Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JF33

Protein Details
Accession C4JF33    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
116-138QIDERMEKRRRLRRLFADLKRSLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 10, cyto 8.5, cyto_mito 6.5, pero 5, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG ure:UREG_00934  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13432  TPR_16  
PF14559  TPR_19  
Amino Acid Sequences MAGRKDFLSQPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPTPEQIQEALAKRAALLGTAPPTAYGASARGEKGGAKHKEEEEEDDERFQDPENEVGLFAYGQYDQDDDEADQIYQQIDERMEKRRRLRRLFADLKRSLATVTDEDWANIPEVGDLTGKNRRARQNLRQRFYAVPDSVIASARDSTEFTTTVAEDGTQTSIQTREGADGTITNFADIGAARDKVLQARLDRAAQSSAADAASGNATNIDPKGYLTSLTKSEMKAGEVEIGDIKRVRVLLESVTKTNPRHAPGWIALARLEEVAGKIVAARNYIAKGCELCPKSEDAWLENIRLNDNHNAKIIAANAIKHNDNSTRLWIEAMKLETEPRAKKNVLRQAILHIPQSVAIWKEAVNLEEDVADARLLLTKATEMIPLSVELWLALARLETPENAQKVLNTARKAVPTSHEIWIAAARLQEQMGTANKVNVMKRAVQALARESAMPKREDWIGEAEKCEEEGAVLTCGAIIRETLGWGLDEDDDRKDIWMEDARSSIARGKYETARAIYAYALRVFVNKRSVWLAAADLERAHGTKESLWQLLERAVEACPQSEVLWMQLAKEKWQAGEIDNARRVLAKAFNQNPNNEDIWLAAVKLEADAQQTDQARELLATARREAGTDRVWIKSVAFERQLGNTEAALDLVNQALQLYPKADKLWMMKGQIYETEKKYPQAREAYGTGTRACPKSVPLWLLASRLEEKLGVVVKSRSILDRARLAVPKNAELWTESVRIERRANNIGQAKIIMAKALQEVPTSGLLWSESIWHLEPRTHRKPRSLEAIKKVDNDPILFLTVARIFWGERRLEKAMTWFEKAIVADSDLGDVWAWYYKFLMQHGTEEKREDVINKCIASEPKHGEIWQTIAKDPVNAHKSTEEILKLTAEHLN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.29
3 0.28
4 0.25
5 0.2
6 0.15
7 0.12
8 0.12
9 0.12
10 0.12
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.2
19 0.23
20 0.25
21 0.29
22 0.3
23 0.29
24 0.32
25 0.34
26 0.32
27 0.38
28 0.37
29 0.32
30 0.32
31 0.29
32 0.27
33 0.31
34 0.31
35 0.27
36 0.25
37 0.25
38 0.22
39 0.25
40 0.23
41 0.17
42 0.14
43 0.15
44 0.17
45 0.18
46 0.17
47 0.15
48 0.16
49 0.15
50 0.15
51 0.11
52 0.1
53 0.12
54 0.16
55 0.16
56 0.16
57 0.17
58 0.18
59 0.23
60 0.32
61 0.35
62 0.36
63 0.42
64 0.44
65 0.5
66 0.5
67 0.5
68 0.46
69 0.44
70 0.41
71 0.37
72 0.35
73 0.29
74 0.27
75 0.21
76 0.2
77 0.17
78 0.18
79 0.18
80 0.17
81 0.17
82 0.16
83 0.16
84 0.11
85 0.1
86 0.08
87 0.07
88 0.07
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.09
93 0.1
94 0.09
95 0.1
96 0.11
97 0.1
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.09
102 0.1
103 0.11
104 0.12
105 0.18
106 0.21
107 0.3
108 0.37
109 0.45
110 0.54
111 0.6
112 0.69
113 0.72
114 0.79
115 0.79
116 0.82
117 0.85
118 0.83
119 0.84
120 0.75
121 0.7
122 0.61
123 0.52
124 0.41
125 0.32
126 0.28
127 0.19
128 0.19
129 0.19
130 0.18
131 0.18
132 0.19
133 0.18
134 0.15
135 0.13
136 0.12
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.12
143 0.19
144 0.24
145 0.29
146 0.36
147 0.44
148 0.53
149 0.62
150 0.68
151 0.73
152 0.78
153 0.78
154 0.75
155 0.7
156 0.63
157 0.6
158 0.57
159 0.46
160 0.37
161 0.33
162 0.3
163 0.28
164 0.26
165 0.2
166 0.14
167 0.14
168 0.13
169 0.13
170 0.12
171 0.13
172 0.14
173 0.14
174 0.13
175 0.14
176 0.13
177 0.12
178 0.12
179 0.1
180 0.08
181 0.09
182 0.11
183 0.09
184 0.09
185 0.1
186 0.11
187 0.12
188 0.13
189 0.12
190 0.12
191 0.12
192 0.13
193 0.11
194 0.12
195 0.12
196 0.15
197 0.14
198 0.12
