Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JIN3

Protein Details
Accession C4JIN3    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
302-323ASSTQPSKAKRNEKRTVDRENDHydrophilic
361-385SEAADGKKSKRKKAKRDQEPPAPLTHydrophilic
923-946IENKRKGAIKGSQRRKAKEQSSEVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
366-381GKKSKRKKAKRDQEPP
886-940KEDLKRHGVKTRRPMATNDGSAAKKSRISTKSGFERRIENKRKGAIKGSQRRKAK
Subcellular Location(s) mito 16, nucl 5.5, cyto_nucl 5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006808  ATP_synth_F0_gsu_mt  
IPR044764  DDX52/Rok1_DEADc  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0000276  C:mitochondrial proton-transporting ATP synthase complex, coupling factor F(o)  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0015078  F:proton transmembrane transporter activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0030490  P:maturation of SSU-rRNA  
GO:0015986  P:proton motive force-driven ATP synthesis  
KEGG ure:UREG_02894  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04718  ATP-synt_G  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd17957  DEADc_DDX52  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MPVAASRLALRQSRLLIRRSAFRQNSTTSEAASKTKDAASSAASKASEGLSKVTSTAGPAIAGAVSGVGNALKRVGGRTGRMISFVESFELKFILPCMVAPITRLTSTALIPPTVYYSRVAIEVTKIVFQTQKMAPPNLATFQTYLQPLLASLRNPSALLSKLDPAPYFGRIRNMDRKQLAFVGVTAAEVIGFFSVGEMLGRWKIDRGIKLIASSYAQMDAFKLLTRSTKFKPDSKTGSLSSSTHLPSAGQASTPQLFPERQFTDADGTRGIKRKRNGDESISLSSDLAVPDFFGSGQPATASSTQPSKAKRNEKRTVDRENDLKQEGNNAPMSEAECKSILKAHKIKVTDLRSFPADEVSEAADGKKSKRKKAKRDQEPPAPLTRKQQKAALRLYPEPLTDFDQLRAKYLISRRLSENISHQGYTVPTEVQLGSLPLLLGGAPTSSRRIKPDETAKSLSEQEPDLLVVAPTGSGKTLSFMIPLINKIIKHHHANPGLKGILAIVLAPTKELVAQIVNEGRKLTAGTGVKITAMRKGMRVVEGAQNIRSLEEESEDDEDVVSSDGELHAIGGNKEKAIPLTRSDILVCTPLLLANALSQDEAGDMASLPSVKTLVLDEADVLLDPLFREQTLEVWKACTCPQLRVGLWSATMGSNIEELAKATIKARQQSLGLKDESFLIRLVVGLKDTAIPNISHKLVYAATEQGKLLGLRQLLHPTAASNSTTRLRPPFLVFTQTISRAVALHSELMYDIPPEAGGSSRIAVLHSELSDSRRSDVMAGFRKGEIWILITTDLLARGVDFKGINGVVNYDIPNSSAAYVHRVGRTGRAGRDGGVAVTFYTKEDISYVKNIANVISASEKLRGTEEGERIPKWLLDALPSLSKKDKEDLKRHGVKTRRPMATNDGSAAKKSRISTKSGFERRIENKRKGAIKGSQRRKAKEQSSEVDEGQDVWNGIED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.47
3 0.49
4 0.49
5 0.55
6 0.56
7 0.61
8 0.58
9 0.58
10 0.6
11 0.57
12 0.59
13 0.56
14 0.51
15 0.43
16 0.41
17 0.38
18 0.36
19 0.34
20 0.3
21 0.27
22 0.28
23 0.27
24 0.24
25 0.24
26 0.24
27 0.26
28 0.26
29 0.28
30 0.25
31 0.24
32 0.24
33 0.23
34 0.23
35 0.18
36 0.2
37 0.17
38 0.17
39 0.18
40 0.18
41 0.16
42 0.15
43 0.17
44 0.14
45 0.12
46 0.12
47 0.12
48 0.1
49 0.1
50 0.07
51 0.05
52 0.05
53 0.04
54 0.05
55 0.05
56 0.06
