FuNGI

A0A098VLI5

Protein Details

Accession

A0A098VLI5

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
24-52	IEENTGRRIKPAKKFKRLQRRIRDDESSS	Hydrophilic
573-594	HIMPYLKKRFCQKMKKDALETV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
30-44	RRIKPAKKFKRLQRR

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR028083 Spt6_acidic_N_dom IPR028088 Spt6_HTH_DNA-bd_dom IPR028231 Spt6_YqgF IPR023323 Tex-like_dom_sf IPR023319 Tex-like_HTH_dom_sf IPR017072 TF_Spt6 IPR037027 YqgF/RNaseH-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0003677 F:DNA binding GO:0006139 P:nucleobase-containing compound metabolic process GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF14641 HTH_44 PF14632 SPT6_acidic PF14639 YqgF

Amino Acid Sequences

MIHASSSSSSSDDDHLDEEDFELIEENTGRRIKPAKKFKRLQRRIRDDESSSDFEDEVVSAAKSHTAPLENMFDESEENFQKSRKSFQKLSSSRYSDEADFFEDEEEEEEDDIANFIEEDMDNEEDNTSRLDQKLNKLHKSSSAWQEMNDIFGEGFDLEMSLEPQDDISIRSKSVSLDEIYEPAEIAAKLFTTEDEAIRVIDIPERIQLRDGHQRPPISETELRMESVYIAFKIEKLAKRPLTDEFRKQFLNAIAAILKFIREDFFEIPFIATHRKEYFQEYLSLDDLWAIYDYDEKWKILQERKAKILSFLELRENSSIDETHLIHYLNKAELEEEDMEDCLEYINYKYGKDSFSTSSSVNSGKSTAFKRPVSMIKRIDGKSELLSSKSPILHEFLPKIGITPRQFGINLTDMMKRFEPEDATVSPQTLIQSMVSTNNSDPEVIKENAISLLAKDFSMEPFVRKAFRALLGNSIFISTHPTEKGIHEISATHEYAHIKFLQKKPMFAFVDSEFLELLEAEKVNLLNVVIDVEFEERYYRQVESFFMSETYSLNAEKWNPFRKQILKDCVDNHIMPYLKKRFCQKMKKDALETVGKFCQHSLTEKLLFGKFIQPESSSNSPSTFMAVSWYDGAPGSLTYAVVINEEGALVESLRLSNMLDRNKKPEDLEKLSEFIAKHQPCVIGVSGISPNVKYSLLADIQKLVSELKLSGK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.18
3	0.18
4	0.17
5	0.16
6	0.14
7	0.12
8	0.11
9	0.11
10	0.09
11	0.1
12	0.11
13	0.11
14	0.16
15	0.19
16	0.19
17	0.23
18	0.32
19	0.4
20	0.49
21	0.59
22	0.64
23	0.73
24	0.82
25	0.87
26	0.9
27	0.92
28	0.93
29	0.93
30	0.92
31	0.9
32	0.88
33	0.85
34	0.77
35	0.73
36	0.69
37	0.62
38	0.53
39	0.46
40	0.38
41	0.3
42	0.27
43	0.2
44	0.14
45	0.11
46	0.09
47	0.08
48	0.08
49	0.11
50	0.11
51	0.12
52	0.15
53	0.16
54	0.17
55	0.21
56	0.26
57	0.23
58	0.24
59	0.23
60	0.2
61	0.19
62	0.19
63	0.2
64	0.17
65	0.18
66	0.19
67	0.2
68	0.26
69	0.27
70	0.36
71	0.4
72	0.46
73	0.51
74	0.59
75	0.68
76	0.68
77	0.73
78	0.73
79	0.69
80	0.62
81	0.59
82	0.54
83	0.44
84	0.41
85	0.35
86	0.29
87	0.24
88	0.23
89	0.2
90	0.16
91	0.14
92	0.14
93	0.13
94	0.1
95	0.09
96	0.09
97	0.09
98	0.08
99	0.08
100	0.07
101	0.05
102	0.05
103	0.04
104	0.06
105	0.05
106	0.07
107	0.1
108	0.11
109	0.11
110	0.11
111	0.12
112	0.11
113	0.12
114	0.12
115	0.11
116	0.13
117	0.14
118	0.2
119	0.24
120	0.33
121	0.43
122	0.49
123	0.54
124	0.55
125	0.55
126	0.57
127	0.59
128	0.57
129	0.56
