237 0.11
238 0.17
239 0.2
240 0.23
241 0.32
242 0.38
243 0.46
244 0.47
245 0.5
246 0.47
247 0.45
248 0.42
249 0.35
250 0.3
251 0.23
252 0.16
253 0.22
254 0.23
255 0.23
256 0.25
257 0.25
258 0.28
259 0.29
260 0.36
261 0.31
262 0.31
263 0.33
264 0.3
265 0.29
266 0.26
267 0.24
268 0.17
269 0.14
270 0.1
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.11
281 0.11
282 0.11
283 0.12
284 0.11
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.07
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.07
295 0.06
296 0.06
297 0.05
298 0.05
299 0.08
300 0.07
301 0.08
302 0.09
303 0.1
304 0.1
305 0.11
306 0.12
307 0.12
308 0.12
309 0.14
310 0.14
311 0.13
312 0.12
313 0.12
314 0.1
315 0.08
316 0.07
317 0.05
318 0.03
319 0.03
320 0.03
321 0.03
322 0.03
323 0.02
324 0.03
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.04
329 0.05
330 0.06
331 0.07
332 0.07
333 0.08
334 0.1
335 0.1
336 0.1
337 0.11
338 0.11
339 0.11
340 0.1
341 0.1
342 0.07
343 0.07
344 0.06
345 0.06
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.04
352 0.05
353 0.04
354 0.05
355 0.11
356 0.13
357 0.17
358 0.2
359 0.25
360 0.32
361 0.4
362 0.44
363 0.41
364 0.42
365 0.44
366 0.5
367 0.54
368 0.51
369 0.47
370 0.48
371 0.53
372 0.52
373 0.48
374 0.43
375 0.4
376 0.41
377 0.39
378 0.39
379 0.4
380 0.45
381 0.48
382 0.44
383 0.44
384 0.39
385 0.37
386 0.31
387 0.24
388 0.19
389 0.15
390 0.17
391 0.14
392 0.15
393 0.17
394 0.18
395 0.18
396 0.23
397 0.26
398 0.25
399 0.24
400 0.23
401 0.22
402 0.21
403 0.26
404 0.18
405 0.16
406 0.14
407 0.12
408 0.12
409 0.11
410 0.11
411 0.05
412 0.07
413 0.07
414 0.08
415 0.09
416 0.11
417 0.11
418 0.1
419 0.13
420 0.15
421 0.17
422 0.18
423 0.19
424 0.21
425 0.26
426 0.27
427 0.3
428 0.37
429 0.39
430 0.46
431 0.48
432 0.46
433 0.44
434 0.52
435 0.55
436 0.5
437 0.48
438 0.42
439 0.38
440 0.37
441 0.35
442 0.26
443 0.18
444 0.12
445 0.08
446 0.06
447 0.05
448 0.04
449 0.05
450 0.04
451 0.04
452 0.05
453 0.05
454 0.07
455 0.08
456 0.11
457 0.11
458 0.11
459 0.12
460 0.13
461 0.14
462 0.13
463 0.13
464 0.11
465 0.11
466 0.11
467 0.11
468 0.14
469 0.13
470 0.13
471 0.13
472 0.12
473 0.13
474 0.14
475 0.15
476 0.11
477 0.1
478 0.12
479 0.12
480 0.13
481 0.15
482 0.15
483 0.15
484 0.16
485 0.17
486 0.17
487 0.18
488 0.19
489 0.19
490 0.18
491 0.17
492 0.18
493 0.2
494 0.22
495 0.25
496 0.28
497 0.27
498 0.3
499 0.31
500 0.32
501 0.3
502 0.29
503 0.29
504 0.27
505 0.27
506 0.25
507 0.23
508 0.21
509 0.2
510 0.2
511 0.15
512 0.11
513 0.09
514 0.08
515 0.07
516 0.05
517 0.05
518 0.04
519 0.03
520 0.04
521 0.04
522 0.04
523 0.05
524 0.05
525 0.06
526 0.07
527 0.08
528 0.1
529 0.11
530 0.14
531 0.16
532 0.2
533 0.24
534 0.27
535 0.3
536 0.37
537 0.38
538 0.44
539 0.42
540 0.42
541 0.4
542 0.38
543 0.38
544 0.31
545 0.33
546 0.29
547 0.33
548 0.31
549 0.29
550 0.29
551 0.25
552 0.23
553 0.2
554 0.22
555 0.17
556 0.16
557 0.18
558 0.25
559 0.35
560 0.44
561 0.51
562 0.56
563 0.65
564 0.74
565 0.82
566 0.83
567 0.84
568 0.86
569 0.85
570 0.84
571 0.76
572 0.67
573 0.58
574 0.49
575 0.41
576 0.33
577 0.25
578 0.18
579 0.16
580 0.16
581 0.15
582 0.15
583 0.13
584 0.1
585 0.11
586 0.17
587 0.21
588 0.24
589 0.31
590 0.33
591 0.36
592 0.4
593 0.43
594 0.38
595 0.41
596 0.46
597 0.43
598 0.45
599 0.49
600 0.5
601 0.53
602 0.57
603 0.54
604 0.46
605 0.45
606 0.44
607 0.42
608 0.37
609 0.3
610 0.27
611 0.25
612 0.26
613 0.25
614 0.22
615 0.21
616 0.21
617 0.21
618 0.19
619 0.18
620 0.18
621 0.17
622 0.2
623 0.21