57 0.06
58 0.07
59 0.08
60 0.09
61 0.11
62 0.18
63 0.21
64 0.25
65 0.31
66 0.37
67 0.36
68 0.38
69 0.36
70 0.32
71 0.3
72 0.27
73 0.23
74 0.18
75 0.17
76 0.16
77 0.16
78 0.13
79 0.11
80 0.11
81 0.11
82 0.1
83 0.1
84 0.13
85 0.14
86 0.14
87 0.15
88 0.19
89 0.19
90 0.2
91 0.2
92 0.18
93 0.18
94 0.19
95 0.23
96 0.21
97 0.18
98 0.18
99 0.18
100 0.21
101 0.2
102 0.2
103 0.16
104 0.16
105 0.17
106 0.18
107 0.18
108 0.13
109 0.15
110 0.17
111 0.17
112 0.18
113 0.17
114 0.17
115 0.19
116 0.19
117 0.23
118 0.22
119 0.29
120 0.31
121 0.33
122 0.33
123 0.34
124 0.36
125 0.33
126 0.31
127 0.25
128 0.22
129 0.21
130 0.24
131 0.22
132 0.19
133 0.16
134 0.14
135 0.13
136 0.16
137 0.17
138 0.14
139 0.16
140 0.17
141 0.18
142 0.18
143 0.19
144 0.18
145 0.18
146 0.2
147 0.2
148 0.21
149 0.23
150 0.26
151 0.25
152 0.25
153 0.25
154 0.27
155 0.29
156 0.27
157 0.33
158 0.34
159 0.42
160 0.48
161 0.51
162 0.55
163 0.56
164 0.56
165 0.51
166 0.49
167 0.43
168 0.33
169 0.28
170 0.22
171 0.17
172 0.15
173 0.11
174 0.09
175 0.07
176 0.06
177 0.06
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.06
187 0.08
188 0.09
189 0.09
190 0.1
191 0.16
192 0.21
193 0.24
194 0.26
195 0.29
196 0.29
197 0.3
198 0.3
199 0.26
200 0.22
201 0.2
202 0.16
203 0.13
204 0.13
205 0.12
206 0.11
207 0.11
208 0.1
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.16
213 0.19
214 0.24
215 0.26
216 0.36
217 0.39
218 0.45
219 0.5
220 0.53
221 0.58
222 0.57
223 0.59
224 0.5
225 0.5
226 0.46
227 0.4
228 0.33
229 0.31
230 0.26
231 0.21
232 0.2
233 0.16
234 0.15
235 0.17
236 0.15
237 0.11
238 0.11
239 0.14
240 0.15
241 0.15
242 0.15
243 0.14
244 0.15
245 0.16
246 0.24
247 0.22
248 0.22
249 0.23
250 0.24
251 0.27
252 0.27
253 0.27
254 0.21
255 0.22
256 0.25
257 0.32
258 0.35
259 0.36
260 0.39
261 0.47
262 0.53
263 0.59
264 0.58
265 0.56
266 0.58
267 0.55
268 0.53
269 0.45
270 0.37
271 0.29
272 0.25
273 0.2
274 0.15
275 0.1
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.05
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.09
288 0.1
289 0.11
290 0.11
291 0.14
292 0.17
293 0.21
294 0.26
295 0.31
296 0.39
297 0.49
298 0.57
299 0.64
300 0.71
301 0.77
302 0.82
303 0.81
304 0.81
305 0.75
306 0.71
307 0.66
308 0.61
309 0.56
310 0.48
311 0.42
312 0.32
313 0.34
314 0.3
315 0.27
316 0.24
317 0.2
318 0.18
319 0.18
320 0.2
321 0.16
322 0.16
323 0.14
324 0.13
325 0.13
326 0.13
327 0.18
328 0.19
329 0.24
330 0.29
331 0.32
332 0.36
333 0.38
334 0.41
335 0.44
336 0.48
337 0.45
338 0.4
339 0.38
340 0.35
341 0.34
342 0.31
343 0.25
344 0.19
345 0.13
346 0.13
347 0.11
348 0.1
349 0.1
350 0.1
351 0.1
352 0.11
353 0.14
354 0.21
355 0.25
