FuNGI

C4JWW1

Protein Details

Accession

C4JWW1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
16-43	QARNAPTNPPRRRQSHNIRSNPARQNMT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1228-1239	AGKRGGLGVKRG

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto 4, pero 3, cyto_mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003107 HAT IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR034397 Prp24_RRM1 IPR034398 Prp24_RRM2 IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR031766 RRM_occluded IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0006396 P:RNA processing
KEGG	ure:UREG_06134 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1 PF16842 RRM_occluded
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12296 RRM1_Prp24 cd12297 RRM2_Prp24 cd12299 RRM4_Prp24

Amino Acid Sequences

MDINSLLSHDAAPANQARNAPTNPPRRRQSHNIRSNPARQNMTSSPLVHQVLTPSNLRDSSPPTRSPVVGPVRSSGATPPSADLPPTRQASTPGMDTLADLASMQQHQPQRSNAPRLRNTESYESQLSPSTMYPNVPPVAHTTPTPRPYEKAMSDGSGDSPRRDYSNTCLNPDARKQATELCAEIQRNPHAYDCRVKFIKLLHQGFVDHVYPPSSPGSRGDPHRYDVLRDLRAAREELDNLFAIGEDLWVEWIQDESLLARTVEERISVMELCQRSVEEEFGSTKLWIIYGDWMLYLYDAASKPGETASQGQWTEEDKTVGREVFSWQSVMEVWRKGAEATRWHINDSHLVWNRYLELAMRELASSPTPDKASQVRGLFESRLQTPHLAWDQTFQIFSNFVSTYYNASYEDTMVSTNAKAGDIKATCDAREPNELALQRAVESGDTAAEWSAYTQYLDFETSHKHKKPIFGFQLRTALYQRALLRFPTDANLWDDYVISVVSESMHHHVNEPVIPIIERAARHCPWSGSLWSQLLLSAERAGYSFQEISDLKHKATRTGLLEAAGVAEVLKVHTTWCSYLRRLPFQSNSTDEDLDVAEVGMRSAIESVQAIGDRGDKAVPNDPLFRLERIYIRYLSETGSWDSARETFKGLVSRHGHSYEFWLMFYNWELLCWSKFTQGDGPRKAPSPHYATAVLKQALQKEDLDWPEKIMDTYIAHCEQYEDAEELQLAIVEIRQVAKRVAKRREKEALEVATQQQATVAQAVQEAQHNVEEAAAHAGKRKRESADINGVASKKPKAEVSEAKSTEHDAVQSLPKRDRENSTVSVKNLPKDVPILKIRQFFRDCGKINSLKLIPADGNSASAIVEFDTKEDAEAAQTRDQKVLEGRTISVQLETKATLFVTNFPPEADEAYIRRIFGPYGEIAEVRFPSLKFNTHRRFCYVQFASTVDAHAALELDQEPVGENLHLVVKISDPSKRQARSGAFEEGREIHISNLDWKATEDDLVELFMAFGKVEVARIPTKADGGSKGFGFVAFSTPETANAALAMDQKEFRSRPLRVKLSSHTGAKRYSTAILSRIGRSKSPSMEPNGGASPASAAISQGDLPVGEKKLRTLGLMNIPDTVNDSRIRTLVEPYGPLVKIILRPDHQGAMVEFRDVGDAGKAALGLDGREIAPGRRIHVGPVSEMLKQPAEHKVDRLEVGKQKQNQKPTLMTQPAAPIMRPGQQGRAGKRGGLGVKRGAFKGKTTTADNTGGREGGHLNDGGTATHEGASTQAPKSKSNDDFRAMLGQTKAKPAGA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.24
3	0.26
4	0.28
5	0.33
6	0.36
7	0.41
8	0.45
9	0.53
10	0.58
11	0.66
12	0.72
13	0.71
14	0.77
15	0.79
16	0.81
17	0.81
18	0.83
19	0.83
20	0.84
21	0.86
22	0.87
23	0.85
24	0.81
25	0.76
26	0.66
27	0.64
28	0.58
29	0.56
30	0.5
31	0.43
32	0.38
33	0.39
34	0.4
35	0.32
36	0.3
37	0.29
38	0.3
39	0.31
40	0.31
41	0.26
42	0.29
43	0.29
44	0.3
45	0.29
46	0.31
47	0.37
48	0.41
49	0.42
50	0.44
51	0.46
52	0.46
53	0.45
54	0.47
55	0.48
56	0.46
57	0.44
58	0.41
59	0.41
60	0.4
61	0.38
62	0.32
63	0.27
64	0.25
65	0.24
66	0.23
67	0.23
68	0.24
69	0.25
70	0.24
71	0.25
72	0.3
73	0.33
74	0.33
75	0.3
76	0.33
77	0.37
78	0.37
79	0.34
80	0.28
81	0.25
82	0.23
83	0.22
84	0.2
85	0.15
86	0.11
87	0.09
88	0.08
89	0.1
90	0.12
91	0.13
92	0.17
93	0.22
94	0.26
95	0.32
96	0.36
97	0.43
98	0.5
99	0.6
100	0.6
101	0.65
102	0.68
103	0.7
104	0.73
105	0.68
106	0.65
107	0.63
108	0.6
109	0.56
110	0.52
111	0.46
112	0.4
113	0.37
114	0.32
115	0.25
116	0.23
117	0.22
118	0.19
119	0.2
120	0.2
121	0.23
122	0.24
123	0.23
124	0.22
125	0.25
126	0.28
127	0.28
128	0.28
129	0.3
130	0.36
131	0.42
132	0.47
133	0.43
134	0.41
135	0.46
136	0.52
137	0.47
138	0.43
139	0.4
140	0.36
141	0.35
142	0.33
143	0.3
144	0.3
145	0.29
146	0.26
147	0.27
148	0.27
149	0.27
150	0.29
151	0.29
152	0.27
153	0.37
154	0.38
155	0.39
156	0.42
157	0.43
158	0.46
159	0.49
160	0.52
161	0.43
162	0.41
163	0.39
164	0.41
165	0.42
166	0.38
167	0.34
168	0.28
169	0.32
170	0.32
171	0.33
172	0.32
173	0.33
174	0.33
175	0.33
176	0.35
177	0.34
178	0.37
179	0.44
180	0.42
181	0.46
182	0.45
183	0.43
184	0.41
185	0.41
186	0.46
187	0.47
188	0.47
189	0.4
190	0.4
191	0.4
192	0.38
193	0.37
194	0.29
195	0.19
196	0.17
197	0.16
198	0.15
199	0.16
200	0.19
201	0.17
202	0.17
203	0.19
204	0.24
205	0.29
206	0.36
207	0.43
208	0.42
209	0.43
210	0.5
211	0.48
212	0.44
213	0.47
214	0.47
215	0.41
216	0.4
217	0.4
218	0.36
219	0.37
220	0.35
221	0.29
222	0.24
223	0.23
224	0.22
225	0.22
226	0.18
227	0.16
228	0.15
229	0.13
230	0.1
231	0.08
232	0.07
233	0.05
234	0.05
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.06
240	0.06
241	0.06
242	0.06
243	0.06
244	0.08
245	0.09
246	0.08
247	0.08
248	0.09
249	0.11
250	0.12
251	0.11
252	0.1
253	0.1
254	0.12
255	0.11
256	0.11
257	0.15
258	0.15
259	0.15
260	0.16
261	0.15
262	0.15
263	0.16
264	0.17
265	0.12
266	0.13
267	0.14
268	0.14
269	0.15
270	0.13
271	0.13
272	0.11
273	0.11
274	0.09
275	0.09
276	0.11
277	0.11
278	0.12
279	0.1
280	0.11
281	0.1
282	0.1
283	0.09
284	0.06
285	0.08
