Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A098VRH7

Protein Details
Accession A0A098VRH7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
75-108SASKERTSDPYSRRRRRSRSRSRCRVETAKRDDPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
84-118PYSRRRRRSRSRSRCRVETAKRDDPPSGAIRKRAR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, mito 1, plas 1, pero 1, cysk 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR006509  RBM39_SF  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12283  RRM1_RBM39_like  
cd12285  RRM3_RBM39_like  
Amino Acid Sequences MSWNIDELDALLEAPFQEKQLSSNDKLSGDTTRSSSPSPSKGKSRYQDDDYFRSPRPSSSTSSSSKRDYSRERPSASKERTSDPYSRRRRRSRSRSRCRVETAKRDDPPSGAIRKRARSPSPELTEGERDRRTVFVQQLAVRLRETELREFFSKVGKVRQVKIVSDRITGRSKGFGYVEFRDEPSVPLAILLSGHKLLGIPILVSNTETEKNRLAEEAAAMCSSRSSSESARTILPPPTQNQPAASSAASRAEKKGPASQFKRLFISSIHPDVDEHMLTPIFSAYGRIDNLSLLVDPVSKRSKGAAVVSFRDHVDAKKAIEQLDGVEIAGKAIKITVASDAQMRALADDSEATVALSMTPQARAELMMRLSRDSDLSTSTHLTQNYFKENPVFYILLSNLYDPIAESSSSATWKADLADDIHDECSKFGALVGRPVVLGNTQGEVLLQYSDLAASQLAVAALQGRWFGGRQIRASVISSQTYQQKMASSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.09
4 0.11
5 0.11
6 0.14
7 0.22
8 0.3
9 0.32
10 0.37
11 0.4
12 0.38
13 0.39
14 0.39
15 0.35
16 0.31
17 0.29
18 0.27
19 0.27
20 0.29
21 0.29
22 0.34
23 0.36
24 0.42
25 0.47
26 0.5
27 0.55
28 0.6
29 0.68
30 0.71
31 0.73
32 0.72
33 0.72
34 0.75
35 0.72
36 0.72
37 0.67
38 0.64
39 0.57
40 0.56
41 0.49
42 0.44
43 0.44
44 0.41
45 0.41
46 0.43
47 0.47
48 0.47
49 0.53
50 0.54
51 0.52
52 0.54
53 0.53
54 0.55
55 0.57
56 0.61
57 0.65
58 0.68
59 0.68
60 0.67
61 0.71
62 0.73
63 0.7
64 0.69
65 0.61
66 0.58
67 0.6
68 0.6
69 0.6
70 0.57
71 0.62
72 0.65
73 0.72
74 0.77
75 0.81
76 0.86
77 0.89
78 0.92
79 0.93
80 0.93
81 0.94
82 0.95
83 0.93
84 0.9
85 0.87
86 0.86
87 0.84
88 0.84
89 0.81
90 0.8
91 0.75
92 0.7
93 0.63
94 0.53
95 0.49
96 0.44
97 0.43
98 0.37
99 0.42
100 0.46
101 0.5
102 0.57
103 0.61
104 0.6
105 0.58
106 0.64
107 0.65
108 0.64
109 0.61
110 0.55
111 0.51
112 0.53
113 0.49
114 0.48
115 0.4
116 0.35
117 0.33
118 0.33
119 0.31
120 0.29
121 0.29
122 0.27
123 0.3
124 0.3
125 0.35
126 0.36
127 0.34
128 0.28
129 0.26
130 0.22
131 0.23
132 0.24
133 0.25
134 0.25
135 0.27
136 0.29
137 0.29
138 0.29
139 0.29
140 0.28
141 0.24
142 0.29
143 0.32
144 0.35
145 0.37
146 0.44
147 0.42
148 0.42
149 0.45
150 0.46
151 0.41
152 0.4
153 0.39
154 0.36
155 0.37
156 0.36
157 0.31
158 0.27
159 0.26
160 0.25
161 0.23
162 0.22
163 0.23
164 0.24
165 0.26
166 0.23
167 0.23
168 0.22
169 0.22
170 0.2
171 0.16
172 0.14
173 0.1
174 0.09
175 0.08
176 0.07
177 0.07
