Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A060SM34

Protein Details
Accession A0A060SM34    Localization Confidence High Confidence Score 24.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MSAAQKLTKKQKKALAFRERKGKGKHydrophilic
97-118GVGAKEQKAKKKRKGANGEGVDBasic
229-263LRLEKVKKRNKELHEQRKKNLLKQKSGKRKPGGEGBasic
301-329DEEGPSRKRGTKKGKKRPPKPLGTGVNAIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-27TKKQKKALAFRERKGKGKPK
82-111AKGKKRKREDGAEQDGVGAKEQKAKKKRKG
229-260LRLEKVKKRNKELHEQRKKNLLKQKSGKRKPG
306-321SRKRGTKKGKKRPPKP
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MSAAQKLTKKQKKALAFRERKGKGKPKSFDELDNDVPVEENQDLAEAEVDAEAGAVEAPARRAAGAQKAGAQAQDAVEGGNAKGKKRKREDGAEQDGVGAKEQKAKKKRKGANGEGVDTGDEAEGESKSSGKKDAKRRYILFVGNLKYTTTKEAVQQHFSKCDPPPTVRLMTPKPSANSRPTAKSKGFAFVEFAHKNALQQGLKLHQTELDGRKINVELTAGGGGKSELRLEKVKKRNKELHEQRKKNLLKQKSGKRKPGGEGGDGEEEVQLERPQRYSATCGVEQVPLKKRTWSVPEGDDEEGPSRKRGTKKGKKRPPKPLGTGVNAIPVG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.82
3 0.83
4 0.82
5 0.85
6 0.82
7 0.79
8 0.79
9 0.78
10 0.77
11 0.77
12 0.78
13 0.74
14 0.78
15 0.74
16 0.7
17 0.67
18 0.64
19 0.56
20 0.51
21 0.44
22 0.35
23 0.32
24 0.25
25 0.21
26 0.14
27 0.11
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.09
32 0.09
33 0.06
34 0.06
35 0.06
36 0.06
37 0.05
38 0.04
39 0.04
40 0.03
41 0.03
42 0.03
43 0.04
44 0.05
45 0.06
46 0.07
47 0.07
48 0.07
49 0.09
50 0.12
51 0.19
52 0.22
53 0.22
54 0.25
55 0.26
56 0.27
57 0.26
58 0.23
59 0.17
60 0.14
61 0.14
62 0.1
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.12
68 0.13
69 0.14
70 0.22
71 0.28
72 0.37
73 0.45
74 0.54
75 0.57
76 0.66
77 0.74
78 0.77
79 0.79
80 0.71
81 0.63
82 0.54
83 0.48
84 0.39
85 0.29
86 0.21
87 0.13
88 0.19
89 0.23
90 0.32
91 0.39
92 0.49
93 0.58
94 0.66
95 0.73
96 0.76
97 0.82
98 0.81
99 0.82
100 0.76
101 0.69
102 0.59
103 0.51
104 0.41
105 0.3
106 0.22
107 0.11
108 0.07
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.06
115 0.07
116 0.08
117 0.14
118 0.2
119 0.27
120 0.37
121 0.48
122 0.55
123 0.62
124 0.63
125 0.63
126 0.62
127 0.57
128 0.51
129 0.47
130 0.4
131 0.33
132 0.31
133 0.26
134 0.22
135 0.21
136 0.18
137 0.14
138 0.13
139 0.17
140 0.25
141 0.28
142 0.32
143 0.35
144 0.34
145 0.35
146 0.34
147 0.33
148 0.26
149 0.29
150 0.26
151 0.25
152 0.26
153 0.28
154 0.29
155 0.27
156 0.31
157 0.28
158 0.31
159 0.32
160 0.31
161 0.29
162 0.31
163 0.34
164 0.32
165 0.36
166 0.34
167 0.37
168 0.4
169 0.44
170 0.4
171 0.4
172 0.37
173 0.37
174 0.35
175 0.28
176 0.26
177 0.22
178 0.29
179 0.26
180 0.25
181 0.21
182 0.2
183 0.2
184 0.19
185 0.22
186 0.15
187 0.15
188 0.18
189 0.19
190 0.21
191 0.22
192 0.2
193 0.16
194 0.17
195 0.23
196 0.24
197 0.26
198 0.25
199 0.25
200 0.26
201 0.25
202 0.24
203 0.18
204 0.15
205 0.09
206 0.08
207 0.1
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.09
215 0.08
216 0.11
217 0.18
218 0.23
219 0.33
220 0.42
221 0.5
222 0.56
223 0.65
224 0.71
225 0.7
226 0.76
227 0.78
228 0.79
229 0.82
230 0.81
231 0.76
232 0.77
233 0.76
234 0.72
235 0.7
236 0.67
237 0.66
238 0.7
239 0.76
240 0.78
241 0.83
242 0.84
243 0.83
244 0.81
245 0.75
246 0.74
247 0.68
248 0.59
249 0.53
250 0.47
251 0.41
252 0.35
253 0.3
254 0.21
255 0.17
256 0.14
257 0.14
258 0.11
259 0.12
260 0.14
261 0.15
262 0.16
263 0.18
264 0.19
265 0.22
266 0.26
267 0.3
268 0.29
269 0.3
270 0.31
271 0.34
272 0.35
273 0.38
274 0.41
275 0.39
276 0.4
277 0.42
278 0.43
279 0.46
280 0.5
281 0.48
282 0.44
283 0.45
284 0.49
285 0.48
286 0.47
287 0.39
288 0.34
289 0.33
290 0.32
291 0.29
292 0.26
293 0.27
294 0.32
295 0.39
296 0.47
297 0.55
298 0.61
299 0.71
300 0.8
301 0.87
302 0.91
303 0.94
304 0.95
305 0.94
306 0.94
307 0.91
308 0.9
309 0.87
310 0.82
311 0.76
312 0.65