Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JIH2

Protein Details
Accession C4JIH2    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
176-205DTRPSALRGKKGKKGKRKGKKSRDIYEETGBasic
584-609SSPLDVRRPQQKPPPKQEPTRRSPVPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
106-107KR
182-198LRGKKGKKGKRKGKKSR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013907  Sds3  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
KEGG ure:UREG_01509  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08598  Sds3  
Amino Acid Sequences MSPKQERFGSEIDSEAETERIEDSPSRLRNRSSIVLSATAYGASPSKLAQSTTYDDLDEDDAVETEASPSKPPRDTRVNGITNNSKRTAADPAGLSTASRELIGKKRKRGDSAVNGTEEIDNEEPLRKRRGSPSGDAAGLETEQEAAADEAEMESKEKEPLSTDEVSPLNEEQPDDTRPSALRGKKGKKGKRKGKKSRDIYEETGENGLGDDSQANGDEQLPEDEDNGEVIDGTDDPEAALKMEESMKKTTAMDVLLSLERQFASLRDKIYDDRIASINEELAQLEKPNPTHPEFLRQLRIIEHHRDEKMAIDEKLFAYKLRSLCIKSQAERSQVNSSYYQNVRDIRERYLQEISEHHYRVQQDRFQTSETSVGYGIPFPTRRAQQAAQQAAYSAEVGILAGTAKYVGFPSAPDMKGLQRNEIEEDFGKLGISLRPTNVNSLPHPPFSQQHDYPSIPSAAVTRQAAEEEFIEQTPWANPQHPIHEQFRHQMQQGIISDHQRFSNPFSTPAAQQRTVDLHAPNGSASTIPEHPSAPNSSAANTPYDYERTRRNLGTAMAVADPADSRGAEGDDLEKPSTFRSLSSSPLDVRRPQQKPPPKQEPTRRSPVPTSIEPMGPPSSIRDLPYSPSSSSTLRAGRFGTTPREDQLSSSSSSARQKPQNFSPIHQSAGITAGGSEKVRMNG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.22
3 0.19
4 0.14
5 0.14
6 0.13
7 0.11
8 0.13
9 0.14
10 0.18
11 0.26
12 0.34
13 0.4
14 0.43
15 0.46
16 0.49
17 0.53
18 0.56
19 0.5
20 0.47
21 0.43
22 0.42
23 0.39
24 0.35
25 0.29
26 0.22
27 0.18
28 0.14
29 0.12
30 0.1
31 0.1
32 0.09
33 0.14
34 0.15
35 0.16
36 0.18
37 0.21
38 0.26
39 0.3
40 0.3
41 0.26
42 0.24
43 0.25
44 0.24
45 0.19
46 0.14
47 0.11
48 0.1
49 0.1
50 0.1
51 0.08
52 0.08
53 0.13
54 0.13
55 0.16
56 0.2
57 0.25
58 0.32
59 0.36
60 0.42
61 0.48
62 0.5
63 0.56
64 0.62
65 0.63
66 0.59
67 0.62
68 0.64
69 0.6
70 0.62
71 0.55
72 0.46
73 0.4
74 0.4
75 0.41
76 0.33
77 0.31
78 0.27
79 0.27
80 0.27
81 0.26
82 0.24
83 0.18
84 0.17
85 0.13
86 0.12
87 0.12
88 0.15
89 0.24
90 0.35
91 0.41
92 0.49
93 0.58
94 0.63
95 0.68
96 0.71
97 0.72
98 0.72
99 0.74
100 0.7
101 0.62
102 0.56
103 0.51
104 0.44
105 0.34
106 0.27
107 0.19
108 0.14
109 0.14
110 0.19
111 0.22
112 0.25
113 0.32
114 0.3
115 0.34
116 0.41
117 0.5
118 0.5
119 0.52
120 0.56
121 0.53
122 0.51
123 0.47
124 0.39
125 0.3
126 0.24
127 0.18
128 0.11
129 0.07
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.04
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.07
142 0.08
143 0.1
144 0.11
145 0.11
146 0.13
147 0.16
148 0.2
149 0.22
150 0.21
151 0.24
152 0.24
153 0.24
154 0.23
155 0.21
156 0.17
157 0.16
158 0.16
159 0.13
160 0.16
161 0.17
162 0.18
163 0.18
164 0.18
165 0.17
166 0.22
167 0.28
168 0.29
169 0.35
170 0.43
171 0.5
172 0.56
173 0.66
174 0.71
175 0.74
176 0.81
177 0.84
178 0.85
179 0.89
180 0.92
181 0.93
182 0.94
183 0.93
184 0.91
185 0.88
186 0.84
187 0.76
188 0.69
189 0.59
190 0.5
191 0.41
192 0.31
193 0.23
194 0.16
195 0.12
196 0.07
197 0.06
198 0.05
199 0.04
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.09
209 0.08
210 0.09
211 0.09
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.06
216 0.05
217 0.05
218 0.04
219 0.04
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.05
227 0.06
228 0.04
229 0.06
230 0.1
231 0.13
232 0.15
233 0.17
234 0.18
235 0.19
236 0.19
237 0.19
238 0.17
239 0.15
240 0.12
241 0.11
242 0.12
243 0.11
244 0.11
245 0.1
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.12
252 0.15
253 0.15
254 0.16
255 0.18
256 0.18
257 0.22
258 0.25
259 0.2
260 0.2
261 0.2
262 0.19
263 0.19
264 0.18
265 0.14
266 0.11
267 0.1
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.09
273 0.1
274 0.1
275 0.13
276 0.17
277 0.19
278 0.24
279 0.23
280 0.3
281 0.32
282 0.36
283 0.37
284 0.34
285 0.33
286 0.29
287 0.33
288 0.29
289 0.3
290 0.31
291 0.3
292 0.3
293 0.3
294 0.28
295 0.26
296 0.26
297 0.23
298 0.2
299 0.16
300 0.17
301 0.16
302 0.18
303 0.16
304 0.12
305 0.11
306 0.14
307 0.14
308 0.15
309 0.18
310 0.18
311 0.21
312 0.29
313 0.3
314 0.28
315 0.36
316 0.38
317 0.4
318 0.39
319 0.39
320 0.36
321 0.34
322 0.35
323 0.29
324 0.26
325 0.26
326 0.26
327 0.24
328 0.22
329 0.23
330 0.24
331 0.27
332 0.28
333 0.27
334 0.32
335 0.31
336 0.31
337 0.3
338 0.28
339 0.24
340 0.23
341 0.24
342 0.23
343 0.23
344 0.21
345 0.22
346 0.23
347 0.27
348 0.3
349 0.29
350 0.26
351 0.28
352 0.29
353 0.27
354 0.26
355 0.22
356 0.21
357 0.17
358 0.15
359 0.13
360 0.11
361 0.1
362 0.1
363 0.1
364 0.09
365 0.1
366 0.11
367 0.15
368 0.16
369 0.18
370 0.22
371 0.23
372 0.27
373 0.34
374 0.36
375 0.33
376 0.31
377 0.29
378 0.24
379 0.23
380 0.17
381 0.08
382 0.05
383 0.04
384 0.04
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.02
389 0.02
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.08
398 0.14
399 0.15
400 0.15
401 0.16
402 0.2
403 0.26
404 0.27
405 0.27
406 0.22
407 0.24
408 0.26
409 0.25
410 0.23
411 0.17
412 0.18
413 0.15
414 0.13
415 0.12
416 0.09
417 0.1
418 0.09
419 0.12
420 0.11
421 0.12
422 0.16
423 0.17
424 0.21
425 0.22
426 0.23
427 0.22
428 0.29
429 0.3
430 0.28
431 0.29
432 0.27
433 0.28
434 0.33
435 0.38
436 0.32
437 0.34
438 0.37
439 0.37
440 0.36
441 0.34
442 0.28
443 0.2
444 0.19
445 0.16
446 0.12
447 0.14
448 0.13
449 0.12
450 0.12
451 0.12
452 0.12
453 0.12
454 0.11
455 0.09
456 0.1
457 0.09
458 0.09
459 0.08
460 0.09
461 0.09
462 0.11
463 0.11
464 0.12
465 0.16
466 0.19
467 0.25
468 0.28
469 0.33
470 0.36
471 0.39
472 0.4
473 0.42
474 0.45
475 0.42
476 0.39
477 0.38
478 0.33
479 0.35
480 0.33
481 0.32
482 0.29
483 0.29
484 0.3
485 0.27
486 0.28
487 0.23
488 0.22
489 0.23
490 0.28
491 0.25
492 0.25
493 0.28
494 0.29
495 0.31
496 0.38
497 0.39
498 0.34
499 0.33
500 0.34
501 0.34
502 0.33
503 0.34
504 0.26
505 0.23
506 0.22
507 0.22
508 0.19
509 0.16
510 0.14
511 0.11
512 0.11
513 0.12
514 0.12
515 0.14
516 0.15
517 0.16
518 0.17
519 0.19
520 0.22
521 0.2
522 0.22
523 0.2
524 0.2
525 0.22
526 0.23
527 0.22
528 0.19
529 0.19
530 0.18
531 0.21
532 0.22
533 0.23
534 0.29
535 0.33
536 0.38
537 0.38
538 0.37
539 0.37
540 0.36
541 0.36
542 0.3
543 0.25
544 0.2
545 0.19
546 0.16
547 0.13
548 0.12
549 0.09
550 0.08
551 0.06
552 0.06
553 0.07
554 0.08
555 0.08
556 0.08
557 0.11
558 0.13
559 0.15
560 0.16
561 0.16
562 0.15
563 0.17
564 0.2
565 0.17
566 0.15
567 0.19
568 0.2
569 0.25
570 0.28
571 0.3
572 0.3
573 0.36
574 0.41
575 0.39
576 0.45
577 0.5
578 0.5
579 0.54
580 0.61
581 0.65
582 0.71
583 0.77
584 0.8
585 0.79
586 0.86
587 0.89
588 0.89
589 0.86
590 0.86
591 0.8
592 0.75
593 0.72
594 0.7
595 0.66
596 0.59
597 0.56
598 0.49
599 0.46
600 0.4
601 0.39
602 0.32
603 0.25
604 0.23
605 0.21
606 0.24
607 0.24
608 0.26
609 0.26
610 0.26
611 0.31
612 0.36
613 0.36
614 0.3
615 0.32
616 0.33
617 0.3
618 0.31
619 0.33
620 0.33
621 0.3
622 0.32
623 0.31
624 0.3
625 0.32
626 0.34
627 0.36
628 0.36
629 0.37
630 0.37
631 0.4
632 0.38
633 0.36
634 0.36
635 0.31
636 0.28
637 0.27
638 0.26
639 0.27
640 0.35
641 0.4
642 0.44
643 0.5
644 0.55
645 0.61
646 0.68
647 0.72
648 0.68
649 0.65
650 0.66
651 0.6
652 0.55
653 0.49
654 0.4
655 0.32
656 0.31
657 0.27
658 0.17
659 0.13
660 0.13
661 0.13
662 0.14
663 0.15