Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JXJ2

Protein Details
Accession C4JXJ2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-75IPNPAPKQGARRRVKPRHLALRAAHydrophilic
525-548EEEQNRPTTKRKSPQELVNWRDRLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
58-69KQGARRRVKPRH
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR039601  Rrn5  
Gene Ontology GO:0000500  C:RNA polymerase I upstream activating factor complex  
GO:0042790  P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I  
KEGG ure:UREG_06365  -  
Amino Acid Sequences MSDSSMSYEPEDEEEEHGQNANKQLRRLKDSEVPLTPNRNFQSNSGSVDDGIPNPAPKQGARRRVKPRHLALRAAARLPVDKYLELYKESLNNVLVGPDCDGAPQLFRSQYGIIQWTSQEKAAFFMALSKKGKDAVPEIAASIGTKSQMEVRHYLDLLQRNFELRNVAEEQVHNIILSDIPAACEISNECCIALESVAKALCLRDEQTHNVAGKRKHGDFWLVDREIATFVEEDQESEAEAEPEEAEPDPILEPEPAPELGSLPDTEPPTGEDSSKNDSSVRTHGIFATAKLLKLSNWIHLSEHFFMNFGRERFEDNWNQLCFQDETPALTCDAFSDFYTLAISITRRVIQSSIFFALSRIRAVERSHVNPKRLVKKEDVSAALDVLGMAHDAKAFWAGVARRCALDVRHPKSGEKYKTVLLDYDEVERLLGAQLDENPRHIKLESPSASTTTEPTEDSDFDSNTSTYSPTQDNMGNDEDLSDPEELYANVMDREASRKEESALWAQINKPVPLSGMNIKLEPNEEEQNRPTTKRKSPQELVNWRDRLLYQSEWETLGQEINGGQRKRRKFGPAFSTDT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.23
3 0.22
4 0.24
5 0.23
6 0.24
7 0.31
8 0.35
9 0.35
10 0.41
11 0.47
12 0.53
13 0.59
14 0.58
15 0.57
16 0.57
17 0.61
18 0.62
19 0.6
20 0.57
21 0.56
22 0.61
23 0.56
24 0.56
25 0.51
26 0.49
27 0.46
28 0.42
29 0.45
30 0.4
31 0.42
32 0.37
33 0.35
34 0.3
35 0.31
36 0.3
37 0.22
38 0.22
39 0.19
40 0.18
41 0.18
42 0.2
43 0.2
44 0.2
45 0.3
46 0.36
47 0.45
48 0.53
49 0.62
50 0.7
51 0.79
52 0.87
53 0.86
54 0.87
55 0.87
56 0.84
57 0.8
58 0.75
59 0.74
60 0.67
61 0.58
62 0.5
63 0.4
64 0.38
65 0.34
66 0.32
67 0.25
68 0.22
69 0.23
70 0.26
71 0.27
72 0.26
73 0.26
74 0.24
75 0.25
76 0.26
77 0.26
78 0.22
79 0.21
80 0.19
81 0.18
82 0.16
83 0.13
84 0.14
85 0.11
86 0.11
87 0.1
88 0.11
89 0.1
90 0.11
91 0.11
92 0.13
93 0.13
94 0.14
95 0.17
96 0.17
97 0.18
98 0.19
99 0.21
100 0.18
101 0.18
102 0.2
103 0.2
104 0.21
105 0.21
106 0.2
107 0.16
108 0.18
109 0.17
110 0.16
111 0.12
112 0.18
113 0.19
114 0.25
115 0.27
116 0.26
117 0.26
118 0.29
119 0.3
120 0.26
121 0.26
122 0.24
123 0.24
124 0.24
125 0.23
126 0.21
127 0.19
128 0.16
129 0.14
130 0.09
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.12
135 0.16
136 0.19
137 0.22
138 0.25
139 0.27
140 0.27
141 0.29
142 0.3
143 0.33
144 0.31
145 0.3
146 0.27
147 0.26
148 0.26
149 0.24
150 0.22
151 0.15
152 0.18
153 0.19
154 0.19
155 0.19
156 0.19
157 0.21
158 0.2
159 0.2
160 0.15
161 0.12
162 0.11
163 0.09
164 0.09
165 0.07
166 0.05
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.09
174 0.11
175 0.1
176 0.1
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.08
182 0.06
183 0.08
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.09
190 0.1
191 0.13
192 0.16
193 0.2
194 0.22
195 0.26
196 0.27
197 0.29
198 0.33
199 0.3
200 0.34
201 0.36
202 0.35
203 0.32
204 0.32
205 0.34
206 0.3
207 0.34
208 0.34
209 0.29
210 0.28
211 0.27
212 0.26
213 0.21
214 0.19
215 0.14
216 0.06
217 0.06
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.08
225 0.08
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.08
243 0.07
244 0.08
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.08
250 0.07
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.1
255 0.11
256 0.13
257 0.13
258 0.13
259 0.12
260 0.14
261 0.2
262 0.2
263 0.19
264 0.17
265 0.17
266 0.19
267 0.2
268 0.21
269 0.16
270 0.16
271 0.16
272 0.18
273 0.18
274 0.16
275 0.18
276 0.15
277 0.14
278 0.14
279 0.15
280 0.11
281 0.17
282 0.18
283 0.17
284 0.18
285 0.18
286 0.18
287 0.2
288 0.24
289 0.2
290 0.2
291 0.15
292 0.14
293 0.13
294 0.16
295 0.17
296 0.13
297 0.14
298 0.14
299 0.18
300 0.2
301 0.25
302 0.25
303 0.26
304 0.32
305 0.3
306 0.3
307 0.26
308 0.26
309 0.23
310 0.19
311 0.19
312 0.13
313 0.14
314 0.15
315 0.16
316 0.14
317 0.12
318 0.12
319 0.09
320 0.1
321 0.09
322 0.08
323 0.09
324 0.08
325 0.09
326 0.09
327 0.08
328 0.07
329 0.07
330 0.08
331 0.07
332 0.09
333 0.1
334 0.1
335 0.11
336 0.12
337 0.12
338 0.13
339 0.15
340 0.15
341 0.14
342 0.14
343 0.13
344 0.16
345 0.15
346 0.14
347 0.12
348 0.11
349 0.13
350 0.14
351 0.2
352 0.22
353 0.27
354 0.37
355 0.41
356 0.43
357 0.46
358 0.52
359 0.56
360 0.57
361 0.56
362 0.52
363 0.51
364 0.52
365 0.52
366 0.46
367 0.38
368 0.32
369 0.28
370 0.22
371 0.17
372 0.13
373 0.08
374 0.06
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.09
385 0.11
386 0.16
387 0.19
388 0.2
389 0.19
390 0.2
391 0.21
392 0.19
393 0.27
394 0.33
395 0.35
396 0.41
397 0.42
398 0.44
399 0.51
400 0.59
401 0.54
402 0.49
403 0.47
404 0.43
405 0.45
406 0.44
407 0.37
408 0.3
409 0.27
410 0.23
411 0.24
412 0.21
413 0.17
414 0.16
415 0.14
416 0.12
417 0.09
418 0.09
419 0.06
420 0.07
421 0.11
422 0.17
423 0.18
424 0.2
425 0.22
426 0.22
427 0.23
428 0.22
429 0.23
430 0.2
431 0.3
432 0.29
433 0.31
434 0.32
435 0.32
436 0.33
437 0.29
438 0.28
439 0.2
440 0.19
441 0.15
442 0.16
443 0.17
444 0.16
445 0.19
446 0.2
447 0.18
448 0.17
449 0.19
450 0.17
451 0.15
452 0.15
453 0.13
454 0.12
455 0.15
456 0.16
457 0.14
458 0.17
459 0.2
460 0.21
461 0.22
462 0.24
463 0.21
464 0.19
465 0.2
466 0.18
467 0.15
468 0.16
469 0.12
470 0.09
471 0.09
472 0.1
473 0.09
474 0.1
475 0.1
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.09
480 0.1
481 0.14
482 0.15
483 0.19
484 0.21
485 0.22
486 0.24
487 0.27
488 0.3
489 0.32
490 0.34
491 0.31
492 0.31
493 0.31
494 0.35
495 0.36
496 0.32
497 0.27
498 0.23
499 0.22
500 0.21
501 0.25
502 0.25
503 0.27
504 0.28
505 0.28
506 0.29
507 0.29
508 0.29
509 0.27
510 0.26
511 0.28
512 0.29
513 0.33
514 0.35
515 0.42
516 0.44
517 0.46
518 0.49
519 0.5
520 0.58
521 0.63
522 0.7
523 0.72
524 0.76
525 0.8
526 0.83
527 0.84
528 0.81
529 0.81
530 0.73
531 0.63
532 0.58
533 0.49
534 0.43
535 0.37
536 0.34
537 0.28
538 0.3
539 0.31
540 0.3
541 0.3
542 0.26
543 0.22
544 0.2
545 0.16
546 0.13
547 0.12
548 0.18
549 0.26
550 0.27
551 0.33
552 0.41
553 0.49
554 0.54
555 0.6
556 0.63
557 0.64
558 0.72
559 0.75