Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JFC4

Protein Details
Accession C4JFC4    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
522-544RILPRLRKLRRVQRHLPRGKRHHBasic
761-786IDSAKDASRSKKRKRPDAGEDKIKQPBasic
953-980AEPSLESKTKRRQNARRWWHTFKYRDIFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
520-543RARILPRLRKLRRVQRHLPRGKRH
767-778ASRSKKRKRPDA
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11, mito 4, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046351  UTP4  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG ure:UREG_02346  -  
Amino Acid Sequences MDIHRCRFVPYNPQAINALAFSHPPSADLSGRGVPTLRLAIGRANGDIELWNPLRGTWCQETILRGGKDRSIEGLVWTLDPSEKDSEGNDVPGKLRLFSIGYSSVVTEWDLEQGRPARHSSGNYGEIWCLAAQPRWKSSRRGEDGRPMPPAEGEFAGQHLAVGCADGAIVLLSTSDGDLKYLRTMRPSTKKSRVLNITFQNRDTIVAAYADSSIRIFDIRNGKLLRTVTLGKGQHKAAKELLVWTVKCLPDGTIVSGDSAGEIRFWDPKNYSLVQRIHSHQADILDIAVSADGESVITVGADQRTTIYKPKAPERGAKSRRWVEVMHRRYHTHDVKAIAVYETKEISVMVSGGLDTVPVIVPLRSHEEELHRKLPSLPQRPQVSSSPSSRLLMSWWDREVNIWRVSSPTLPEPLEPQQHKLVAKVLFQGEENLTSAALSSNGKFLVAASISEVKAFALSPKVNGDKTILQVNKLEIPVEISKHGAREVAISPDCQWLCLIRPDNTVCMAKIDSDPEVPGRARILPRLRKLRRVQRHLPRGKRHHGSLGTYDRTIRCVAFSADSRILACGDIAGFVDSWVLQDETVLLTNGTSDDKTFQPESSDDDSSDEEGDSSESDGQRWVVPRFDSPIPQCKPGILLMTFRPPSQSQPTPLMNGDKSNSTSHISEGRLIVLTTEHQPLEFNVIQGKLTDWARRNPKTYLPKAFTIIKDRAMGAFWDPNGSNERLWLYGPSWLWMFDLSQDFPTPEDLEAEKKSNAVSKIDSAKDASRSKKRKRPDAGEDKIKQPNSGAGDRIPLWHDSIGFGRKMRKVIGSDGKAAQATLSNLNHHVNQHQNDEEDVDLHLEPSRSLLADLRREQAPSSQNADLDDRSDLEKNEAKEKQKQSQPPSLSSSPVKPPSSDLPNGTAPSQVAFAVVIHTQSKTNPNVQKASETNDNASDTESIQPQVQNSPNGAEPSLESKTKRRQNARRWWHTFKYRDIFGIVPLSQGFTSEKMNGDSIGKGLEVAVVERPMWDVPLPGRYVRDYE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.45
3 0.41
4 0.31
5 0.26
6 0.16
7 0.16
8 0.16
9 0.18
10 0.17
11 0.16
12 0.19
13 0.2
14 0.22
15 0.22
16 0.24
17 0.24
18 0.25
19 0.25
20 0.23
21 0.2
22 0.21
23 0.21
24 0.19
25 0.15
26 0.16
27 0.19
28 0.22
29 0.23
30 0.21
31 0.2
32 0.19
33 0.18
34 0.18
35 0.14
36 0.18
37 0.17
38 0.18
39 0.16
40 0.17
41 0.21
42 0.21
43 0.28
44 0.25
45 0.27
46 0.29
47 0.31
48 0.33
49 0.35
50 0.42
51 0.37
52 0.36
53 0.36
54 0.36
55 0.37
56 0.35
57 0.33
58 0.27
59 0.26
60 0.23
61 0.25
62 0.22
63 0.2
64 0.19
65 0.17
66 0.15
67 0.16
68 0.18
69 0.17
70 0.17
71 0.17
72 0.18
73 0.23
74 0.22
75 0.26
76 0.24
77 0.22
78 0.23
79 0.28
80 0.27
81 0.23
82 0.22
83 0.2
84 0.19
85 0.18
86 0.21
87 0.18
88 0.18
89 0.18
90 0.18
91 0.16
92 0.15
93 0.15
94 0.11
95 0.1
96 0.14
97 0.15
98 0.14
99 0.2
100 0.25
101 0.27
102 0.28
103 0.3
104 0.29
105 0.32
106 0.35
107 0.35
108 0.37
109 0.38
110 0.37
111 0.36
112 0.32
113 0.28
114 0.26
115 0.2
116 0.15
117 0.13
118 0.16
119 0.21
120 0.25
121 0.32
122 0.38
123 0.43
124 0.49
125 0.56
126 0.63
127 0.66
128 0.68
129 0.67
130 0.71
131 0.73
132 0.7
133 0.65
134 0.55
135 0.47
136 0.4
137 0.35
138 0.28
139 0.22
140 0.18
141 0.14
142 0.14
143 0.14
144 0.12
145 0.11
146 0.09
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.05
152 0.05
153 0.04
154 0.04
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.04
162 0.05
163 0.05
164 0.07
165 0.08
166 0.09
167 0.15
168 0.19
169 0.2
170 0.25
171 0.29
172 0.38
173 0.48
174 0.55
175 0.59
176 0.64
177 0.72
178 0.71
179 0.76
180 0.76
181 0.71
182 0.72
183 0.72
184 0.71
185 0.65
186 0.61
187 0.54
188 0.45
189 0.4
190 0.33
191 0.24
192 0.16
193 0.13
194 0.12
195 0.1
196 0.11
197 0.1
198 0.09
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.12
205 0.21
206 0.22
207 0.29
208 0.3
209 0.3
210 0.34
211 0.35
212 0.3
213 0.26
214 0.27
215 0.23
216 0.3
217 0.33
218 0.32
219 0.35
220 0.37
221 0.37
222 0.36
223 0.37
224 0.32
225 0.31
226 0.29
227 0.26
228 0.28
229 0.29
230 0.27
231 0.26
232 0.3
233 0.26
234 0.26
235 0.24
236 0.2
237 0.19
238 0.21
239 0.2
240 0.17
241 0.17
242 0.16
243 0.16
244 0.15
245 0.1
246 0.1
247 0.07
248 0.05
249 0.06
250 0.07
251 0.12
252 0.14
253 0.18
254 0.19
255 0.21
256 0.27
257 0.28
258 0.31
259 0.33
260 0.35
261 0.35
262 0.38
263 0.39
264 0.42
265 0.4
266 0.37
267 0.31
268 0.28
269 0.25
270 0.2
271 0.17
272 0.09
273 0.08
274 0.07
275 0.06
276 0.05
277 0.04
278 0.04
279 0.03
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.04
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.07
291 0.09
292 0.12
293 0.18
294 0.21
295 0.24
296 0.29
297 0.36
298 0.44
299 0.45
300 0.51
301 0.53
302 0.6
303 0.63
304 0.64
305 0.66
306 0.63
307 0.62
308 0.57
309 0.51
310 0.5
311 0.54
312 0.55
313 0.54
314 0.5
315 0.49
316 0.51
317 0.59
318 0.54
319 0.47
320 0.44
321 0.39
322 0.38
323 0.37
324 0.33
325 0.24
326 0.2
327 0.17
328 0.14
329 0.12
330 0.1
331 0.1
332 0.09
333 0.08
334 0.07
335 0.06
336 0.05
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.05
349 0.07
350 0.14
351 0.14
352 0.15
353 0.17
354 0.24
355 0.32
356 0.37
357 0.4
358 0.34
359 0.34
360 0.34
361 0.39
362 0.42
363 0.43
364 0.43
365 0.46
366 0.51
367 0.52
368 0.54
369 0.5
370 0.46
371 0.41
372 0.39
373 0.36
374 0.33
375 0.32
376 0.29
377 0.25
378 0.2
379 0.23
380 0.23
381 0.21
382 0.2
383 0.2
384 0.2
385 0.22
386 0.26
387 0.24
388 0.23
389 0.21
390 0.2
391 0.2
392 0.22
393 0.21
394 0.18
395 0.15
396 0.16
397 0.16
398 0.16
399 0.18
400 0.22
401 0.28
402 0.27
403 0.28
404 0.28
405 0.31
406 0.31
407 0.28
408 0.29
409 0.23
410 0.24
411 0.24
412 0.21
413 0.18
414 0.18
415 0.19
416 0.14
417 0.13
418 0.12
419 0.09
420 0.08
421 0.07
422 0.07
423 0.05
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.07
428 0.07
429 0.07
430 0.07
431 0.06
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.07
436 0.1
437 0.1
438 0.1
439 0.1
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.07
444 0.09
445 0.09
446 0.1
447 0.13
448 0.16
449 0.15
450 0.16
451 0.18
452 0.15
453 0.17
454 0.23
455 0.2
456 0.19
457 0.2
458 0.21
459 0.21
460 0.19
461 0.18
462 0.1
463 0.14
464 0.14
465 0.13
466 0.13
467 0.12
468 0.12
469 0.12
470 0.13
471 0.1
472 0.09
473 0.1
474 0.11
475 0.14
476 0.13
477 0.13
478 0.14
479 0.19
480 0.18
481 0.16
482 0.15
483 0.11
484 0.13
485 0.18
486 0.19
487 0.16
488 0.2
489 0.2
490 0.21
491 0.23
492 0.22
493 0.16
494 0.15
495 0.13
496 0.11
497 0.11
498 0.11
499 0.1
500 0.09
501 0.1
502 0.09
503 0.11
504 0.09
505 0.09
506 0.09
507 0.11
508 0.12
509 0.17
510 0.25
511 0.3
512 0.38
513 0.48
514 0.5
515 0.56
516 0.64
517 0.68
518 0.7
519 0.72
520 0.74
521 0.73
522 0.82
523 0.82
524 0.82
525 0.82
526 0.8
527 0.8
528 0.74
529 0.66
530 0.62
531 0.55
532 0.48
533 0.45
534 0.43
535 0.37
536 0.33
537 0.33
538 0.26
539 0.26
540 0.24
541 0.17
542 0.11
543 0.11
544 0.12
545 0.12
546 0.13
547 0.15
548 0.15
549 0.15
550 0.15
551 0.14
552 0.13
553 0.11
554 0.1
555 0.05
556 0.04
557 0.04
558 0.04
559 0.04
560 0.04
561 0.04
562 0.04
563 0.04
564 0.04
565 0.05
566 0.05
567 0.04
568 0.04
569 0.05
570 0.05
571 0.06
572 0.06
573 0.04
574 0.04
575 0.04
576 0.05
577 0.06
578 0.05
579 0.05
580 0.07
581 0.08
582 0.12
583 0.13
584 0.12
585 0.14
586 0.14
587 0.19
588 0.21
589 0.22
590 0.18
591 0.19
592 0.19
593 0.18
594 0.18
595 0.12
596 0.08
597 0.07
598 0.07
599 0.06
600 0.06
601 0.08
602 0.08
603 0.08
604 0.09
605 0.09
606 0.11
607 0.14
608 0.14
609 0.14
610 0.15
611 0.16
612 0.2
613 0.21
614 0.24
615 0.24
616 0.33
617 0.33
618 0.34
619 0.33
620 0.29
621 0.29
622 0.25
623 0.26
624 0.17
625 0.17
626 0.16
627 0.23
628 0.24
629 0.22
630 0.24
631 0.21
632 0.24
633 0.29
634 0.31
635 0.27
636 0.33
637 0.34
638 0.34
639 0.34
640 0.34
641 0.27
642 0.26
643 0.24
644 0.2
645 0.21
646 0.2
647 0.2
648 0.18
649 0.18
650 0.18
651 0.21
652 0.2
653 0.19
654 0.19
655 0.17
656 0.15
657 0.15
658 0.13
659 0.09
660 0.1
661 0.1
662 0.12
663 0.11
664 0.11
665 0.11
666 0.11
667 0.18
668 0.17
669 0.15
670 0.15
671 0.15
672 0.16
673 0.15
674 0.16
675 0.12
676 0.14
677 0.2
678 0.2
679 0.28
680 0.37
681 0.41
682 0.44
683 0.43
684 0.5
685 0.54
686 0.59
687 0.61
688 0.55
689 0.54
690 0.54
691 0.56
692 0.49
693 0.46
694 0.41
695 0.35
696 0.32
697 0.3
698 0.27
699 0.22
700 0.2
701 0.16
702 0.16
703 0.13
704 0.15
705 0.14
706 0.16
707 0.19
708 0.2
709 0.17
710 0.16
711 0.17
712 0.15
713 0.15
714 0.15
715 0.12
716 0.15
717 0.15
718 0.15
719 0.14
720 0.13
721 0.13
722 0.12
723 0.12
724 0.1
725 0.13
726 0.13
727 0.14
728 0.14
729 0.14
730 0.14
731 0.16
732 0.14
733 0.11
734 0.13
735 0.12
736 0.16
737 0.18
738 0.2
739 0.18
740 0.18
741 0.18
742 0.21
743 0.22
744 0.21
745 0.2
746 0.23
747 0.29
748 0.3
749 0.3
750 0.28
751 0.29
752 0.34
753 0.38
754 0.41
755 0.45
756 0.54
757 0.63
758 0.68
759 0.74
760 0.78
761 0.82
762 0.83
763 0.84
764 0.84
765 0.83
766 0.86
767 0.8
768 0.76
769 0.74
770 0.65
771 0.54
772 0.44
773 0.4
774 0.35
775 0.34
776 0.29
777 0.22
778 0.25
779 0.25
780 0.26
781 0.23
782 0.18
783 0.18
784 0.17
785 0.16
786 0.14
787 0.18
788 0.2
789 0.2
790 0.22
791 0.27
792 0.29
793 0.31
794 0.32
795 0.33
796 0.32
797 0.39
798 0.46
799 0.43
800 0.44
801 0.42
802 0.42
803 0.37
804 0.34
805 0.25
806 0.18
807 0.17
808 0.19
809 0.19
810 0.19
811 0.21
812 0.23
813 0.25
814 0.24
815 0.27
816 0.29
817 0.31
818 0.34
819 0.34
820 0.33
821 0.31
822 0.31
823 0.26
824 0.18
825 0.16
826 0.13
827 0.11
828 0.1
829 0.12
830 0.11
831 0.1
832 0.11
833 0.12
834 0.1
835 0.11
836 0.15
837 0.19
838 0.27
839 0.3
840 0.32
841 0.32
842 0.33
843 0.33
844 0.35
845 0.34
846 0.3
847 0.33
848 0.31
849 0.31
850 0.32
851 0.34
852 0.28
853 0.25
854 0.21
855 0.17
856 0.18
857 0.2
858 0.18
859 0.21
860 0.25
861 0.25
862 0.33
863 0.38
864 0.41
865 0.48
866 0.55
867 0.58
868 0.63
869 0.7
870 0.69
871 0.72
872 0.72
873 0.67
874 0.67
875 0.6
876 0.56
877 0.51
878 0.48
879 0.47
880 0.5
881 0.47
882 0.4
883 0.43
884 0.45
885 0.49
886 0.48
887 0.42
888 0.39
889 0.41
890 0.42
891 0.38
892 0.32
893 0.25
894 0.22
895 0.2
896 0.15
897 0.11
898 0.09
899 0.09
900 0.09
901 0.1
902 0.11
903 0.11
904 0.12
905 0.13
906 0.16
907 0.23
908 0.25
909 0.34
910 0.39
911 0.44
912 0.48
913 0.49
914 0.53
915 0.48
916 0.5
917 0.5
918 0.46
919 0.43
920 0.4
921 0.4
922 0.33
923 0.33
924 0.27
925 0.2
926 0.21
927 0.2
928 0.18
929 0.19
930 0.2
931 0.2
932 0.26
933 0.29
934 0.29
935 0.28
936 0.3
937 0.3
938 0.31
939 0.3
940 0.23
941 0.2
942 0.23
943 0.26
944 0.27
945 0.27
946 0.34
947 0.44
948 0.52
949 0.6
950 0.65
951 0.71
952 0.78
953 0.87
954 0.89
955 0.9
956 0.91
957 0.9
958 0.88
959 0.88
960 0.83
961 0.82
962 0.78
963 0.7
964 0.63
965 0.57
966 0.48
967 0.41
968 0.41
969 0.31
970 0.25
971 0.22
972 0.22
973 0.19
974 0.2
975 0.19
976 0.14
977 0.18
978 0.19
979 0.21
980 0.21
981 0.22
982 0.22
983 0.22
984 0.21
985 0.18
986 0.16
987 0.14
988 0.12
989 0.11
990 0.11
991 0.09
992 0.1
993 0.12
994 0.12
995 0.12
996 0.13
997 0.15
998 0.13
999 0.15
1000 0.14
1001 0.14
1002 0.16
1003 0.23
1004 0.25
1005 0.25
1006 0.28