Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A060SMN6

Protein Details
Accession A0A060SMN6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
124-150SASTSPNAGKQRPRKPPKKPGASEASDHydrophilic
560-580TGDGKKGRRRRGKTASPSRVDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
132-144GKQRPRKPPKKPG
564-573KKGRRRRGKT
Subcellular Location(s) mito 16, nucl 5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031127  E3_UB_ligase_RBR  
IPR002867  IBR_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR044066  TRIAD_supradom  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF01485  IBR  
PF13923  zf-C3HC4_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51873  TRIAD  
PS50089  ZF_RING_2  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
CDD cd20335  BRcat_RBR  
cd22585  Rcat_RBR_DEAH12-like  
Amino Acid Sequences MIAIEPIFFLYLKHVSHSPFRLRRSPQLGRFHLSYAGRLQMAQSSSVRPAKWGLSGCVKKEIGVDMLMSPTTGLRLPCNFSHDILDLAKLPADNELVIQHAQKIREALEAQAFTKGAGHASNASASTSPNAGKQRPRKPPKKPGASEASDKPSSGKDAALQNLGDSVKEAVGAPAISTQCRLPNTTSAYAKGGPRITASDQASQDEANKSSSDATYYSTCMKNPRPSVRALTISMEDANGPTVDTLTTLTERQCDEIPSRERERTSPLTEGTPRNESKLQKPQDFVNHTVFSVKNDRRRPQDVFQRSVDSMPLQSHTRHDLPPGAPTQTVPLVPPGLGLDDGTPRAPQSRPPPEVMTMTILDSTKVTFGPGFSILQVVTGFECLHVILDNVPSAAPPDLITTTMESFGKVASFQQSVSSPRDTTLAYKVTYTNGDDAAAAATAMNGKELMGTKIDAHLLEEKSTSLGHGTLYDGDVLFELPTPFQIGFVGYPTEDLAKKAIALAPQSRIGFSRITAELYTGIPAVGTYSVRFRGLPPQFSTDDLRKHFVGPLEVVDNEATGDGKKGRRRRGKTASPSRVDSGQSATNDQPKETCEGVMLQRAKYQSLDGAIQGLRRMLEKYDEDVSINVVPPPHGKYVRVWAHFTSPDIAAKACQALHRFCPQFVAKERIFARHIKSLRYALPGSIYDVLAPEINLLRSFIRDDAGTSITVIDKRSPQLPAAPVTVKLVSESMQSLTRAKTAFDRLLRGDKVVEDGQVVWSDFFGGPAGESFLRDLEQVHPNVKISADYRRRTLALFGMPEERVRVREEILAKVKILKARRTHRYPIPGDRIAGFINEGLAMLQRELGRENVWVDLTNLKLVVRGEEDAQKVAHLAVLHARQRAPRRGLLGGAECPVCFGEVSQPVALSCGHAWCKDCLAGYLNASIDNKSFPITCLADGARCAQPISLSIAQRLLGTDEFDAVVNAAFSSYVQERPKEFHYCPTPDCPQVYRKIASRKSKSALQCPSCLVRICPHCDMEYHETMSCQDRDPEAEMLFEEWKRGRDVKDCPNCKVPIERSAGCNHMTCVSCKIHICWACLETFPTSGEVYGHMRSMHGGIGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.26
3 0.34
4 0.41
5 0.47
6 0.5
7 0.57
8 0.62
9 0.65
10 0.72
11 0.74
12 0.76
13 0.75
14 0.78
15 0.77
16 0.73
17 0.69
18 0.61
19 0.58
20 0.49
21 0.43
22 0.36
23 0.35
24 0.29
25 0.27
26 0.26
27 0.24
28 0.24
29 0.25
30 0.23
31 0.22
32 0.29
33 0.34
34 0.33
35 0.3
36 0.32
37 0.31
38 0.35
39 0.35
40 0.32
41 0.38
42 0.44
43 0.45
44 0.49
45 0.47
46 0.42
47 0.41
48 0.39
49 0.3
50 0.25
51 0.24
52 0.16
53 0.18
54 0.17
55 0.14
56 0.12
57 0.09
58 0.1
59 0.12
60 0.12
61 0.15
62 0.19
63 0.24
64 0.26
65 0.32
66 0.32
67 0.31
68 0.34
69 0.3
70 0.29
71 0.25
72 0.25
73 0.21
74 0.19
75 0.19
76 0.15
77 0.15
78 0.14
79 0.14
80 0.12
81 0.11
82 0.11
83 0.12
84 0.13
85 0.14
86 0.17
87 0.2
88 0.21
89 0.22
90 0.24
91 0.22
92 0.27
93 0.27
94 0.25
95 0.27
96 0.28
97 0.27
98 0.28
99 0.26
100 0.21
101 0.22
102 0.19
103 0.14
104 0.13
105 0.14
106 0.13
107 0.14
108 0.16
109 0.14
110 0.15
111 0.14
112 0.14
113 0.14