286	0.08
287	0.1
288	0.1
289	0.1
290	0.11
291	0.11
292	0.12
293	0.1
294	0.13
295	0.14
296	0.21
297	0.21
298	0.2
299	0.21
300	0.23
301	0.25
302	0.23
303	0.22
304	0.16
305	0.19
306	0.21
307	0.2
308	0.18
309	0.15
310	0.18
311	0.19
312	0.19
313	0.17
314	0.14
315	0.14
316	0.15
317	0.17
318	0.17
319	0.15
320	0.14
321	0.15
322	0.16
323	0.16
324	0.19
325	0.21
326	0.23
327	0.26
328	0.34
329	0.33
330	0.34
331	0.36
332	0.33
333	0.33
334	0.3
335	0.35
336	0.33
337	0.34
338	0.33
339	0.32
340	0.31
341	0.27
342	0.24
343	0.15
344	0.11
345	0.11
346	0.12
347	0.11
348	0.1
349	0.11
350	0.12
351	0.11
352	0.12
353	0.11
354	0.13
355	0.15
356	0.15
357	0.17
358	0.2
359	0.24
360	0.28
361	0.29
362	0.27
363	0.27
364	0.29
365	0.27
366	0.26
367	0.24
368	0.2
369	0.2
370	0.2
371	0.19
372	0.17
373	0.22
374	0.23
375	0.21
376	0.19
377	0.2
378	0.21
379	0.2
380	0.2
381	0.15
382	0.13
383	0.12
384	0.12
385	0.13
386	0.11
387	0.1
388	0.12
389	0.12
390	0.14
391	0.14
392	0.15
393	0.12
394	0.13
395	0.13
396	0.12
397	0.12
398	0.09
399	0.09
400	0.08
401	0.09
402	0.08
403	0.09
404	0.08
405	0.08
406	0.08
407	0.08
408	0.14
409	0.14
410	0.16
411	0.19
412	0.2
413	0.19
414	0.23
415	0.24
416	0.2
417	0.24
418	0.24
419	0.2
420	0.24
421	0.24
422	0.22
423	0.21
424	0.19
425	0.14
426	0.14
427	0.13
428	0.08
429	0.08
430	0.06
431	0.06
432	0.05
433	0.05
434	0.04
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.05
439	0.05
440	0.06
441	0.05
442	0.06
443	0.07
444	0.08
445	0.08
446	0.09
447	0.15
448	0.2
449	0.28
450	0.31
451	0.35
452	0.37
453	0.44
454	0.48
455	0.52
456	0.56
457	0.55
458	0.55
459	0.53
460	0.57
461	0.5
462	0.47
463	0.39
464	0.31
465	0.24
466	0.25
467	0.24
468	0.2
469	0.21
470	0.19
471	0.19
472	0.18
473	0.18
474	0.15
475	0.14
476	0.13
477	0.15
478	0.16
479	0.14
480	0.13
481	0.13
482	0.11
483	0.1
484	0.08
485	0.05
486	0.04
487	0.04
488	0.04
489	0.04
490	0.06
491	0.07
492	0.1
493	0.1
494	0.11
495	0.12
496	0.13
497	0.14
498	0.13
499	0.12
500	0.1
501	0.1
502	0.09
503	0.09
504	0.11
505	0.1
506	0.12
507	0.17
508	0.18
509	0.2
510	0.21
511	0.2
512	0.19
513	0.22
514	0.22
515	0.18
516	0.2
517	0.18
518	0.17
519	0.17
520	0.15
521	0.13
522	0.11
523	0.1
524	0.08
525	0.07
526	0.07
527	0.07
528	0.07
529	0.06
530	0.08
531	0.07
532	0.06
533	0.1
534	0.1
535	0.13
536	0.19
537	0.19
538	0.18
539	0.21
540	0.22
541	0.21
542	0.22
543	0.25
544	0.21
545	0.22
546	0.23
547	0.2
548	0.19
549	0.16
550	0.15
551	0.1
552	0.07
553	0.04
554	0.04
555	0.03
556	0.03
557	0.03
558	0.03
559	0.04
560	0.05
561	0.06
562	0.07
563	0.12
564	0.15
565	0.17
566	0.22
567	0.26
568	0.31
569	0.33
570	0.37
571	0.37
572	0.35
573	0.38
574	0.35
575	0.35
576	0.31
577	0.28
578	0.23
579	0.19
580	0.17
581	0.13
582	0.1
583	0.06
584	0.04
585	0.04
586	0.04
587	0.03
588	0.03
589	0.03
590	0.03
591	0.03
592	0.03
593	0.04
594	0.04
595	0.04
596	0.05
597	0.05
598	0.05
599	0.07
600	0.06
601	0.07
602	0.07
603	0.07
604	0.09
605	0.14
606	0.15
607	0.16
608	0.17
609	0.17
610	0.2
611	0.21
612	0.2
613	0.16
614	0.16
615	0.17
616	0.18
617	0.2
618	0.17
619	0.17
620	0.17
621	0.16
622	0.16
623	0.14
624	0.13
625	0.12
626	0.12
627	0.11
628	0.11
629	0.11
630	0.13
631	0.13
632	0.11
633	0.12
634	0.11
635	0.13
636	0.18
637	0.18
638	0.23
639	0.25
640	0.26
641	0.27
642	0.27
643	0.26
644	0.21
645	0.25
646	0.21
647	0.19
648	0.17
649	0.16
650	0.15
651	0.15
652	0.15
653	0.13
654	0.09
655	0.09
656	0.09
657	0.08
658	0.09
659	0.1
660	0.1
661	0.12
662	0.12
663	0.14
664	0.2
665	0.27
666	0.35
667	0.37
668	0.38
669	0.36
670	0.38
671	0.38
672	0.34
673	0.31
674	0.3
675	0.27
676	0.28
677	0.29
678	0.27
679	0.29
680	0.31
681	0.26
682	0.21
683	0.22
684	0.22
685	0.2
686	0.2
687	0.18
688	0.15
689	0.19
690	0.19
691	0.2
692	0.17
693	0.17
694	0.16
695	0.16
696	0.15
697	0.1
698	0.1
699	0.08
700	0.09
701	0.12
702	0.12
703	0.12
704	0.11
705	0.12
706	0.11
707	0.11
708	0.1
709	0.08
710	0.07
711	0.08
712	0.08
713	0.07
714	0.06
715	0.06
716	0.04
717	0.03
718	0.03
719	0.03
720	0.03
721	0.05
722	0.06
723	0.07
724	0.09
725	0.14
726	0.2
727	0.29
728	0.39
729	0.47
730	0.49
731	0.56
732	0.63
733	0.59
734	0.57
735	0.54
736	0.47
737	0.4
738	0.39
739	0.32
740	0.27
741	0.24
742	0.2
743	0.14
744	0.12
745	0.1
746	0.09
747	0.08
748	0.05
749	0.06
750	0.06
751	0.07
752	0.08
753	0.08
754	0.08
755	0.08
756	0.08
757	0.08
758	0.08
759	0.07
760	0.06
761	0.08
762	0.08
763	0.08
764	0.13
765	0.16
766	0.19
767	0.22
768	0.25
769	0.24
770	0.29
771	0.34
772	0.35
773	0.42
774	0.4
775	0.38
776	0.37
777	0.36
778	0.31
779	0.29
780	0.24
781	0.15
782	0.15
783	0.17
784	0.17
785	0.24
786	0.31
787	0.34
788	0.42
789	0.42
790	0.42
791	0.4
792	0.38
793	0.33
794	0.25
795	0.2
796	0.11
797	0.12
798	0.17
799	0.21
800	0.23
801	0.26
802	0.29
803	0.32
804	0.35
805	0.38
806	0.36
807	0.38
808	0.4
809	0.42
810	0.41
811	0.39
812	0.44
813	0.41
814	0.38
815	0.35
816	0.3
817	0.25
818	0.26
819	0.26
820	0.24
821	0.26
822	0.29
823	0.32
824	0.38
825	0.38
826	0.42
827	0.43
828	0.39
829	0.41
830	0.45
831	0.42
832	0.39
833	0.44
834	0.4
835	0.38
836	0.41
837	0.36
838	0.29
839	0.28
840	0.25
841	0.19
842	0.16
843	0.17
844	0.12
845	0.12
846	0.1
847	0.1
848	0.08
849	0.08
850	0.07
851	0.05
852	0.06
853	0.06
854	0.06
855	0.07
856	0.07
857	0.07
858	0.08
859	0.07
860	0.08
861	0.11
862	0.13
863	0.17
864	0.21
865	0.22
866	0.24
867	0.24
868	0.24
869	0.24
870	0.25
871	0.22
872	0.2
873	0.2
874	0.2
875	0.21
876	0.2
877	0.18
878	0.16
879	0.14
880	0.14
881	0.13
882	0.12
883	0.11
884	0.11
885	0.1
886	0.1
887	0.12
888	0.15
889	0.17
890	0.17
891	0.16
892	0.17
893	0.15
894	0.16
895	0.14
896	0.12
897	0.11
898	0.16
899	0.17
900	0.17
901	0.17
902	0.16
903	0.15
904	0.13
905	0.15
906	0.1
907	0.12
908	0.12
909	0.12
910	0.11
911	0.14
912	0.13
913	0.12
914	0.14
915	0.11
916	0.16
917	0.18
918	0.24
919	0.27
920	0.37
921	0.46
922	0.5
923	0.53
924	0.54
925	0.57
926	0.52
927	0.57
928	0.49
929	0.41
930	0.36
931	0.35
932	0.31
933	0.27
934	0.25
935	0.15
936	0.13
937	0.11
938	0.09
939	0.08
940	0.05
941	0.06
942	0.06
943	0.07
944	0.06
945	0.06
946	0.07
947	0.07
948	0.08
949	0.06
950	0.06
951	0.06
952	0.08
953	0.08
954	0.07
955	0.08
956	0.08
957	0.11
958	0.12
959	0.16
960	0.17
961	0.24
962	0.31
963	0.33
964	0.34
965	0.39
966	0.42
967	0.43
968	0.46
969	0.48
970	0.41
971	0.39
972	0.4
973	0.33
974	0.3
975	0.26
976	0.22
977	0.13
978	0.15
979	0.15
980	0.17
981	0.18
982	0.17
983	0.16
984	0.16
985	0.18
986	0.16
987	0.17
988	0.12
989	0.11
990	0.11
991	0.11
992	0.1
993	0.07
994	0.07
995	0.06
996	0.06
997	0.05
998	0.05
999	0.05
1000	0.05
1001	0.06
1002	0.07
1003	0.11
1004	0.12
1005	0.13
1006	0.15
1007	0.15
1008	0.16
1009	0.17
1010	0.18
1011	0.18
1012	0.2
1013	0.22
1014	0.19
1015	0.2
1016	0.18
1017	0.17
1018	0.16
1019	0.13
1020	0.12
1021	0.11
1022	0.11
1023	0.14
1024	0.14
1025	0.14
1026	0.15
1027	0.14
1028	0.12
1029	0.11
1030	0.1
1031	0.09
1032	0.12
1033	0.13
1034	0.12
1035	0.13
1036	0.15
1037	0.21
1038	0.21
1039	0.25
1040	0.3
1041	0.33
1042	0.41
1043	0.51
1044	0.57
1045	0.55
1046	0.6
1047	0.6
1048	0.61
1049	0.62
1050	0.59
1051	0.55
1052	0.51
