Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JQ38

Protein Details
Accession C4JQ38    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
262-282TYINDKNKRFNQKLARFYNKYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, cyto 3.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG ure:UREG_03271  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MTAEERSSTMPEDPKILRESEERIPGSSTPSMDADKELAAPGEQQPADDPTSKNQQRLDRFKALQARAKSAAKSNLKETAAESQRLKTDPTLLNSISRKHAFASHNLLKADIEASGEDFERKRAWDWTIDESEKWDRRMEKKQKHRDDVAFQDWRQDAHKNYKRQLRRMEPNLDAYETQKADAVMRAAANGGLDLVEGEDGELVAVDKNGTFYSTADSIEFAQNRPDRAAVDRLVADLQKAEEIRLKKRRERGLGEDDADVTYINDKNKRFNQKLARFYNKYTAEIRDSFERGTMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.34
3 0.32
4 0.3
5 0.29
6 0.33
7 0.34
8 0.41
9 0.37
10 0.36
11 0.37
12 0.35
13 0.36
14 0.34
15 0.28
16 0.22
17 0.23
18 0.24
19 0.22
20 0.23
21 0.19
22 0.16
23 0.16
24 0.14
25 0.12
26 0.11
27 0.12
28 0.13
29 0.18
30 0.17
31 0.17
32 0.18
33 0.2
34 0.23
35 0.25
36 0.24
37 0.23
38 0.34
39 0.37
40 0.39
41 0.42
42 0.48
43 0.54
44 0.61
45 0.64
46 0.62
47 0.61
48 0.63
49 0.66
50 0.63
51 0.6
52 0.54
53 0.52
54 0.48
55 0.5
56 0.45
57 0.42
58 0.46
59 0.46
60 0.45
61 0.43
62 0.45
63 0.42
64 0.41
65 0.37
66 0.37
67 0.34
68 0.36
69 0.33
70 0.29
71 0.31
72 0.32
73 0.31
74 0.23
75 0.27
76 0.26
77 0.28
78 0.3
79 0.27
80 0.32
81 0.33
82 0.34
83 0.33
84 0.3
85 0.27
86 0.24
87 0.3
88 0.27
89 0.29
90 0.36
91 0.36
92 0.39
93 0.38
94 0.37
95 0.3
96 0.28
97 0.24
98 0.15
99 0.09
100 0.05
101 0.06
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.08
106 0.09
107 0.1
108 0.1
109 0.11
110 0.13
111 0.15
112 0.18
113 0.21
114 0.25
115 0.28
116 0.28
117 0.27
118 0.27
119 0.33
120 0.3
121 0.29
122 0.27
123 0.27
124 0.32
125 0.43
126 0.5
127 0.53
128 0.61
129 0.71
130 0.76
131 0.78
132 0.78
133 0.71
134 0.66
135 0.62
136 0.58
137 0.51
138 0.42
139 0.41
140 0.36
141 0.32
142 0.29
143 0.26
144 0.22
145 0.3
146 0.37
147 0.38
148 0.44
149 0.51
150 0.56
151 0.6
152 0.66
153 0.64
154 0.66
155 0.68
156 0.67
157 0.61
158 0.6
159 0.54
160 0.46
161 0.37
162 0.29
163 0.26
164 0.2
165 0.18
166 0.14
167 0.13
168 0.12
169 0.13
170 0.12
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.08
175 0.08
176 0.07
177 0.05
178 0.05
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.1
201 0.11
202 0.11
203 0.1
204 0.11
205 0.13
206 0.17
207 0.18
208 0.15
209 0.22
210 0.24
211 0.25
212 0.25
213 0.24
214 0.21
215 0.24
216 0.28
217 0.22
218 0.22
219 0.21
220 0.21
221 0.21
222 0.2
223 0.17
224 0.13
225 0.12
226 0.12
227 0.12
228 0.13
229 0.17
230 0.21
231 0.3
232 0.38
233 0.45
234 0.5
235 0.58
236 0.67
237 0.7
238 0.73
239 0.72
240 0.72
241 0.71
242 0.66
243 0.58
244 0.49
245 0.4
246 0.33
247 0.24
248 0.15
249 0.13
250 0.14
251 0.18
252 0.23
253 0.25
254 0.34
255 0.43
256 0.53
257 0.54
258 0.61
259 0.67
260 0.71
261 0.8
262 0.8
263 0.82
264 0.76
265 0.75
266 0.75
267 0.68
268 0.62
269 0.55
270 0.51
271 0.47
272 0.45
273 0.45
274 0.41
275 0.4
276 0.37