Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JJ84

Protein Details
Accession C4JJ84    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
199-225RSWHDTEKADRQKKKRKLDEASKPTEPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
210-215QKKKRK
Subcellular Location(s) cyto 10, nucl 8, mito 4, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007832  RNA_pol_Rpc34  
IPR016049  RNA_pol_Rpc34-like  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
KEGG ure:UREG_01691  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05158  RNA_pol_Rpc34  
Amino Acid Sequences MASSSSAGPKAKAAKDVNELASAIYDKCISDFSSDHLFYQHDLLGLGVIPNNDLALLMKCAQSLVDQSLFRMLHGKDDRLAWKVVEQSDAEKLQNLNAEERMVYNVIHSTGRQGVWTKTIKARTNLHQTIMNRCLKSLEAKNYIKSVRNVKYPQRKIYMLAGLQPSEEVTGGAWFTDGILDADFIHSLGVWIERWISARSWHDTEKADRQKKKRKLDEASKPTEPQYLPYLPTYTGYPTVTDITKAINASGLTPVTLGEGSIAQLLEMLCYDGRLVSLRDGAAYKSVKKPNQISLQRELGFQGPGADKGTSDQDQLALGSNGMTEVPCGRCPVFSLCHEGGPINAENCEYFQEWLKEALSF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.48
3 0.53
4 0.5
5 0.43
6 0.4
7 0.32
8 0.29
9 0.25
10 0.18
11 0.14
12 0.13
13 0.11
14 0.12
15 0.13
16 0.12
17 0.14
18 0.14
19 0.17
20 0.25
21 0.26
22 0.25
23 0.26
24 0.25
25 0.23
26 0.25
27 0.22
28 0.14
29 0.13
30 0.13
31 0.11
32 0.11
33 0.1
34 0.09
35 0.08
36 0.08
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.06
41 0.07
42 0.07
43 0.1
44 0.11
45 0.12
46 0.12
47 0.12
48 0.12
49 0.12
50 0.13
51 0.14
52 0.18
53 0.17
54 0.18
55 0.24
56 0.24
57 0.23
58 0.26
59 0.22
60 0.27
61 0.3
62 0.32
63 0.27
64 0.32
65 0.35
66 0.32
67 0.33
68 0.24
69 0.23
70 0.27
71 0.25
72 0.23
73 0.21
74 0.2
75 0.24
76 0.25
77 0.23
78 0.21
79 0.2
80 0.19
81 0.23
82 0.21
83 0.19
84 0.18
85 0.18
86 0.16
87 0.16
88 0.16
89 0.12
90 0.11
91 0.1
92 0.1
93 0.11
94 0.11
95 0.1
96 0.11
97 0.14
98 0.14
99 0.15
100 0.16
101 0.16
102 0.22
103 0.25
104 0.26
105 0.29
106 0.36
107 0.39
108 0.42
109 0.46
110 0.47
111 0.55
112 0.53
113 0.49
114 0.47
115 0.44
116 0.45
117 0.48
118 0.46
119 0.35
120 0.34
121 0.33
122 0.29
123 0.34
124 0.32
125 0.32
126 0.35
127 0.37
128 0.38
129 0.41
130 0.43
131 0.41
132 0.39
133 0.41
134 0.36
135 0.42
136 0.46
137 0.51
138 0.59
139 0.61
140 0.63
141 0.59
142 0.56
143 0.5
144 0.5
145 0.45
146 0.35
147 0.32
148 0.27
149 0.22
150 0.21
151 0.19
152 0.14
153 0.1
154 0.09
155 0.05
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.12
185 0.15
186 0.18
187 0.21
188 0.22
189 0.23
190 0.25
191 0.28
192 0.35
193 0.42
194 0.47
195 0.51
196 0.6
197 0.67
198 0.74
199 0.81
200 0.8
201 0.8
202 0.81
203 0.84
204 0.85
205 0.83
206 0.8
207 0.72
208 0.64
209 0.56
210 0.52
211 0.41
212 0.33
213 0.29
214 0.25
215 0.24
216 0.24
217 0.24
218 0.19
219 0.2
220 0.18
221 0.15
222 0.15
223 0.14
224 0.13
225 0.13
226 0.15
227 0.14
228 0.14
229 0.13
230 0.11
231 0.13
232 0.12
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.12
238 0.11
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.08
243 0.07
244 0.06
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.07
249 0.06
250 0.05
251 0.07
252 0.07
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.05
257 0.06
258 0.06
259 0.05
260 0.06
261 0.07
262 0.08
263 0.09
264 0.11
265 0.11
266 0.12
267 0.13
268 0.13
269 0.18
270 0.19
271 0.22
272 0.28
273 0.37
274 0.39
275 0.46
276 0.5
277 0.53
278 0.61
279 0.65
280 0.62
281 0.61
282 0.65
283 0.58
284 0.54
285 0.47
286 0.38
287 0.3
288 0.24
289 0.22
290 0.16
291 0.16
292 0.18
293 0.16
294 0.14
295 0.16
296 0.21
297 0.18
298 0.18
299 0.17
300 0.16
301 0.16
302 0.17
303 0.17
304 0.12
305 0.11
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.08
310 0.08
311 0.06
312 0.1
313 0.13
314 0.14
315 0.18
316 0.18
317 0.18
318 0.22
319 0.26
320 0.28
321 0.27
322 0.34
323 0.32
324 0.33
325 0.33
326 0.3
327 0.26
328 0.25
329 0.26
330 0.18
331 0.17
332 0.17
333 0.17
334 0.17
335 0.2
336 0.17
337 0.16
338 0.21
339 0.23
340 0.24
341 0.26