Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A2LLC1

Protein Details
Accession A0A0A2LLC1    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-50NLPLRTADAERKRKSKKDASAASPSKKRKQTSSSKATPHQPHydrophilic
347-387VHLEASPKKEKKEKKEKKEKKEKTEKKEKKSKSSKSKSKDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
20-38RKRKSKKDASAASPSKKRK
353-386PKKEKKEKKEKKEKKEKTEKKEKKSKSSKSKSKD
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 10.666, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041901  RNAP_I_Rpa43_N  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
CDD cd04328  RNAP_I_Rpa43_N  
Amino Acid Sequences MAIDAMEIDNLPLRTADAERKRKSKKDASAASPSKKRKQTSSSKATPHQPQDSTPESPFTLTTATLYLPLSPISISPTHALASLLAEHLSPLLLTYFPPLKGVVLAYSNASISSKPPANPRSSSDLNPQPLTLATTADEYGVLYVYLTATFLVFRPKRGQTLDGWVNVQSEGFLGAVVFNLFSVGVERKRLPSNWKWVAPGEEAETPAVTDDDSGSDKDMADFDAEKECFKPATLSAEEIAIDGEEEDESAHSGYFQSVSGHRVSGSVRFRVVDVDVIPGSERDRGFLSIEGTMLSVEEEEKLLESERQGQSLPPSFFSSPQKVSGSIPVMNVPAASAVQELSTVDVHLEASPKKEKKEKKEKKEKKEKTEKKEKKSKSSKSKSKDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.17
3 0.26
4 0.33
5 0.43
6 0.5
7 0.6
8 0.69
9 0.75
10 0.81
11 0.82
12 0.81
13 0.82
14 0.83
15 0.8
16 0.82
17 0.83
18 0.82
19 0.81
20 0.79
21 0.78
22 0.77
23 0.75
24 0.73
25 0.74
26 0.76
27 0.78
28 0.8
29 0.79
30 0.79
31 0.81
32 0.8
33 0.79
34 0.76
35 0.73
36 0.64
37 0.58
38 0.57
39 0.55
40 0.52
41 0.44
42 0.39
43 0.32
44 0.3
45 0.28
46 0.22
47 0.18
48 0.14
49 0.14
50 0.12
51 0.11
52 0.12
53 0.12
54 0.11
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.09
59 0.09
60 0.11
61 0.11
62 0.13
63 0.13
64 0.14
65 0.14
66 0.14
67 0.14
68 0.11
69 0.11
70 0.1
71 0.09
72 0.08
73 0.08
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.05
78 0.04
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.09
83 0.12
84 0.12
85 0.13
86 0.13
87 0.13
88 0.14
89 0.14
90 0.12
91 0.1
92 0.11
93 0.1
94 0.11
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.08
99 0.08
100 0.13
101 0.16
102 0.18
103 0.26
104 0.31
105 0.36
106 0.38
107 0.41
108 0.43
109 0.43
110 0.44
111 0.44
112 0.46
113 0.45
114 0.42
115 0.38
116 0.31
117 0.28
118 0.26
119 0.19
120 0.12
121 0.09
122 0.09
123 0.1
124 0.09
125 0.09
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.03
131 0.03
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.05
139 0.14
140 0.14
141 0.17
142 0.22
143 0.24
144 0.28
145 0.3
146 0.32
147 0.25
148 0.33
149 0.34
150 0.3
151 0.29
152 0.25
153 0.24
154 0.21
155 0.19
156 0.1
157 0.06
158 0.06
159 0.05
160 0.04
161 0.03
162 0.03
163 0.04
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.04
171 0.07
172 0.07
173 0.1
174 0.11
175 0.14
176 0.16
177 0.19
178 0.24
179 0.28
180 0.37
181 0.4
182 0.41
183 0.4
184 0.38
185 0.39
186 0.33
187 0.28
188 0.21
189 0.16
190 0.15
191 0.14
192 0.12
193 0.09
194 0.08
195 0.08
196 0.05
197 0.04
198 0.04
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.12
212 0.12
213 0.12
214 0.13
215 0.13
216 0.12
217 0.12
218 0.13
219 0.09
220 0.14
221 0.15
222 0.15
223 0.15
224 0.15
225 0.15
226 0.13
227 0.12
228 0.06
229 0.05
230 0.04
231 0.04
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.08
245 0.08
246 0.11
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.13
252 0.18
253 0.21
254 0.21
255 0.21
256 0.21
257 0.21
258 0.21
259 0.21
260 0.16
261 0.13
262 0.14
263 0.13
264 0.13
265 0.13
266 0.12
267 0.12
268 0.14
269 0.14
270 0.12
271 0.14
272 0.15
273 0.16
274 0.17
275 0.18
276 0.14
277 0.14
278 0.13
279 0.11
280 0.09
281 0.08
282 0.07
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.07
290 0.08
291 0.09
292 0.1
293 0.18
294 0.19
295 0.2
296 0.2
297 0.21
298 0.26
299 0.33
300 0.33
301 0.26
302 0.3
303 0.3
304 0.35
305 0.4
306 0.4
307 0.36
308 0.39
309 0.39
310 0.35
311 0.36
312 0.38
313 0.35
314 0.3
315 0.29
316 0.25
317 0.24
318 0.23
319 0.21
320 0.14
321 0.11
322 0.09
323 0.08
324 0.07
325 0.06
326 0.06
327 0.07
328 0.07
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.07
333 0.07
334 0.08
335 0.09
336 0.13
337 0.13
338 0.18
339 0.28
340 0.32
341 0.38
342 0.47
343 0.55
344 0.62
345 0.73
346 0.78
347 0.8
348 0.88
349 0.92
350 0.94
351 0.96
352 0.95
353 0.95
354 0.96
355 0.95
356 0.94
357 0.95
358 0.94
359 0.93
360 0.93
361 0.91
362 0.91
363 0.92
364 0.92
365 0.92
366 0.93
367 0.92