Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JDM9

Protein Details
Accession C4JDM9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
77-110SPTPANNRDRRRLQRLRKKEYFLRKQKPKPLTARHydrophilic
258-278QFENRPADRANRKFKWKNLDYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
84-113RDRRRLQRLRKKEYFLRKQKPKPLTAREKR
Subcellular Location(s) mito 10, nucl 9, cyto 5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016848  RNase_P/MRP_Rpp29-subunit  
IPR036980  RNase_P/MRP_Rpp29_sf  
IPR023538  RNP1  
IPR023534  Rof/RNase_P-like  
IPR002730  Rpp29/RNP1  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0030677  C:ribonuclease P complex  
GO:0004519  F:endonuclease activity  
GO:0033204  F:ribonuclease P RNA binding  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
KEGG ure:UREG_00661  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01868  RNase_P-MRP_p29  
Amino Acid Sequences MNDGTRGILEKPRAFGRGCGLGGVLVLRRRAARKVIIEHSPPTSRTNCFPALILPTPQSDSSRRQVKLKPLYLRPTSPTPANNRDRRRLQRLRKKEYFLRKQKPKPLTAREKRALGVHDLPKEEVKYEIFKKLNSLWVEYMWEVLELKKVADKGPMITAMAHGAKLASADFHGAELQVVRSRCVSRVGVKGIVVRDSKFAFVLVTEKNEMKTGLVAIPKEHTVFRFEIPIPALPSTDNDQPPKPDSPKNLTFELHGSQFENRPADRANRKFKWKNLDYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.37
3 0.37
4 0.37
5 0.34
6 0.3
7 0.26
8 0.22
9 0.21
10 0.2
11 0.18
12 0.14
13 0.15
14 0.16
15 0.2
16 0.23
17 0.28
18 0.32
19 0.36
20 0.4
21 0.47
22 0.5
23 0.53
24 0.54
25 0.52
26 0.52
27 0.48
28 0.43
29 0.4
30 0.38
31 0.34
32 0.34
33 0.37
34 0.34
35 0.31
36 0.3
37 0.28
38 0.3
39 0.3
40 0.28
41 0.23
42 0.22
43 0.24
44 0.25
45 0.25
46 0.23
47 0.26
48 0.33
49 0.4
50 0.4
51 0.45
52 0.49
53 0.56
54 0.62
55 0.64
56 0.64
57 0.63
58 0.69
59 0.67
60 0.64
61 0.58
62 0.54
63 0.49
64 0.45
65 0.43
66 0.43
67 0.48
68 0.55
69 0.59
70 0.6
71 0.66
72 0.71
73 0.75
74 0.77
75 0.78
76 0.8
77 0.82
78 0.86
79 0.87
80 0.85
81 0.83
82 0.81
83 0.82
84 0.81
85 0.81
86 0.81
87 0.81
88 0.83
89 0.85
90 0.83
91 0.81
92 0.79
93 0.78
94 0.79
95 0.77
96 0.79
97 0.74
98 0.69
99 0.61
100 0.55
101 0.46
102 0.39
103 0.37
104 0.32
105 0.31
106 0.3
107 0.29
108 0.28
109 0.27
110 0.23
111 0.17
112 0.13
113 0.15
114 0.16
115 0.23
116 0.23
117 0.22
118 0.24
119 0.25
120 0.29
121 0.25
122 0.25
123 0.19
124 0.18
125 0.19
126 0.17
127 0.16
128 0.09
129 0.09
130 0.07
131 0.06
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.08
136 0.09
137 0.09
138 0.12
139 0.12
140 0.11
141 0.12
142 0.13
143 0.11
144 0.11
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.09
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.04
155 0.04
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.06
164 0.09
165 0.1
166 0.1
167 0.13
168 0.14
169 0.15
170 0.18
171 0.2
172 0.21
173 0.26
174 0.29
175 0.28
176 0.28
177 0.3
178 0.27
179 0.3
180 0.26
181 0.21
182 0.21
183 0.2
184 0.2
185 0.17
186 0.16
187 0.11
188 0.1
189 0.13
190 0.11
191 0.14
192 0.15
193 0.16
194 0.17
195 0.18
196 0.17
197 0.14
198 0.14
199 0.12
200 0.13
201 0.15
202 0.15
203 0.15
204 0.17
205 0.18
206 0.18
207 0.18
208 0.16
209 0.17
210 0.19
211 0.19
212 0.23
213 0.22
214 0.24
215 0.25
216 0.27
217 0.25
218 0.24
219 0.23
220 0.18
221 0.21
222 0.22
223 0.27
224 0.28
225 0.3
226 0.32
227 0.36
228 0.4
229 0.45
230 0.46
231 0.45
232 0.48
233 0.53
234 0.58
235 0.58
236 0.58
237 0.51
238 0.47
239 0.44
240 0.41
241 0.34
242 0.28
243 0.26
244 0.25
245 0.29
246 0.31
247 0.32
248 0.29
249 0.3
250 0.32
251 0.4
252 0.47
253 0.52
254 0.58
255 0.61
256 0.72
257 0.77
258 0.81
259 0.82