FuNGI

A0A0A2JYK2

Protein Details

Accession

A0A0A2JYK2

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
342-361	GTPIRRKKRKGALTNPSAYS	Hydrophilic
455-478	NTSGQAKRHGAKHKRGRNGNEAIG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
346-351	RRKKRK
461-471	KRHGAKHKRGR

Subcellular Location(s)

nucl 15, mito 7, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPKQWIDKKNASKFQLFHRSQNDPLIHDTSADDRFLYQVGGPAPAPASSSASTTSKKTLPNLFDLQSEYGDSARKNEGEAANYGVYYDDSSYDYMQHLRELGSGSGDAYFVEAKTEKAKGRAGRGMKLEDALRQVSLVDKDTYGQGTSVAPSLYGSQYGDMRSTTSSFVRKPTYQDQQNVPDAIAGFKPDMDPRLREALEALEDEAFVEDGDADGIFGELTANAEEIDEGEWEDSLFDHDVEDDGWESDATEKAPVQPDSTDAHRSIDDELPEEPAKPPMEPGEMPEHDKPAPDMQPTDQSWMSEFAKFKKDAKAGNVPAPAAPTIAASQTMASTVFTAGGTPIRRKKRKGALTNPSAYSMTSSALARTAGHRLLDDRFDKVEQLYSLDEEDEYDDSMSMISGMTGATGMTGMTDMSAASSQAPSLIDGNGEAVHSRSTFNNVMDDFLSSWDPNTSGQAKRHGAKHKRGRNGNEAIGIRMLDEVRSGLGPARIQGKGKVSGRA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.71
2	0.71
3	0.72
4	0.65
5	0.63
6	0.62
7	0.62
8	0.58
9	0.64
10	0.56
11	0.48
12	0.49
13	0.45
14	0.37
15	0.32
16	0.3
17	0.26
18	0.26
19	0.23
20	0.19
21	0.15
22	0.16
23	0.16
24	0.15
25	0.11
26	0.13
27	0.13
28	0.15
29	0.15
30	0.15
31	0.15
32	0.15
33	0.15
34	0.12
35	0.16
36	0.14
37	0.16
38	0.18
39	0.21
40	0.23
41	0.25
42	0.28
43	0.29
44	0.32
45	0.37
46	0.42
47	0.41
48	0.46
49	0.49
50	0.45
51	0.42
52	0.42
53	0.37
54	0.3
55	0.27
56	0.2
57	0.16
58	0.18
59	0.16
60	0.17
61	0.19
62	0.19
63	0.19
64	0.25
65	0.26
66	0.25
67	0.26
68	0.27
69	0.23
70	0.23
71	0.21
72	0.15
73	0.13
74	0.12
75	0.11
76	0.08
77	0.09
78	0.11
79	0.11
80	0.12
81	0.13
82	0.15
83	0.15
84	0.15
85	0.14
86	0.13
87	0.14
88	0.15
89	0.14
90	0.13
91	0.12
92	0.11
93	0.11
94	0.1
95	0.08
96	0.07
97	0.08
98	0.06
99	0.09
100	0.09
101	0.1
102	0.13
103	0.18
104	0.19
105	0.23
106	0.29
107	0.3
108	0.37
109	0.43
110	0.44
111	0.45
112	0.46
113	0.45
114	0.4
115	0.38
116	0.33
117	0.28
118	0.27
119	0.22
120	0.18
121	0.15
122	0.14
123	0.15
124	0.15
125	0.15
126	0.13
127	0.13
128	0.13
129	0.15
130	0.15
131	0.13
132	0.11
133	0.09
134	0.09
135	0.09
136	0.1
137	0.09
138	0.08
139	0.08
140	0.1
141	0.09
142	0.09
143	0.09
144	0.09
145	0.11
146	0.11
147	0.12
148	0.1
149	0.11
150	0.11
151	0.12
152	0.13
153	0.15
154	0.18
155	0.19
156	0.23
157	0.28
158	0.28
159	0.33
160	0.38
161	0.44
162	0.47
163	0.51
164	0.52
165	0.52
166	0.54
167	0.48
168	0.4
169	0.32
170	0.26
171	0.21
172	0.16
173	0.11
174	0.08
175	0.08
176	0.09
177	0.09
178	0.12
179	0.13
180	0.14
181	0.16
182	0.22
183	0.22
184	0.21
185	0.2
186	0.18
187	0.17
188	0.16
189	0.14
190	0.08
191	0.07
192	0.07
193	0.07
194	0.06
195	0.04
196	0.04
197	0.03
198	0.03
199	0.03
200	0.03
201	0.03
202	0.03