356 0.34
357 0.45
358 0.55
359 0.63
360 0.74
361 0.81
362 0.85
363 0.9
364 0.9
365 0.89
366 0.86
367 0.77
368 0.75
369 0.67
370 0.58
371 0.57
372 0.57
373 0.52
374 0.47
375 0.51
376 0.48
377 0.52
378 0.56
379 0.51
380 0.46
381 0.42
382 0.43
383 0.38
384 0.32
385 0.26
386 0.22
387 0.21
388 0.2
389 0.19
390 0.18
391 0.22
392 0.22
393 0.23
394 0.21
395 0.17
396 0.2
397 0.23
398 0.3
399 0.27
400 0.29
401 0.29
402 0.33
403 0.34
404 0.3
405 0.31
406 0.3
407 0.29
408 0.27
409 0.25
410 0.22
411 0.21
412 0.21
413 0.17
414 0.1
415 0.08
416 0.09
417 0.09
418 0.08
419 0.08
420 0.06
421 0.06
422 0.06
423 0.05
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.03
428 0.03
429 0.03
430 0.03
431 0.04
432 0.08
433 0.11
434 0.12
435 0.15
436 0.2
437 0.22
438 0.27
439 0.37
440 0.39
441 0.42
442 0.44
443 0.42
444 0.39
445 0.4
446 0.34
447 0.26
448 0.2
449 0.15
450 0.12
451 0.11
452 0.09
453 0.07
454 0.06
455 0.05
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.03
461 0.04
462 0.04
463 0.05
464 0.06
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.08
469 0.08
470 0.09
471 0.1
472 0.1
473 0.1
474 0.12
475 0.17
476 0.19
477 0.23
478 0.27
479 0.33
480 0.39
481 0.41
482 0.4
483 0.39
484 0.35
485 0.3
486 0.25
487 0.17
488 0.11
489 0.09
490 0.07
491 0.04
492 0.05
493 0.04
494 0.04
495 0.04
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.04
501 0.05
502 0.06
503 0.1
504 0.1
505 0.1
506 0.11
507 0.1
508 0.1
509 0.1
510 0.09
511 0.11
512 0.12
513 0.12
514 0.13
515 0.13
516 0.13
517 0.15
518 0.15
519 0.12
520 0.15
521 0.15
522 0.15
523 0.17
524 0.18
525 0.17
526 0.18
527 0.17
528 0.19
529 0.22
530 0.22
531 0.2
532 0.19
533 0.18
534 0.17
535 0.15
536 0.11
537 0.08
538 0.08
539 0.08
540 0.09
541 0.1
542 0.1
543 0.1
544 0.09
545 0.08
546 0.07
547 0.07
548 0.05
549 0.03
550 0.04
551 0.04
552 0.04
553 0.04
554 0.04
555 0.05
556 0.06
557 0.06
558 0.1
559 0.1
560 0.1
561 0.11
562 0.11
563 0.11
564 0.14
565 0.15
566 0.14
567 0.19
568 0.19
569 0.2
570 0.2
571 0.18
572 0.16
573 0.15
574 0.13
575 0.08
576 0.08
577 0.07
578 0.07
579 0.07
580 0.06
581 0.06
582 0.06
583 0.06
584 0.06
585 0.06
586 0.05
587 0.05
588 0.05
589 0.04
590 0.04
591 0.03
592 0.03
593 0.04
594 0.04
595 0.04
596 0.04
597 0.04
598 0.04
599 0.04
600 0.05
601 0.06
602 0.06
603 0.06
604 0.06
605 0.06
606 0.07
607 0.06
608 0.05
609 0.04
610 0.04
611 0.04
612 0.05
613 0.05
614 0.05
615 0.06
616 0.06
617 0.1
618 0.14
619 0.17
620 0.16
621 0.18
622 0.18
623 0.19
624 0.2
625 0.23
626 0.19
627 0.2
628 0.23
629 0.26
630 0.26
631 0.28
632 0.3
633 0.24
634 0.23
635 0.2
636 0.18
637 0.13
638 0.13
639 0.1
640 0.07
641 0.07
642 0.06
643 0.07
