FuNGI

A0A0A2L9F6

Protein Details

Accession

A0A0A2L9F6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-24	MPSQKTEHKRKRSVDNDRPSKKPA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
470-497	GRAEAHARRVARLRVPVEFPKVSRGGRK

Subcellular Location(s)

mito 14.5, cyto_mito 10.666, cyto_nucl 7.333, nucl 7, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009668 RNA_pol-assoc_fac_A49-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF06870 RNA_pol_I_A49

Amino Acid Sequences

MPSQKTEHKRKRSVDNDRPSKKPALHQLPPLAASVVEDKSELAPVIADTPGLQSSKSLHWNPYIKSRPNVSKSAVSTRNPGIVSSEILLQSSDHAKLDFVGREGTGDDTDSQVKHYVAVIDPERKTWKVVEVRRATLRGAVRSRKPEEDSDDEMNTMRAQRTALTNTFGTKQSRKAVQSMAENAQLSNAPAGAVPQAGAALISSLPANTASGLAKALAMQAEVQAAKPLPTPNLAVSHPSDVYTIETLVPGSHSTLSQLNGVDEWKTQVEAGLGVTTVSRYVSNRVGAVVNSDNTTHLQVLRFIQLLIEFGRCLKHAGANAKSGGPGSKRLPPREDLRRILSNTTGAATTKPKPGAAAETASTDLLPESVIDAVRRRFAPSGGYVSKNDFTLLHTTICALSLHIPPQPARDGGSSSLGGNAPNELATDPSDLRDDLRLDPNTIHQYFRELGCRIDKPRETEFAKWNIKGGRAEAHARRVARLRVPVEFPKVSRGGRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.88
2	0.89
3	0.89
4	0.86
5	0.83
6	0.78
7	0.75
8	0.69
9	0.66
10	0.66
11	0.65
12	0.65
13	0.68
14	0.69
15	0.65
16	0.61
17	0.53
18	0.43
19	0.32
20	0.27
21	0.24
22	0.18
23	0.15
24	0.14
25	0.14
26	0.14
27	0.15
28	0.14
29	0.09
30	0.09
31	0.09
32	0.11
33	0.1
34	0.09
35	0.08
36	0.1
37	0.12
38	0.12
39	0.12
40	0.11
41	0.15
42	0.21
43	0.28
44	0.3
45	0.31
46	0.39
47	0.45
48	0.47
49	0.54
50	0.58
51	0.56
52	0.58
53	0.63
54	0.65
55	0.64
56	0.66
57	0.6
58	0.58
59	0.56
60	0.6
61	0.59
62	0.51
63	0.51
64	0.48
65	0.49
66	0.42
67	0.37
68	0.31
69	0.25
70	0.25
71	0.2
72	0.21
73	0.15
74	0.15
75	0.15
76	0.12
77	0.13
78	0.14
79	0.14
80	0.12
81	0.12
82	0.12
83	0.13
84	0.17
85	0.16
86	0.15
87	0.15
88	0.14
89	0.14
90	0.15
91	0.16
92	0.12
93	0.11
94	0.11
95	0.11
96	0.14
97	0.13
98	0.14
99	0.15
100	0.15
101	0.14
102	0.15
103	0.15
104	0.14
105	0.19
106	0.21
107	0.26
108	0.27
109	0.29
110	0.33
111	0.31
112	0.32
113	0.28
114	0.32
115	0.35
116	0.41
117	0.47
118	0.48
119	0.53
120	0.55
121	0.55
122	0.47
123	0.44
124	0.41
125	0.38
126	0.4
127	0.42
128	0.44
129	0.51
130	0.55
131	0.54
132	0.54
133	0.51
134	0.5
135	0.49
136	0.48
137	0.44
138	0.4
139	0.35
140	0.32
141	0.28
142	0.22
143	0.18
144	0.13
145	0.1
146	0.1
147	0.11
148	0.15
149	0.19
150	0.2
151	0.2
152	0.2
153	0.21
154	0.23
155	0.25
156	0.26
157	0.24
158	0.28
159	0.31
160	0.37
161	0.37
162	0.37
163	0.37
164	0.37
165	0.38
166	0.38
167	0.34
168	0.31
169	0.29
170	0.26
171	0.23
172	0.19
173	0.15
174	0.11
175	0.08
176	0.05
177	0.05
178	0.06
179	0.05
180	0.05
181	0.05
182	0.04
183	0.04
184	0.04
185	0.04
186	0.03
187	0.03
188	0.03
189	0.03
190	0.03
191	0.03
192	0.04
193	0.04