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.1
203 0.11
204 0.1
205 0.1
206 0.11
207 0.12
208 0.13
209 0.15
210 0.18
211 0.19
212 0.18
213 0.23
214 0.25
215 0.27
216 0.27
217 0.26
218 0.24
219 0.21
220 0.19
221 0.15
222 0.13
223 0.1
224 0.09
225 0.07
226 0.07
227 0.08
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.07
236 0.08
237 0.1
238 0.1
239 0.12
240 0.12
241 0.15
242 0.16
243 0.2
244 0.21
245 0.19
246 0.24
247 0.23
248 0.22
249 0.2
250 0.18
251 0.18
252 0.16
253 0.16
254 0.15
255 0.14
256 0.14
257 0.14
258 0.13
259 0.11
260 0.12
261 0.11
262 0.1
263 0.11
264 0.14
265 0.21
266 0.23
267 0.24
268 0.27
269 0.3
270 0.3
271 0.36
272 0.36
273 0.32
274 0.31
275 0.3
276 0.32
277 0.29
278 0.36
279 0.29
280 0.26
281 0.23
282 0.22
283 0.21
284 0.16
285 0.14
286 0.08
287 0.07
288 0.07
289 0.06
290 0.05
291 0.06
292 0.09
293 0.09
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.12
298 0.13
299 0.13
300 0.11
301 0.12
302 0.13
303 0.21
304 0.21
305 0.2
306 0.21
307 0.23
308 0.23
309 0.25
310 0.24
311 0.18
312 0.23
313 0.24
314 0.24
315 0.23
316 0.23
317 0.21
318 0.2
319 0.21
320 0.22
321 0.23
322 0.23
323 0.22
324 0.21
325 0.2
326 0.21
327 0.19
328 0.17
329 0.15
330 0.15
331 0.16
332 0.18
333 0.19
334 0.18
335 0.19
336 0.17
337 0.19
338 0.19
339 0.21
340 0.2
341 0.19
342 0.2
343 0.18
344 0.16
345 0.16
346 0.16
347 0.13
348 0.12
349 0.12
350 0.14
351 0.2
352 0.22
353 0.21
354 0.26
355 0.26
356 0.3
357 0.38
358 0.45
359 0.43
360 0.41
361 0.39
362 0.39
363 0.44
364 0.42
365 0.34
366 0.25
367 0.2
368 0.19
369 0.19
370 0.16
371 0.1
372 0.09
373 0.08
374 0.07
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.1
379 0.09
380 0.09
381 0.09
382 0.09
383 0.07
384 0.06
385 0.06
386 0.04
387 0.04
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.06
394 0.07
395 0.08
396 0.06
397 0.06
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.06
403 0.05
404 0.05
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.03
409 0.03
410 0.04
411 0.05
412 0.05
413 0.07
414 0.11
415 0.12
416 0.12
417 0.12
418 0.12
419 0.14
420 0.21
421 0.23
422 0.2
423 0.23
424 0.24
425 0.25
426 0.26
427 0.25
428 0.21
429 0.2
430 0.22
431 0.21
432 0.2
433 0.18
434 0.17
435 0.17
436 0.15
437 0.12
438 0.09
439 0.08
440 0.08
441 0.08
442 0.07
443 0.06
444 0.08
445 0.08
446 0.1
447 0.1
448 0.1
449 0.12
450 0.15
451 0.15
452 0.16
453 0.16
454 0.16
455 0.17
456 0.19
457 0.18
458 0.16
459 0.17
460 0.16
461 0.16
462 0.14
463 0.13
464 0.12
465 0.15
466 0.16
467 0.16
468 0.14
469 0.15
470 0.16
471 0.16
472 0.16
473 0.19
474 0.19
475 0.19
476 0.19
477 0.19
478 0.17
479 0.17
480 0.15
481 0.09
482 0.06
483 0.06
484 0.06
485 0.05
486 0.05
487 0.05
488 0.05
489 0.05
490 0.05
491 0.04
492 0.03
493 0.04
494 0.04
495 0.04
496 0.04
497 0.04
498 0.05
499 0.05
500 0.06
501 0.05
502 0.06
503 0.07
504 0.08
505 0.08
506 0.08
507 0.08
508 0.08
509 0.07
510 0.09
511 0.13
512 0.14
513 0.14
514 0.15
515 0.15
516 0.15
517 0.16
518 0.18
519 0.16
520 0.15
521 0.15
522 0.18
523 0.2
524 0.23
525 0.24
526 0.21
527 0.19
528 0.19
529 0.18
530 0.15
531 0.14
532 0.12
533 0.11
534 0.1
535 0.09
536 0.12
537 0.13
538 0.15
539 0.19
540 0.18
541 0.19
542 0.2
543 0.2
544 0.18
545 0.17
546 0.15
547 0.12
548 0.13
549 0.12
550 0.1
551 0.1
552 0.1
553 0.09
554 0.09
555 0.07
556 0.07
557 0.08
558 0.13
559 0.15
560 0.16
561 0.16
562 0.16
563 0.16
564 0.18
565 0.17
566 0.12
567 0.1
568 0.09
569 0.11
570 0.11
571 0.11
572 0.09
573 0.09
574 0.09
575 0.1
576 0.09
577 0.08
578 0.11
579 0.1
580 0.11
581 0.15
582 0.15
583 0.16
584 0.19
585 0.19
586 0.16
587 0.18
588 0.19
589 0.15
590 0.24
591 0.25
592 0.27
593 0.29
594 0.29
595 0.27
596 0.27
597 0.26
598 0.21
599 0.22
600 0.21
601 0.28
602 0.34
603 0.42
604 0.45
605 0.46
606 0.44
607 0.43
608 0.39
609 0.31
610 0.24
611 0.16
612 0.15
613 0.13
614 0.11
615 0.07
616 0.07
617 0.06
618 0.06
619 0.07
620 0.06
621 0.07
622 0.08
623 0.08
624 0.13
625 0.14
626 0.14
627 0.15
628 0.14
629 0.13
630 0.12
631 0.12
632 0.12
633 0.16
634 0.17
635 0.17
636 0.19
637 0.19
638 0.2
639 0.2
640 0.2
641 0.17
642 0.21
643 0.22
644 0.21
645 0.22
646 0.22
647 0.21
648 0.22
649 0.23
650 0.22
651 0.22
652 0.23
653 0.23
654 0.25
655 0.28
656 0.24
657 0.22
658 0.17
659 0.16
660 0.14
661 0.13
662 0.11
663 0.08
664 0.06
665 0.06
666 0.06
667 0.05
668 0.05
669 0.05
670 0.06
671 0.06
672 0.08
673 0.09
674 0.11
675 0.12
676 0.13
677 0.16
678 0.19
679 0.26
680 0.28
681 0.29
682 0.3
683 0.3
684 0.31
685 0.33
686 0.34
687 0.32
688 0.31
689 0.36
690 0.35
691 0.39
692 0.44
693 0.42
694 0.45
695 0.46
696 0.45
697 0.42
698 0.42
699 0.42
700 0.38
701 0.36
702 0.3
703 0.27
704 0.3
705 0.26
706 0.26
707 0.22
708 0.22
709 0.25
710 0.29
711 0.27
712 0.24
713 0.28
714 0.28
715 0.29
716 0.27
717 0.26
718 0.23
719 0.22
720 0.2
721 0.15
722 0.14
723 0.16
724 0.18
725 0.15
726 0.16
727 0.16
728 0.17
729 0.19
730 0.2
731 0.18
732 0.19
733 0.22
734 0.24
735 0.28
736 0.3
737 0.33
738 0.36
739 0.36
740 0.38
741 0.37
742 0.35
743 0.32
744 0.3
745 0.25
746 0.23
747 0.24
748 0.22
749 0.21
750 0.19
751 0.22
752 0.24
753 0.28
754 0.32
755 0.33
756 0.35
757 0.39
758 0.4
759 0.43
760 0.46
761 0.43
762 0.39
763 0.35
764 0.3
765 0.27
766 0.25
767 0.17
768 0.12
769 0.12
770 0.13
771 0.16
772 0.16
773 0.13
774 0.14
775 0.15
776 0.17
777 0.16
778 0.13
779 0.11
780 0.11
781 0.1
782 0.1
783 0.11
784 0.1
785 0.12
786 0.14
787 0.15
788 0.16
789 0.21
790 0.29
791 0.36
792 0.46
793 0.54
794 0.57
795 0.64
796 0.7
797 0.72
798 0.75
799 0.75
800 0.74
801 0.74
802 0.78
803 0.73
804 0.7
805 0.65
806 0.59
807 0.52
808 0.44
809 0.36
810 0.28
811 0.26
812 0.22
813 0.2
814 0.18
815 0.17
816 0.16
817 0.14
818 0.13
819 0.12
820 0.16
821 0.22
822 0.23
823 0.24
824 0.3
825 0.33
826 0.34
827 0.34
828 0.38
829 0.42
830 0.42
831 0.42
832 0.37
833 0.34
834 0.36
835 0.35
836 0.3
837 0.22
838 0.19
839 0.16
840 0.16
841 0.16
842 0.13
843 0.13
844 0.1
845 0.09
846 0.08
847 0.12
848 0.11
849 0.11
850 0.12
851 0.14
852 0.17
853 0.19
854 0.25
855 0.21
856 0.28
857 0.36
858 0.41
859 0.41
860 0.42
861 0.42
862 0.38
863 0.38
864 0.36
865 0.33
866 0.34
867 0.37
868 0.34
869 0.34
870 0.37
871 0.4
872 0.41
873 0.44
874 0.43
875 0.41
876 0.44
877 0.43
878 0.41
879 0.39
880 0.39
881 0.36
882 0.32
883 0.29
884 0.31
885 0.31
886 0.3
887 0.31
888 0.35
889 0.35
890 0.33
891 0.35
892 0.32
893 0.33
894 0.33
895 0.36
896 0.29
897 0.25
898 0.26
899 0.24
900 0.23