FuNGI

A0A060SIW5

Protein Details

Accession

A0A060SIW5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
42-65	AASGKRIRARVKPKVKRLEVHVPV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
45-58	GKRIRARVKPKVKR
187-192	KKEKKP

Subcellular Location(s)

cyto 11.5, cyto_nucl 9.5, nucl 6.5, cysk 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006886 RNA_pol_III_Rpc5
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04801 RPC5

Amino Acid Sequences

MEGEDRLVSVIPVHLTNALEPNLHLHQYPLLTRPLEVPPSAAASGKRIRARVKPKVKRLEVHVPVDTRPEVWNAERSKELGAARVEDDKEKNQELAKVKQREGEEPRLTEVRMRSEQVPQMGVYVLGVLREGRLHLHPISETHQFRPTLTYMDMHTRKTRRTRGDDSDEDDGPPPDPDEPVPAPAPKKEKKPPGDAKEVQVAIRKTGEVSGLQFQGGMTQVRRDMLTMIHAEEDEQWDDYEYCGGEWIYALWNKLHLQDERLHKTIQNIYERLLGFLELVSAAQYESPVDAIGIQPALSAILSESTLILLLEFRVLFRNIASRHVAASSAGVTICWVDVVLARLGQSIVCAAGMFGDVKSEDANQPEALRAQKEDDMLRAAIQLPGKWRDVVGVIGSKYASPAAARLASTLAWGVYVMTEKLSGNRSVMTQEIKAYLSEALQRRLKQVGLKRTQRVDAHMVAESERFTDAIVVSLCLNSTPITLNLRADRNRMQLSLI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.15
3	0.17
4	0.2
5	0.19
6	0.18
7	0.18
8	0.22
9	0.22
10	0.23
11	0.21
12	0.18
13	0.2
14	0.23
15	0.25
16	0.24
17	0.26
18	0.25
19	0.26
20	0.29
21	0.31
22	0.31
23	0.29
24	0.27
25	0.23
26	0.26
27	0.26
28	0.25
29	0.2
30	0.23
31	0.29
32	0.34
33	0.37
34	0.39
35	0.44
36	0.51
37	0.61
38	0.65
39	0.71
40	0.74
41	0.8
42	0.86
43	0.87
44	0.83
45	0.81
46	0.81
47	0.77
48	0.72
49	0.67
50	0.58
51	0.52
52	0.51
53	0.43
54	0.34
55	0.28
56	0.24
57	0.23
58	0.23
59	0.3
60	0.28
61	0.31
62	0.3
63	0.3
64	0.29
65	0.3
66	0.28
67	0.26
68	0.25
69	0.24
70	0.24
71	0.28
72	0.28
73	0.28
74	0.31
75	0.3
76	0.33
77	0.33
78	0.33
79	0.3
80	0.36
81	0.37
82	0.43
83	0.47
84	0.49
85	0.49
86	0.52
87	0.52
88	0.54
89	0.56
90	0.57
91	0.52
92	0.47
93	0.5
94	0.46
95	0.44
96	0.4
97	0.35
98	0.33
99	0.31
100	0.32
101	0.3
102	0.34
103	0.38
104	0.35
105	0.33
106	0.26
107	0.24
108	0.21
109	0.18
110	0.12
111	0.1
112	0.07
113	0.06
114	0.06
115	0.05
116	0.05
117	0.06
118	0.06
119	0.08
120	0.09
121	0.13
122	0.14
123	0.15
124	0.15
125	0.17
126	0.2
127	0.26
128	0.27
129	0.26
130	0.31
131	0.3
132	0.3
133	0.32
134	0.29
135	0.24
136	0.23
137	0.22
138	0.18
139	0.27
140	0.29
141	0.29
142	0.35
143	0.36
144	0.42
145	0.5
146	0.57
147	0.56
148	0.62
149	0.67
150	0.68
151	0.73
152	0.69
153	0.64
154	0.59
155	0.5
156	0.43
157	0.36
158	0.28
159	0.2
160	0.16
161	0.13
162	0.09
163	0.1
164	0.09
165	0.13
166	0.13
167	0.15
168	0.17
169	0.19
170	0.2
171	0.23
172	0.32
173	0.31
174	0.39
175	0.45
176	0.53
177	0.56
178	0.65
179	0.71
180	0.69
181	0.74
182	0.68
183	0.62
184	0.59
185	0.54
186	0.45
187	0.4
188	0.33
189	0.25
190	0.23
191	0.2
192	0.14
193	0.14
194	0.14
195	0.09
196	0.11
197	0.13
198	0.12
199	0.12
200	0.12
201	0.11
202	0.1
203	0.11
204	0.1
205	0.07
206	0.08
207	0.09
208	0.1
209	0.1
210	0.09
211	0.09
212	0.08
213	0.1
214	0.1
215	0.1
216	0.09
217	0.09
218	0.09
219	0.09
220	0.1
221	0.08
222	0.08
223	0.07
224	0.08
225	0.08
226	0.08
227	0.08
228	0.06
229	0.05
230	0.06
231	0.05
232	0.04
233	0.04
234	0.05
235	0.06
236	0.07
237	0.08
238	0.07
239	0.09
240	0.1
241	0.12
242	0.15
243	0.14
244	0.15
245	0.21
246	0.28
247	0.32
248	0.33
249	0.31
250	0.29
251	0.32
252	0.34
253	0.34
254	0.32
255	0.27
256	0.26
257	0.31
258	0.3
259	0.27
260	0.22
261	0.16
262	0.11
263	0.1
264	0.09
265	0.04
266	0.04
267	0.03
268	0.03
269	0.03
270	0.03
271	0.03
272	0.03
273	0.03
274	0.04
275	0.04
276	0.03
277	0.04
278	0.04
279	0.04
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.04
285	0.03
286	0.03
287	0.03
288	0.03
289	0.04
290	0.04
291	0.04
292	0.04
293	0.04
294	0.04
295	0.04
296	0.03
297	0.03
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.07
302	0.08
303	0.08
304	0.09
305	0.15
306	0.15
307	0.18
308	0.21
309	0.19
310	0.19
311	0.19
312	0.19
313	0.13
314	0.13
315	0.1
316	0.08
317	0.07
318	0.06
319	0.06
320	0.06
321	0.05
322	0.05
323	0.04
324	0.03
325	0.04
326	0.07
327	0.07
328	0.07
329	0.07
330	0.08
331	0.08
332	0.08
333	0.07
334	0.05
335	0.05
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.05
341	0.05
342	0.04
343	0.05
344	0.05
345	0.06
346	0.07
347	0.09
348	0.1
349	0.11
350	0.13
351	0.13
352	0.14
353	0.14
354	0.16
355	0.17
356	0.17
357	0.16
358	0.17
359	0.19
360	0.21
361	0.21
362	0.2
363	0.2
364	0.19
365	0.18
366	0.16
367	0.15
368	0.15
369	0.15
370	0.15
371	0.17
372	0.21
373	0.22
374	0.21
375	0.21
376	0.19
377	0.19
378	0.19
379	0.17
380	0.17
381	0.16
382	0.16
383	0.17
384	0.15
385	0.15
386	0.13
387	0.11
388	0.07
389	0.08
390	0.11
391	0.12
392	0.12
393	0.13
394	0.13
395	0.13
396	0.13
397	0.13
398	0.09
399	0.07
400	0.07
401	0.06
402	0.06
403	0.07
404	0.07
405	0.07
406	0.09
407	0.09
408	0.12
409	0.16
410	0.16
411	0.16
412	0.17
413	0.17
414	0.18
415	0.21
416	0.21
417	0.19
418	0.2
419	0.21
420	0.2
421	0.19
422	0.19
423	0.16
424	0.15
425	0.21
426	0.23
427	0.28
428	0.33
429	0.35
430	0.37
431	0.39
432	0.41
433	0.41
434	0.46
435	0.5
436	0.54
437	0.61
438	0.66
439	0.68
440	0.72
441	0.67
442	0.64
443	0.6
444	0.54
445	0.48
446	0.43
447	0.38
448	0.32
449	0.3
450	0.25
451	0.19
452	0.16
453	0.12
454	0.1
455	0.11
456	0.1
457	0.13
458	0.13
459	0.12
460	0.13
461	0.13
462	0.13
463	0.11
464	0.12
465	0.08
466	0.09
467	0.11
468	0.14
469	0.18
470	0.2
471	0.25
472	0.31
473	0.38
474	0.41
475	0.45
476	0.48
477	0.51
478	0.53

A0A060SIW5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer