Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JHC4

Protein Details
Accession C4JHC4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
722-746GDHTVVKEKRKERFREKFMNNSSWVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013194  HDAC_interact_dom  
IPR039774  Sin3-like  
IPR031693  Sin3_C  
Gene Ontology GO:0003714  F:transcription corepressor activity  
KEGG ure:UREG_02697  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08295  Sin3_corepress  
PF16879  Sin3a_C  
Amino Acid Sequences MHIEPKDEIIEPKAKDESGIVNLAHCRALGPSYRLLPKLERQKPCSGRDELCQSVLNDEWASHPTWASEDSGFVAHRKNQHEDSLHRVEEDRHDYDHYIEAGIRTIQLMEALLQQVSVMSETDRANFKLPPGLGGQSETIYKKVIKKIYEKEYGLRILEELFLNPSQVLPIVIARLKQKIEEWKLSQREWEKVWREQMQKGYWRSLDHQSSINKKDDKKLLTTKHFQAEIQAKFEEARALRRSGYPVLSYQFKHTFTDSEVILDATHLVLCYIDHNSAGFGTDPQKVMNFVRDFIPVFFGMDRDAVRTYLSEVYDTTPVNEDMDNESVPSDEINGLRTRRMVNSKKLDLLRDVLDNRGDKSLRPDGDKFTPSISRFSTPGLGSTTGSTPAPDSNGTFDSAELQWMEHPNQGNFNQQREYPLNEPYKKKVHHLYGNLTIYCFLRTFEMLYTRLLHLKGGEEAAHEELRRAIAPKAAHDLGMLDKIPKEFFYDTDPKSNLYQQMIRMCEEVVKGNADTSHLEEILRRFYNRNRGWELYTLDKQLAAIAKFASNIFNTDPKDKSADIVNLFFKERDKEETTHNHEIQYRKQVEKMIKDGDIYRISYVPTSSTATIQLFTTEDSTLENNDLTPEAKWSYYVSAYSMRDPTEGVLFSDMRIPFLKRNLPPKLESDEEYSQFFRPLISNEGLVIRICANSYHILYEPGTEEWWCRIPQPKDTQKSAIGDHTVVKEKRKERFREKFMNNSSWVHGLNEEEVEESKQRFRTWVGATDKDSPHSEKSPVGKSEDQQDNVDEVMTNAD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.29
3 0.29
4 0.28
5 0.25
6 0.28
7 0.24
8 0.24
9 0.26
10 0.27
11 0.25
12 0.2
13 0.16
14 0.14
15 0.18
16 0.2
17 0.22
18 0.26
19 0.32
20 0.37
21 0.39
22 0.41
23 0.43
24 0.46
25 0.54
26 0.58
27 0.6
28 0.62
29 0.7
30 0.75
31 0.76
32 0.74
33 0.69
34 0.63
35 0.62
36 0.63
37 0.55
38 0.5
39 0.47
40 0.4
41 0.37
42 0.34
43 0.29
44 0.21
45 0.19
46 0.18
47 0.17
48 0.18
49 0.15
50 0.15
51 0.13
52 0.14
53 0.16
54 0.16
55 0.14
56 0.14
57 0.14
58 0.16
59 0.16
60 0.16
61 0.2
62 0.22
63 0.29
64 0.33
65 0.39
66 0.4
67 0.47
68 0.51
69 0.5
70 0.54
71 0.55
72 0.5
73 0.44
74 0.42
75 0.38
76 0.4
77 0.43
78 0.36
79 0.31
80 0.33
81 0.33
82 0.33
83 0.33
84 0.26
85 0.2
86 0.19
87 0.17
88 0.16
89 0.15
90 0.14
91 0.1
92 0.1
93 0.09
94 0.08
95 0.08
96 0.07
97 0.09
98 0.1
99 0.09
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.06
106 0.06
107 0.1
108 0.11
109 0.15
110 0.18
111 0.19
112 0.21
113 0.21
114 0.22
115 0.25
116 0.24
117 0.23
118 0.23
119 0.23
120 0.22
121 0.22
122 0.22
123 0.16
124 0.2
125 0.19
126 0.17
127 0.17
128 0.21
129 0.25
130 0.32
131 0.36
132 0.39
133 0.47
134 0.55
135 0.61
136 0.66
137 0.62
138 0.58
139 0.58
140 0.55
141 0.47
142 0.38
143 0.3
144 0.22
145 0.22
146 0.19
147 0.14
148 0.13
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.11
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.06
157 0.07
158 0.1
159 0.11
160 0.14
161 0.16
162 0.2
163 0.2
164 0.21
165 0.25
166 0.32
167 0.38
168 0.43
169 0.46
170 0.51
171 0.55
172 0.54
173 0.57
174 0.51
175 0.49
176 0.45
177 0.49
178 0.45
179 0.46
180 0.53
181 0.53
182 0.54
183 0.54
184 0.58
185 0.55
186 0.57
187 0.55
188 0.53
189 0.47
190 0.45
191 0.45
192 0.46
193 0.43
194 0.37
195 0.4
196 0.4
197 0.46
198 0.48
199 0.51
200 0.48
201 0.47
202 0.52
203 0.54
204 0.51
205 0.51
206 0.56
207 0.57
208 0.59
209 0.64
210 0.61
211 0.6
212 0.57
213 0.49
214 0.48
215 0.47
216 0.41
217 0.38
218 0.32
219 0.27
220 0.26
221 0.26
222 0.24
223 0.17
224 0.22
225 0.21
226 0.23
227 0.24
228 0.26
229 0.29
230 0.27
231 0.28
232 0.23
233 0.22
234 0.23
235 0.26
236 0.25
237 0.27
238 0.29
239 0.29
240 0.29
241 0.27
242 0.26
243 0.24
244 0.26
245 0.2
246 0.16
247 0.15
248 0.13
249 0.12
250 0.1
251 0.08
252 0.06
253 0.06
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.05
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.07
267 0.07
268 0.09
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.13
273 0.14
274 0.15
275 0.21
276 0.19
277 0.17
278 0.19
279 0.2
280 0.2
281 0.19
282 0.2
283 0.12
284 0.13
285 0.12
286 0.1
287 0.09
288 0.1
289 0.1
290 0.09
291 0.1
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.11
296 0.12
297 0.13
298 0.11
299 0.11
300 0.13
301 0.15
302 0.15
303 0.13
304 0.12
305 0.12
306 0.12
307 0.12
308 0.11
309 0.11
310 0.13
311 0.12
312 0.1
313 0.1
314 0.09
315 0.09
316 0.08
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.08
321 0.11
322 0.12
323 0.13
324 0.14
325 0.15
326 0.18
327 0.28
328 0.32
329 0.38
330 0.44
331 0.46
332 0.5
333 0.5
334 0.47
335 0.39
336 0.36
337 0.28
338 0.25
339 0.23
340 0.19
341 0.2
342 0.19
343 0.19
344 0.2
345 0.19
346 0.15
347 0.2
348 0.25
349 0.24
350 0.27
351 0.28
352 0.28
353 0.33
354 0.33
355 0.28
356 0.24
357 0.27
358 0.24
359 0.26
360 0.23
361 0.2
362 0.2
363 0.2
364 0.21
365 0.16
366 0.17
367 0.16
368 0.15
369 0.13
370 0.14
371 0.13
372 0.11
373 0.11
374 0.09
375 0.08
376 0.08
377 0.09
378 0.08
379 0.08
380 0.09
381 0.1
382 0.11
383 0.1
384 0.1
385 0.11
386 0.1
387 0.1
388 0.08
389 0.07
390 0.08
391 0.09
392 0.11
393 0.11
394 0.12
395 0.12
396 0.15
397 0.16
398 0.23
399 0.24
400 0.25
401 0.24
402 0.23
403 0.27
404 0.26
405 0.29
406 0.22
407 0.27
408 0.33
409 0.37
410 0.39
411 0.39
412 0.45
413 0.42
414 0.45
415 0.45
416 0.45
417 0.46
418 0.48
419 0.48
420 0.48
421 0.5
422 0.45
423 0.38
424 0.32
425 0.25
426 0.22
427 0.17
428 0.1
429 0.08
430 0.08
431 0.09
432 0.09
433 0.12
434 0.12
435 0.13
436 0.15
437 0.14
438 0.17
439 0.15
440 0.14
441 0.12
442 0.12
443 0.11
444 0.1
445 0.1
446 0.08
447 0.09
448 0.11
449 0.11
450 0.1
451 0.1
452 0.1
453 0.1
454 0.1
455 0.11
456 0.09
457 0.12
458 0.12
459 0.14
460 0.19
461 0.18
462 0.17
463 0.16
464 0.16
465 0.13
466 0.14
467 0.13
468 0.08