130	0.57
131	0.51
132	0.48
133	0.51
134	0.44
135	0.39
136	0.31
137	0.22
138	0.13
139	0.12
140	0.13
141	0.07
142	0.07
143	0.05
144	0.04
145	0.04
146	0.05
147	0.06
148	0.05
149	0.05
150	0.05
151	0.05
152	0.06
153	0.06
154	0.08
155	0.12
156	0.13
157	0.13
158	0.14
159	0.15
160	0.15
161	0.17
162	0.17
163	0.14
164	0.16
165	0.17
166	0.17
167	0.17
168	0.16
169	0.14
170	0.11
171	0.12
172	0.08
173	0.08
174	0.07
175	0.06
176	0.07
177	0.07
178	0.07
179	0.09
180	0.11
181	0.11
182	0.12
183	0.12
184	0.11
185	0.12
186	0.12
187	0.08
188	0.1
189	0.1
190	0.1
191	0.14
192	0.15
193	0.15
194	0.17
195	0.19
196	0.21
197	0.32
198	0.33
199	0.35
200	0.39
201	0.4
202	0.38
203	0.4
204	0.37
205	0.33
206	0.33
207	0.29
208	0.29
209	0.29
210	0.28
211	0.24
212	0.22
213	0.16
214	0.15
215	0.14
216	0.09
217	0.09
218	0.09
219	0.09
220	0.12
221	0.18
222	0.2
223	0.23
224	0.32
225	0.34
226	0.36
227	0.38
228	0.41
229	0.44
230	0.46
231	0.51
232	0.46
233	0.46
234	0.45
235	0.43
236	0.4
237	0.33
238	0.29
239	0.2
240	0.18
241	0.16
242	0.15
243	0.15
244	0.11
245	0.09
246	0.07
247	0.07
248	0.07
249	0.06
250	0.1
251	0.11
252	0.12
253	0.13
254	0.13
255	0.13
256	0.13
257	0.13
258	0.15
259	0.14
260	0.16
261	0.17
262	0.19
263	0.2
264	0.24
265	0.26
266	0.23
267	0.27
268	0.24
269	0.24
270	0.22
271	0.21
272	0.16
273	0.13
274	0.11
275	0.07
276	0.07
277	0.05
278	0.04
279	0.06
280	0.07
281	0.11
282	0.13
283	0.12
284	0.12
285	0.16
286	0.22
287	0.27
288	0.34
289	0.38
290	0.41
291	0.46
292	0.49
293	0.45
294	0.42
295	0.37
296	0.32
297	0.26
298	0.23
299	0.23
300	0.2
301	0.21
302	0.19
303	0.18
304	0.16
305	0.14
306	0.13
307	0.09
308	0.11
309	0.1
310	0.1
311	0.11
312	0.11
313	0.11
314	0.12
315	0.12
316	0.11
317	0.1
318	0.09
319	0.08
320	0.08
321	0.1
322	0.1
323	0.09
324	0.08
325	0.08
326	0.08
327	0.07
328	0.07
329	0.04
330	0.04
331	0.03
332	0.04
333	0.08
334	0.09
335	0.09
336	0.1
337	0.12
338	0.13
339	0.14
340	0.16
341	0.14
342	0.16
343	0.18
344	0.17
345	0.16
346	0.17
347	0.17
348	0.14
349	0.12
350	0.11
351	0.1
352	0.14
353	0.15
354	0.19
355	0.25
356	0.24
357	0.25
358	0.28
359	0.36
360	0.36
361	0.41
362	0.38
363	0.36
364	0.43
365	0.42
366	0.4
367	0.33
368	0.31
369	0.24
370	0.26
371	0.22
372	0.16
373	0.17
374	0.16
375	0.17
376	0.17
377	0.16
378	0.13
379	0.15
380	0.16
381	0.18
382	0.17
383	0.15
384	0.15
385	0.14
386	0.14
387	0.14
388	0.18
389	0.18
390	0.19
391	0.19
392	0.2
393	0.2
394	0.2
395	0.21
396	0.17
397	0.17
398	0.16
399	0.19
400	0.17
401	0.19
402	0.19
403	0.16
404	0.14
405	0.14
406	0.14
407	0.12
408	0.15
409	0.14
410	0.17
411	0.17
412	0.17
413	0.16
414	0.15