194	0.04
195	0.04
196	0.05
197	0.05
198	0.06
199	0.06
200	0.06
201	0.06
202	0.06
203	0.06
204	0.05
205	0.05
206	0.04
207	0.05
208	0.06
209	0.06
210	0.06
211	0.06
212	0.07
213	0.07
214	0.09
215	0.09
216	0.09
217	0.1
218	0.12
219	0.12
220	0.14
221	0.14
222	0.15
223	0.15
224	0.16
225	0.15
226	0.14
227	0.13
228	0.11
229	0.12
230	0.1
231	0.09
232	0.07
233	0.07
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.05
238	0.06
239	0.06
240	0.05
241	0.07
242	0.08
243	0.09
244	0.1
245	0.1
246	0.09
247	0.09
248	0.1
249	0.09
250	0.08
251	0.08
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.07
256	0.06
257	0.06
258	0.06
259	0.05
260	0.05
261	0.04
262	0.05
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.05
267	0.06
268	0.09
269	0.11
270	0.12
271	0.13
272	0.14
273	0.14
274	0.13
275	0.15
276	0.14
277	0.12
278	0.12
279	0.12
280	0.11
281	0.11
282	0.13
283	0.1
284	0.1
285	0.1
286	0.11
287	0.13
288	0.14
289	0.13
290	0.12
291	0.12
292	0.1
293	0.11
294	0.1
295	0.09
296	0.07
297	0.07
298	0.08
299	0.08
300	0.1
301	0.1
302	0.12
303	0.15
304	0.22
305	0.24
306	0.26
307	0.27
308	0.25
309	0.25
310	0.22
311	0.21
312	0.16
313	0.18
314	0.18
315	0.25
316	0.31
317	0.35
318	0.38
319	0.4
320	0.46
321	0.52
322	0.57
323	0.54
324	0.54
325	0.55
326	0.54
327	0.51
328	0.45
329	0.36
330	0.28
331	0.25
332	0.19
333	0.13
334	0.14
335	0.16
336	0.18
337	0.22
338	0.23
339	0.22
340	0.22
341	0.23
342	0.26
343	0.24
344	0.23
345	0.18
346	0.19
347	0.19
348	0.18
349	0.17
350	0.12
351	0.09
352	0.07
353	0.06
354	0.04
355	0.04
356	0.06
357	0.07
358	0.08
359	0.12
360	0.14
361	0.18
362	0.18
363	0.2
364	0.21
365	0.21
366	0.24
367	0.23
368	0.3
369	0.3
370	0.32
371	0.3
372	0.33
373	0.34
374	0.3
375	0.27
376	0.2
377	0.18
378	0.2
379	0.21
380	0.17
381	0.16
382	0.16
383	0.16
384	0.16
385	0.14
386	0.1
387	0.12
388	0.14
389	0.16
390	0.17
391	0.2
392	0.19
393	0.23
394	0.25
395	0.22
396	0.22
397	0.21
398	0.22
399	0.22
400	0.25
401	0.22
402	0.19
403	0.21
404	0.19
405	0.17
406	0.15
407	0.14
408	0.1
409	0.1
410	0.1
411	0.08
412	0.09
413	0.1
414	0.13
415	0.12
416	0.13
417	0.15
418	0.15
419	0.16
420	0.19
421	0.2
422	0.21
423	0.28
424	0.29
425	0.29
426	0.3
427	0.35
428	0.4
429	0.38
430	0.36
431	0.28
432	0.31
433	0.32
434	0.34
435	0.34
436	0.27
437	0.29
438	0.35
439	0.41
440	0.41
441	0.48
442	0.49
443	0.49
444	0.53
445	0.58
446	0.55
447	0.56
448	0.58
449	0.59
450	0.62
451	0.56
452	0.57
453	0.52
454	0.53
455	0.49
456	0.44
457	0.4
458	0.37
459	0.45
460	0.45
461	0.49
462	0.49
463	0.48
464	0.5
465	0.51
466	0.53
467	0.51
468	0.54
469	0.49
470	0.49
471	0.55
472	0.57
473	0.57
474	0.55
475	0.5
476	0.49
477	0.51

A0A0A2L9F6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer