Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JUM9

Protein Details
Accession C4JUM9    Localization Confidence Low Confidence Score 8.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-48GYVVESPRRKRARHKRTASFGTQLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-40RRKRARHKR
Subcellular Location(s) plas 20, nucl 2, vacu 2, mito 1, cyto 1, E.R. 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024512  Ser_palmitoyltrfase_ssu-like  
Gene Ontology GO:0005789  C:endoplasmic reticulum membrane  
KEGG ure:UREG_04832  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11779  SPT_ssu-like  
Amino Acid Sequences MVATLGLLPRNTVLFKPETLDRRDGYVVESPRRKRARHKRTASFGTQLAIVGAAAVGVYEDLAAAVGEPHKAFDTEVMGEKSPRDRVFSSPTGLLIFCLVSSISFSFGSASIFNSPRINPAAAKFHLEHQGRWHHRLASAKRKFESQSPFAAAIERRRFRLAIDRLVTSSRRERIKASPRIVSRLTNYINLSDGSAWKHFRHDTSNLPTMAAELHSIYTSNPPHVKPRPPAFIDDWLSLYSAMPTTDVPPAPATQSIAAAHRPNVLKRVFDRLCLEYYRYEVTCGVYVMTPGEKLIFNTFILVVLSLLTWALLLYFPSLLYQKLSRLDWLLTGRDGPNANVTIPMSTRTDTTVSFLQAPPRCT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.24
4 0.3
5 0.34
6 0.38
7 0.43
8 0.39
9 0.41
10 0.42
11 0.38
12 0.35
13 0.36
14 0.37
15 0.4
16 0.48
17 0.47
18 0.56
19 0.63
20 0.64
21 0.68
22 0.73
23 0.75
24 0.77
25 0.84
26 0.83
27 0.86
28 0.89
29 0.83
30 0.77
31 0.67
32 0.57
33 0.47
34 0.36
35 0.26
36 0.18
37 0.12
38 0.07
39 0.06
40 0.04
41 0.03
42 0.03
43 0.03
44 0.02
45 0.02
46 0.02
47 0.02
48 0.02
49 0.03
50 0.03
51 0.03
52 0.04
53 0.05
54 0.07
55 0.07
56 0.08
57 0.09
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.13
62 0.13
63 0.18
64 0.19
65 0.19
66 0.19
67 0.21
68 0.24
69 0.27
70 0.26
71 0.27
72 0.26
73 0.3
74 0.37
75 0.38
76 0.38
77 0.32
78 0.31
79 0.28
80 0.26
81 0.21
82 0.14
83 0.11
84 0.07
85 0.07
86 0.06
87 0.05
88 0.06
89 0.07
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.09
95 0.1
96 0.09
97 0.1
98 0.13
99 0.14
100 0.15
101 0.17
102 0.17
103 0.19
104 0.21
105 0.21
106 0.18
107 0.2
108 0.25
109 0.23
110 0.27
111 0.24
112 0.26
113 0.33
114 0.33
115 0.31
116 0.3
117 0.4
118 0.4
119 0.44
120 0.43
121 0.36
122 0.37
123 0.45
124 0.47
125 0.48
126 0.51
127 0.52
128 0.5
129 0.52
130 0.51
131 0.49
132 0.48
133 0.4
134 0.37
135 0.35
136 0.34
137 0.31
138 0.32
139 0.27
140 0.28
141 0.34
142 0.31
143 0.3
144 0.31
145 0.31
146 0.29
147 0.37
148 0.33
149 0.32
150 0.33
151 0.31
152 0.31
153 0.33
154 0.33
155 0.26
156 0.27
157 0.25
158 0.25
159 0.26
160 0.28
161 0.36
162 0.45
163 0.5
164 0.49
165 0.5
166 0.48
167 0.51
168 0.49
169 0.42
170 0.34
171 0.31
172 0.29
173 0.26
174 0.25
175 0.21
176 0.2
177 0.18
178 0.17
179 0.11
180 0.11
181 0.1
182 0.12
183 0.14
184 0.13
185 0.17
186 0.17
187 0.19
188 0.23
189 0.24
190 0.28
191 0.32
192 0.37
193 0.34
194 0.33
195 0.31
196 0.26
197 0.23
198 0.16
199 0.11
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.11
206 0.11
207 0.15
208 0.18
209 0.19
210 0.27
211 0.32
212 0.39
213 0.42
214 0.48
215 0.52
216 0.5
217 0.54
218 0.49
219 0.5
220 0.46
221 0.39
222 0.34
223 0.26
224 0.25
225 0.21
226 0.17
227 0.11
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.12
234 0.12
235 0.12
236 0.13
237 0.13
238 0.14
239 0.15
240 0.14
241 0.11
242 0.13
243 0.13
244 0.13
245 0.16
246 0.16
247 0.17
248 0.21
249 0.23
250 0.22
251 0.28
252 0.28
253 0.28
254 0.29
255 0.38
256 0.33
257 0.35
258 0.38
259 0.34
260 0.36
261 0.34
262 0.34
263 0.25
264 0.27
265 0.27
266 0.23
267 0.21
268 0.19
269 0.19
270 0.18
271 0.17
272 0.15
273 0.11
274 0.11
275 0.11
276 0.11
277 0.09
278 0.08
279 0.1
280 0.09
281 0.11
282 0.14
283 0.14
284 0.13
285 0.15
286 0.14
287 0.13
288 0.13
289 0.11
290 0.08
291 0.07
292 0.06
293 0.05
294 0.05
295 0.04
296 0.04
297 0.03
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.05
302 0.06
303 0.06
304 0.08
305 0.09
306 0.1
307 0.13
308 0.14
309 0.18
310 0.22
311 0.23
312 0.24
313 0.26
314 0.26
315 0.28
316 0.3
317 0.28
318 0.24
319 0.27
320 0.25
321 0.27
322 0.27
323 0.23
324 0.25
325 0.24
326 0.23
327 0.22
328 0.22
329 0.2
330 0.19
331 0.21
332 0.18
333 0.18
334 0.19
335 0.19
336 0.21
337 0.19
338 0.23
339 0.24
340 0.24
341 0.27
342 0.28
343 0.34