Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A2LIJ9

Protein Details
Accession A0A0A2LIJ9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
431-453LYENKGGPQGPKRNRANQKPRKRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
435-453KGGPQGPKRNRANQKPRKR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024337  tRNA_splic_suSen54  
IPR024336  tRNA_splic_suSen54_N  
Gene Ontology GO:0004519  F:endonuclease activity  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF12928  tRNA_int_end_N2  
Amino Acid Sequences MADADEDAIRAPENAAAQPEVDLSDETQDFRFLNHLNFFADSSPGIPRRGEKDFEPNPTELQADVLSASRGAMHNALSYPRLHPAKTRVIAFYAPDGYVAPTQPDRATPKAAGEDGKSSESTPKPARPLPNSARISPDACVYVPSPKGQFFKTMGQADSSSRVWLLPEEALYLIERGSLDIRWPSPSGSAAGPGEEDLSVPMSLQAAYACFMGRGGLTLERYSVYTSLKRLGYALVRAPGWCDDMEPRDSDATDVTEIASPKLIGPGLAGMLGSLFNWIHDPRSTASTATGPIIGTGIHRHYMDVYRKLAIIPWYDPVTAPERHPSDTTPPFRVVFHIYKPSTPFKKSALPTPDFRIAVVSTRDQTTMPTMTQLGALLESTPLDPPRGEKMDRMMYMRLRHGYRNVVMAIVDQGVISYLRIADSAFGKEKLYENKGGPQGPKRNRANQKPRKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.16
3 0.16
4 0.16
5 0.16
6 0.16
7 0.14
8 0.13
9 0.12
10 0.1
11 0.14
12 0.15
13 0.16
14 0.16
15 0.17
16 0.16
17 0.16
18 0.2
19 0.17
20 0.22
21 0.24
22 0.25
23 0.24
24 0.25
25 0.25
26 0.22
27 0.21
28 0.16
29 0.14
30 0.2
31 0.21
32 0.22
33 0.23
34 0.26
35 0.31
36 0.36
37 0.37
38 0.34
39 0.41
40 0.46
41 0.52
42 0.52
43 0.47
44 0.43
45 0.42
46 0.39
47 0.28
48 0.24
49 0.16
50 0.12
51 0.12
52 0.11
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.1
59 0.11
60 0.11
61 0.13
62 0.14
63 0.16
64 0.15
65 0.16
66 0.16
67 0.24
68 0.25
69 0.24
70 0.29
71 0.34
72 0.43
73 0.45
74 0.47
75 0.4
76 0.4
77 0.41
78 0.37
79 0.33
80 0.25
81 0.2
82 0.18
83 0.17
84 0.16
85 0.16
86 0.15
87 0.14
88 0.13
89 0.15
90 0.16
91 0.2
92 0.23
93 0.25
94 0.28
95 0.26
96 0.28
97 0.29
98 0.31
99 0.28
100 0.24
101 0.25
102 0.23
103 0.24
104 0.21
105 0.19
106 0.24
107 0.24
108 0.29
109 0.3
110 0.32
111 0.36
112 0.42
113 0.49
114 0.46
115 0.55
116 0.54
117 0.59
118 0.58
119 0.54
120 0.53
121 0.47
122 0.44
123 0.35
124 0.3
125 0.21
126 0.18
127 0.18
128 0.14
129 0.17
130 0.17
131 0.19
132 0.19
133 0.22
134 0.24
135 0.23
136 0.27
137 0.25
138 0.29
139 0.34
140 0.35
141 0.31
142 0.3
143 0.3
144 0.27
145 0.28
146 0.23
147 0.16
148 0.13
149 0.13
150 0.11
151 0.11
152 0.11
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.06
166 0.07
167 0.09
168 0.1
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.12
173 0.13
174 0.13
175 0.11
176 0.13
177 0.11
178 0.1
179 0.1
180 0.09
181 0.09
182 0.07
183 0.07
184 0.04
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.04
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.04
199 0.05
200 0.04
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.1
213 0.11
214 0.16
215 0.15
216 0.15
217 0.15
218 0.15
219 0.15
220 0.15
221 0.16
222 0.13
223 0.13
224 0.13
225 0.14
226 0.12
227 0.13
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.12
232 0.14
233 0.14
234 0.14
235 0.13
236 0.13
237 0.12
238 0.11
239 0.09
240 0.08
241 0.08
242 0.07
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.09
250 0.08
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.03
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.06
265 0.07
266 0.08
267 0.09
268 0.11
269 0.12
270 0.15
271 0.16
272 0.14
273 0.15
274 0.15
275 0.15
276 0.14
277 0.13
278 0.1
279 0.09
280 0.09
281 0.08
282 0.07
283 0.08
284 0.09
285 0.11
286 0.11
287 0.11
288 0.13
289 0.2
290 0.25
291 0.28
292 0.28
293 0.27
294 0.27
295 0.27
296 0.28
297 0.24
298 0.21
299 0.17
300 0.19
301 0.2
302 0.2
303 0.2
304 0.19
305 0.21
306 0.19
307 0.2
308 0.24
309 0.25
310 0.27
311 0.28
312 0.28
313 0.32
314 0.39
315 0.42
316 0.38
317 0.39
318 0.38
319 0.37
320 0.37
321 0.35
322 0.31
323 0.31
324 0.37
325 0.35
326 0.37
327 0.41
328 0.48
329 0.47
330 0.46
331 0.44
332 0.39
333 0.47
334 0.46
335 0.5
336 0.5
337 0.48
338 0.48
339 0.51
340 0.54
341 0.45
342 0.43
343 0.37
344 0.29
345 0.29
346 0.29
347 0.26
348 0.21
349 0.22
350 0.23
351 0.2
352 0.21
353 0.21
354 0.2
355 0.17
356 0.17
357 0.16
358 0.16
359 0.16
360 0.15
361 0.11
362 0.09
363 0.09
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.1
369 0.1
370 0.11
371 0.11
372 0.14
373 0.22
374 0.27
375 0.28
376 0.28
377 0.34
378 0.41
379 0.43
380 0.44
381 0.42
382 0.42
383 0.45
384 0.49
385 0.48
386 0.43
387 0.45
388 0.47
389 0.48
390 0.45
391 0.45
392 0.39
393 0.33
394 0.3
395 0.26
396 0.22
397 0.16
398 0.14
399 0.08
400 0.08
401 0.08
402 0.08
403 0.07
404 0.07
405 0.06
406 0.07
407 0.07
408 0.07
409 0.09
410 0.11
411 0.17
412 0.19
413 0.2
414 0.21
415 0.23
416 0.29
417 0.35
418 0.38
419 0.39
420 0.38
421 0.46
422 0.51
423 0.54
424 0.55
425 0.57
426 0.62
427 0.65
428 0.72
429 0.72
430 0.77
431 0.82
432 0.87
433 0.88