644 0.06
645 0.06
646 0.07
647 0.08
648 0.08
649 0.08
650 0.13
651 0.16
652 0.2
653 0.21
654 0.21
655 0.24
656 0.29
657 0.33
658 0.34
659 0.32
660 0.28
661 0.26
662 0.27
663 0.25
664 0.2
665 0.15
666 0.1
667 0.09
668 0.09
669 0.1
670 0.08
671 0.08
672 0.07
673 0.07
674 0.09
675 0.1
676 0.1
677 0.1
678 0.1
679 0.12
680 0.16
681 0.17
682 0.14
683 0.14
684 0.15
685 0.14
686 0.16
687 0.15
688 0.16
689 0.17
690 0.18
691 0.18
692 0.16
693 0.17
694 0.15
695 0.15
696 0.13
697 0.13
698 0.13
699 0.15
700 0.19
701 0.18
702 0.19
703 0.17
704 0.15
705 0.16
706 0.17
707 0.16
708 0.12
709 0.16
710 0.18
711 0.2
712 0.22
713 0.24
714 0.25
715 0.27
716 0.31
717 0.34
718 0.32
719 0.36
720 0.33
721 0.33
722 0.34
723 0.33
724 0.3
725 0.24
726 0.22
727 0.17
728 0.17
729 0.15
730 0.12
731 0.12
732 0.1
733 0.1
734 0.1
735 0.1
736 0.1
737 0.08
738 0.07
739 0.06
740 0.06
741 0.05
742 0.06
743 0.06
744 0.07
745 0.08
746 0.08
747 0.09
748 0.09
749 0.1
750 0.1
751 0.11
752 0.12
753 0.11
754 0.12
755 0.13
756 0.15
757 0.2
758 0.2
759 0.2
760 0.19
761 0.19
762 0.19
763 0.21
764 0.28
765 0.31
766 0.32
767 0.32
768 0.31
769 0.31
770 0.29
771 0.28
772 0.19
773 0.14
774 0.12
775 0.12
776 0.12
777 0.11
778 0.11
779 0.1
780 0.1
781 0.08
782 0.07
783 0.06
784 0.08
785 0.08
786 0.11
787 0.1
788 0.1
789 0.14
790 0.14
791 0.15
792 0.13
793 0.14
794 0.12
795 0.14
796 0.14
797 0.12
798 0.12
799 0.11
800 0.12
801 0.12
802 0.11
803 0.11
804 0.11
805 0.15
806 0.18
807 0.22
808 0.22
809 0.24
810 0.24
811 0.28
812 0.36
813 0.36
814 0.36
815 0.38
816 0.37
817 0.35
818 0.38
819 0.32
820 0.25
821 0.2
822 0.17
823 0.12
824 0.13
825 0.12
826 0.09
827 0.11
828 0.1
829 0.1
830 0.11
831 0.13
832 0.15
833 0.19
834 0.21
835 0.2
836 0.22
837 0.22
838 0.21
839 0.21
840 0.17
841 0.15
842 0.15
843 0.16
844 0.15
845 0.19
846 0.19
847 0.17
848 0.2
849 0.19
850 0.21
851 0.27
852 0.29
853 0.34
854 0.38
855 0.37
856 0.37
857 0.37
858 0.32
859 0.27
860 0.27
861 0.19
862 0.18
863 0.21
864 0.22
865 0.29
866 0.29
867 0.32
868 0.33
869 0.36
870 0.35
871 0.4
872 0.47
873 0.49
874 0.58
875 0.64
876 0.69
877 0.75
878 0.77
879 0.78
880 0.78
881 0.77
882 0.77
883 0.78
884 0.75
885 0.68
886 0.68
887 0.68
888 0.68
889 0.61
890 0.54
891 0.5
892 0.43
893 0.44
894 0.43
895 0.37
896 0.33
897 0.33
898 0.4
899 0.37
900 0.43
901 0.46
902 0.52
903 0.6
904 0.64
905 0.67
906 0.6
907 0.66
908 0.68
909 0.73
910 0.73
911 0.71
912 0.7
913 0.73
914 0.77
915 0.72
916 0.72
917 0.69
918 0.71
919 0.73
920 0.76
921 0.77
922 0.79
923 0.81
924 0.81
925 0.83
926 0.81
927 0.8
928 0.78
929 0.77
930 0.76
931 0.73
932 0.65
933 0.57
934 0.47
935 0.39
936 0.31
937 0.26
938 0.19