Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JRE9

Protein Details
Accession C4JRE9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-72SAERERRQQEGGKRRRRDKRLQVKLGHGGTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
48-62RRQQEGGKRRRRDKR
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto 9.5, mito_nucl 7.833, cyto_mito 6.833, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
IPR032819  TruB_C  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG ure:UREG_05038  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF16198  TruB_C_2  
PF01509  TruB_N  
Amino Acid Sequences MSQAANLEGVFAVHKPAGISSAEVLRNLQHHFNRSKFFQPWISAERERRQQEGGKRRRRDKRLQVKLGHGGTLDPIATGVLVTGVGKGTKQLNGFLACTKTYEAVILFGVATDSYDRVGKVVSHAPYEHITREKVEEALKAFRGKTMQRPSIFSALKVQGKKLYEYAREGKEPPVEIAERPVEVLNLEIVEWYEPGKHEWKWPTQEAGAEEKTIAKKMIAQEKDLINEDLKHGEENDSLKRKTPPIPDDHAQGTAPTTQEPSLKRQKTELSNEETATASDSTTQQQSAPTPEAQKSEPAPDSSELHPPPPAVKLTMTVCSGFYVRSLAHDLGLALGSNAIMSELVRTRQGDFELSPERTLEYKDLEAGEEVWSAKMQRLLDDWREKNKAKDGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.1
3 0.11
4 0.13
5 0.12
6 0.14
7 0.13
8 0.2
9 0.2
10 0.21
11 0.21
12 0.21
13 0.24
14 0.26
15 0.32
16 0.3
17 0.37
18 0.44
19 0.49
20 0.53
21 0.54
22 0.58
23 0.53
24 0.54
25 0.52
26 0.49
27 0.5
28 0.49
29 0.52
30 0.51
31 0.56
32 0.58
33 0.61
34 0.59
35 0.56
36 0.56
37 0.57
38 0.6
39 0.63
40 0.66
41 0.67
42 0.73
43 0.81
44 0.86
45 0.88
46 0.89
47 0.89
48 0.89
49 0.9
50 0.9
51 0.86
52 0.83
53 0.82
54 0.72
55 0.62
56 0.51
57 0.4
58 0.31
59 0.26
60 0.18
61 0.09
62 0.08
63 0.07
64 0.06
65 0.06
66 0.04
67 0.03
68 0.03
69 0.04
70 0.04
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.08
75 0.1
76 0.14
77 0.15
78 0.16
79 0.2
80 0.22
81 0.23
82 0.23
83 0.23
84 0.2
85 0.2
86 0.19
87 0.16
88 0.14
89 0.14
90 0.11
91 0.1
92 0.1
93 0.09
94 0.08
95 0.07
96 0.07
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.06
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.08
106 0.08
107 0.11
108 0.16
109 0.17
110 0.18
111 0.18
112 0.2
113 0.22
114 0.24
115 0.23
116 0.2
117 0.2
118 0.19
119 0.21
120 0.2
121 0.2
122 0.2
123 0.19
124 0.19
125 0.22
126 0.23
127 0.22
128 0.21
129 0.21
130 0.23
131 0.24
132 0.3
133 0.36
134 0.4
135 0.4
136 0.43
137 0.45
138 0.49
139 0.47
140 0.38
141 0.36
142 0.34
143 0.37
144 0.34
145 0.32
146 0.28
147 0.29
148 0.3
149 0.28
150 0.28
151 0.26
152 0.31
153 0.35
154 0.34
155 0.35
156 0.35
157 0.33
158 0.31
159 0.28
160 0.24
161 0.2
162 0.18
163 0.16
164 0.18
165 0.16
166 0.13
167 0.13
168 0.13
169 0.09
170 0.08
171 0.09
172 0.05
173 0.05
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.05
182 0.07
183 0.1
184 0.11
185 0.16
186 0.21
187 0.26
188 0.3
189 0.31
190 0.31
191 0.29
192 0.3
193 0.27
194 0.28
195 0.23
196 0.18
197 0.17
198 0.17
199 0.17
200 0.16
201 0.14
202 0.09
203 0.12
204 0.16
205 0.25
206 0.23
207 0.24
208 0.28
209 0.29
210 0.3
211 0.29
212 0.25
213 0.17
214 0.17
215 0.16
216 0.13
217 0.12
218 0.11
219 0.1
220 0.1
221 0.12
222 0.14
223 0.2
224 0.24
225 0.24
226 0.27
227 0.3
228 0.32
229 0.37
230 0.42
231 0.41
232 0.42
233 0.48
234 0.47
235 0.48
236 0.45
237 0.4
238 0.32
239 0.26
240 0.21
241 0.16
242 0.14
243 0.11
244 0.11
245 0.11
246 0.16
247 0.17
248 0.24
249 0.32
250 0.35
251 0.36
252 0.39
253 0.45
254 0.48
255 0.54
256 0.53
257 0.5
258 0.49
259 0.48
260 0.45
261 0.38
262 0.31
263 0.24
264 0.18
265 0.11
266 0.1
267 0.11
268 0.12
269 0.13
270 0.13
271 0.12
272 0.14
273 0.16
274 0.18
275 0.2
276 0.21
277 0.24
278 0.26
279 0.28
280 0.27
281 0.29
282 0.27
283 0.3
284 0.29
285 0.27
286 0.28
287 0.27
288 0.3
289 0.27
290 0.34
291 0.29
292 0.28
293 0.28
294 0.25
295 0.24
296 0.24
297 0.24
298 0.17
299 0.17
300 0.2
301 0.21
302 0.24
303 0.24
304 0.21
305 0.2
306 0.19
307 0.19
308 0.15
309 0.13
310 0.12
311 0.1
312 0.12
313 0.16
314 0.15
315 0.15
316 0.15
317 0.15
318 0.14
319 0.14
320 0.11
321 0.06
322 0.06
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.08
330 0.1
331 0.12
332 0.15
333 0.16
334 0.18
335 0.21
336 0.23
337 0.23
338 0.21
339 0.26
340 0.3
341 0.31
342 0.29
343 0.27
344 0.27
345 0.25
346 0.27
347 0.24
348 0.21
349 0.2
350 0.22
351 0.23
352 0.22
353 0.21
354 0.2
355 0.18
356 0.16
357 0.15
358 0.13
359 0.14
360 0.13
361 0.15
362 0.18
363 0.18
364 0.18
365 0.22
366 0.29
367 0.37
368 0.47
369 0.5
370 0.55
371 0.63
372 0.64
373 0.66