Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JFL1

Protein Details
Accession C4JFL1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1006-1031QDELQRLQRNKERRHAREKQKSLMTEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
511-520VIKRKHQKGK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040240  TAF1  
IPR022591  TAF1_HAT_dom  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0004402  F:histone acetyltransferase activity  
GO:0001091  F:RNA polymerase II general transcription initiation factor binding  
GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
KEGG ure:UREG_01025  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12157  DUF3591  
Amino Acid Sequences MSQPPQPDGLKPADDPFDTFMRELNSPTGTRELEFMSRELDPGEKADDAVDYEDIEDDDDLPDEEPSKHPDAEDKTVQQGQGWDSFTQDLDTEFSRQPPGDELDDLFGDVPSSPVAAEADKHGGFGRAQETQLAPGESGLQSPVDDMDMIFGDDGKERSPTPTDMDPETLRQYQLQQALFAMSAYGPDNPPAPPENHEELLASLWPKFNRDAMPRFLELLPPKKSHYIGKTPLKPPKRILPTKLKLEFAQDQERMFRSTGKLTKQASEPDSPSVIMISPPPKDDDTLDDIMDLEEDDWDEQLPGGVTMQDLQFICADWDFKDTISDEEGPDQNHLPAPDGEFNEEEDDWLFETTPPAKKRKLEKGPADYLALSHIDFPLLDDPAEVTAKLAKRIILDMNDPRLLLDEITPEPSVQETKLGSARTQTDNSTKRMMQRYNISNDEAYEMLKENHKNKVRSTLGNIVLEHSMPAVRLQWPYYKTRLARQEARSFHRPALTFFPNLPITFKKPAVIKRKHQKGKDAKSLYDSTKSLSLADNSHVLLLEYSEEHPMMMSNFGMGSRVINYYRKKNAEDSMRPKGEIGETAVLLPEDKSPFSTFGHVDPGETTTAIATGMFLAPVFRQESKNTDFLVVRNSTGVDGASYYLRNIENLYVAGQQFPSVDVPGPHSRKVTTAAKNRLKMICYRQIRKNRNHRVSVADITEHFPESTDMQNRQKMKEFLQFSKDHKEWEMKPGEPIPDEDVLRGYVKPEDICLLESMQVGLQYLHDAGYDREEDEDDDGDKEGDSLEQQLAPWKATRNFLLASQGKAMLQLHGEGDPTGRGEGFSFIKTSMKGGFRAVGESVEDKLDAQRLKELGGHSYNVARQQKSYEDSIRRIWESQKKSLSSTIEHSDAESDIDVDEAEDLFGKSSGLERRTPLPGRRDDETTSQFSRLSTSSQTNKVMRIVRQVRNSRGQIEEVQEIVKDPRVIKQYQKQRYEAELRELSAADMVPTGDPETDARRMKHIQDELQRLQRNKERRHAREKQKSLMTEPREGSPETANSPAPTAAPKGATQRKCANCGQVGHIKTNKKYDSPFPPSPLVGGMIIKSKPPTYTFLDSALFSTGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.33
3 0.31
4 0.29
5 0.28
6 0.26
7 0.25
8 0.24
9 0.24
10 0.24
11 0.24
12 0.25
13 0.24
14 0.27
15 0.29
16 0.27
17 0.26
18 0.26
19 0.26
20 0.26
21 0.27
22 0.25
23 0.23
24 0.22
25 0.22
26 0.21
27 0.19
28 0.16
29 0.16
30 0.18
31 0.15
32 0.15
33 0.15
34 0.14
35 0.14
36 0.15
37 0.13
38 0.11
39 0.11
40 0.11
41 0.11
42 0.11
43 0.1
44 0.08
45 0.08
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.11
51 0.12
52 0.14
53 0.2
54 0.24
55 0.24
56 0.24
57 0.31
58 0.35
59 0.41
60 0.45
61 0.42
62 0.44
63 0.46
64 0.46
65 0.4
66 0.37
67 0.32
68 0.31
69 0.31
70 0.25
71 0.24
72 0.25
73 0.23
74 0.21
75 0.18
76 0.13
77 0.13
78 0.15
79 0.17
80 0.18
81 0.2
82 0.22
83 0.22
84 0.23
85 0.24
86 0.27
87 0.25
88 0.25
89 0.24
90 0.23
91 0.23
92 0.22
93 0.18
94 0.14
95 0.11
96 0.1
97 0.09
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.07
103 0.08
104 0.09
105 0.11
106 0.17
107 0.16
108 0.17
109 0.17
110 0.18
111 0.18
112 0.2
113 0.21
114 0.18
115 0.19
116 0.21
117 0.21
118 0.22
119 0.25
120 0.22
121 0.18
122 0.16
123 0.18
124 0.15
125 0.15
126 0.13
127 0.1
128 0.09
129 0.1
130 0.1
131 0.08
132 0.08
133 0.07
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.1
141 0.11
142 0.1
143 0.12
144 0.12
145 0.16
146 0.2
147 0.21
148 0.23
149 0.28
150 0.3
151 0.31
152 0.35
153 0.33
154 0.33
155 0.36
156 0.33
157 0.29
158 0.27
159 0.27
160 0.29
161 0.33
162 0.3
163 0.25
164 0.24
165 0.24
166 0.22
167 0.19
168 0.14
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.1
173 0.09
174 0.1
175 0.12
176 0.11
177 0.15
178 0.16
179 0.17
180 0.19
181 0.26
182 0.3
183 0.3
184 0.3
185 0.27
186 0.25
187 0.24
188 0.23
189 0.16
190 0.12
191 0.15
192 0.16
193 0.17
194 0.19
195 0.21
196 0.26
197 0.33
198 0.37
199 0.39
200 0.44
201 0.42
202 0.44
203 0.4
204 0.4
205 0.39
206 0.41
207 0.4
208 0.38
209 0.4
210 0.41
211 0.43
212 0.44
213 0.45
214 0.47
215 0.51
216 0.59
217 0.65
218 0.69
219 0.76
220 0.75
221 0.73
222 0.69
223 0.69
224 0.7
225 0.68
226 0.68
227 0.7
228 0.71
229 0.76
230 0.75
231 0.67
232 0.57
233 0.57
234 0.54
235 0.48
236 0.49
237 0.41
238 0.37
239 0.38
240 0.39
241 0.35
242 0.29
243 0.27
244 0.22
245 0.28
246 0.33
247 0.34
248 0.4
249 0.4
250 0.43
251 0.44
252 0.48
253 0.44
254 0.43
255 0.4
256 0.35
257 0.34
258 0.3
259 0.26
260 0.2
261 0.16
262 0.12
263 0.14
264 0.15
265 0.15
266 0.16
267 0.19
268 0.19
269 0.2
270 0.2
271 0.21
272 0.24
273 0.24
274 0.23
275 0.2
276 0.19
277 0.18
278 0.17
279 0.12
280 0.06
281 0.04
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.06
296 0.09
297 0.09
298 0.1
299 0.1
300 0.1
301 0.11
302 0.1
303 0.11
304 0.08
305 0.1
306 0.1
307 0.1
308 0.11
309 0.11
310 0.12
311 0.14
312 0.15
313 0.13
314 0.16
315 0.18
316 0.17
317 0.18
318 0.18
319 0.15
320 0.16
321 0.16
322 0.14
323 0.13
324 0.16
325 0.19
326 0.19
327 0.2
328 0.18
329 0.19
330 0.19
331 0.18
332 0.15
333 0.11
334 0.11
335 0.09
336 0.09
337 0.09
338 0.06
339 0.09
340 0.13
341 0.2
342 0.23
343 0.28
344 0.32
345 0.38
346 0.47
347 0.56
348 0.62
349 0.65
350 0.7
351 0.73
352 0.74
353 0.69
354 0.62
355 0.51
356 0.4
357 0.32
358 0.23
359 0.15
360 0.11
361 0.09
362 0.07
363 0.07
364 0.08
365 0.08
366 0.08
367 0.08
368 0.07
369 0.07
370 0.09
371 0.09
372 0.08
373 0.06
374 0.1
375 0.12
376 0.13
377 0.14
378 0.14
379 0.14
380 0.17
381 0.19
382 0.16
383 0.2
384 0.22
385 0.26
386 0.25
387 0.24
388 0.22
389 0.21
390 0.19
391 0.15
392 0.11
393 0.1
394 0.1
395 0.13
396 0.13
397 0.11
398 0.11
399 0.11
400 0.12
401 0.09
402 0.11
403 0.09
404 0.11
405 0.14
406 0.15
407 0.14
408 0.16
409 0.2
410 0.21
411 0.22
412 0.23
413 0.28
414 0.31
415 0.34
416 0.35
417 0.33
418 0.36
419 0.42
420 0.42
421 0.38
422 0.42
423 0.45
424 0.47
425 0.47
426 0.42
427 0.35
428 0.33
429 0.3
430 0.22
431 0.16
432 0.11
433 0.1
434 0.09
435 0.14
436 0.18
437 0.19
438 0.28
439 0.34
440 0.35
441 0.36
442 0.44
443 0.44
444 0.42
445 0.45
446 0.44
447 0.42
448 0.41
449 0.4
450 0.32
451 0.28
452 0.25
453 0.2
454 0.12
