Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JJG7

Protein Details
Accession C4JJG7    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
484-506LGQIGGKKKQKKEDPKTEKGQTSHydrophilic
577-604QTKASVQRSRAKSPKRSKSPTPGIKTAPHydrophilic
618-637TPDERANRKREELRRQLESKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
366-368SKK
383-408PKRSRTKGKGLGAIGGRKIKTPDTKK
470-499KPMDKAAKSRPKSGLGQIGGKKKQKKEDPK
584-647RSRAKSPKRSKSPTPGIKTAPPAPKKEESITKTETPDERANRKREELRRQLESKAGPTKKKRRF
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 11.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
KEGG ure:UREG_01774  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MAVTWKRLPLEGHESCPFLYVSYTFGSRGYEIFLTDLAHVWSESLSRKQILAYALKQDTSIDPSQDDDQYSVLLQKISDALSGKAGTTLSLRGHRNRDDLKLSTETKLPTPLEPLVWIINLTRSPQNVFTKQVFLPVIRGAANCEARTQLLIEKLKEKDWALGKLFDKLESSGINLNTVFPSLTGTRHGRKGSAFSQAAKLIKGIAPFDENTWHLQSQEQNLNAPIDETIIREIAAADSVLKLDALENSSGDWWTKTWDSDHAITSPITSRTEAANKQLTKSTEQNQNESDDEFETRETPPRLKKPSRPADAAYNNKQRAQSVGKGRINQSTGSSENEAISPIQSPPPREQVKRPKIVGTINPKASKKGSRADSTESDTPLSPKRSRTKGKGLGAIGGRKIKTPDTKKPPSGMSDASTESDIPARKDVDKPSIQEESTESEADQDLTLRPNKRQKLSPTDDEESDKSLPKPMDKAAKSRPKSGLGQIGGKKKQKKEDPKTEKGQTSQANVSDEERTHDRVEASQAPTPKPAKRQNKLGMIGGGKPSRERTATRGQDKPPITSQGDVPTADETSDGEQTKASVQRSRAKSPKRSKSPTPGIKTAPPAPKKEESITKTETPDERANRKREELRRQLESKAGPTKKKRRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.39
3 0.39
4 0.31
5 0.22
6 0.2
7 0.15
8 0.14
9 0.15
10 0.17
11 0.15
12 0.16
13 0.18
14 0.17
15 0.17
16 0.18
17 0.16
18 0.15
19 0.16
20 0.15
21 0.14
22 0.14
23 0.15
24 0.12
25 0.12
26 0.11
27 0.1
28 0.1
29 0.12
30 0.16
31 0.19
32 0.22
33 0.23
34 0.24
35 0.24
36 0.27
37 0.3
38 0.32
39 0.31
40 0.36
41 0.36
42 0.36
43 0.35
44 0.33
45 0.3
46 0.3
47 0.29
48 0.22
49 0.2
50 0.23
51 0.26
52 0.26
53 0.25
54 0.19
55 0.17
56 0.16
57 0.16
58 0.16
59 0.14
60 0.12
61 0.11
62 0.12
63 0.13
64 0.13
65 0.15
66 0.14
67 0.14
68 0.16
69 0.17
70 0.16
71 0.16
72 0.15
73 0.13
74 0.13
75 0.16
76 0.16
77 0.23
78 0.28
79 0.34
80 0.41
81 0.45
82 0.51
83 0.52
84 0.54
85 0.54
86 0.51
87 0.5
88 0.49
89 0.47
90 0.41
91 0.41
92 0.36
93 0.32
94 0.36
95 0.32
96 0.27
97 0.29
98 0.28
99 0.25
100 0.24
101 0.24
102 0.19
103 0.17
104 0.16
105 0.12
106 0.14
107 0.15
108 0.17
109 0.18
110 0.19
111 0.21
112 0.28
113 0.35
114 0.35
115 0.39
116 0.38
117 0.39
118 0.38
119 0.41
120 0.35
121 0.28
122 0.27
123 0.23
124 0.23
125 0.19
126 0.19
127 0.16
128 0.22
129 0.25
130 0.22
131 0.22
132 0.21
133 0.2
134 0.21
135 0.19
136 0.15
137 0.2
138 0.23
139 0.24
140 0.29
141 0.31
142 0.31
143 0.34
144 0.31
145 0.3
146 0.31
147 0.35
148 0.31
149 0.36
150 0.35
151 0.38
152 0.38
153 0.33
154 0.29
155 0.24
156 0.23
157 0.17
158 0.19
159 0.17
160 0.16
161 0.17
162 0.16
163 0.16
164 0.14
165 0.14
166 0.12
167 0.07
168 0.1
169 0.1
170 0.11
171 0.15
172 0.2
173 0.24
174 0.3
175 0.3
176 0.3
177 0.3
178 0.35
179 0.32
180 0.36
181 0.34
182 0.3
183 0.32
184 0.34
185 0.34
186 0.28
187 0.26
188 0.18
189 0.18
190 0.18
191 0.15
192 0.12
193 0.13
194 0.13
195 0.14
196 0.15
197 0.14
198 0.16
199 0.19
200 0.18
201 0.16
202 0.18
203 0.2
204 0.23
205 0.27
206 0.25
207 0.23
208 0.24
209 0.24
210 0.22
211 0.19
212 0.13
213 0.09
214 0.09
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.07
220 0.08
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.05
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.06
241 0.09
242 0.1
243 0.1
244 0.11
245 0.14
246 0.18
247 0.19
248 0.2
249 0.18
250 0.18
251 0.17
252 0.17
253 0.16
254 0.14
255 0.13
256 0.12
257 0.13
258 0.14
259 0.19
260 0.2
261 0.22
262 0.27
263 0.27
264 0.28
265 0.31
266 0.3
267 0.29
268 0.32
269 0.34
270 0.36
271 0.37
272 0.39
273 0.36
274 0.37
275 0.33
276 0.29
277 0.24
278 0.15
279 0.14
280 0.12
281 0.11
282 0.1
283 0.1
284 0.14
285 0.15
286 0.19
287 0.25
288 0.32
289 0.4
290 0.45
291 0.52
292 0.58
293 0.66
294 0.67
295 0.64
296 0.58
297 0.59
298 0.61
299 0.6
300 0.57
301 0.56
302 0.51
303 0.51
304 0.49
305 0.4
306 0.36
307 0.34
308 0.32
309 0.31
310 0.4
311 0.4
312 0.42
313 0.43
314 0.43
315 0.4
316 0.34
317 0.28
318 0.21
319 0.2
320 0.19
321 0.19
322 0.15
323 0.14
324 0.14
325 0.13
326 0.09
327 0.09
328 0.08
329 0.07
330 0.11
331 0.13
332 0.15
333 0.17
334 0.26
335 0.31
336 0.32
337 0.41
338 0.48
339 0.55
340 0.6
341 0.58
342 0.53
343 0.51
344 0.53
345 0.5
346 0.48
347 0.45
348 0.44
349 0.48
350 0.45
351 0.44
352 0.43
353 0.42
354 0.37
355 0.38
356 0.38
357 0.37
358 0.4
359 0.43
360 0.42
361 0.42
362 0.4
363 0.33
364 0.29
365 0.25
366 0.24
367 0.24
368 0.27
369 0.24
370 0.29
371 0.36
372 0.44
373 0.51
374 0.56
375 0.62
376 0.65
377 0.67
378 0.66
379 0.59
380 0.54
381 0.5
382 0.45
383 0.37
384 0.32
385 0.28
386 0.23
387 0.24
388 0.24
389 0.31
390 0.36
391 0.43
392 0.49
393 0.57
394 0.59
395 0.61
396 0.59
397 0.53
398 0.5
399 0.42
400 0.34
401 0.28
402 0.26
403 0.24
404 0.21
405 0.17
406 0.14
407 0.15
408 0.15
409 0.13
410 0.15
411 0.16
412 0.17
413 0.22
414 0.25
415 0.29
416 0.31
417 0.32
418 0.34
419 0.36
420 0.34
421 0.3
422 0.28
423 0.25
424 0.23
425 0.22
426 0.17
427 0.14
428 0.14
429 0.14
430 0.12
431 0.09
432 0.08
433 0.12
434 0.17
435 0.18
436 0.25
437 0.33
438 0.4
439 0.44
440 0.51
441 0.55
442 0.6
443 0.65
444 0.66
445 0.65
446 0.62
447 0.59
448 0.55
449 0.48
450 0.41
451 0.36
452 0.3
453 0.23
454 0.25
455 0.25
456 0.23
457 0.26
458 0.27
459 0.35
460 0.35
461 0.42
462 0.47
463 0.56
464 0.57
465 0.61
466 0.6
467 0.56
468 0.57
469 0.55
470 0.53
471 0.46
472 0.5
473 0.49
474 0.53
475 0.55
476 0.59
477 0.61
478 0.59
479 0.66
480 0.68
481 0.73
482 0.75
483 0.79
484 0.82
485 0.84
486 0.86
487 0.85
488 0.79
489 0.7
490 0.68
491 0.6
492 0.55
493 0.51
494 0.45
495 0.39
496 0.35
497 0.34
498 0.3
499 0.26
500 0.25
501 0.24
502 0.25
503 0.24
504 0.25
505 0.24
506 0.22
507 0.28
508 0.3
509 0.3
510 0.3
511 0.33
512 0.32
513 0.38
514 0.41
515 0.4
516 0.44
517 0.5
518 0.58
519 0.61
520 0.7
521 0.72
522 0.77
523 0.75
524 0.69
525 0.64
526 0.55
527 0.51
528 0.47
529 0.4
530 0.32
531 0.31
532 0.31
533 0.3
534 0.32
535 0.31
536 0.31
537 0.4
538 0.49
539 0.54
540 0.58
541 0.57
542 0.62
543 0.62
544 0.6
545 0.54
546 0.51
547 0.46
548 0.4
549 0.39
550 0.37
551 0.37
552 0.33
553 0.29
554 0.24
555 0.22
556 0.2
557 0.17
558 0.12
559 0.12
560 0.17
561 0.17
562 0.15
563 0.15
564 0.16
565 0.21
566 0.25
567 0.26
568 0.27
569 0.32
570 0.42
571 0.48
572 0.57
573 0.62
574 0.66
575 0.74
576 0.79
577 0.84
578 0.85
579 0.87
580 0.86
581 0.88
582 0.89
583 0.89
584 0.86
585 0.82
586 0.76
587 0.74
588 0.71
589 0.69
590 0.68
591 0.64
592 0.61
593 0.61
594 0.62
595 0.61
596 0.62
597 0.63
598 0.58
599 0.59
600 0.6
601 0.57
602 0.54
603 0.56
604 0.52
605 0.48
606 0.52
607 0.54
608 0.58
609 0.62
610 0.66
611 0.66
612 0.71
613 0.75
614 0.76
615 0.78
616 0.79
617 0.78
618 0.8
619 0.77
620 0.72
621 0.7
622 0.64
623 0.61
624 0.61
625 0.61
626 0.61
627 0.69