Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A098VRT6

Protein Details
Accession A0A098VRT6    Localization Confidence High Confidence Score 19.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
127-176DSNSEPKKDSKLKRPKKPQKDNLKSIYVSSLPKDVEKKQFKKFRKFGNIAHydrophilic
689-708ADVKKVKRSNEPSKGQERPRBasic
718-738APSKEFKPRGSAKRLNPKDSSHydrophilic
772-791DSSRAFKSSAPNKRFKPKAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
132-146PKKDSKLKRPKKPQK
693-792KKVKRSNEPSKGQERPRASNKRFKSEAPSKEFKPRGSAKRLNPKDSSKGSRSNAPNKRLNPKDSSKGSRSNAPNKRLNPKDSSRAFKSSAPNKRFKPKAE
Subcellular Location(s) nucl 17.5, mito_nucl 12, mito 5.5, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12416  RRM4_RBM28_like  
Amino Acid Sequences MSSCIGSKPEKDANSKCSLFIRGIPAGSSNDELLNLFSDIGPLRSCFVVNPGKEAGAEAIAPSKFCYGFVRFVTEEDAQKALEQLKSTKFKGSKLKLEIALKKHTGSENKPPRKVLTVESKKDSALDSNSEPKKDSKLKRPKKPQKDNLKSIYVSSLPKDVEKKQXFKKFRKFGNIASLEFPLDGLIVYSSGKEVSFALPKIHDHIFKGSKLKASLTKEQPQKSHRLIVRNISFSTTKEEILDKFSAFGEVFEVQIPKKADNSLMGFCFVQYLSKSSADEAILKMNATKLNGRKIAIDYAVSKTLYEKIKDTDSDDTDGVVKTDIGNSDLSDDDSNDKASEAEMDRCNDIVDFDDHSSEICNEESCENEVLQTEAENIPEIATNHLENHSKTLFVRNLLFETESEKVAETFSKFGKLQYVRIVKDFLGRSKGCAFVSFVHQEDASKCLDEFSNSSRPPSFVENSSSSKSLKGSKISLDLYDQIDSAWVIEGRHIDVLQAIPKLSAKEIASKTAEEKKEADKRNLYLLKESFVDRASPEWEEISEMDKQKRVKAYQERSLKLKNLNCFVSKTRVSIRNMPVGVDEKQLKTIIGTCVSKAYPEFKPIPRYLKQVKVIRDKERKTSTGELKSLGYAFVEFSDHKHALSLIRKMNNKKDIFTAQKRPIVEFAVENSTILARRQGRMSQTDIDAADVKKVKRSNEPSKGQERPRASNKRFKSEAPSKEFKPRGSAKRLNPKDSSKGSRSNAPNKRLNPKDSSKGSRSNAPNKRLNPKDSSRAFKSSAPNKRFKPKAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.58
3 0.53
4 0.5
5 0.47
6 0.41
7 0.39
8 0.39
9 0.33
10 0.32
11 0.31
12 0.29
13 0.29
14 0.29
15 0.26
16 0.2
17 0.17
18 0.17
19 0.17
20 0.15
21 0.14
22 0.12
23 0.11
24 0.1
25 0.12
26 0.12
27 0.13
28 0.14
29 0.12
30 0.14
31 0.14
32 0.15
33 0.13
34 0.2
35 0.26
36 0.25
37 0.29
38 0.29
39 0.29
40 0.29
41 0.29
42 0.23
43 0.16
44 0.15
45 0.11
46 0.15
47 0.14
48 0.15
49 0.15
50 0.17
51 0.16
52 0.17
53 0.22
54 0.21
55 0.27
56 0.28
57 0.34
58 0.31
59 0.32
60 0.36
61 0.34
62 0.32
63 0.28
64 0.28
65 0.21
66 0.21
67 0.23
68 0.21
69 0.2
70 0.2
71 0.23
72 0.3
73 0.37
74 0.38
75 0.44
76 0.43
77 0.48
78 0.57
79 0.6
80 0.61
81 0.61
82 0.66
83 0.64
84 0.7
85 0.7
86 0.65
87 0.65
88 0.57
89 0.51
90 0.49
91 0.48
92 0.48
93 0.46
94 0.52
95 0.55
96 0.63
97 0.67
98 0.66
99 0.63
100 0.61
101 0.58
102 0.54
103 0.54
104 0.55
105 0.57
106 0.58
107 0.56
108 0.5
109 0.49
110 0.43
111 0.36
112 0.29
113 0.27
114 0.26
115 0.34
116 0.38
117 0.38
118 0.38
119 0.36
120 0.41
121 0.47
122 0.51
123 0.53
124 0.61
125 0.7
126 0.79
127 0.88
128 0.9
129 0.92
130 0.95
131 0.94
132 0.94
133 0.94
134 0.93
135 0.88
136 0.84
137 0.73
138 0.63
139 0.57
140 0.49
141 0.4
142 0.32
143 0.3
144 0.24
145 0.27
146 0.31
147 0.33
148 0.4
149 0.49
150 0.54
151 0.59
152 0.68
153 0.74
154 0.8
155 0.81
156 0.81
157 0.81
158 0.8
159 0.75
160 0.76
161 0.71
162 0.61
163 0.56
164 0.46
165 0.36
166 0.3
167 0.25
168 0.14
169 0.1
170 0.07
171 0.05
172 0.04
173 0.04
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.1
182 0.14
183 0.15
184 0.16
185 0.17
186 0.18
187 0.22
188 0.25
189 0.23
190 0.21
191 0.29
192 0.3
193 0.32
194 0.37
195 0.35
196 0.36
197 0.35
198 0.37
199 0.36
200 0.38
201 0.44
202 0.47
203 0.53
204 0.57
205 0.6
206 0.63
207 0.6
208 0.62
209 0.57
210 0.58
211 0.53
212 0.53
213 0.52
214 0.55
215 0.56
216 0.51
217 0.48
218 0.42
219 0.39
220 0.32
221 0.36
222 0.28
223 0.22
224 0.2
225 0.22
226 0.2
227 0.23
228 0.24
229 0.17
230 0.16
231 0.16
232 0.16
233 0.14
234 0.13
235 0.11
236 0.09
237 0.1
238 0.1
239 0.11
240 0.1
241 0.15
242 0.16
243 0.14
244 0.15
245 0.16
246 0.16
247 0.19
248 0.23
249 0.2
250 0.2
251 0.2
252 0.19
253 0.17
254 0.17
255 0.13
256 0.11
257 0.09
258 0.11
259 0.12
260 0.14
261 0.14
262 0.14
263 0.16
264 0.15
265 0.16
266 0.14
267 0.14
268 0.13
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.13
273 0.13
274 0.18
275 0.19
276 0.26
277 0.29
278 0.29
279 0.29
280 0.29
281 0.3
282 0.25
283 0.23
284 0.18
285 0.18
286 0.19
287 0.17
288 0.15
289 0.14
290 0.19
291 0.21
292 0.2
293 0.19
294 0.19
295 0.22
296 0.23
297 0.25
298 0.24
299 0.23
300 0.24
301 0.22
302 0.2
303 0.18
304 0.17
305 0.15
306 0.1
307 0.08
308 0.06
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.08
313 0.07
314 0.08
315 0.09
316 0.1
317 0.08
318 0.09
319 0.1
320 0.1
321 0.1
322 0.09
323 0.09
324 0.08
325 0.08
326 0.1
327 0.09
328 0.13
329 0.15
330 0.16
331 0.16
332 0.16
333 0.16
334 0.13
335 0.12
336 0.09
337 0.08
338 0.09
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.1
344 0.08
345 0.08
346 0.06
347 0.06
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.09
352 0.1
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.08
358 0.07
359 0.07
360 0.06
361 0.07
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.08
370 0.08
371 0.11
372 0.12
373 0.11
374 0.15
375 0.13
376 0.13
377 0.13
378 0.18
379 0.17
380 0.17
381 0.19
382 0.16
383 0.17
384 0.17
385 0.17
386 0.11
387 0.13
388 0.12
389 0.11
390 0.1
391 0.1
392 0.09
393 0.09
394 0.1
395 0.08
396 0.09
397 0.09
398 0.12
399 0.12
400 0.12
401 0.2
402 0.19
403 0.21
404 0.27
405 0.32
406 0.3
407 0.31
408 0.32
409 0.25
410 0.29
411 0.29
412 0.23
413 0.24
414 0.23
415 0.24
416 0.25
417 0.27
418 0.22
419 0.21
420 0.2
421 0.15
422 0.2
423 0.19
424 0.18
425 0.16
426 0.16
427 0.16
428 0.15
429 0.15
430 0.11
431 0.09
432 0.09
433 0.09
434 0.09
435 0.09
436 0.11
437 0.14
438 0.21
439 0.21
440 0.23
441 0.23
442 0.23
443 0.24
444 0.27
445 0.24
446 0.18
447 0.23
448 0.25
449 0.28
450 0.29
451 0.29
452 0.24
453 0.23
454 0.23
455 0.25
456 0.24
457 0.24
458 0.24
459 0.24
460 0.28
461 0.28
462 0.27
463 0.22
464 0.21
465 0.19
466 0.18
467 0.16
468 0.11
469 0.11
470 0.1
471 0.08
472 0.07
473 0.06
474 0.05
475 0.07
476 0.08
477 0.08
478 0.09
479 0.09
480 0.08
481 0.08
482 0.09
483 0.1
484 0.1
485 0.09
486 0.09
487 0.1
488 0.11
489 0.11
490 0.13
491 0.12
492 0.19
493 0.2
494 0.24
495 0.24
496 0.24
497 0.28
498 0.32
499 0.33
500 0.27
501 0.28
502 0.32
503 0.4
504 0.44
505 0.47
506 0.43
507 0.44
508 0.51
509 0.53
510 0.46
511 0.43
512 0.39
513 0.35
514 0.31
515 0.31
516 0.23
517 0.19
518 0.19
519 0.13
520 0.14
521 0.14
522 0.14
523 0.13
524 0.12
525 0.12
526 0.12
527 0.12
528 0.12
529 0.15
530 0.18
531 0.2
532 0.23
533 0.24
534 0.28
535 0.34
536 0.34
537 0.39
538 0.46
539 0.52
540 0.57
541 0.65
542 0.63
543 0.62
544 0.65
545 0.6
546 0.57
547 0.54
548 0.51
549 0.47
550 0.47
551 0.44
552 0.42
553 0.4
554 0.4
555 0.37
556 0.34
557 0.37
558 0.4
559 0.43
560 0.48
561 0.5
562 0.5
563 0.48
564 0.45
565 0.4
566 0.36
567 0.33
568 0.29
569 0.28
570 0.21
571 0.23
572 0.23
573 0.21
574 0.18
575 0.2
576 0.18
577 0.2
578 0.2
579 0.18
580 0.21
581 0.21
582 0.21
583 0.19
584 0.21
585 0.18
586 0.24
587 0.29
588 0.31
589 0.39
590 0.43
591 0.49
592 0.48
593 0.54
594 0.55
595 0.58
596 0.62
597 0.61
598 0.64
599 0.68
600 0.72
601 0.74
602 0.77
603 0.72
604 0.73
605 0.73
606 0.67
607 0.62
608 0.64
609 0.62
610 0.6
611 0.58
612 0.5
613 0.44
614 0.43
615 0.37
616 0.28
617 0.19
618 0.12
619 0.1
620 0.09
621 0.11
622 0.09
623 0.11
624 0.18
625 0.18
626 0.18
627 0.18
628 0.19
629 0.23
630 0.29
631 0.34
632 0.33
633 0.4
634 0.47
635 0.54
636 0.62
637 0.65
638 0.61
639 0.56
640 0.55
641 0.57
642 0.6
643 0.61
644 0.62
645 0.6
646 0.63
647 0.62
648 0.58
649 0.52
650 0.45
651 0.38
652 0.29
653 0.25
654 0.26
655 0.25
656 0.22
657 0.2
658 0.18
659 0.17
660 0.17
661 0.21
662 0.18
663 0.21
664 0.25
665 0.29
666 0.33
667 0.36
668 0.41
669 0.38
670 0.36
671 0.37
672 0.33
673 0.3
674 0.29
675 0.26
676 0.27
677 0.28
678 0.27
679 0.3
680 0.34
681 0.36
682 0.42
683 0.52
684 0.57
685 0.62
686 0.69
687 0.71
688 0.77
689 0.82
690 0.79
691 0.78
692 0.74
693 0.73
694 0.75
695 0.78
696 0.76
697 0.77
698 0.76
699 0.77
700 0.74
701 0.68
702 0.68
703 0.67
704 0.7
705 0.68
706 0.68
707 0.63
708 0.7
709 0.71
710 0.63
711 0.62
712 0.62
713 0.63
714 0.66
715 0.71
716 0.71
717 0.77
718 0.83
719 0.81
720 0.79
721 0.76
722 0.75
723 0.75
724 0.74
725 0.69
726 0.7
727 0.67
728 0.69
729 0.71
730 0.72
731 0.73
732 0.72
733 0.74
734 0.73
735 0.8
736 0.78
737 0.76
738 0.74
739 0.73
740 0.74
741 0.75
742 0.76
743 0.72
744 0.73
745 0.7
746 0.7
747 0.71
748 0.72
749 0.73
750 0.72
751 0.74
752 0.73
753 0.8
754 0.78
755 0.76
756 0.74
757 0.73
758 0.75
759 0.74
760 0.75
761 0.71
762 0.69
763 0.66
764 0.63
765 0.65
766 0.65
767 0.68
768 0.68
769 0.7
770 0.72
771 0.79