Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C4JHC4

Protein Details
Accession C4JHC4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
722-746GDHTVVKEKRKERFREKFMNNSSWVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013194  HDAC_interact_dom  
IPR039774  Sin3-like  
IPR031693  Sin3_C  
Gene Ontology GO:0003714  F:transcription corepressor activity  
KEGG ure:UREG_02697  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08295  Sin3_corepress  
PF16879  Sin3a_C  
Amino Acid Sequences MHIEPKDEIIEPKAKDESGIVNLAHCRALGPSYRLLPKLERQKPCSGRDELCQSVLNDEWASHPTWASEDSGFVAHRKNQHEDSLHRVEEDRHDYDHYIEAGIRTIQLMEALLQQVSVMSETDRANFKLPPGLGGQSETIYKKVIKKIYEKEYGLRILEELFLNPSQVLPIVIARLKQKIEEWKLSQREWEKVWREQMQKGYWRSLDHQSSINKKDDKKLLTTKHFQAEIQAKFEEARALRRSGYPVLSYQFKHTFTDSEVILDATHLVLCYIDHNSAGFGTDPQKVMNFVRDFIPVFFGMDRDAVRTYLSEVYDTTPVNEDMDNESVPSDEINGLRTRRMVNSKKLDLLRDVLDNRGDKSLRPDGDKFTPSISRFSTPGLGSTTGSTPAPDSNGTFDSAELQWMEHPNQGNFNQQREYPLNEPYKKKVHHLYGNLTIYCFLRTFEMLYTRLLHLKGGEEAAHEELRRAIAPKAAHDLGMLDKIPKEFFYDTDPKSNLYQQMIRMCEEVVKGNADTSHLEEILRRFYNRNRGWELYTLDKQLAAIAKFASNIFNTDPKDKSADIVNLFFKERDKEETTHNHEIQYRKQVEKMIKDGDIYRISYVPTSSTATIQLFTTEDSTLENNDLTPEAKWSYYVSAYSMRDPTEGVLFSDMRIPFLKRNLPPKLESDEEYSQFFRPLISNEGLVIRICANSYHILYEPGTEEWWCRIPQPKDTQKSAIGDHTVVKEKRKERFREKFMNNSSWVHGLNEEEVEESKQRFRTWVGATDKDSPHSEKSPVGKSEDQQDNVDEVMTNAD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.29
3 0.29
4 0.28
5 0.25
6 0.28
7 0.24
8 0.24
9 0.26
10 0.27
11 0.25
12 0.2
13 0.16
14 0.14
15 0.18
16 0.2
17 0.22
18 0.26
19 0.32
20 0.37
21 0.39
22 0.41
23 0.43
24 0.46
25 0.54
26 0.58
27 0.6
28 0.62
29 0.7
30 0.75
31 0.76
32 0.74
33 0.69
34 0.63
35 0.62
36 0.63
37 0.55
38 0.5
39 0.47
40 0.4
41 0.37
42 0.34
43 0.29
44 0.21
45 0.19
46 0.18
47 0.17
48 0.18
49 0.15
50 0.15
51 0.13
52 0.14
53 0.16
54 0.16
55 0.14
56 0.14
57 0.14
58 0.16
59 0.16
60 0.16
61 0.2
62 0.22
63 0.29
64 0.33
65 0.39
66 0.4
67 0.47
68 0.51
69 0.5
70 0.54
71 0.55
72 0.5
73 0.44
74 0.42
75 0.38
76 0.4
77 0.43
78 0.36
79 0.31
80 0.33
81 0.33
82 0.33
83 0.33
84 0.26
85 0.2
86 0.19
87 0.17
88 0.16
89 0.15
90 0.14
91 0.1
92 0.1
93 0.09
94 0.08
95 0.08
96 0.07
97 0.09
98 0.1
99 0.09
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.06
106 0.06
107 0.1
108 0.11
109 0.15
110 0.18
111 0.19
112 0.21
113 0.21
114 0.22
115 0.25
116 0.24
117 0.23
118 0.23
119 0.23
120 0.22
121 0.22
122 0.22
123 0.16
124 0.2
125 0.19
126 0.17
127 0.17
128 0.21
129 0.25
130 0.32
131 0.36
132 0.39
133 0.47
134 0.55
135 0.61
136 0.66
137 0.62
138 0.58
139 0.58
140 0.55
141 0.47
142 0.38
143 0.3
144 0.22
145 0.22
146 0.19
147 0.14
148 0.13
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.11
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.06
157 0.07
158 0.1
159 0.11
160 0.14
161 0.16
162 0.2
163 0.2
164 0.21
165 0.25
166 0.32
167 0.38
168 0.43
169 0.46
170 0.51
171 0.55
172 0.54
173 0.57
174 0.51
175 0.49
176 0.45
177 0.49
178 0.45
179 0.46
180 0.53
181 0.53
182 0.54
183 0.54
184 0.58
185 0.55
186 0.57
187 0.55
188 0.53
189 0.47
190 0.45
191 0.45
192 0.46
193 0.43
194 0.37
195 0.4
196 0.4
197 0.46
198 0.48
199 0.51
200 0.48
201 0.47
202 0.52
203 0.54
204 0.51
205 0.51
206 0.56
207 0.57
208 0.59
209 0.64
210 0.61
211 0.6
212 0.57
213 0.49
214 0.48
215 0.47
216 0.41
217 0.38
218 0.32
219 0.27
220 0.26
221 0.26
222 0.24
223 0.17
224 0.22
225 0.21
226 0.23
227 0.24
228 0.26
229 0.29
230 0.27
231 0.28
232 0.23
233 0.22
234 0.23
235 0.26
236 0.25
237 0.27
238 0.29
239 0.29
240 0.29
241 0.27
242 0.26
243 0.24
244 0.26
245 0.2
246 0.16
247 0.15
248 0.13
249 0.12
250 0.1
251 0.08
252 0.06
253 0.06
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.05
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.07
267 0.07
268 0.09
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.13
273 0.14
274 0.15
275 0.21
276 0.19
277 0.17
278 0.19
279 0.2
280 0.2
281 0.19
282 0.2
283 0.12
284 0.13
285 0.12
286 0.1
287 0.09
288 0.1
289 0.1
290 0.09
291 0.1
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.11
296 0.12
297 0.13
298 0.11
299 0.11
300 0.13
301 0.15
302 0.15
303 0.13
304 0.12
305 0.12
306 0.12
307 0.12
308 0.11
309 0.11
310 0.13
311 0.12
312 0.1
313 0.1
314 0.09
315 0.09
316 0.08
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.08
321 0.11
322 0.12
323 0.13
324 0.14
325 0.15
326 0.18
327 0.28
328 0.32
329 0.38
330 0.44
331 0.46
332 0.5
333 0.5
334 0.47
335 0.39
336 0.36
337 0.28
338 0.25
339 0.23
340 0.19
341 0.2
342 0.19
343 0.19
344 0.2
345 0.19
346 0.15
347 0.2
348 0.25
349 0.24
350 0.27
351 0.28
352 0.28
353 0.33
354 0.33
355 0.28
356 0.24
357 0.27
358 0.24
359 0.26
360 0.23
361 0.2
362 0.2
363 0.2
364 0.21
365 0.16
366 0.17
367 0.16
368 0.15
369 0.13
370 0.14
371 0.13
372 0.11
373 0.11
374 0.09
375 0.08
376 0.08
377 0.09
378 0.08
379 0.08
380 0.09
381 0.1
382 0.11
383 0.1
384 0.1
385 0.11
386 0.1
387 0.1
388 0.08
389 0.07
390 0.08
391 0.09
392 0.11
393 0.11
394 0.12
395 0.12
396 0.15
397 0.16
398 0.23
399 0.24
400 0.25
401 0.24
402 0.23
403 0.27
404 0.26
405 0.29
406 0.22
407 0.27
408 0.33
409 0.37
410 0.39
411 0.39
412 0.45
413 0.42
414 0.45
415 0.45
416 0.45
417 0.46
418 0.48
419 0.48
420 0.48
421 0.5
422 0.45
423 0.38
424 0.32
425 0.25
426 0.22
427 0.17
428 0.1
429 0.08
430 0.08
431 0.09
432 0.09
433 0.12
434 0.12
435 0.13
436 0.15
437 0.14
438 0.17
439 0.15
440 0.14
441 0.12
442 0.12
443 0.11
444 0.1
445 0.1
446 0.08
447 0.09
448 0.11
449 0.11
450 0.1
451 0.1
452 0.1
453 0.1
454 0.1
455 0.11
456 0.09
457 0.12
458 0.12
459 0.14
460 0.19
461 0.18
462 0.17
463 0.16
464 0.16
465 0.13
466 0.14
467 0.13
468 0.08
