Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JYD6

Protein Details
Accession C4JYD6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
369-402REEEEEKEREERRRKRNEKRRKNGKEGQNGIKQEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
375-393KEREERRRKRNEKRRKNGK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 7, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002575  Aminoglycoside_PTrfase  
IPR011009  Kinase-like_dom_sf  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR040107  Snu23  
IPR022755  Znf_C2H2_jaz  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG ure:UREG_07187  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01636  APH  
PF12171  zf-C2H2_jaz  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
Amino Acid Sequences MDPFHSKAQFYMAMSNAVDHLQDDPPNTSRAGHNFPSHLGLCSQGSILVFATILQVPTFGGERICSAIGTLIRSTRVPDHKMGPFENEKEMCEYLLAPASMHTFKTREEYNAVVQRAEELQERPHQITFTHGDFKAHNILVDEDGHLAGFLDWESAGWCPEYWEFTTAMSPDSSPEVARFKLSNALSHIQKMSDSQAKKSAYGTPSSDTAFRKTWDREAYAEKAAADEAKAKAESKARYEAKLLGKKYYAPVDYSTLEATTSRARRLDVASLVGKTTIVPAGAAVGKRGRGAGFYCADCDLTFKDNIQLVEHLNSKQHLIATGQSGEVVRAGVEDVRQRLRWLSHKRRMDAEEEKKAGELDLNQRLKTREEEEEKEREERRRKRNEKRRKNGKEGQNGIKQEDSWEGRLGVIA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.27
3 0.22
4 0.19
5 0.17
6 0.12
7 0.14
8 0.14
9 0.16
10 0.18
11 0.21
12 0.23
13 0.24
14 0.25
15 0.24
16 0.26
17 0.3
18 0.35
19 0.36
20 0.38
21 0.39
22 0.4
23 0.43
24 0.39
25 0.34
26 0.27
27 0.24
28 0.21
29 0.19
30 0.18
31 0.14
32 0.13
33 0.12
34 0.12
35 0.09
36 0.08
37 0.08
38 0.1
39 0.09
40 0.1
41 0.08
42 0.08
43 0.08
44 0.09
45 0.1
46 0.09
47 0.08
48 0.08
49 0.1
50 0.12
51 0.12
52 0.11
53 0.1
54 0.13
55 0.14
56 0.16
57 0.16
58 0.15
59 0.17
60 0.17
61 0.2
62 0.25
63 0.3
64 0.32
65 0.35
66 0.4
67 0.43
68 0.47
69 0.46
70 0.45
71 0.43
72 0.41
73 0.45
74 0.39
75 0.35
76 0.34
77 0.33
78 0.27
79 0.21
80 0.19
81 0.13
82 0.15
83 0.14
84 0.1
85 0.11
86 0.14
87 0.14
88 0.15
89 0.16
90 0.14
91 0.15
92 0.2
93 0.21
94 0.2
95 0.22
96 0.24
97 0.29
98 0.35
99 0.34
100 0.3
101 0.28
102 0.27
103 0.24
104 0.24
105 0.19
106 0.13
107 0.16
108 0.22
109 0.25
110 0.25
111 0.26
112 0.24
113 0.22
114 0.25
115 0.25
116 0.23
117 0.26
118 0.24
119 0.25
120 0.25
121 0.27
122 0.28
123 0.24
124 0.21
125 0.16
126 0.17
127 0.17
128 0.17
129 0.15
130 0.1
131 0.09
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.05
136 0.05
137 0.04
138 0.04
139 0.03
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.07
147 0.07
148 0.1
149 0.1
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.13
154 0.12
155 0.12
156 0.1
157 0.09
158 0.08
159 0.1
160 0.1
161 0.08
162 0.1
163 0.12
164 0.12
165 0.13
166 0.13
167 0.12
168 0.18
169 0.19
170 0.19
171 0.21
172 0.24
173 0.23
174 0.24
175 0.24
176 0.17
177 0.17
178 0.16
179 0.16
180 0.18
181 0.19
182 0.19
183 0.25
184 0.25
185 0.26
186 0.26
187 0.28
188 0.23
189 0.24
190 0.24
191 0.19
192 0.2
193 0.2
194 0.22
195 0.18
196 0.2
197 0.19
198 0.18
199 0.22
200 0.22
201 0.27
202 0.27
203 0.27
204 0.26
205 0.29
206 0.32
207 0.28
208 0.27
209 0.21
210 0.18
211 0.16
212 0.13
213 0.09
214 0.1
215 0.09
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.13
220 0.19
221 0.2
222 0.21
223 0.29
224 0.3
225 0.31
226 0.32
227 0.36
228 0.39
229 0.43
230 0.41
231 0.35
232 0.34
233 0.34
234 0.35
235 0.33
236 0.25
237 0.21
238 0.21
239 0.22
240 0.22
241 0.21
242 0.19
243 0.14
244 0.13
245 0.12
246 0.11
247 0.14
248 0.16
249 0.17
250 0.18
251 0.18
252 0.2
253 0.23
254 0.25
255 0.2
256 0.22
257 0.21
258 0.2
259 0.2
260 0.18
261 0.15
262 0.11
263 0.11
264 0.08
265 0.06
266 0.06
267 0.05
268 0.07
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.11
273 0.12
274 0.12
275 0.13
276 0.11
277 0.11
278 0.13
279 0.17
280 0.18
281 0.18
282 0.19
283 0.18
284 0.19
285 0.17
286 0.17
287 0.14
288 0.14
289 0.14
290 0.13
291 0.17
292 0.19
293 0.2
294 0.2
295 0.19
296 0.18
297 0.21
298 0.23
299 0.2
300 0.2
301 0.2
302 0.19
303 0.19
304 0.18
305 0.15
306 0.14
307 0.16
308 0.17
309 0.17
310 0.16
311 0.15
312 0.15
313 0.14
314 0.12
315 0.1
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.09
321 0.13
322 0.17
323 0.21
324 0.22
325 0.23
326 0.26
327 0.31
328 0.39
329 0.46
330 0.53
331 0.58
332 0.66
333 0.68
334 0.72
335 0.69
336 0.68
337 0.67
338 0.65
339 0.65
340 0.58
341 0.55
342 0.48
343 0.45
344 0.38
345 0.29
346 0.26
347 0.24
348 0.32
349 0.35
350 0.36
351 0.39
352 0.4
353 0.41
354 0.41
355 0.37
356 0.37
357 0.41
358 0.47
359 0.5
360 0.55
361 0.56
362 0.58
363 0.59
364 0.59
365 0.62
366 0.66
367 0.7
368 0.74
369 0.82
370 0.86
371 0.91
372 0.93
373 0.94
374 0.95
375 0.96
376 0.95
377 0.95
378 0.93
379 0.93
380 0.92
381 0.89
382 0.87
383 0.84
384 0.77
385 0.7
386 0.62
387 0.52
388 0.44
389 0.44
390 0.39
391 0.33
392 0.33
393 0.29