469 0.09
470 0.1
471 0.1
472 0.1
473 0.13
474 0.11
475 0.12
476 0.19
477 0.25
478 0.26
479 0.32
480 0.32
481 0.3
482 0.32
483 0.34
484 0.3
485 0.26
486 0.27
487 0.25
488 0.3
489 0.29
490 0.29
491 0.26
492 0.23
493 0.21
494 0.19
495 0.17
496 0.12
497 0.12
498 0.11
499 0.12
500 0.12
501 0.11
502 0.11
503 0.12
504 0.12
505 0.11
506 0.11
507 0.13
508 0.14
509 0.19
510 0.19
511 0.18
512 0.2
513 0.25
514 0.36
515 0.38
516 0.44
517 0.44
518 0.45
519 0.46
520 0.47
521 0.45
522 0.41
523 0.39
524 0.33
525 0.27
526 0.25
527 0.22
528 0.19
529 0.2
530 0.14
531 0.12
532 0.12
533 0.12
534 0.13
535 0.13
536 0.13
537 0.1
538 0.11
539 0.12
540 0.17
541 0.19
542 0.22
543 0.23
544 0.23
545 0.26
546 0.24
547 0.23
548 0.23
549 0.25
550 0.23
551 0.26
552 0.26
553 0.24
554 0.25
555 0.25
556 0.22
557 0.2
558 0.2
559 0.24
560 0.26
561 0.26
562 0.32
563 0.41
564 0.47
565 0.53
566 0.52
567 0.48
568 0.48
569 0.5
570 0.49
571 0.5
572 0.47
573 0.4
574 0.41
575 0.44
576 0.46
577 0.48
578 0.48
579 0.42
580 0.37
581 0.37
582 0.36
583 0.36
584 0.32
585 0.28
586 0.23
587 0.2
588 0.2
589 0.19
590 0.18
591 0.13
592 0.13
593 0.15
594 0.14
595 0.14
596 0.17
597 0.17
598 0.17
599 0.16
600 0.14
601 0.12
602 0.12
603 0.13
604 0.1
605 0.09
606 0.1
607 0.11
608 0.11
609 0.12
610 0.11
611 0.09
612 0.1
613 0.11
614 0.1
615 0.09
616 0.11
617 0.12
618 0.12
619 0.12
620 0.13
621 0.15
622 0.16
623 0.16
624 0.15
625 0.2
626 0.22
627 0.25
628 0.26
629 0.24
630 0.22
631 0.22
632 0.21
633 0.18
634 0.17
635 0.15
636 0.15
637 0.15
638 0.15
639 0.2
640 0.19
641 0.18
642 0.19
643 0.21
644 0.22
645 0.29
646 0.37
647 0.36
648 0.46
649 0.52
650 0.55
651 0.55
652 0.55
653 0.55
654 0.5
655 0.47
656 0.45
657 0.42
658 0.39
659 0.39
660 0.36
661 0.31
662 0.29
663 0.26
664 0.2
665 0.17
666 0.18
667 0.2
668 0.2
669 0.2
670 0.19
671 0.21
672 0.2
673 0.18
674 0.16
675 0.12
676 0.11
677 0.11
678 0.1
679 0.12
680 0.14
681 0.15
682 0.16
683 0.16
684 0.18
685 0.18
686 0.19
687 0.19
688 0.16
689 0.17
690 0.15
691 0.16
692 0.17
693 0.2
694 0.19
695 0.2
696 0.29
697 0.32
698 0.41
699 0.5
700 0.57
701 0.61
702 0.66
703 0.67
704 0.63
705 0.63
706 0.57
707 0.51
708 0.44
709 0.38
710 0.36
711 0.36
712 0.39
713 0.38
714 0.42
715 0.45
716 0.49
717 0.57
718 0.64
719 0.69
720 0.71
721 0.79
722 0.82
723 0.84
724 0.84
725 0.86
726 0.84
727 0.81
728 0.74
729 0.66
730 0.59
731 0.52
732 0.46
733 0.36
734 0.3
735 0.24
736 0.22
737 0.2
738 0.17
739 0.15
740 0.15
741 0.17
742 0.19
743 0.2
744 0.23
745 0.26
746 0.27
747 0.28
748 0.3
749 0.35
750 0.36
751 0.43
752 0.45
753 0.47
754 0.51
755 0.56
756 0.55
757 0.51
758 0.51
759 0.46
760 0.44
761 0.42
762 0.41
763 0.39
764 0.44
765 0.48
766 0.48
767 0.5
768 0.5
769 0.48
770 0.56
771 0.58
772 0.54
773 0.48
774 0.46
775 0.41
776 0.36
777 0.34
778 0.23