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.05
188 0.05
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.08
194 0.11
195 0.12
196 0.13
197 0.16
198 0.16
199 0.16
200 0.16
201 0.15
202 0.12
203 0.12
204 0.11
205 0.09
206 0.08
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.08
214 0.09
215 0.14
216 0.16
217 0.17
218 0.18
219 0.19
220 0.2
221 0.21
222 0.23
223 0.2
224 0.2
225 0.24
226 0.25
227 0.24
228 0.23
229 0.22
230 0.2
231 0.2
232 0.18
233 0.13
234 0.12
235 0.16
236 0.16
237 0.15
238 0.16
239 0.17
240 0.19
241 0.2
242 0.26
243 0.26
244 0.34
245 0.37
246 0.44
247 0.46
248 0.46
249 0.47
250 0.41
251 0.37
252 0.28
253 0.3
254 0.25
255 0.22
256 0.21
257 0.18
258 0.18
259 0.19
260 0.2
261 0.14
262 0.11
263 0.09
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.06
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.08
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.08
279 0.08
280 0.05
281 0.05
282 0.07
283 0.07
284 0.11
285 0.14
286 0.14
287 0.14
288 0.15
289 0.18
290 0.18
291 0.23
292 0.24
293 0.25
294 0.27
295 0.28
296 0.28
297 0.26
298 0.25
299 0.22
300 0.17
301 0.18
302 0.18
303 0.17
304 0.21
305 0.23
306 0.22
307 0.21
308 0.21
309 0.16
310 0.16
311 0.14
312 0.09
313 0.09
314 0.08
315 0.07
316 0.08
317 0.07
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.05
322 0.05
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.1
327 0.11
328 0.11
329 0.12
330 0.11
331 0.09
332 0.09
333 0.08
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.06
345 0.06
346 0.07
347 0.08
348 0.08
349 0.08
350 0.09
351 0.11
352 0.13
353 0.15
354 0.17
355 0.17
356 0.18
357 0.19
358 0.18
359 0.18
360 0.16
361 0.14
362 0.13
363 0.14
364 0.15
365 0.16
366 0.18
367 0.21
368 0.2
369 0.22
370 0.25
371 0.28
372 0.33
373 0.31
374 0.3
375 0.31
376 0.31
377 0.31
378 0.3
379 0.26
380 0.19
381 0.22
382 0.21
383 0.2
384 0.19
385 0.18
386 0.14
387 0.14
388 0.13
389 0.1
390 0.12
391 0.1
392 0.09
393 0.09
394 0.11
395 0.12
396 0.14
397 0.14
398 0.12
399 0.11
400 0.12
401 0.13
402 0.12
403 0.12
404 0.12
405 0.14
406 0.16
407 0.17
408 0.18
409 0.19
410 0.17
411 0.16
412 0.16
413 0.13
414 0.11
415 0.11
416 0.16
417 0.15
418 0.21
419 0.22
420 0.21
421 0.21
422 0.21
423 0.2
424 0.15
425 0.16
426 0.11
427 0.11
428 0.11
429 0.1
430 0.1
431 0.1
432 0.1
433 0.08
434 0.07
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.06
444 0.06
445 0.05
446 0.05
447 0.07
448 0.07
449 0.08
450 0.08
451 0.08
452 0.1
453 0.1
454 0.16
455 0.21
456 0.26
457 0.28
458 0.32
459 0.35
460 0.36
461 0.38
462 0.37
463 0.34
464 0.31
465 0.31
466 0.32
467 0.36
468 0.36
469 0.35
470 0.32