114 0.15
115 0.15
116 0.19
117 0.25
118 0.3
119 0.39
120 0.49
121 0.57
122 0.66
123 0.76
124 0.8
125 0.85
126 0.9
127 0.91
128 0.92
129 0.87
130 0.84
131 0.83
132 0.78
133 0.73
134 0.69
135 0.65
136 0.55
137 0.5
138 0.43
139 0.36
140 0.35
141 0.29
142 0.23
143 0.21
144 0.26
145 0.28
146 0.3
147 0.27
148 0.23
149 0.26
150 0.25
151 0.2
152 0.15
153 0.13
154 0.1
155 0.11
156 0.11
157 0.08
158 0.09
159 0.09
160 0.08
161 0.12
162 0.13
163 0.13
164 0.14
165 0.15
166 0.19
167 0.21
168 0.23
169 0.21
170 0.27
171 0.33
172 0.38
173 0.39
174 0.36
175 0.38
176 0.39
177 0.37
178 0.36
179 0.32
180 0.26
181 0.26
182 0.28
183 0.27
184 0.31
185 0.32
186 0.33
187 0.32
188 0.33
189 0.32
190 0.28
191 0.29
192 0.25
193 0.23
194 0.18
195 0.17
196 0.16
197 0.18
198 0.18
199 0.16
200 0.13
201 0.15
202 0.15
203 0.17
204 0.21
205 0.21
206 0.22
207 0.28
208 0.35
209 0.41
210 0.48
211 0.54
212 0.52
213 0.55
214 0.6
215 0.58
216 0.55
217 0.47
218 0.42
219 0.34
220 0.33
221 0.29
222 0.22
223 0.17
224 0.13
225 0.12
226 0.09
227 0.08
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.08
234 0.09
235 0.11
236 0.12
237 0.14
238 0.15
239 0.17
240 0.17
241 0.18
242 0.2
243 0.27
244 0.31
245 0.35
246 0.4
247 0.42
248 0.42
249 0.42
250 0.46
251 0.45
252 0.43
253 0.4
254 0.37
255 0.38
256 0.42
257 0.44
258 0.4
259 0.41
260 0.37
261 0.38
262 0.42
263 0.41
264 0.43
265 0.5
266 0.53
267 0.5
268 0.52
269 0.52
270 0.56
271 0.57
272 0.53
273 0.5
274 0.43
275 0.38
276 0.4
277 0.35
278 0.3
279 0.34
280 0.36
281 0.38
282 0.45
283 0.52
284 0.56
285 0.62
286 0.64
287 0.63
288 0.68
289 0.67
290 0.63
291 0.59
292 0.57
293 0.51
294 0.46
295 0.38
296 0.28
297 0.22
298 0.18
299 0.18
300 0.16
301 0.16
302 0.18
303 0.22
304 0.25
305 0.24
306 0.25
307 0.28
308 0.27
309 0.3
310 0.3
311 0.26
312 0.23
313 0.22
314 0.23
315 0.19
316 0.18
317 0.14
318 0.14
319 0.12
320 0.12
321 0.12
322 0.1
323 0.09
324 0.08
325 0.08
326 0.07
327 0.08
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.12
333 0.12
334 0.17
335 0.25
336 0.34
337 0.37
338 0.4
339 0.43
340 0.42
341 0.43
342 0.38
343 0.31
344 0.22
345 0.2
346 0.18
347 0.15
348 0.13
349 0.12
350 0.11
351 0.09
352 0.08
353 0.08
354 0.07
355 0.07
356 0.09
357 0.1
358 0.1
359 0.09
360 0.1
361 0.09
362 0.09
363 0.09
364 0.07
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.05
369 0.06
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.07
381 0.07
382 0.06
383 0.06
384 0.07
385 0.08
386 0.08
387 0.09
388 0.1
389 0.1
390 0.11
391 0.11
392 0.09
393 0.09
394 0.09
395 0.08
396 0.07
397 0.07
398 0.09
399 0.09
400 0.09
401 0.11
402 0.13
403 0.16
404 0.19
405 0.2
406 0.18
407 0.18
408 0.19
409 0.18
410 0.18
411 0.2
412 0.19
413 0.17
414 0.18
415 0.18
416 0.18
417 0.19
418 0.18
419 0.14
420 0.12
421 0.12
422 0.1
423 0.1
424 0.09
425 0.07
426 0.06
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.05
435 0.06
436 0.07
437 0.07
438 0.08
439 0.08