469 0.09
470 0.1
471 0.1
472 0.1
473 0.13
474 0.11
475 0.12
476 0.19
477 0.25
478 0.26
479 0.32
480 0.32
481 0.3
482 0.32
483 0.34
484 0.3
485 0.26
486 0.27
487 0.25
488 0.3
489 0.29
490 0.29
491 0.26
492 0.23
493 0.21
494 0.19
495 0.17
496 0.12
497 0.12
498 0.11
499 0.12
500 0.12
501 0.11
502 0.11
503 0.12
504 0.12
505 0.11
506 0.11
507 0.13
508 0.14
509 0.19
510 0.19
511 0.18
512 0.2
513 0.25
514 0.36
515 0.38
516 0.44
517 0.44
518 0.45
519 0.46
520 0.47
521 0.45
522 0.41
523 0.39
524 0.33
525 0.27
526 0.25
527 0.22
528 0.19
529 0.2
530 0.14
531 0.12
532 0.12
533 0.12
534 0.13
535 0.13
536 0.13
537 0.1
538 0.11
539 0.12
540 0.17
541 0.19
542 0.22
543 0.23
544 0.23
545 0.26
546 0.24
547 0.23
548 0.23
549 0.25
550 0.23
551 0.26
552 0.26
553 0.24
554 0.25
555 0.25
556 0.22
557 0.2
558 0.2
559 0.24
560 0.26
561 0.26
562 0.32
563 0.41
564 0.47
565 0.53
566 0.52
567 0.48
568 0.48
569 0.5
570 0.49
571 0.5
572 0.47
573 0.4
574 0.41
575 0.44
576 0.46
577 0.48
578 0.48
579 0.42
580 0.37
581 0.37
582 0.36
583 0.36
584 0.32
585 0.28
586 0.23
587 0.2
588 0.2
589 0.19
590 0.18
591 0.13
592 0.13
593 0.15
594 0.14
595 0.14
596 0.17
597 0.17
598 0.17
599 0.16
600 0.14
601 0.12
602 0.12
603 0.13
604 0.1
605 0.09
606 0.1
607 0.11
608 0.11
609 0.12
610 0.11
611 0.09
612 0.1
613 0.11
614 0.1
615 0.09
616 0.11
617 0.12
618 0.12
619 0.12
620 0.13
621 0.15
622 0.16
623 0.16
624 0.15
625 0.2
626 0.22
627 0.25
628 0.26
629 0.24
630 0.22
631 0.22
632 0.21
633 0.18
634 0.17
635 0.15
636 0.15
637 0.15
638 0.15
639 0.2
640 0.19
641 0.18
642 0.19
643 0.21
644 0.22
645 0.29
646 0.37
647 0.36
648 0.46
649 0.52
650 0.55
651 0.55
652 0.55
653 0.55
654 0.5
655 0.47
656 0.45
657 0.42
658 0.39
659 0.39
660 0.36
661 0.31
662 0.29
663 0.26
664 0.2
665 0.17
666 0.18
667 0.2
668 0.2
669 0.2
670 0.19
671 0.21
672 0.2
673 0.18
674 0.16
675 0.12
676 0.11
677 0.11
678 0.1
679 0.12
680 0.14
681 0.15
682 0.16
683 0.16
684 0.18
685 0.18
686 0.19
687 0.19
688 0.16
689 0.17
690 0.15
691 0.16
692 0.17
693 0.2
694 0.19
695 0.2
696 0.29
697 0.32
698 0.41
699 0.5
700 0.57
701 0.61
702 0.66
703 0.67
704 0.63
705 0.63
706 0.57
707 0.51
708 0.44
709 0.38
710 0.36
711 0.36
712 0.39
713 0.38
714 0.42
715 0.45
716 0.49
717 0.57
718 0.64
719 0.69
720 0.71
721 0.79
722 0.82
723 0.84
724 0.84
725 0.86
726 0.84
727 0.81
728 0.74
729 0.66
730 0.59
731 0.52
732 0.46
733 0.36
734 0.3
735 0.24
736 0.22
737 0.2
738 0.17
739 0.15
740 0.15
741 0.17
742 0.19
743 0.2
744 0.23
745 0.26
746 0.27
747 0.28
748 0.3
749 0.35
750 0.36
751 0.43
752 0.45
753 0.47
754 0.51
755 0.56
756 0.55
757 0.51
758 0.51
759 0.46
760 0.44
761 0.42
762 0.41
763 0.39
764 0.44
765 0.48
766 0.48
767 0.5
768 0.5
769 0.48
770 0.56
771 0.58
772 0.54
773 0.48
774 0.46
775 0.41
776 0.36
777 0.34
778 0.23