1053	0.5
1054	0.47
1055	0.44
1056	0.37
1057	0.34
1058	0.3
1059	0.28
1060	0.26
1061	0.29
1062	0.3
1063	0.31
1064	0.35
1065	0.35
1066	0.34
1067	0.36
1068	0.39
1069	0.38
1070	0.41
1071	0.43
1072	0.43
1073	0.46
1074	0.45
1075	0.43
1076	0.39
1077	0.35
1078	0.29
1079	0.23
1080	0.17
1081	0.12
1082	0.12
1083	0.09
1084	0.07
1085	0.07
1086	0.08
1087	0.09
1088	0.08
1089	0.07
1090	0.07
1091	0.08
1092	0.12
1093	0.14
1094	0.16
1095	0.16
1096	0.17
1097	0.22
1098	0.23
1099	0.24
1100	0.22
1101	0.26
1102	0.32
1103	0.35
1104	0.34
1105	0.32
1106	0.31
1107	0.29
1108	0.31
1109	0.25
1110	0.19
1111	0.19
1112	0.2
1113	0.2
1114	0.21
1115	0.23
1116	0.2
1117	0.23
1118	0.25
1119	0.25
1120	0.24
1121	0.24
1122	0.29
1123	0.27
1124	0.25
1125	0.22
1126	0.2
1127	0.22
1128	0.25
1129	0.3
1130	0.26
1131	0.3
1132	0.33
1133	0.34
1134	0.32
1135	0.3
1136	0.26
1137	0.26
1138	0.25
1139	0.21
1140	0.18
1141	0.16
1142	0.17
1143	0.14
1144	0.14
1145	0.08
1146	0.08
1147	0.08
1148	0.08
1149	0.08
1150	0.07
1151	0.08
1152	0.08
1153	0.07
1154	0.08
1155	0.09
1156	0.08
1157	0.11
1158	0.12
1159	0.12
1160	0.18
1161	0.19
1162	0.21
1163	0.26
1164	0.26
1165	0.27
1166	0.33
1167	0.33
1168	0.28
1169	0.32
1170	0.32
1171	0.28
1172	0.29
1173	0.28
1174	0.25
1175	0.24
1176	0.26
1177	0.29
1178	0.33
1179	0.32
1180	0.35
1181	0.37
1182	0.38
1183	0.41
1184	0.4
1185	0.4
1186	0.42
1187	0.48
1188	0.52
1189	0.54
1190	0.61
1191	0.64
1192	0.71
1193	0.69
1194	0.67
1195	0.66
1196	0.64
1197	0.67
1198	0.62
1199	0.56
1200	0.49
1201	0.48
1202	0.47
1203	0.42
1204	0.36
1205	0.3
1206	0.27
1207	0.33
1208	0.35
1209	0.33
1210	0.33
1211	0.4
1212	0.47
1213	0.49
1214	0.54
1215	0.48
1216	0.45
1217	0.45
1218	0.45
1219	0.44
1220	0.42
1221	0.41
1222	0.4
1223	0.45
1224	0.47
1225	0.47
1226	0.48
1227	0.43
1228	0.41
1229	0.44
1230	0.43
1231	0.42
1232	0.43
1233	0.47
1234	0.45
1235	0.51
1236	0.48
1237	0.44
1238	0.39
1239	0.36
1240	0.31
1241	0.27
1242	0.23
1243	0.18
1244	0.19
1245	0.16
1246	0.14
1247	0.15
1248	0.16
1249	0.14
1250	0.15
1251	0.15
1252	0.13
1253	0.14
1254	0.14
1255	0.11
1256	0.12
1257	0.17
1258	0.18
1259	0.19
1260	0.24
1261	0.25
1262	0.29
1263	0.35
1264	0.43
1265	0.47
1266	0.53
1267	0.57
1268	0.56
1269	0.55
1270	0.53
1271	0.55
1272	0.46
1273	0.43
1274	0.38
1275	0.37
1276	0.35
1277	0.4

C4JWW1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer