Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JE96

Protein Details
Accession C4JE96    Localization Confidence High Confidence Score 20.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
168-197IETREKKSSDKERKHRSHRHRDGDDRRSRHBasic
204-266EDDRRSSHRHRHRRSDGHSRSRSRSTSPPRRSHRSPSPHRRHRSDSPRPRHRSRSPYRSRDDPBasic
274-299YHYPRRSPPYKRQEDRGERRRQAPNDBasic
365-385IDLSDRLRRGRRNIEKEQEAYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
167-263GIETREKKSSDKERKHRSHRHRDGDDRRSRHRSKRYDEDDRRSSHRHRHRRSDGHSRSRSRSTSPPRRSHRSPSPHRRHRSDSPRPRHRSRSPYRSR
284-285KR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR022209  CWC25  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG ure:UREG_00518  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
PF12542  CWC25  
Amino Acid Sequences MGGDLNLKKSWNPVLLKNQERVWIEQKKALEERKRIDQMMKERAEERQIQELQEMQEAAGGKKRLNRVDWMYSGPAAGQLGTTEEMEGYLLGKRRIDGLIKGNENSKLEKASGESSFMALQNANTMKDTATKIREDPMLAIKKQEQAAYEAMMNDPTRRRQLLKAAGIETREKKSSDKERKHRSHRHRDGDDRRSRHRSKRYDEDDRRSSHRHRHRRSDGHSRSRSRSTSPPRRSHRSPSPHRRHRSDSPRPRHRSRSPYRSRDDPAQYKRESYHYPRRSPPYKRQEDRGERRRQAPNDEERAARLAAMQQDANDLDQARISRLNAVEARERAEREAEEAARAESSKYGGKGAFVNGLNRRAGDIDLSDRLRRGRRNIEKEQEAY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.58
3 0.63
4 0.63
5 0.6
6 0.59
7 0.57
8 0.55
9 0.54
10 0.52
11 0.5
12 0.5
13 0.49
14 0.49
15 0.54
16 0.58
17 0.58
18 0.58
19 0.61
20 0.66
21 0.69
22 0.65
23 0.63
24 0.62
25 0.62
26 0.64
27 0.61
28 0.54
29 0.5
30 0.51
31 0.51
32 0.48
33 0.42
34 0.42
35 0.41
36 0.39
37 0.39
38 0.38
39 0.34
40 0.3
41 0.27
42 0.17
43 0.17
44 0.18
45 0.17
46 0.19
47 0.19
48 0.18
49 0.24
50 0.31
51 0.34
52 0.36
53 0.42
54 0.43
55 0.49
56 0.49
57 0.48
58 0.43
59 0.37
60 0.34
61 0.27
62 0.21
63 0.15
64 0.12
65 0.08
66 0.06
67 0.08
68 0.09
69 0.09
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.06
76 0.08
77 0.11
78 0.12
79 0.13
80 0.13
81 0.16
82 0.18
83 0.2
84 0.21
85 0.26
86 0.32
87 0.34
88 0.35
89 0.36
90 0.37
91 0.36
92 0.34
93 0.28
94 0.22
95 0.2
96 0.2
97 0.19
98 0.19
99 0.18
100 0.18
101 0.17
102 0.16
103 0.17
104 0.17
105 0.15
106 0.11
107 0.11
108 0.13
109 0.14
110 0.14
111 0.13
112 0.13
113 0.12
114 0.16
115 0.19
116 0.19
117 0.21
118 0.22
119 0.23
120 0.25
121 0.27
122 0.23
123 0.23
124 0.26
125 0.29
126 0.27
127 0.29
128 0.28
129 0.3
130 0.31
131 0.31
132 0.23
133 0.2
134 0.21
135 0.2
136 0.18
137 0.14
138 0.13
139 0.13
140 0.13
141 0.12
142 0.14
143 0.16
144 0.19
145 0.21
146 0.23
147 0.24
148 0.33
149 0.38
150 0.41
151 0.41
152 0.39
153 0.39
154 0.38
155 0.39
156 0.33
157 0.28
158 0.25
159 0.22
160 0.22
161 0.28
162 0.38
163 0.44
164 0.51
165 0.58
166 0.68
167 0.76
168 0.85
169 0.88
170 0.88
171 0.89
172 0.89
173 0.88
174 0.84
175 0.84
176 0.83
177 0.83
178 0.81
179 0.74
180 0.7
181 0.7
182 0.7
183 0.69
184 0.69
185 0.67
186 0.66
187 0.72
188 0.73
189 0.75
190 0.77
191 0.76
192 0.73
193 0.67
194 0.65
195 0.6
196 0.56
197 0.55
198 0.58
199 0.6
200 0.62
201 0.69
202 0.74
203 0.78
204 0.8
205 0.82
206 0.81
207 0.81
208 0.81
209 0.76
210 0.71
211 0.68
212 0.63
213 0.56
214 0.56
215 0.56
216 0.59
217 0.63
218 0.68
219 0.7
220 0.76
221 0.77
222 0.76
223 0.75
224 0.75
225 0.77
226 0.78
227 0.82
228 0.84
229 0.87
230 0.84
231 0.82
232 0.81
233 0.81
234 0.81
235 0.81
236 0.82
237 0.84
238 0.86
239 0.86
240 0.85
241 0.83
242 0.83
243 0.82
244 0.82
245 0.82
246 0.83
247 0.81
248 0.78
249 0.74
250 0.72
251 0.71
252 0.69
253 0.66
254 0.65
255 0.6
256 0.56
257 0.54
258 0.5
259 0.48
260 0.47
261 0.51
262 0.52
263 0.57
264 0.63
265 0.7
266 0.73
267 0.75
268 0.77
269 0.77
270 0.79
271 0.77
272 0.78
273 0.8
274 0.82
275 0.84
276 0.84
277 0.83
278 0.78
279 0.81
280 0.82
281 0.75
282 0.72
283 0.7
284 0.69
285 0.66
286 0.64
287 0.56
288 0.49
289 0.47
290 0.39
291 0.3
292 0.21
293 0.17
294 0.17
295 0.18
296 0.17
297 0.15
298 0.17
299 0.18
300 0.17
301 0.15
302 0.13
303 0.11
304 0.13
305 0.13
306 0.13
307 0.15
308 0.15
309 0.18
310 0.18
311 0.24
312 0.24
313 0.27
314 0.32
315 0.31
316 0.34
317 0.33
318 0.34
319 0.3
320 0.31
321 0.28
322 0.24
323 0.29
324 0.26
325 0.24
326 0.23
327 0.22
328 0.2
329 0.2
330 0.17
331 0.13
332 0.15
333 0.17
334 0.17
335 0.2
336 0.19
337 0.2
338 0.22
339 0.23
340 0.27
341 0.25
342 0.31
343 0.33
344 0.37
345 0.36
346 0.34
347 0.33
348 0.27
349 0.26
350 0.21
351 0.19
352 0.2
353 0.25
354 0.28
355 0.29
356 0.31
357 0.36
358 0.42
359 0.46
360 0.5
361 0.55
362 0.63
363 0.7
364 0.78
365 0.81