415	0.14
416	0.11
417	0.11
418	0.07
419	0.07
420	0.08
421	0.1
422	0.1
423	0.11
424	0.1
425	0.12
426	0.12
427	0.12
428	0.11
429	0.12
430	0.16
431	0.16
432	0.16
433	0.14
434	0.14
435	0.14
436	0.14
437	0.11
438	0.06
439	0.07
440	0.07
441	0.07
442	0.07
443	0.08
444	0.08
445	0.12
446	0.12
447	0.12
448	0.14
449	0.16
450	0.17
451	0.17
452	0.19
453	0.17
454	0.2
455	0.22
456	0.2
457	0.25
458	0.25
459	0.25
460	0.23
461	0.21
462	0.18
463	0.14
464	0.19
465	0.13
466	0.14
467	0.14
468	0.15
469	0.17
470	0.17
471	0.23
472	0.18
473	0.18
474	0.15
475	0.16
476	0.18
477	0.22
478	0.21
479	0.16
480	0.17
481	0.18
482	0.19
483	0.2
484	0.19
485	0.2
486	0.27
487	0.32
488	0.4
489	0.4
490	0.43
491	0.43
492	0.49
493	0.46
494	0.39
495	0.38
496	0.29
497	0.32
498	0.28
499	0.26
500	0.17
501	0.15
502	0.14
503	0.1
504	0.1
505	0.07
506	0.06
507	0.06
508	0.07
509	0.07
510	0.07
511	0.08
512	0.07
513	0.05
514	0.05
515	0.06
516	0.05
517	0.05
518	0.06
519	0.07
520	0.07
521	0.07
522	0.09
523	0.08
524	0.1
525	0.12
526	0.12
527	0.12
528	0.13
529	0.14
530	0.16
531	0.17
532	0.16
533	0.15
534	0.15
535	0.14
536	0.13
537	0.13
538	0.11
539	0.1
540	0.1
541	0.12
542	0.15
543	0.21
544	0.28
545	0.34
546	0.36
547	0.39
548	0.47
549	0.52
550	0.58
551	0.62
552	0.64
553	0.6
554	0.62
555	0.61
556	0.58
557	0.55
558	0.46
559	0.37
560	0.33
561	0.31
562	0.27
563	0.34
564	0.38
565	0.37
566	0.41
567	0.49
568	0.54
569	0.62
570	0.72
571	0.73
572	0.74
573	0.81
574	0.85
575	0.8
576	0.74
577	0.69
578	0.67
579	0.59
580	0.53
581	0.47
582	0.4
583	0.36
584	0.32
585	0.31
586	0.24
587	0.27
588	0.26
589	0.29
590	0.31
591	0.32
592	0.36
593	0.32
594	0.32
595	0.28
596	0.31
597	0.26
598	0.25
599	0.26
600	0.24
601	0.25
602	0.31
603	0.34
604	0.3
605	0.29
606	0.28
607	0.27
608	0.25
609	0.26
610	0.19
611	0.14
612	0.16
613	0.15
614	0.16
615	0.16
616	0.16
617	0.14
618	0.14
619	0.14
620	0.1
621	0.1
622	0.1
623	0.08
624	0.08
625	0.08
626	0.09
627	0.09
628	0.09
629	0.09
630	0.08
631	0.07
632	0.07
633	0.07
634	0.06
635	0.06
636	0.06
637	0.06
638	0.06
639	0.07
640	0.07
641	0.07
642	0.07
643	0.13
644	0.19
645	0.29
646	0.37
647	0.4
648	0.48
649	0.52
650	0.55
651	0.53
652	0.55
653	0.56
654	0.55
655	0.58
656	0.53
657	0.5
658	0.48
659	0.47
660	0.39
661	0.34
662	0.37
663	0.31
664	0.31
665	0.32
666	0.33
667	0.3
668	0.33
669	0.29
670	0.2
671	0.19
672	0.21
673	0.19
674	0.2
675	0.2
676	0.17
677	0.17
678	0.17
679	0.18
680	0.14
681	0.14
682	0.18
683	0.22
684	0.24
685	0.24
686	0.27
687	0.27
688	0.27
689	0.26
690	0.21
691	0.16
692	0.16

A0A098VLI5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer