Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JSW8

Protein Details
Accession C4JSW8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-81AASLRFQPTKRPQLPSQKLKAKHydrophilic
132-158GFYGEKRQRGGRKRRKKNRDAEVVYNWBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
137-150KRQRGGRKRRKKNR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10.833, nucl 10, cyto 9.5, cyto_mito 8.166, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040052  RBM17  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
KEGG ure:UREG_05557  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
Amino Acid Sequences MAAPPTGPKSGLSLYANLLDPSDASSGSNTISRAPVVFKQAADGGSQEDDAASKKQQISAASLRFQPTKRPQLPSQKLKAKPAIPKPPVVSAATSPANHSTTSGPAADTIRPPAKTTLADWAATAEDDDINGFYGEKRQRGGRKRRKKNRDAEVVYNWDDIYDPSRPNSYDAYRHSEEKIREVREWKDRLYAHRMARRTSSEVESDDEYRRRPMNSSSRLSLSRVNLFGWVINVLLTPLLEQFAPPKQFAPPPNLNDIPRQPSAPNSPVTEVAPPPAAPLPDDQTGEDAFARRLRLSQNTGQEPSMAPVQPPSLPPPPPPPEDIPSVPTPKEVYSAATISRAPVRYTLPPAPEDIPATEEELEATFAKETEEVPEEDAPRSLRPGQKGFAERLLAKYGWTKGSGLGASGTGIINPLQVKVEKQKKRPDAEGGGFVTPAGRGKIIGGKQKKQDEGKFGAMSEVIVLHGMVDGMDLNAELEAGEDGGLIQEIGEECGEKYGRVERVFVDRNSEGQVPVFVKFTNQLSALRAVNALEGRVFNGNTITARFFDVEKFEEGIYK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.29
3 0.29
4 0.25
5 0.23
6 0.17
7 0.15
8 0.15
9 0.14
10 0.11
11 0.1
12 0.11
13 0.12
14 0.13
15 0.15
16 0.13
17 0.14
18 0.16
19 0.16
20 0.16
21 0.2
22 0.22
23 0.27
24 0.29
25 0.27
26 0.28
27 0.3
28 0.29
29 0.26
30 0.22
31 0.18
32 0.16
33 0.16
34 0.13
35 0.1
36 0.11
37 0.12
38 0.14
39 0.14
40 0.19
41 0.2
42 0.24
43 0.27
44 0.28
45 0.33
46 0.39
47 0.42
48 0.4
49 0.42
50 0.42
51 0.45
52 0.44
53 0.47
54 0.48
55 0.54
56 0.58
57 0.61
58 0.66
59 0.72
60 0.81
61 0.81
62 0.81
63 0.8
64 0.78
65 0.79
66 0.79
67 0.74
68 0.73
69 0.74
70 0.74
71 0.68
72 0.69
73 0.64
74 0.61
75 0.58
76 0.5
77 0.42
78 0.32
79 0.35
80 0.32
81 0.3
82 0.26
83 0.27
84 0.26
85 0.24
86 0.24
87 0.2
88 0.18
89 0.2
90 0.19
91 0.15
92 0.16
93 0.18
94 0.19
95 0.19
96 0.23
97 0.26
98 0.26
99 0.28
100 0.28
101 0.29
102 0.28
103 0.28
104 0.31
105 0.28
106 0.28
107 0.25
108 0.24
109 0.21
110 0.19
111 0.18
112 0.09
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.14
122 0.18
123 0.19
124 0.21
125 0.28
126 0.37
127 0.48
128 0.59
129 0.63
130 0.7
131 0.79
132 0.88
133 0.92
134 0.94
135 0.93
136 0.92
137 0.92
138 0.87
139 0.82
140 0.77
141 0.72
142 0.63
143 0.54
144 0.43
145 0.32
146 0.26
147 0.19
148 0.16
149 0.14
150 0.13
151 0.14
152 0.17
153 0.18
154 0.2
155 0.24
156 0.24
157 0.27
158 0.31
159 0.37
160 0.37
161 0.38
162 0.38
163 0.4
164 0.38
165 0.39
166 0.42
167 0.37
168 0.39
169 0.41
170 0.44
171 0.47
172 0.49
173 0.42
174 0.43
175 0.42
176 0.43
177 0.47
178 0.48
179 0.46
180 0.49
181 0.5
182 0.45
183 0.47
184 0.45
185 0.42
186 0.38
187 0.33
188 0.29
189 0.28
190 0.28
191 0.26
192 0.25
193 0.25
194 0.24
195 0.22
196 0.24
197 0.24
198 0.23
199 0.24
200 0.29
201 0.35
202 0.41
203 0.44
204 0.42
205 0.44
206 0.44
207 0.44
