Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A098VMW3

Protein Details
Accession A0A098VMW3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
349-370DSEVSKKKIKKGKYSADQASQSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
355-359KKIKK
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto 8, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001406  PsdUridine_synth_TruA  
IPR020095  PsdUridine_synth_TruA_C  
IPR020094  TruA/RsuA/RluB/E/F_N  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
Amino Acid Sequences MSETLDRTEMMAPPVKFPKKKVALVLAYLGTNYQGMQMYIGLMRACRTDKGVHAAMQVVSLKVIFKDPIASIMSSINSHLPKDIRVCGIHPVSQTFDSKLHCDSRFYEYLLPTFMFKCDSSFDLSFLENMAAKRDTLDGKNEAASDGSECEDNVAGNEDQASMQKHKLAADFYSNNFKPTLADIEQLSAFRLSSKEKDRLDALLKCFEGSHFFHNYTIKKSAVDPSACRKIISFSKAHWYPLPLIPRNGDHDYASRCPGLFDGHFQESFEIRKNECPKSPWRGSLVSSKINPLSYDTYALEIDSFKEKEIYPAIASEEFSKNIFMNWWCAISLHAYDFQYVLQQWTPPDSEVSKKKIKKGKYSADQASQSEPPKVEQKNPDPSISQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.47
3 0.48
4 0.51
5 0.57
6 0.59
7 0.63
8 0.64
9 0.64
10 0.59
11 0.58
12 0.58
13 0.49
14 0.4
15 0.35
16 0.27
17 0.18
18 0.14
19 0.11
20 0.1
21 0.09
22 0.09
23 0.1
24 0.1
25 0.11
26 0.11
27 0.13
28 0.1
29 0.1
30 0.11
31 0.14
32 0.16
33 0.16
34 0.19
35 0.2
36 0.24
37 0.31
38 0.33
39 0.32
40 0.31
41 0.32
42 0.29
43 0.28
44 0.26
45 0.18
46 0.15
47 0.13
48 0.13
49 0.1
50 0.13
51 0.1
52 0.09
53 0.13
54 0.13
55 0.16
56 0.17
57 0.17
58 0.16
59 0.17
60 0.18
61 0.15
62 0.16
63 0.17
64 0.16
65 0.17
66 0.19
67 0.19
68 0.21
69 0.25
70 0.27
71 0.26
72 0.26
73 0.27
74 0.3
75 0.32
76 0.31
77 0.29
78 0.27
79 0.26
80 0.28
81 0.28
82 0.23
83 0.23
84 0.22
85 0.23
86 0.26
87 0.29
88 0.27
89 0.28
90 0.29
91 0.33
92 0.33
93 0.33
94 0.34
95 0.28
96 0.28
97 0.27
98 0.25
99 0.19
100 0.17
101 0.16
102 0.14
103 0.13
104 0.13
105 0.13
106 0.14
107 0.18
108 0.18
109 0.18
110 0.17
111 0.18
112 0.16
113 0.15
114 0.14
115 0.11
116 0.1
117 0.12
118 0.11
119 0.11
120 0.12
121 0.14
122 0.16
123 0.16
124 0.2
125 0.19
126 0.19
127 0.21
128 0.2
129 0.18
130 0.15
131 0.13
132 0.1
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.06
137 0.07
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.08
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.09
148 0.12
149 0.1
150 0.11
151 0.13
152 0.14
153 0.15
154 0.16
155 0.16
156 0.15
157 0.19
158 0.2
159 0.2
160 0.28
161 0.26
162 0.26
163 0.25
164 0.23
165 0.18
166 0.18
167 0.21
168 0.13
169 0.14
170 0.14
171 0.15
172 0.15
173 0.14
174 0.14
175 0.09
176 0.07
177 0.07
178 0.08
179 0.09
180 0.13
181 0.18
182 0.25
183 0.25
184 0.27
185 0.27
186 0.29
187 0.32
188 0.32
189 0.29
190 0.26
191 0.25
192 0.24
193 0.23
194 0.2
195 0.19
196 0.16
197 0.18
198 0.16
199 0.17
200 0.19
201 0.24
202 0.25
203 0.25
204 0.26
205 0.23
206 0.21
207 0.22
208 0.25
209 0.26
210 0.27
211 0.25
212 0.3
213 0.37
214 0.37
215 0.35
216 0.3
217 0.3
218 0.33
219 0.34
220 0.29
221 0.22
222 0.31
223 0.32
224 0.34
225 0.31
226 0.28
227 0.27
228 0.3
229 0.36
230 0.3
231 0.3
232 0.3
233 0.31
234 0.34
235 0.33
236 0.3
237 0.23
238 0.25
239 0.28
240 0.28
241 0.28
242 0.23
243 0.2
244 0.19
245 0.19
246 0.18
247 0.14
248 0.16
249 0.19
250 0.2
251 0.21
252 0.2
253 0.21
254 0.19
255 0.2
256 0.23
257 0.21
258 0.19
259 0.27
260 0.34
261 0.37
262 0.39
263 0.42
264 0.44
265 0.5
266 0.55
267 0.51
268 0.49
269 0.47
270 0.46
271 0.5
272 0.48
273 0.45
274 0.4
275 0.4
276 0.37
277 0.35
278 0.33
279 0.28
280 0.27
281 0.22
282 0.24
283 0.21
284 0.21
285 0.2
286 0.19
287 0.16
288 0.12
289 0.13
290 0.15
291 0.15
292 0.13
293 0.16
294 0.16
295 0.19
296 0.21
297 0.22
298 0.17
299 0.18
300 0.2
301 0.19
302 0.2
303 0.2
304 0.2
305 0.19
306 0.18
307 0.19
308 0.16
309 0.16
310 0.19
311 0.16
312 0.18
313 0.18
314 0.19
315 0.18
316 0.18
317 0.18
318 0.17
319 0.18
320 0.15
321 0.19
322 0.18
323 0.18
324 0.19
325 0.18
326 0.19
327 0.17
328 0.18
329 0.15
330 0.16
331 0.17
332 0.2
333 0.22
334 0.19
335 0.22
336 0.22
337 0.3
338 0.36
339 0.42
340 0.48
341 0.52
342 0.6
343 0.65
344 0.71
345 0.73
346 0.76
347 0.8
348 0.8
349 0.84
350 0.83
351 0.83
352 0.79
353 0.7
354 0.65
355 0.6
356 0.53
357 0.48
358 0.41
359 0.37
360 0.4
361 0.43
362 0.46
363 0.5
364 0.56
365 0.62
366 0.65