Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A060SSX2

Protein Details
Accession A0A060SSX2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-58PGSSRSKSPSTSPRPKPKSRRPSVSSPMTWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-49STSPRPKPKSRR
518-525KEKSPKKA
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 9, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011333  SKP1/BTB/POZ_sf  
Amino Acid Sequences MLSSSLNRPTHHRPQPSISGPMPAVLPAPGSSRSKSPSTSPRPKPKSRRPSVSSPMTWLSRASSSSSVQSNTPYAPSKPVRISEPRFMDPIEALTLPRGGVLGAGAIVVRTPQDALAGPRASASTPDLTRTRSASPQRATVREYEDRTDYERPSSPPLPPIPDDDSEYEEEAQDAEPESVTSDWHSASQPVTSHPPPPPPSRPPPSIPSIPDYDSEVAPAPPRPVSPLRPSPKAYPPTPTPDHFAVPTVPAGVPALPPQPPFDAILVSPVPNSTLDPSKIIVSLETSTATNKTTMATLVSRPSYMASFLLGLFPSNDADTQSVYSNNSDVESSFNSIFQHHLASSGVLTQTSTNLHVFLDRPSAPYAHILAYLRSPHSTPETPASLPHAARLNGSPARVEALIELRDEAAYLGLDELERLCNDELRHARQGTPSSLGLGLHMRGFSSASTHSVRSLHTLRERAEPIERGIDKAVLRRSDDSGFASAETAEGARKSGSSAELEVPWPSPPELKQRAALKEKSPKKAGFASLKARPAVEWI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.74
3 0.72
4 0.7
5 0.6
6 0.56
7 0.48
8 0.43
9 0.36
10 0.26
11 0.22
12 0.15
13 0.15
14 0.11
15 0.14
16 0.17
17 0.21
18 0.22
19 0.26
20 0.31
21 0.33
22 0.35
23 0.4
24 0.46
25 0.53
26 0.62
27 0.68
28 0.74
29 0.8
30 0.88
31 0.91
32 0.91
33 0.92
34 0.92
35 0.92
36 0.87
37 0.88
38 0.87
39 0.85
40 0.76
41 0.7
42 0.66
43 0.57
44 0.51
45 0.41
46 0.35
47 0.28
48 0.27
49 0.26
50 0.24
51 0.23
52 0.27
53 0.29
54 0.28
55 0.26
56 0.27
57 0.26
58 0.24
59 0.26
60 0.25
61 0.23
62 0.31
63 0.33
64 0.37
65 0.4
66 0.41
67 0.44
68 0.5
69 0.55
70 0.56
71 0.58
72 0.54
73 0.51
74 0.48
75 0.43
76 0.33
77 0.29
78 0.23
79 0.16
80 0.14
81 0.14
82 0.14
83 0.12
84 0.11
85 0.09
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.05
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.05
99 0.05
100 0.07
101 0.08
102 0.11
103 0.18
104 0.18
105 0.18
106 0.18
107 0.18
108 0.17
109 0.17
110 0.17
111 0.16
112 0.16
113 0.2
114 0.22
115 0.24
116 0.26
117 0.27
118 0.28
119 0.31
120 0.38
121 0.42
122 0.43
123 0.49
124 0.52
125 0.52
126 0.51
127 0.47
128 0.47
129 0.44
130 0.44
131 0.39
132 0.36
133 0.35
134 0.37
135 0.38
136 0.32
137 0.3
138 0.31
139 0.3
140 0.34
141 0.35
142 0.32
143 0.34
144 0.35
145 0.36
146 0.33
147 0.36
148 0.33
149 0.32
150 0.33
151 0.29
152 0.29
153 0.25
154 0.25
155 0.21
156 0.16
157 0.15
158 0.12
159 0.11
160 0.08
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.08
171 0.09
172 0.1
173 0.1
174 0.1
175 0.12
176 0.12
177 0.13
178 0.19
179 0.19
180 0.22
181 0.24
182 0.31
183 0.34
184 0.4
185 0.45
186 0.46
187 0.53
188 0.56
189 0.58
190 0.55
191 0.55
192 0.54
193 0.51
194 0.46
195 0.4
196 0.36
197 0.33
198 0.29
199 0.28
200 0.24
201 0.19
202 0.18
203 0.16
204 0.13
205 0.13
206 0.13
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.14
211 0.17
212 0.22
213 0.28
214 0.36
215 0.4
216 0.45
217 0.48
218 0.48
219 0.53
220 0.54
221 0.48
222 0.43
223 0.42
224 0.44
225 0.45
226 0.41
227 0.37
228 0.33
229 0.33
230 0.28
231 0.25
232 0.18
233 0.16
234 0.14
235 0.11
236 0.09
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.11
246 0.11
247 0.12
248 0.13
249 0.12
250 0.11
251 0.09
252 0.12
253 0.11
254 0.1
255 0.09
256 0.08
257 0.08
258 0.07
259 0.08
260 0.07
261 0.09
262 0.1
263 0.11
264 0.12
265 0.12
266 0.12
267 0.12
268 0.1
269 0.09
270 0.09
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.09
276 0.09
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.09
284 0.1
285 0.12
286 0.13
287 0.12
288 0.12
289 0.12
290 0.11
291 0.11
292 0.09
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.06
300 0.07
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.09
309 0.09
310 0.1
311 0.1
312 0.1
313 0.09
314 0.09
315 0.08
316 0.08
317 0.09
318 0.09
319 0.11
320 0.11
321 0.12
322 0.12
323 0.12
324 0.13
325 0.11
326 0.12
327 0.09
328 0.1
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.09
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.08
338 0.08
339 0.1
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.1
344 0.11
345 0.11
346 0.15
347 0.14
348 0.16
349 0.16
350 0.17
351 0.16
352 0.17
353 0.17
354 0.13
355 0.15
356 0.14
357 0.13
358 0.15
359 0.17
360 0.16
361 0.16
362 0.16
363 0.15
364 0.21
365 0.22
366 0.22
367 0.24
368 0.26
369 0.25
370 0.26
371 0.29
372 0.27
373 0.25
374 0.26
375 0.26
376 0.23
377 0.24
378 0.25
379 0.26
380 0.24
381 0.24
382 0.21
383 0.17
384 0.19
385 0.17
386 0.16
387 0.11
388 0.13
389 0.13
390 0.13
391 0.13
392 0.11
393 0.11
394 0.11
395 0.09
396 0.06
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.06
404 0.07
405 0.07
406 0.09
407 0.1
408 0.13
409 0.13
410 0.22
411 0.27
412 0.31
413 0.38
414 0.36
415 0.38
416 0.4
417 0.44
418 0.38
419 0.37
420 0.31
421 0.26
422 0.26
423 0.23
424 0.2
425 0.18
426 0.16
427 0.13
428 0.13
429 0.11
430 0.1
431 0.11
432 0.1
433 0.11
434 0.11
435 0.14
436 0.17
437 0.17
438 0.19
439 0.2
440 0.21
441 0.25
442 0.27
443 0.31
444 0.35
445 0.4
446 0.4
447 0.46
448 0.47
449 0.43
450 0.46
451 0.41
452 0.36
453 0.4
454 0.38
455 0.33
456 0.32
457 0.33
458 0.29
459 0.33
460 0.37
461 0.31
462 0.34
463 0.35
464 0.37
465 0.35
466 0.36
467 0.33
468 0.28
469 0.25
470 0.22
471 0.2
472 0.16
473 0.14
474 0.12
475 0.09
476 0.09
477 0.08
478 0.09
479 0.09
480 0.09
481 0.1
482 0.12
483 0.14
484 0.15
485 0.18
486 0.2
487 0.21
488 0.22
489 0.22
490 0.21
491 0.2
492 0.2
493 0.18
494 0.19
495 0.21
496 0.31
497 0.37
498 0.4
499 0.46
500 0.51
501 0.59
502 0.64
503 0.66
504 0.64
505 0.67
506 0.73
507 0.75
508 0.75
509 0.68
510 0.66
511 0.67
512 0.67
513 0.66
514 0.65
515 0.64
516 0.63
517 0.66
518 0.62
519 0.55