FuNGI

A0A098VLW9

Protein Details

Accession

A0A098VLW9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
45-71	EEEEKNEDHRRTKKKTKRNQFVETEAL	Hydrophilic
78-99	DEEESRYTRRRRSGRASREEED	Acidic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
55-60	RTKKKT

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 10.5, cyto 6.5, pero 3, cysk 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005824 KOW IPR041973 KOW_Spt5_1 IPR041976 KOW_Spt5_3 IPR005100 NGN-domain IPR006645 NGN-like_dom IPR036735 NGN_dom_sf IPR039385 NGN_Euk IPR014722 Rib_L2_dom2 IPR005825 Ribosomal_L24/26_CS IPR039659 SPT5 IPR008991 Translation_prot_SH3-like_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005840 C:ribosome GO:0003735 F:structural constituent of ribosome GO:0003746 F:translation elongation factor activity GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II GO:0140673 P:transcription elongation-coupled chromatin remodeling
Pfam	View protein in Pfam PF03439 Spt5-NGN
PROSITE	View protein in PROSITE PS01108 RIBOSOMAL_L24
CDD	cd00380 KOW cd06081 KOW_Spt5_1 cd06083 KOW_Spt5_3 cd09888 NGN_Euk

Amino Acid Sequences

MPPSLEEDEYEEEVDETIDRNALDQDEEGSDDEDFGLDDLSSDPEEEEKNEDHRRTKKKTKRNQFVETEALVGDDEEDEEESRYTRRRRSGRASREEEDEEEDDFIEEDESELLEAQQTYSRLLAERRAHPRALADVDDQTLAKEAEEETQRIKSLYGRSSAAEARAAAAAAEEQGFLPETFLTPTVQDPKLWMVRCRPGKERLLAFNMMRRYLTMTASADLSAEAVPKIFSVVVREPLLKGFIYVEAFTKQEVLTFCERMPNCWSSSITLVPINEMPEVLRPSERYQSSTSGSGAAHGLKSGAWVRIKRGKYANDLAQVLAVDEGEDGLAIARLRLLPRLSFGKGGGGHGAAVTERPSAQLFNPVEVAERARLLGIPGPTRSSTPGYWMFGGEYFKDGFLEREIKATGVEVQTMLPTLDELEVFGGFSAVDAGSATDAAILFIERGSSVLVTEGELLGRKGIVEDIIDEGEIALVSFDQQTTLSVPMKSLRKIFQIGDSVRVLRGTSAGTVGLVTRVQGVRVTLFSQSSKSEFEVLARDLGPSEASNSEDNMYGRSGSKAAIFGRPENITFAIEELVMLAGHGPGLIVKIDTSSKEPFFIIDSHSILCERIKETSIQKLRPSKFAMDSVGAVISIGDTIQMLHGASQVSNLTGRIVSIYRSTIWVALAQPFPIIAVRASSVILANGGGTKILNLPPSAAMRQQKGASSRRLRGRTVLVREGPYKGLTALVKELEHQGQVAWIELHTNSKRVSVPVSALSEVDSKGDSQGHPGSYGQQKGFSTPSGFPMVGSNAGFATPAGLERSGWRTPGAANAGFRTPGGAGGGQFDLGSRTPGYFGATATGGAGGGDRTPAYFGIGDRTPSGFAMGSRTPSAGFGAAEGWRTPASGGFLGGTVGARNANLEGGSGTPTWQQGTGTPTWQQGSGTPTWQQGMSPWGAAPPMSGAVSPWGRGSMQSSQGHGTPSSSWNSHNFSGGGGMTPLSATHRVDDSNDDANFEASWARPSLHVMALINGVMKSAIVTGHCSGSLIPIESIEEPKIVSEVPPSQLRLQRPVKKDRVVVLAGDHLKTTGILVGIDGADAIVRVDAPSSQNASGFIIVPALLVGKLGT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.13
3	0.1
4	0.09
5	0.1
6	0.09
7	0.1
8	0.12
9	0.13
10	0.13
11	0.13
12	0.14
13	0.14
14	0.15
15	0.15
16	0.14
17	0.13
18	0.12
19	0.12
20	0.09
21	0.08
22	0.07
23	0.07
24	0.05
25	0.06
26	0.07
27	0.09
28	0.09
29	0.09
30	0.1
31	0.12
32	0.13
33	0.14
34	0.18
35	0.19
36	0.26
37	0.34
38	0.39
39	0.45
40	0.54
41	0.62
42	0.68
43	0.77
44	0.79
45	0.82
46	0.88
47	0.91
48	0.92
49	0.92
50	0.91
51	0.87
52	0.83
53	0.78
54	0.68
55	0.58
56	0.46
57	0.37
58	0.27
59	0.2
60	0.14
61	0.08
62	0.07
63	0.07
64	0.08
65	0.08
66	0.09
67	0.1
68	0.11
69	0.14
70	0.22
71	0.28
72	0.35
73	0.44
74	0.52
75	0.61
76	0.71
77	0.79
78	0.82
79	0.86
80	0.86
81	0.79
82	0.76
83	0.7
84	0.61
85	0.55
86	0.46
87	0.36
88	0.29
89	0.25
90	0.19
91	0.16
92	0.14
93	0.09
94	0.07
95	0.07
96	0.07
97	0.06
98	0.06
99	0.06
100	0.06
101	0.07
102	0.08
103	0.08
104	0.11
105	0.12
106	0.13
107	0.14
108	0.15
109	0.16
110	0.18
111	0.26
112	0.3
113	0.38
114	0.45
115	0.5
116	0.49
117	0.48
118	0.48
119	0.45
120	0.41
121	0.35
122	0.29
123	0.26
124	0.26
125	0.26
126	0.23
127	0.18
128	0.17
129	0.14
130	0.11
131	0.1
132	0.1
133	0.15
134	0.18
135	0.2
136	0.2
137	0.23
138	0.24
139	0.23
140	0.23
141	0.22
142	0.27
143	0.29
144	0.3
145	0.29
146	0.3
147	0.33
148	0.35
149	0.31
150	0.25
151	0.21
152	0.18
153	0.17
154	0.16
155	0.11
156	0.09
157	0.08
158	0.07
159	0.07
160	0.06
161	0.06
162	0.06
163	0.08
164	0.08
165	0.08
166	0.08
167	0.08
168	0.09
169	0.1
170	0.1
171	0.1
172	0.14
173	0.2
174	0.2
175	0.2
176	0.21
177	0.26
178	0.32
179	0.34
180	0.35
181	0.36
182	0.44
183	0.53
184	0.56
185	0.56
186	0.57
187	0.61
188	0.64
189	0.63
190	0.6
191	0.57
192	0.56
193	0.51
194	0.49
195	0.45
196	0.39
197	0.33
198	0.27
199	0.27
200	0.24
201	0.24
202	0.22
203	0.2
204	0.2
205	0.2
206	0.19
207	0.15
208	0.12
209	0.12
210	0.09
211	0.08
212	0.07
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.07
217	0.07
218	0.07
219	0.12
220	0.15
221	0.2
222	0.22
223	0.23
224	0.22
225	0.23
226	0.24
227	0.18
228	0.16
229	0.12
230	0.13
231	0.13
232	0.13
233	0.14
234	0.14
235	0.14
236	0.14
237	0.14
238	0.11
239	0.13
240	0.14
241	0.16
242	0.19
243	0.2
244	0.2
245	0.27
246	0.27
247	0.27
248	0.31
249	0.3
250	0.27
251	0.28
252	0.29
253	0.23
254	0.26
255	0.24
256	0.21
257	0.2
258	0.18
259	0.17
260	0.18
261	0.17
262	0.14
263	0.13
264	0.11
265	0.13
266	0.15
267	0.14
268	0.15
269	0.16
270	0.2
271	0.27
272	0.28
273	0.28
274	0.29
275	0.32
276	0.33
277	0.32
278	0.29
279	0.24
280	0.22
281	0.19
282	0.18
283	0.15
284	0.12
285	0.1
286	0.1
287	0.07
288	0.1
289	0.12
290	0.15
291	0.18
292	0.19
293	0.26
294	0.34
295	0.36
296	0.39
297	0.44
298	0.44
299	0.46
300	0.52
301	0.51
302	0.48
303	0.47
304	0.41
305	0.35
306	0.3
307	0.23
308	0.16
309	0.1
310	0.05
311	0.04
312	0.04
313	0.03
314	0.03
315	0.03
316	0.03
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.05
321	0.06
322	0.07
323	0.11
324	0.12
325	0.11
326	0.15
327	0.19
328	0.2
329	0.2
330	0.19
331	0.21
332	0.2
333	0.21
334	0.19
335	0.15
336	0.13
337	0.12
338	0.12
339	0.07
340	0.06
341	0.07
342	0.06
343	0.06
344	0.07
345	0.08
346	0.09
347	0.09
348	0.18
349	0.17
350	0.18
351	0.18
352	0.17
353	0.18
354	0.17
355	0.19
356	0.11
357	0.11
358	0.09
359	0.09
360	0.09
361	0.08
362	0.11
363	0.12
364	0.13
365	0.14
366	0.16
367	0.17
368	0.17
369	0.19
370	0.2
371	0.17
372	0.2
373	0.23
374	0.23
375	0.22
376	0.22
377	0.2
378	0.18
379	0.19
380	0.14
381	0.13
382	0.11
383	0.11
384	0.11
385	0.11
386	0.09
387	0.11
388	0.14
389	0.13
390	0.14
391	0.15
392	0.14
393	0.14
394	0.13
395	0.14
396	0.11
397	0.11
398	0.09
399	0.09
400	0.09
401	0.09
402	0.08
403	0.05
404	0.04
405	0.05
406	0.05
407	0.05
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.05
412	0.05
413	0.04
414	0.03
415	0.03
416	0.04
417	0.03
418	0.03
419	0.03
420	0.03
421	0.03
422	0.04
423	0.03
424	0.03
425	0.03
426	0.03
427	0.03
428	0.03
429	0.03
430	0.03
431	0.04
432	0.03
433	0.03
434	0.04
435	0.04
436	0.04
437	0.05
438	0.05
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.06
444	0.06
445	0.05
446	0.05
447	0.04
448	0.04
449	0.04
450	0.04
451	0.04
452	0.05
453	0.06
454	0.06
455	0.06
456	0.05
457	0.05
458	0.05
459	0.04
460	0.03
461	0.02
462	0.02
463	0.03
464	0.03
465	0.03
466	0.03
467	0.04
468	0.04
469	0.06
470	0.09
471	0.1
472	0.1
473	0.11
474	0.15
475	0.19
476	0.2
477	0.22
478	0.22
479	0.23
480	0.26
481	0.26
482	0.25
483	0.29
484	0.27
485	0.28
486	0.26
487	0.24
488	0.21
489	0.21
490	0.16
491	0.1
492	0.1
493	0.07
494	0.06
495	0.06
496	0.06
497	0.05
498	0.05
499	0.05
500	0.05
501	0.05
502	0.04
503	0.06
504	0.06
505	0.07
506	0.07
507	0.07
508	0.07
509	0.08
510	0.09
511	0.08
512	0.09
513	0.09
514	0.1
515	0.11
516	0.12
517	0.12
518	0.12
519	0.13
520	0.12
521	0.12
522	0.13
523	0.13
524	0.12
525	0.11
526	0.11
527	0.09
528	0.09
529	0.08
530	0.06
531	0.07
532	0.06
533	0.08
534	0.08
535	0.09
536	0.09
537	0.1
538	0.1
539	0.1
540	0.09
541	0.08
542	0.09
543	0.09
544	0.08
545	0.07
546	0.08
547	0.09
548	0.1
549	0.14
550	0.14
551	0.14
552	0.17
553	0.17
554	0.17
555	0.16
556	0.15
557	0.12
558	0.1
559	0.1
560	0.08
561	0.07
562	0.06
563	0.05
564	0.04
565	0.04
566	0.03
567	0.03
568	0.03
569	0.03
570	0.03
571	0.02
572	0.02
573	0.03
574	0.03
575	0.03
576	0.03
577	0.04
578	0.05
579	0.06
580	0.09
581	0.12
582	0.12
583	0.13
584	0.13
585	0.12
586	0.13
587	0.13
588	0.13
589	0.12
590	0.13
591	0.12
592	0.12
593	0.12
594	0.11
595	0.11
596	0.1
597	0.09
598	0.09
599	0.1
600	0.13
601	0.15
602	0.24
603	0.29
604	0.3
605	0.35
606	0.43
607	0.44
608	0.46
609	0.47
610	0.4
611	0.37
612	0.36
613	0.32
614	0.24
615	0.23
616	0.18
617	0.15
618	0.11
619	0.09
620	0.06
621	0.04
622	0.03
623	0.03
624	0.02
625	0.02
626	0.02
627	0.03
628	0.03
629	0.03
630	0.03
631	0.05
632	0.05
633	0.05
634	0.06
635	0.06
636	0.06
637	0.07
638	0.07
639	0.06
640	0.06
641	0.06
642	0.06
643	0.06
644	0.07
645	0.08
646	0.09
647	0.09
648	0.1
649	0.11
650	0.1
651	0.1
652	0.11
653	0.1
654	0.13
655	0.13
656	0.11
657	0.11
658	0.1
659	0.1
660	0.08
661	0.08
662	0.05
663	0.05
664	0.05
665	0.06
666	0.06
667	0.07
668	0.06
669	0.06
670	0.06
671	0.05
672	0.05
673	0.04
674	0.04
675	0.04
676	0.04
677	0.04
678	0.06
679	0.08
680	0.09
681	0.08
682	0.09
683	0.11
684	0.13
685	0.14
686	0.17
687	0.19
688	0.2
689	0.23
690	0.24
691	0.25
692	0.29
693	0.33
694	0.38
695	0.41
696	0.46
697	0.52
698	0.54
699	0.52
700	0.5
701	0.53
702	0.52
703	0.51
704	0.5
705	0.45
706	0.44
707	0.44
708	0.42
709	0.35
710	0.28
711	0.22
712	0.16
713	0.16
714	0.14
715	0.13
716	0.13
717	0.13
718	0.13
719	0.13
720	0.16
721	0.14
722	0.13
723	0.12
724	0.1
725	0.1
726	0.1
727	0.1
728	0.07
729	0.06
730	0.07
731	0.07
732	0.14
733	0.14
734	0.16
735	0.16
736	0.19
737	0.2
738	0.2
739	0.22
740	0.17
741	0.18
742	0.2
743	0.21
744	0.19
745	0.18
746	0.18
747	0.17
748	0.16
749	0.14
750	0.11
751	0.09
752	0.1
753	0.12
754	0.1
755	0.13
756	0.16
757	0.16
758	0.17
759	0.17
760	0.21
761	0.24
762	0.28
763	0.24
764	0.25
765	0.25
766	0.26
767	0.27
768	0.23
769	0.22
770	0.19
771	0.22
772	0.21
773	0.21
774	0.19
775	0.19
776	0.19
777	0.17
778	0.16
779	0.13
780	0.1
781	0.1
782	0.1
783	0.08
784	0.07
785	0.05
786	0.06
787	0.07
788	0.07
789	0.07
790	0.1
791	0.16
792	0.16
793	0.16
794	0.16
795	0.16
796	0.16
797	0.21
798	0.23
799	0.19
800	0.2
801	0.21
802	0.21
803	0.21
804	0.2
805	0.16
806	0.12
807	0.1
808	0.1
809	0.09
810	0.08
811	0.1
812	0.1
813	0.09
814	0.09
815	0.08
816	0.09
817	0.08
818	0.1
819	0.08
820	0.08
821	0.09
822	0.1
823	0.12
824	0.11
825	0.11
826	0.11
827	0.11
828	0.11
829	0.1
830	0.1
831	0.07
832	0.06
833	0.06
834	0.04
835	0.04
836	0.05
837	0.05
838	0.05
839	0.06
840	0.06
841	0.08
842	0.08
843	0.09
844	0.13
845	0.15
846	0.16
847	0.16
848	0.17
849	0.16
850	0.15
851	0.16
852	0.12
853	0.11
854	0.15
855	0.16
856	0.17
857	0.17
858	0.18
859	0.16
860	0.16
861	0.17
862	0.13
863	0.11
864	0.09
865	0.1
866	0.11
867	0.12
868	0.11
869	0.12
870	0.1
871	0.11
872	0.1
873	0.1
874	0.12
875	0.11
876	0.12
877	0.1
878	0.1
879	0.1
880	0.1
881	0.09
882	0.06
883	0.06
884	0.06
885	0.06
886	0.06
887	0.07
888	0.07
889	0.07
890	0.07
891	0.07
892	0.07
893	0.09
894	0.09
895	0.1
896	0.11
897	0.12
898	0.12
899	0.13
900	0.12
901	0.13
902	0.18
903	0.19
904	0.2
905	0.22
906	0.24
907	0.24
908	0.25
909	0.22
910	0.2
911	0.23
912	0.22
913	0.23
914	0.22
915	0.23
916	0.24
917	0.23
918	0.2
919	0.17
920	0.19
921	0.18
922	0.16
923	0.14
924	0.14
925	0.14
926	0.14
927	0.12
928	0.09
929	0.09
930	0.09
931	0.09
932	0.08
933	0.14
934	0.15
935	0.16
936	0.15
937	0.15
938	0.14
939	0.15
940	0.2
941	0.2
942	0.27
943	0.29
944	0.31
945	0.31
946	0.33
947	0.34
948	0.3
949	0.25
950	0.2
951	0.21
952	0.23
953	0.23
954	0.24
955	0.27
956	0.32
957	0.32
958	0.31
959	0.28
960	0.24
961	0.25
962	0.22
963	0.17
964	0.12
965	0.11
966	0.09
967	0.08
968	0.09
969	0.1
970	0.13
971	0.13
972	0.15
973	0.17
974	0.17
975	0.19
976	0.23
977	0.24
978	0.28
979	0.27
980	0.26
981	0.24
982	0.24
983	0.22
984	0.18
985	0.16
986	0.1
987	0.12
988	0.12
989	0.12
990	0.12
991	0.16
992	0.19
993	0.19
994	0.21
995	0.19
996	0.19
997	0.2
998	0.19
999	0.17
1000	0.14
1001	0.12
1002	0.09
1003	0.08
1004	0.07
1005	0.07
1006	0.08
1007	0.07
1008	0.11
1009	0.13
1010	0.14
1011	0.14
1012	0.15
1013	0.14
1014	0.16
1015	0.17
1016	0.15
1017	0.14
1018	0.13
1019	0.15
1020	0.17
1021	0.19
1022	0.17
1023	0.15
1024	0.13
1025	0.13
1026	0.14
1027	0.12
1028	0.11
1029	0.14
1030	0.17
1031	0.22
1032	0.26
1033	0.29
1034	0.35
1035	0.41
1036	0.44
1037	0.49
1038	0.55
1039	0.59
1040	0.63
1041	0.7
1042	0.72
1043	0.74
1044	0.75
1045	0.71
1046	0.68
1047	0.6
1048	0.53
1049	0.46
1050	0.45
1051	0.41
1052	0.36
1053	0.3
1054	0.23
1055	0.21
1056	0.2
1057	0.18
1058	0.11
1059	0.09
1060	0.08
1061	0.08
1062	0.1
1063	0.09
1064	0.09
1065	0.08
1066	0.06
1067	0.05
1068	0.05
1069	0.05
1070	0.04
1071	0.04
1072	0.05
1073	0.05
1074	0.08
1075	0.1
1076	0.15
1077	0.19
1078	0.2
1079	0.2
1080	0.21
1081	0.23
1082	0.22
1083	0.21
1084	0.16
1085	0.13
1086	0.12
1087	0.11
1088	0.1
1089	0.09
1090	0.07

A0A098VLW9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer