Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JFT0

Protein Details
Accession C4JFT0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
286-310STIFYTCMKCKHRKTTKQTDLDCLDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012164  Rpa12/Rpb9/Rpc10/TFS  
IPR025718  SAP30_Sin3-bd  
IPR034004  Zn_ribbon_RPA12_C  
IPR001222  Znf_TFIIS  
Gene Ontology GO:0003899  F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006379  P:mRNA cleavage  
KEGG ure:UREG_02414  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13867  SAP30_Sin3_bdg  
PF01096  TFIIS_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51133  ZF_TFIIS_2  
CDD cd10507  Zn-ribbon_RPA12  
Amino Acid Sequences MAPPRQRGPAATNLDDSRSEASSGQRERQFGASKGRRGGNTATATSKDAKPPHPAVVLAGEAEQTTTEHPAINWSTMPLSVLHQYRYVHNLPCPSAFSSQINSILLSRGIGLRSPTAIAARNAQRAANRTPQSSSSSSKRAKEATSGTQDGVGLHPVSQARVSKDHLASAVRKHFNNTAISEQDAIARSLRAPSRKAMVVQFCEDCGNLLDDIPDELLRYTALNYTQTSTSENFPSRLRNKLKSYTQEVTREAVGSGPQIEMDCVKCPSREVTYAQVQLRSADEGSTIFYTCMKCKHRKTTKQTDLDCLDSGRDKTIYWLEPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.41
3 0.37
4 0.31
5 0.24
6 0.23
7 0.19
8 0.23
9 0.29
10 0.33
11 0.39
12 0.4
13 0.41
14 0.42
15 0.47
16 0.47
17 0.43
18 0.5
19 0.5
20 0.51
21 0.56
22 0.59
23 0.52
24 0.51
25 0.51
26 0.48
27 0.45
28 0.41
29 0.38
30 0.35
31 0.37
32 0.37
33 0.36
34 0.34
35 0.35
36 0.36
37 0.41
38 0.43
39 0.45
40 0.43
41 0.4
42 0.35
43 0.32
44 0.28
45 0.2
46 0.17
47 0.12
48 0.1
49 0.1
50 0.08
51 0.06
52 0.07
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.15
58 0.16
59 0.17
60 0.16
61 0.15
62 0.15
63 0.14
64 0.15
65 0.11
66 0.11
67 0.15
68 0.17
69 0.17
70 0.2
71 0.21
72 0.23
73 0.28
74 0.3
75 0.27
76 0.28
77 0.31
78 0.29
79 0.29
80 0.3
81 0.27
82 0.25
83 0.24
84 0.23
85 0.21
86 0.22
87 0.22
88 0.2
89 0.18
90 0.16
91 0.15
92 0.13
93 0.11
94 0.09
95 0.08
96 0.08
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.1
104 0.12
105 0.12
106 0.17
107 0.2
108 0.23
109 0.24
110 0.24
111 0.25
112 0.27
113 0.3
114 0.33
115 0.32
116 0.29
117 0.31
118 0.31
119 0.34
120 0.33
121 0.33
122 0.29
123 0.35
124 0.38
125 0.39
126 0.4
127 0.38
128 0.35
129 0.35
130 0.35
131 0.32
132 0.34
133 0.32
134 0.29
135 0.27
136 0.26
137 0.22
138 0.18
139 0.13
140 0.07
141 0.06
142 0.08
143 0.07
144 0.08
145 0.09
146 0.11
147 0.12
148 0.14
149 0.16
150 0.19
151 0.19
152 0.19
153 0.19
154 0.19
155 0.19
156 0.22
157 0.28
158 0.26
159 0.26
160 0.27
161 0.29
162 0.3
163 0.31
164 0.29
165 0.24
166 0.22
167 0.22
168 0.21
169 0.18
170 0.17
171 0.15
172 0.13
173 0.1
174 0.1
175 0.09
176 0.13
177 0.16
178 0.17
179 0.17
180 0.19
181 0.22
182 0.23
183 0.25
184 0.27
185 0.29
186 0.28
187 0.29
188 0.28
189 0.25
190 0.24
191 0.22
192 0.17
193 0.12
194 0.11
195 0.08
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.08
209 0.09
210 0.11
211 0.12
212 0.14
213 0.14
214 0.15
215 0.17
216 0.17
217 0.18
218 0.21
219 0.22
220 0.22
221 0.23
222 0.31
223 0.31
224 0.39
225 0.43
226 0.46
227 0.51
228 0.58
229 0.64
230 0.62
231 0.67
232 0.64
233 0.64
234 0.61
235 0.57
236 0.5
237 0.43
238 0.37
239 0.29
240 0.23
241 0.17
242 0.13
243 0.12
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.1
249 0.11
250 0.13
251 0.15
252 0.16
253 0.16
254 0.18
255 0.22
256 0.25
257 0.27
258 0.28
259 0.32
260 0.37
261 0.44
262 0.44
263 0.42
264 0.38
265 0.35
266 0.33
267 0.29
268 0.22
269 0.15
270 0.14
271 0.12
272 0.14
273 0.14
274 0.13
275 0.11
276 0.14
277 0.16
278 0.19
279 0.27
280 0.32
281 0.41
282 0.5
283 0.61
284 0.69
285 0.77
286 0.84
287 0.87
288 0.9
289 0.9
290 0.85
291 0.82
292 0.76
293 0.69
294 0.6
295 0.5
296 0.42
297 0.37
298 0.34
299 0.29
300 0.25
301 0.22
302 0.25
303 0.31