440 0.09
441 0.1
442 0.09
443 0.09
444 0.14
445 0.13
446 0.13
447 0.13
448 0.12
449 0.12
450 0.12
451 0.11
452 0.06
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.06
458 0.07
459 0.07
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.06
473 0.06
474 0.06
475 0.07
476 0.07
477 0.06
478 0.06
479 0.06
480 0.08
481 0.08
482 0.08
483 0.08
484 0.07
485 0.07
486 0.08
487 0.09
488 0.09
489 0.11
490 0.13
491 0.14
492 0.17
493 0.17
494 0.17
495 0.16
496 0.17
497 0.15
498 0.13
499 0.15
500 0.12
501 0.13
502 0.12
503 0.12
504 0.11
505 0.11
506 0.11
507 0.07
508 0.07
509 0.05
510 0.05
511 0.05
512 0.04
513 0.04
514 0.05
515 0.06
516 0.08
517 0.08
518 0.09
519 0.09
520 0.18
521 0.21
522 0.24
523 0.25
524 0.28
525 0.28
526 0.3
527 0.32
528 0.26
529 0.29
530 0.27
531 0.28
532 0.24
533 0.24
534 0.24
535 0.22
536 0.19
537 0.14
538 0.13
539 0.12
540 0.11
541 0.11
542 0.09
543 0.08
544 0.06
545 0.06
546 0.05
547 0.04
548 0.05
549 0.08
550 0.12
551 0.18
552 0.25
553 0.35
554 0.45
555 0.51
556 0.6
557 0.67
558 0.72
559 0.77
560 0.82
561 0.81
562 0.74
563 0.7
564 0.62
565 0.54
566 0.45
567 0.35
568 0.27
569 0.21
570 0.18
571 0.19
572 0.19
573 0.22
574 0.21
575 0.2
576 0.18
577 0.16
578 0.19
579 0.17
580 0.15
581 0.1
582 0.12
583 0.13
584 0.19
585 0.19
586 0.16
587 0.18
588 0.19
589 0.19
590 0.17
591 0.17
592 0.11
593 0.11
594 0.12
595 0.09
596 0.11
597 0.1
598 0.1
599 0.1
600 0.1
601 0.08
602 0.09
603 0.09
604 0.08
605 0.11
606 0.11
607 0.14
608 0.16
609 0.16
610 0.15
611 0.15
612 0.16
613 0.13
614 0.12
615 0.1
616 0.08
617 0.08
618 0.1
619 0.13
620 0.16
621 0.16
622 0.17
623 0.17
624 0.27
625 0.34
626 0.35
627 0.34
628 0.3
629 0.33
630 0.33
631 0.32
632 0.24
633 0.18
634 0.17
635 0.15
636 0.14
637 0.1
638 0.1
639 0.1
640 0.09
641 0.11
642 0.13
643 0.15
644 0.18
645 0.25
646 0.26
647 0.25
648 0.29
649 0.28
650 0.3
651 0.32
652 0.36
653 0.28
654 0.33
655 0.34
656 0.34
657 0.35
658 0.33
659 0.33
660 0.34
661 0.36
662 0.32
663 0.34
664 0.33
665 0.34
666 0.34
667 0.3
668 0.23
669 0.24
670 0.21
671 0.2
672 0.18
673 0.15
674 0.11
675 0.11
676 0.11
677 0.09
678 0.08
679 0.07
680 0.06
681 0.07
682 0.07
683 0.07
684 0.07
685 0.08
686 0.09
687 0.09
688 0.09
689 0.08
690 0.09
691 0.11
692 0.12
693 0.11
694 0.1
695 0.1
696 0.1
697 0.12
698 0.12
699 0.11
700 0.12
701 0.14
702 0.16
703 0.17
704 0.17
705 0.2
706 0.22
707 0.22
708 0.24
709 0.23
710 0.21
711 0.22
712 0.21
713 0.17
714 0.15
715 0.13
716 0.1
717 0.1
718 0.1
719 0.09
720 0.11
721 0.12
722 0.13
723 0.14
724 0.16
725 0.15
726 0.15
727 0.18
728 0.21
729 0.26
730 0.26
731 0.29
732 0.29
733 0.35
734 0.35
735 0.31
736 0.27
737 0.22
738 0.24
739 0.21
740 0.18
741 0.12
742 0.12
743 0.12
744 0.13
745 0.13
746 0.08
747 0.08
748 0.09
749 0.08
750 0.08
751 0.07
752 0.06
753 0.06
754 0.06
755 0.08
756 0.07
757 0.07
758 0.07
759 0.07
760 0.08
761 0.08
762 0.09
763 0.12
764 0.17
765 0.18
766 0.19
767 0.2
768 0.2
769 0.21
770 0.19
771 0.17
772 0.14
773 0.23
774 0.3
775 0.31
776 0.33
777 0.35
778 0.36
779 0.34
780 0.35
781 0.29
782 0.25
783 0.24
784 0.23
785 0.24
786 0.23
787 0.23
788 0.23
789 0.19
790 0.16
791 0.18
792 0.18
793 0.16
794 0.2
795 0.22
796 0.27
797 0.31
798 0.31
799 0.28
800 0.31
801 0.32
802 0.32
803 0.35
804 0.35
805 0.39
806 0.47
807 0.57
808 0.6
809 0.65
810 0.68
811 0.72
812 0.71
813 0.72
814 0.71
815 0.63
816 0.57
817 0.51
818 0.45
819 0.35
820 0.29
821 0.2
822 0.12
823 0.1
824 0.08
825 0.07
826 0.06
827 0.06
828 0.06
829 0.06
830 0.09
831 0.09
832 0.1
833 0.11
834 0.12
835 0.12
836 0.13
837 0.14
838 0.12
839 0.13
840 0.12
841 0.13
842 0.14
843 0.14
844 0.13
845 0.13
846 0.11
847 0.13
848 0.13
849 0.13
850 0.13
851 0.13
852 0.15
853 0.2
854 0.21
855 0.2
856 0.2
857 0.18
858 0.16
859 0.15
860 0.14
861 0.09
862 0.09
863 0.13
864 0.19
865 0.23
866 0.25
867 0.27
868 0.31
869 0.4
870 0.48
871 0.47
872 0.45
873 0.46
874 0.45
875 0.45
876 0.43
877 0.38
878 0.31
879 0.29
880 0.25
881 0.21
882 0.2
883 0.18
884 0.14
885 0.1
886 0.09
887 0.13
888 0.16
889 0.19
890 0.18
891 0.18
892 0.18
893 0.19
894 0.18
895 0.14
896 0.11
897 0.14
898 0.16
899 0.18
900 0.2
901 0.21
902 0.23
903 0.22
904 0.22
905 0.19
906 0.2
907 0.2
908 0.19
909 0.21
910 0.19
911 0.2
912 0.2
913 0.19
914 0.16
915 0.15
916 0.14
917 0.13
918 0.14
919 0.12
920 0.17
921 0.18
922 0.17
923 0.2
924 0.2
925 0.2
926 0.2
927 0.24
928 0.2
929 0.19
930 0.19
931 0.16
932 0.16
933 0.16
934 0.22
935 0.23
936 0.22
937 0.23
938 0.24
939 0.24
940 0.23
941 0.23
942 0.18
943 0.13
944 0.14
945 0.13
946 0.12
947 0.12
948 0.12
949 0.11
950 0.09
951 0.08
952 0.06
953 0.06
954 0.05
955 0.05
956 0.05
957 0.09
958 0.11
959 0.17
960 0.2
961 0.24
962 0.26
963 0.3
964 0.36
965 0.39
966 0.39
967 0.42
968 0.47
969 0.49
970 0.51
971 0.54
972 0.54
973 0.51
974 0.54
975 0.49
976 0.47
977 0.5
978 0.52
979 0.49
980 0.51
981 0.57
982 0.63
983 0.69
984 0.71
985 0.71
986 0.7
987 0.73
988 0.73
989 0.73
990 0.74
991 0.68
992 0.63
993 0.59
994 0.58
995 0.55
996 0.49
997 0.42
998 0.4
999 0.42
1000 0.45
1001 0.45
1002 0.43
1003 0.4
1004 0.39
1005 0.44
1006 0.43
1007 0.4
1008 0.37
1009 0.33
1010 0.31
1011 0.32
1012 0.37
1013 0.31
1014 0.26
1015 0.24
1016 0.23
1017 0.26
1018 0.29
1019 0.3
1020 0.25
1021 0.24
1022 0.22
1023 0.21
1024 0.24
1025 0.21
1026 0.21
1027 0.2
1028 0.22
1029 0.26
1030 0.3
1031 0.32
1032 0.36
1033 0.44
1034 0.51
1035 0.59
1036 0.63
1037 0.64
1038 0.67
1039 0.65
1040 0.61
1041 0.62
1042 0.56
1043 0.54
1044 0.56
1045 0.53
1046 0.49
1047 0.51
1048 0.51
1049 0.44
1050 0.41
1051 0.33
1052 0.32
1053 0.31
1054 0.29
1055 0.3
1056 0.3
1057 0.32
1058 0.33
1059 0.34
1060 0.37
1061 0.4
1062 0.41
1063 0.39
1064 0.38
1065 0.35
1066 0.34
1067 0.34
1068 0.27
1069 0.24
1070 0.22
1071 0.19
1072 0.18
1073 0.17
1074 0.16
1075 0.17
1076 0.18
1077 0.18
1078 0.19
1079 0.17
1080 0.17
1081 0.18
1082 0.19