203	0.03
204	0.02
205	0.02
206	0.03
207	0.02
208	0.03
209	0.03
210	0.03
211	0.03
212	0.04
213	0.04
214	0.04
215	0.04
216	0.04
217	0.04
218	0.04
219	0.04
220	0.04
221	0.04
222	0.04
223	0.05
224	0.05
225	0.05
226	0.05
227	0.05
228	0.05
229	0.05
230	0.05
231	0.04
232	0.04
233	0.04
234	0.04
235	0.04
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.06
240	0.06
241	0.08
242	0.11
243	0.12
244	0.12
245	0.12
246	0.14
247	0.15
248	0.17
249	0.18
250	0.15
251	0.16
252	0.15
253	0.16
254	0.16
255	0.17
256	0.14
257	0.13
258	0.13
259	0.14
260	0.15
261	0.15
262	0.12
263	0.14
264	0.14
265	0.13
266	0.13
267	0.12
268	0.14
269	0.14
270	0.16
271	0.2
272	0.2
273	0.24
274	0.25
275	0.26
276	0.23
277	0.23
278	0.22
279	0.19
280	0.2
281	0.18
282	0.18
283	0.17
284	0.24
285	0.24
286	0.26
287	0.22
288	0.2
289	0.2
290	0.22
291	0.22
292	0.19
293	0.2
294	0.19
295	0.25
296	0.26
297	0.28
298	0.32
299	0.34
300	0.34
301	0.39
302	0.45
303	0.42
304	0.45
305	0.44
306	0.37
307	0.33
308	0.31
309	0.25
310	0.16
311	0.13
312	0.08
313	0.08
314	0.08
315	0.08
316	0.06
317	0.07
318	0.06
319	0.07
320	0.06
321	0.06
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.06
328	0.1
329	0.12
330	0.18
331	0.26
332	0.36
333	0.43
334	0.47
335	0.56
336	0.63
337	0.71
338	0.75
339	0.78
340	0.78
341	0.8
342	0.81
343	0.72
344	0.64
345	0.54
346	0.43
347	0.35
348	0.25
349	0.17
350	0.13
351	0.12
352	0.1
353	0.11
354	0.11
355	0.1
356	0.11
357	0.14
358	0.14
359	0.15
360	0.15
361	0.16
362	0.18
363	0.24
364	0.23
365	0.22
366	0.22
367	0.22
368	0.23
369	0.21
370	0.22
371	0.17
372	0.17
373	0.16
374	0.15
375	0.15
376	0.14
377	0.13
378	0.1
379	0.11
380	0.1
381	0.09
382	0.09
383	0.08
384	0.07
385	0.07
386	0.07
387	0.05
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.03
392	0.03
393	0.03
394	0.03
395	0.03
396	0.03
397	0.03
398	0.03
399	0.03
400	0.03
401	0.03
402	0.04
403	0.03
404	0.04
405	0.05
406	0.05
407	0.06
408	0.07
409	0.06
410	0.08
411	0.09
412	0.09
413	0.1
414	0.1
415	0.09
416	0.09
417	0.1
418	0.09
419	0.09
420	0.08
421	0.08
422	0.09
423	0.1
424	0.11
425	0.11
426	0.17
427	0.2
428	0.21
429	0.25
430	0.24
431	0.25
432	0.24
433	0.25
434	0.19
435	0.18
436	0.19
437	0.14
438	0.15
439	0.14
440	0.14
441	0.14
442	0.19
443	0.22
444	0.25
445	0.3
446	0.38
447	0.43
448	0.48
449	0.55
450	0.6
451	0.65
452	0.7
453	0.76
454	0.77
455	0.81
456	0.85
457	0.84
458	0.83
459	0.81
460	0.75
461	0.72
462	0.64
463	0.55
464	0.47
465	0.39
466	0.3
467	0.24
468	0.2
469	0.12
470	0.12
471	0.11
472	0.1
473	0.11
474	0.11
475	0.12
476	0.15
477	0.16
478	0.18
479	0.24
480	0.25
481	0.27
482	0.32
483	0.35
484	0.4

A0A0A2JYK2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer