Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A2KXC0

Protein Details
Accession A0A0A2KXC0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-67ASRALRKKLKYGNIHRQLRAHydrophilic
178-207STLLTSPKEKPKPKKVKKDKKLSISYKRFDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
185-199KEKPKPKKVKKDKKL
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 11.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR044103  GAT_LSB5  
IPR045007  LSB5  
IPR002014  VHS_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0035091  F:phosphatidylinositol binding  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:0007015  P:actin filament organization  
GO:0006897  P:endocytosis  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0007034  P:vacuolar transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00790  VHS  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50179  VHS  
CDD cd14232  GAT_LSB5  
cd16980  VHS_Lsb5  
Amino Acid Sequences MFQSSKPYSAVTVQIEVLTSEQYEVEDSSGIVDLVEVVRIQASGPMEASRALRKKLKYGNIHRQLRALTILDFLVQNAGERFLRDFADEALLERLRIAATDSVSDPLVKQKCKQIFGQWASSYKDTPGMAKVTALYKQVPKRKQPATQAKAKVLREGSDSNEPPMGHVVSVSGGSGPSTLLTSPKEKPKPKKVKKDKKLSISYKRFDIEKERPEILQALAASSVASTNLLNALKHVNRETHRVSEDAECSHRFDTCKELRHTILRYIQYIETGEFLGGLIHANEELVDALMAFEVLDKSVDYDSDSEDDVLEGNWKQRHGLGLHDTDVSDGLAGLNINPPKPPRPNRPVSLPVASSSQHTRQIFDSESESEEEDDDDNPFGDRNAIKTPAVERPGLSWKEV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.22
4 0.19
5 0.14
6 0.11
7 0.09
8 0.09
9 0.09
10 0.1
11 0.1
12 0.1
13 0.09
14 0.09
15 0.09
16 0.09
17 0.09
18 0.07
19 0.07
20 0.07
21 0.07
22 0.07
23 0.06
24 0.06
25 0.06
26 0.06
27 0.07
28 0.09
29 0.1
30 0.1
31 0.11
32 0.12
33 0.12
34 0.15
35 0.17
36 0.23
37 0.27
38 0.31
39 0.37
40 0.39
41 0.48
42 0.55
43 0.62
44 0.63
45 0.69
46 0.75
47 0.79
48 0.84
49 0.76
50 0.71
51 0.63
52 0.54
53 0.47
54 0.37
55 0.27
56 0.21
57 0.19
58 0.16
59 0.15
60 0.13
61 0.11
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.11
66 0.1
67 0.11
68 0.13
69 0.13
70 0.14
71 0.14
72 0.14
73 0.13
74 0.16
75 0.15
76 0.14
77 0.17
78 0.16
79 0.16
80 0.15
81 0.14
82 0.1
83 0.1
84 0.11
85 0.09
86 0.1
87 0.12
88 0.12
89 0.13
90 0.14
91 0.14
92 0.12
93 0.18
94 0.23
95 0.23
96 0.26
97 0.33
98 0.39
99 0.42
100 0.44
101 0.44
102 0.49
103 0.51
104 0.55
105 0.49
106 0.47
107 0.47
108 0.45
109 0.38
110 0.28
111 0.28
112 0.21
113 0.2
114 0.19
115 0.17
116 0.16
117 0.16
118 0.17
119 0.15
120 0.17
121 0.17
122 0.17
123 0.22
124 0.29
125 0.38
126 0.43
127 0.48
128 0.55
129 0.59
130 0.64
131 0.68
132 0.72
133 0.69
134 0.72
135 0.69
136 0.67
137 0.68
138 0.61
139 0.56
140 0.46
141 0.41
142 0.35
143 0.32
144 0.29
145 0.29
146 0.29
147 0.25
148 0.27
149 0.25
150 0.22
151 0.22
152 0.19
153 0.11
154 0.1
155 0.09
156 0.07
157 0.07
158 0.06
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.06
168 0.08
169 0.12
170 0.15
171 0.24
172 0.33
173 0.4
174 0.49
175 0.59
176 0.69
177 0.75
178 0.83
179 0.86
180 0.89
181 0.9
182 0.93
183 0.89
184 0.87
185 0.87
186 0.85
187 0.85
188 0.82
189 0.74
190 0.66
191 0.59
192 0.5
193 0.42
194 0.41
195 0.38
196 0.35
197 0.37
198 0.35
199 0.33
200 0.33
201 0.33
202 0.24
203 0.19
204 0.13
205 0.09
206 0.08
207 0.08
208 0.07
209 0.06
210 0.05
211 0.03
212 0.04
213 0.03
214 0.04
215 0.07
216 0.08
217 0.07
218 0.08
219 0.13
220 0.14
221 0.16
222 0.17
223 0.2
224 0.21
225 0.28
226 0.3
227 0.3
228 0.3
229 0.28
230 0.29
231 0.27
232 0.27
233 0.23
234 0.24
235 0.2
236 0.21
237 0.21
238 0.21
239 0.18
240 0.17
241 0.24
242 0.26
243 0.33
244 0.34
245 0.37
246 0.38
247 0.43
248 0.44
249 0.41
250 0.42
251 0.36
252 0.35
253 0.34
254 0.32
255 0.27
256 0.26
257 0.2
258 0.14
259 0.12
260 0.11
261 0.07
262 0.07
263 0.06
264 0.05
265 0.05
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.03
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.03
279 0.03
280 0.03
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.07
289 0.08
290 0.1
291 0.11
292 0.12
293 0.1
294 0.1
295 0.1
296 0.09
297 0.08
298 0.09
299 0.09
300 0.14
301 0.16
302 0.16
303 0.17
304 0.18
305 0.23
306 0.21
307 0.26
308 0.28
309 0.28
310 0.3
311 0.3
312 0.28
313 0.24
314 0.23
315 0.17
316 0.1
317 0.07
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.11
323 0.13
324 0.13
325 0.16
326 0.2
327 0.27
328 0.37
329 0.46
330 0.51
331 0.59
332 0.68
333 0.7
334 0.76
335 0.75
336 0.71
337 0.68
338 0.59
339 0.51
340 0.45
341 0.4
342 0.34
343 0.33
344 0.32
345 0.35
346 0.34
347 0.34
348 0.33
349 0.38
350 0.37
351 0.33
352 0.32
353 0.26
354 0.27
355 0.26
356 0.25
357 0.21
358 0.19
359 0.18
360 0.15
361 0.13
362 0.13
363 0.12
364 0.11
365 0.11
366 0.11
367 0.1
368 0.14
369 0.14
370 0.17
371 0.22
372 0.25
373 0.25
374 0.28
375 0.32
376 0.35
377 0.38
378 0.36
379 0.31
380 0.33
381 0.42