Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JIG9

Protein Details
Accession C4JIG9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
89-115TSKRLRPDRVPPPPRKHKNPCHQFVKTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
100-104PPPRK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG ure:UREG_01506  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MEMKLVSADTLVQDGIERDVAAEPVAANGDEQGQHKIKVDETAEALSGIDNLSTDTSSVDTSDLSDETSSSSDSSSDDSDGDSAPEEMTSKRLRPDRVPPPPRKHKNPCHQFVKTGRCRRGENCRYSHEIPDKTRRATKDAGSEPKRPSLFQMLVDQQKEDEARRVMQAIAWLGERGMLDERAAGEGVAGGEEAAKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.1
3 0.1
4 0.09
5 0.09
6 0.1
7 0.1
8 0.09
9 0.09
10 0.07
11 0.07
12 0.08
13 0.07
14 0.06
15 0.07
16 0.08
17 0.1
18 0.11
19 0.17
20 0.18
21 0.19
22 0.22
23 0.23
24 0.22
25 0.26
26 0.26
27 0.21
28 0.21
29 0.21
30 0.18
31 0.17
32 0.16
33 0.11
34 0.09
35 0.07
36 0.05
37 0.04
38 0.05
39 0.05
40 0.05
41 0.05
42 0.05
43 0.06
44 0.06
45 0.07
46 0.07
47 0.06
48 0.07
49 0.08
50 0.07
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.08
56 0.08
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.09
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.07
70 0.06
71 0.05
72 0.05
73 0.06
74 0.05
75 0.09
76 0.11
77 0.12
78 0.17
79 0.21
80 0.24
81 0.27
82 0.36
83 0.43
84 0.52
85 0.6
86 0.64
87 0.69
88 0.78
89 0.82
90 0.82
91 0.82
92 0.82
93 0.83
94 0.84
95 0.83
96 0.8
97 0.74
98 0.7
99 0.68
100 0.68
101 0.67
102 0.66
103 0.64
104 0.59
105 0.61
106 0.6
107 0.63
108 0.62
109 0.6
110 0.56
111 0.55
112 0.58
113 0.56
114 0.59
115 0.55
116 0.52
117 0.5
118 0.55
119 0.55
120 0.52
121 0.55
122 0.5
123 0.48
124 0.46
125 0.44
126 0.43
127 0.46
128 0.53
129 0.53
130 0.57
131 0.54
132 0.58
133 0.55
134 0.46
135 0.42
136 0.4
137 0.37
138 0.33
139 0.37
140 0.36
141 0.41
142 0.41
143 0.37
144 0.29
145 0.3
146 0.29
147 0.24
148 0.24
149 0.21
150 0.22
151 0.23
152 0.24
153 0.21
154 0.21
155 0.22
156 0.18
157 0.16
158 0.16
159 0.14
160 0.13
161 0.14
162 0.13
163 0.12
164 0.13
165 0.12
166 0.11
167 0.12
168 0.13
169 0.13
170 0.13
171 0.11
172 0.08
173 0.09
174 0.08
175 0.07
176 0.06
177 0.05