Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JSM5

Protein Details
Accession C4JSM5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-75FTKPPAPKSSSQTKKKPTQKRVKKEDEPPVPRRMSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
45-65PAPKSSSQTKKKPTQKRVKKE
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006974  P:DNA damage response  
KEGG ure:UREG_05464  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MPRVKDEPELSEFEKQRAANIAERDALLKKLALEAKSAGIFTKPPAPKSSSQTKKKPTQKRVKKEDEPPVPRRMSCRLRGLTADSEIAKRKAEEDYAAHKAAVEAKRLRVSGDLNLGDIVVGLGPGSTPRYQRTFGKEDVKNTTDKGLKALREKMSGLELWEPWEPNRIKITPERIYSMLFHPTESKPLVFAGDKVGNLGILDASQTPEENEEDEEDGYADPTITTIKPHSRTISAIYIHPSDSSKLYTASYDSSIRALDLEKSVATEAYAPASMSDDEPLSGVDMAPGDPHVLYFTTLDGYFGRHDVRAPNKSNPGGKSATSLYQLSEKKIGGFSLYPAQPHYIATASLDRTMKVWDLRQLSLKHPKPVAEHTSSLSVSHAAFNSRGQIATSSYDNTLKVYDLGAKGIKDWKPNHTLSDDLEPDTVIRHNCQTGKWVTM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.37
3 0.36
4 0.37
5 0.38
6 0.35
7 0.37
8 0.38
9 0.34
10 0.35
11 0.35
12 0.29
13 0.27
14 0.22
15 0.19
16 0.16
17 0.21
18 0.26
19 0.23
20 0.24
21 0.24
22 0.27
23 0.27
24 0.26
25 0.2
26 0.17
27 0.17
28 0.17
29 0.25
30 0.25
31 0.27
32 0.32
33 0.38
34 0.42
35 0.48
36 0.57
37 0.58
38 0.64
39 0.71
40 0.76
41 0.8
42 0.84
43 0.88
44 0.88
45 0.89
46 0.9
47 0.91
48 0.93
49 0.93
50 0.92
51 0.9
52 0.9
53 0.89
54 0.88
55 0.82
56 0.8
57 0.73
58 0.66
59 0.61
60 0.6
61 0.58
62 0.56
63 0.6
64 0.54
65 0.53
66 0.54
67 0.54
68 0.48
69 0.42
70 0.38
71 0.29
72 0.3
73 0.31
74 0.3
75 0.26
76 0.23
77 0.22
78 0.22
79 0.23
80 0.22
81 0.23
82 0.28
83 0.31
84 0.32
85 0.3
86 0.27
87 0.26
88 0.3
89 0.28
90 0.28
91 0.26
92 0.3
93 0.34
94 0.34
95 0.34
96 0.29
97 0.28
98 0.25
99 0.29
100 0.25
101 0.22
102 0.22
103 0.21
104 0.17
105 0.15
106 0.11
107 0.04
108 0.03
109 0.03
110 0.02
111 0.03
112 0.03
113 0.06
114 0.09
115 0.11
116 0.15
117 0.19
118 0.22
119 0.28
120 0.35
121 0.37
122 0.41
123 0.49
124 0.48
125 0.49
126 0.53
127 0.5
128 0.43
129 0.39
130 0.39
131 0.33
132 0.3
133 0.3
134 0.28
135 0.3
136 0.34
137 0.41
138 0.37
139 0.36
140 0.36
141 0.33
142 0.3
143 0.27
144 0.23
145 0.18
146 0.15
147 0.16
148 0.16
149 0.16
150 0.14
151 0.22
152 0.21
153 0.21
154 0.26
155 0.24
156 0.25
157 0.3
158 0.38
159 0.35
160 0.36
161 0.37
162 0.33
163 0.33
164 0.32
165 0.29
166 0.27
167 0.21
168 0.2
169 0.21
170 0.21
171 0.23
172 0.22
173 0.2
174 0.14
175 0.14
176 0.16
177 0.12
178 0.12
179 0.13
180 0.14
181 0.14
182 0.13
183 0.13
184 0.11
185 0.1
186 0.1
187 0.05
188 0.03
189 0.04
190 0.04
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.04
208 0.03
209 0.04
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.08
214 0.14
215 0.17
216 0.19
217 0.21
218 0.21
219 0.22
220 0.25
221 0.27
222 0.23
223 0.21
224 0.21
225 0.2
226 0.19
227 0.19
228 0.16
229 0.12
230 0.12
231 0.12
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.11
238 0.12
239 0.12
240 0.12
241 0.12
242 0.11
243 0.11
244 0.1
245 0.1
246 0.09
247 0.08
248 0.09
249 0.08
250 0.08
251 0.09
252 0.08
253 0.07
254 0.07
255 0.06
256 0.07
257 0.07
258 0.06
259 0.06
260 0.08
261 0.08
262 0.07
263 0.08
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.06
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.08
285 0.08
286 0.09
287 0.08
288 0.1
289 0.1
290 0.11
291 0.12
292 0.1
293 0.12
294 0.18
295 0.25
296 0.32
297 0.36
298 0.41
299 0.46
300 0.5
301 0.54
302 0.49
303 0.46
304 0.41
305 0.36
306 0.34
307 0.29
308 0.28
309 0.25
310 0.24
311 0.2
312 0.25
313 0.26
314 0.25
315 0.27
316 0.25
317 0.24
318 0.24
319 0.23
320 0.18
321 0.17
322 0.16
323 0.2
324 0.21
325 0.2
326 0.21
327 0.22
328 0.2
329 0.2
330 0.2
331 0.13
332 0.12
333 0.14
334 0.17
335 0.16
336 0.21
337 0.21
338 0.19
339 0.19
340 0.21
341 0.22
342 0.21
343 0.23
344 0.25
345 0.28
346 0.3
347 0.37
348 0.37
349 0.42
350 0.5
351 0.52
352 0.52
353 0.5
354 0.52
355 0.49
356 0.55
357 0.55
358 0.49
359 0.46
360 0.42
361 0.44
362 0.4
363 0.36
364 0.28
365 0.22
366 0.18
367 0.19
368 0.17
369 0.15
370 0.16
371 0.16
372 0.2
373 0.19
374 0.19
375 0.16
376 0.17
377 0.17
378 0.19
379 0.2
380 0.18
381 0.2
382 0.22
383 0.21
384 0.21
385 0.19
386 0.17
387 0.16
388 0.15
389 0.18
390 0.17
391 0.2
392 0.22
393 0.21
394 0.23
395 0.31
396 0.33
397 0.36
398 0.39
399 0.43
400 0.48
401 0.5
402 0.52
403 0.48
404 0.47
405 0.42
406 0.47
407 0.41
408 0.35
409 0.33
410 0.28
411 0.25
412 0.24
413 0.25
414 0.18
415 0.19
416 0.22
417 0.28
418 0.3
419 0.31
420 0.37