Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A060S8W5

Protein Details
Accession A0A060S8W5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
348-380NNLKNTPSTSRKRRSDAGRKRKHARIEESDEHDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
358-372RKRRSDAGRKRKHAR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 5.5, cyto_mito 5, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF09011  HMG_box_2  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MTITYGTTPKIVGVPVPVEKRPQRPALTAEQREEAAARRRIKQGSLEEDIAGWYSETVAFADSLSTRYGNTRDHYVNMMFKSPDKLRAAERKPNAYNAFLHHLAKEAKEQDDDGTLNAAQLSAAHHEQYKMLSKEEKAAFIEELVETRQAQQYGLRLTQRARTLDINRTTQLIEELLAGLQSRVGIQAMYLIVRSNPELDLEPLWFFTDPALEDYLRGTVRKFEPERIGILAEAFSVAGSDLFSQLRTNREKVNWLKSEIRKMVADSLVEVTGDAKAAMSYAQYTRDIQLKYGVSLVGWTHEKWCNPSDLGNSLPSLKTLHDALKNGDCMFKHLTDAEKAIIEQEYVNNLKNTPSTSRKRRSDAGRKRKHARIEESDEHDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.26
3 0.31
4 0.31
5 0.38
6 0.44
7 0.51
8 0.55
9 0.58
10 0.56
11 0.56
12 0.6
13 0.62
14 0.66
15 0.63
16 0.59
17 0.53
18 0.48
19 0.44
20 0.4
21 0.36
22 0.34
23 0.36
24 0.38
25 0.41
26 0.47
27 0.5
28 0.52
29 0.54
30 0.53
31 0.52
32 0.53
33 0.49
34 0.43
35 0.4
36 0.37
37 0.29
38 0.21
39 0.13
40 0.07
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.08
49 0.08
50 0.09
51 0.1
52 0.1
53 0.1
54 0.13
55 0.17
56 0.2
57 0.22
58 0.27
59 0.28
60 0.3
61 0.33
62 0.33
63 0.35
64 0.32
65 0.33
66 0.27
67 0.26
68 0.31
69 0.29
70 0.34
71 0.32
72 0.33
73 0.37
74 0.46
75 0.52
76 0.54
77 0.58
78 0.59
79 0.58
80 0.64
81 0.58
82 0.51
83 0.46
84 0.4
85 0.41
86 0.34
87 0.33
88 0.25
89 0.27
90 0.26
91 0.25
92 0.26
93 0.23
94 0.23
95 0.22
96 0.23
97 0.2
98 0.21
99 0.2
100 0.15
101 0.14
102 0.12
103 0.11
104 0.1
105 0.09
106 0.06
107 0.06
108 0.07
109 0.08
110 0.09
111 0.1
112 0.11
113 0.11
114 0.12
115 0.15
116 0.21
117 0.19
118 0.21
119 0.23
120 0.23
121 0.31
122 0.31
123 0.31
124 0.24
125 0.24
126 0.22
127 0.19
128 0.19
129 0.11
130 0.11
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.09
135 0.12
136 0.11
137 0.11
138 0.12
139 0.15
140 0.17
141 0.2
142 0.19
143 0.19
144 0.2
145 0.25
146 0.27
147 0.25
148 0.24
149 0.27
150 0.3
151 0.36
152 0.39
153 0.37
154 0.33
155 0.33
156 0.3
157 0.25
158 0.22
159 0.14
160 0.1
161 0.07
162 0.07
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.03
170 0.03
171 0.04
172 0.03
173 0.03
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.07
186 0.08
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.08
191 0.09
192 0.08
193 0.07
194 0.06
195 0.07
196 0.06
197 0.07
198 0.09
199 0.08
200 0.08
201 0.09
202 0.11
203 0.11
204 0.1
205 0.09
206 0.13
207 0.15
208 0.23
209 0.24
210 0.27
211 0.31
212 0.32
213 0.33
214 0.29
215 0.28
216 0.19
217 0.18
218 0.13
219 0.09
220 0.07
221 0.05
222 0.04
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.07
232 0.1
233 0.16
234 0.2
235 0.22
236 0.25
237 0.27
238 0.35
239 0.4
240 0.48
241 0.45
242 0.45
243 0.52
244 0.52
245 0.59
246 0.53
247 0.49
248 0.41
249 0.38
250 0.38
251 0.31
252 0.27
253 0.19
254 0.18
255 0.15
256 0.14
257 0.13
258 0.09
259 0.07
260 0.07
261 0.06
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.06
268 0.08
269 0.1
270 0.12
271 0.13
272 0.15
273 0.22
274 0.22
275 0.2
276 0.25
277 0.24
278 0.23
279 0.23
280 0.21
281 0.14
282 0.15
283 0.15
284 0.12
285 0.13
286 0.13
287 0.17
288 0.21
289 0.22
290 0.25
291 0.27
292 0.27
293 0.26
294 0.29
295 0.28
296 0.27
297 0.28
298 0.25
299 0.24
300 0.22
301 0.21
302 0.19
303 0.17
304 0.14
305 0.15
306 0.16
307 0.21
308 0.23
309 0.25
310 0.29
311 0.33
312 0.35
313 0.33
314 0.35
315 0.28
316 0.28
317 0.31
318 0.27
319 0.24
320 0.24
321 0.27
322 0.25
323 0.27
324 0.24
325 0.21
326 0.2
327 0.2
328 0.18
329 0.15
330 0.13
331 0.13
332 0.18
333 0.19
334 0.22
335 0.21
336 0.21
337 0.23
338 0.24
339 0.26
340 0.28
341 0.36
342 0.43
343 0.53
344 0.63
345 0.69
346 0.74
347 0.79
348 0.82
349 0.84
350 0.85
351 0.85
352 0.86
353 0.87
354 0.89
355 0.89
356 0.88
357 0.86
358 0.84
359 0.83
360 0.82
361 0.8