208 0.4
209 0.33
210 0.29
211 0.26
212 0.24
213 0.21
214 0.2
215 0.18
216 0.14
217 0.11
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.06
230 0.11
231 0.13
232 0.13
233 0.14
234 0.16
235 0.21
236 0.23
237 0.29
238 0.3
239 0.31
240 0.36
241 0.38
242 0.37
243 0.36
244 0.38
245 0.35
246 0.3
247 0.28
248 0.23
249 0.23
250 0.27
251 0.26
252 0.25
253 0.21
254 0.22
255 0.21
256 0.22
257 0.2
258 0.15
259 0.14
260 0.12
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.08
266 0.09
267 0.12
268 0.13
269 0.14
270 0.12
271 0.13
272 0.13
273 0.13
274 0.12
275 0.09
276 0.08
277 0.09
278 0.1
279 0.09
280 0.11
281 0.13
282 0.17
283 0.21
284 0.25
285 0.3
286 0.32
287 0.34
288 0.32
289 0.3
290 0.26
291 0.23
292 0.2
293 0.14
294 0.11
295 0.1
296 0.12
297 0.12
298 0.13
299 0.16
300 0.18
301 0.19
302 0.21
303 0.28
304 0.32
305 0.33
306 0.35
307 0.34
308 0.32
309 0.35
310 0.34
311 0.3
312 0.29
313 0.3
314 0.26
315 0.24
316 0.22
317 0.18
318 0.19
319 0.16
320 0.14
321 0.13
322 0.14
323 0.13
324 0.13
325 0.13
326 0.12
327 0.16
328 0.15
329 0.14
330 0.15
331 0.17
332 0.19
333 0.25
334 0.27
335 0.25
336 0.25
337 0.27
338 0.26
339 0.25
340 0.23
341 0.18
342 0.16
343 0.14
344 0.15
345 0.12
346 0.11
347 0.1
348 0.09
349 0.1
350 0.08
351 0.08
352 0.07
353 0.06
354 0.07
355 0.07
356 0.07
357 0.09
358 0.11
359 0.11
360 0.13
361 0.15
362 0.16
363 0.16
364 0.18
365 0.17
366 0.15
367 0.18
368 0.21
369 0.22
370 0.26
371 0.29
372 0.3
373 0.35
374 0.38
375 0.37
376 0.36
377 0.35
378 0.3
379 0.29
380 0.31
381 0.24
382 0.22
383 0.24
384 0.23
385 0.21
386 0.21
387 0.19
388 0.17
389 0.2
390 0.19
391 0.15
392 0.13
393 0.11
394 0.1
395 0.1
396 0.09
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.07
401 0.08
402 0.08
403 0.09
404 0.1
405 0.13
406 0.23
407 0.33
408 0.39
409 0.47
410 0.57
411 0.63
412 0.69
413 0.71
414 0.69
415 0.67
416 0.62
417 0.6
418 0.52
419 0.44
420 0.38
421 0.32
422 0.25
423 0.17
424 0.15
425 0.1
426 0.08
427 0.08
428 0.09
429 0.17
430 0.21
431 0.3
432 0.36
433 0.42
434 0.5
435 0.57
436 0.62
437 0.64
438 0.64
439 0.63
440 0.61
441 0.6
442 0.54
443 0.47
444 0.41
445 0.33
446 0.27
447 0.19
448 0.14
449 0.07
450 0.06
451 0.06
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.04
461 0.04
462 0.04
463 0.04
464 0.03
465 0.04
466 0.04
467 0.04
468 0.04
469 0.04
470 0.04
471 0.04
472 0.04
473 0.03
474 0.03
475 0.05
476 0.05
477 0.06
478 0.07
479 0.07
480 0.07
481 0.12
482 0.12
483 0.11
484 0.13
485 0.19
486 0.25
487 0.26
488 0.28
489 0.26
490 0.35
491 0.41
492 0.4
493 0.4
494 0.35
495 0.36
496 0.38
497 0.37
498 0.28
499 0.23
500 0.27
501 0.21
502 0.21
503 0.21
504 0.16
505 0.17
506 0.2
507 0.21
508 0.21
509 0.21
510 0.22
511 0.23
512 0.28
513 0.27
514 0.24
515 0.23
516 0.19
517 0.21
518 0.2
519 0.18
520 0.15
521 0.15
522 0.16
523 0.19
524 0.18
525 0.15
526 0.16
527 0.17
528 0.17
529 0.19
530 0.19
531 0.16
532 0.19
533 0.19
534 0.19
535 0.2
536 0.23
537 0.24
538 0.25
539 0.25