455 0.08
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.08
460 0.09
461 0.11
462 0.15
463 0.18
464 0.21
465 0.25
466 0.29
467 0.28
468 0.34
469 0.41
470 0.43
471 0.48
472 0.51
473 0.56
474 0.55
475 0.6
476 0.59
477 0.53
478 0.48
479 0.44
480 0.39
481 0.33
482 0.34
483 0.3
484 0.26
485 0.24
486 0.26
487 0.23
488 0.23
489 0.23
490 0.18
491 0.2
492 0.23
493 0.23
494 0.21
495 0.24
496 0.33
497 0.41
498 0.46
499 0.51
500 0.58
501 0.68
502 0.72
503 0.71
504 0.73
505 0.73
506 0.75
507 0.76
508 0.69
509 0.59
510 0.57
511 0.57
512 0.49
513 0.42
514 0.33
515 0.24
516 0.23
517 0.22
518 0.18
519 0.15
520 0.15
521 0.12
522 0.13
523 0.13
524 0.1
525 0.1
526 0.09
527 0.08
528 0.07
529 0.06
530 0.05
531 0.05
532 0.05
533 0.06
534 0.06
535 0.06
536 0.06
537 0.06
538 0.06
539 0.05
540 0.04
541 0.04
542 0.04
543 0.04
544 0.05
545 0.04
546 0.04
547 0.05
548 0.07
549 0.08
550 0.14
551 0.17
552 0.23
553 0.29
554 0.32
555 0.33
556 0.34
557 0.39
558 0.42
559 0.47
560 0.48
561 0.51
562 0.49
563 0.47
564 0.44
565 0.39
566 0.31
567 0.23
568 0.19
569 0.11
570 0.1
571 0.1
572 0.1
573 0.08
574 0.08
575 0.08
576 0.07
577 0.07
578 0.07
579 0.09
580 0.1
581 0.12
582 0.12
583 0.14
584 0.13
585 0.13
586 0.18
587 0.17
588 0.16
589 0.15
590 0.15
591 0.13
592 0.12
593 0.11
594 0.06
595 0.06
596 0.05
597 0.05
598 0.03
599 0.03
600 0.03
601 0.03
602 0.03
603 0.04
604 0.04
605 0.06
606 0.08
607 0.09
608 0.11
609 0.12
610 0.17
611 0.2
612 0.23
613 0.22
614 0.22
615 0.21
616 0.2
617 0.24
618 0.2
619 0.17
620 0.15
621 0.14
622 0.12
623 0.11
624 0.11
625 0.05
626 0.05
627 0.06
628 0.06
629 0.06
630 0.06
631 0.08
632 0.08
633 0.08
634 0.09
635 0.09
636 0.08
637 0.09
638 0.1
639 0.1
640 0.1
641 0.1
642 0.09
643 0.09
644 0.08
645 0.09
646 0.08
647 0.07
648 0.07
649 0.07
650 0.13
651 0.21
652 0.23
653 0.24
654 0.25
655 0.24
656 0.25
657 0.31
658 0.34
659 0.34
660 0.41
661 0.5
662 0.55
663 0.58
664 0.61
665 0.57
666 0.51
667 0.48
668 0.46
669 0.45
670 0.46
671 0.5
672 0.54
673 0.62
674 0.69
675 0.74
676 0.78
677 0.79
678 0.8
679 0.78
680 0.71
681 0.67
682 0.63
683 0.56
684 0.46
685 0.36
686 0.29
687 0.26
688 0.25
689 0.2
690 0.14
691 0.11
692 0.11
693 0.12
694 0.15
695 0.18
696 0.22
697 0.26
698 0.32
699 0.34
700 0.36
701 0.4
702 0.38
703 0.38
704 0.41
705 0.41
706 0.4
707 0.44
708 0.45
709 0.42
710 0.48
711 0.44
712 0.38
713 0.36
714 0.39
715 0.34
716 0.38
717 0.39
718 0.31
719 0.34
720 0.35
721 0.34
722 0.29
723 0.28
724 0.23
725 0.21
726 0.21
727 0.18
728 0.16
729 0.15
730 0.15
731 0.14
732 0.12
733 0.1
734 0.12
735 0.11
736 0.11
737 0.12
738 0.11
739 0.12
740 0.12
741 0.11
742 0.11
743 0.11
744 0.11
745 0.09
746 0.09
747 0.08
748 0.07
749 0.07
750 0.06
751 0.06
752 0.06
753 0.06
754 0.07
755 0.06
756 0.09
757 0.1
758 0.09
759 0.1
760 0.1
761 0.11
762 0.11
763 0.12
764 0.1
765 0.1
766 0.1
767 0.09
768 0.09
769 0.08
770 0.07
771 0.06
772 0.06
773 0.07
774 0.07
775 0.07
776 0.08
777 0.13
778 0.14
779 0.15
780 0.17
781 0.2
782 0.23
783 0.25
784 0.27
785 0.24
786 0.24
787 0.24
788 0.31
789 0.28
790 0.26
791 0.25
792 0.24
793 0.21
794 0.22
795 0.21
796 0.13
797 0.12
798 0.11
799 0.11
800 0.1
801 0.11
802 0.09
803 0.09
804 0.08
805 0.09
806 0.08
807 0.07
808 0.07
809 0.07
810 0.1
811 0.12
812 0.12
813 0.12
814 0.12
815 0.14
816 0.14
817 0.16
818 0.18
819 0.18
820 0.19
821 0.2
822 0.22
823 0.21
824 0.22
825 0.21
826 0.16
827 0.15
828 0.15
829 0.15
830 0.12
831 0.11
832 0.1
833 0.11
834 0.15
835 0.15
836 0.15
837 0.18
838 0.18
839 0.19
840 0.22
841 0.21
842 0.22
843 0.23
844 0.23
845 0.2
846 0.22
847 0.23
848 0.28
849 0.33
850 0.29
851 0.28
852 0.3
853 0.34
854 0.34
855 0.38
856 0.38
857 0.38
858 0.41
859 0.46
860 0.47
861 0.44
862 0.44
863 0.47
864 0.47
865 0.48
866 0.53
867 0.54
868 0.52
869 0.52
870 0.55
871 0.5
872 0.43
873 0.42
874 0.38
875 0.33
876 0.31
877 0.29
878 0.25
879 0.22
880 0.19
881 0.14
882 0.1
883 0.07
884 0.07
885 0.07
886 0.06
887 0.06
888 0.05
889 0.05
890 0.05
891 0.05
892 0.06
893 0.06
894 0.06
895 0.06
896 0.11
897 0.17
898 0.19
899 0.22
900 0.24
901 0.28
902 0.36
903 0.43
904 0.45
905 0.47
906 0.52
907 0.54
908 0.55
909 0.55
910 0.51
911 0.52
912 0.51
913 0.48
914 0.42
915 0.39
916 0.36
917 0.32
918 0.32
919 0.25
920 0.23
921 0.22
922 0.27
923 0.32
924 0.37
925 0.44
926 0.43
927 0.44
928 0.47
929 0.48
930 0.43
931 0.48
932 0.51
933 0.52
934 0.6
935 0.65
936 0.66
937 0.69
938 0.7
939 0.63
940 0.56
941 0.52
942 0.47
943 0.43
944 0.38
945 0.3
946 0.27
947 0.23
948 0.22
949 0.2
950 0.2
951 0.19
952 0.17
953 0.23
954 0.28
955 0.31
956 0.39
957 0.46
958 0.53
959 0.6
960 0.66
961 0.64
962 0.63
963 0.68
964 0.69
965 0.63
966 0.61
967 0.54
968 0.48
969 0.45
970 0.41
971 0.32
972 0.25
973 0.21
974 0.12
975 0.1
976 0.1
977 0.08
978 0.09
979 0.09
980 0.08
981 0.09
982 0.11
983 0.15
984 0.22
985 0.27
986 0.28
987 0.33
988 0.38
989 0.41
990 0.48
991 0.5
992 0.51
993 0.54
994 0.62
995 0.63
996 0.68
997 0.7
998 0.64
999 0.66
1000 0.65
1001 0.66
1002 0.66
1003 0.69
1004 0.71
1005 0.74
1006 0.82
1007 0.84
1008 0.88
1009 0.89
1010 0.88
1011 0.87
1012 0.85
1013 0.79
1014 0.76
1015 0.74
1016 0.68
1017 0.65
1018 0.59
1019 0.54
1020 0.49
1021 0.46
1022 0.41
1023 0.36
1024 0.33
1025 0.28
1026 0.3
1027 0.28
1028 0.25
1029 0.26
1030 0.24
1031 0.21
1032 0.2
1033 0.2
1034 0.2
1035 0.2
1036 0.23
1037 0.31
1038 0.4
1039 0.43
1040 0.47
1041 0.54
1042 0.57
1043 0.6
1044 0.62
1045 0.6
1046 0.56
1047 0.56
1048 0.56
1049 0.54
1050 0.51
1051 0.54
1052 0.56
1053 0.56
1054 0.55
1055 0.61
1056 0.59
1057 0.56
1058 0.58
1059 0.59
1060 0.63
1061 0.64
1062 0.66
1063 0.62
1064 0.62
1065 0.56
1066 0.52
1067 0.45
1068 0.36
1069 0.29
1070 0.23
1071 0.19
1072 0.21
1073 0.21
1074 0.22
1075 0.24
1076 0.23
1077 0.25
1078 0.27
1079 0.3
1080 0.32
1081 0.38
1082 0.38
1083 0.39
1084 0.39
1085 0.36
1086 0.34