FuNGI

A0A060SIA2

Protein Details

Accession

A0A060SIA2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
16-42	FDETMFPKCPTNKRRRTSRLDKEPEED	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
288-298	RPKGRKVIKNR
307-311	GRKKA

Subcellular Location(s)

cyto 8.5, cyto_nucl 8, mito 7, nucl 6.5, plas 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR013103 RVT_2
Pfam	View protein in Pfam PF07727 RVT_2
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MRSPNNVIFTSTHALFDETMFPKCPTNKRRRTSRLDKEPEEDPSDQESSIPSGPDDDDDEPRRPPQNLPPKGQEQEHDDAPETPPRVRTPSPPPRVPEMPPTPRKPTASARERKVPVRPGNIYGESKHPVQQFKEIEKQGEWDKITGQKPGRSRATEPSRSEQIPGNSSAPSPPSDIPAPSASGDASGSANNEGSGHSSDEVEDALRTDSETGLAKLCQEGGGALINYLLMKAVPPVDDILPDTSNVREWTYRDITRLPQAEQKEWKAACREDLEALRRRKVFELVDRPKGRKVIKNRWVFDIKSDGRKKARLVAKGFSQVEGIDYDQIFSPVVRFETVRLILALSALENWYITGLDVRNAYLYGKLEEEIYMEQPEGFTAKGQEHKVLQLLRSLYGLKQAGLAWWRTLNESMKELGFKRLVSDAGLFIFRDKNGLLVIVVVYVDDTLFCGPNKALVEKMKAKFMEKWECRDLGEPKEFLRMRIQRSGSTIRIDQCAYLEKVLQRCGMQNAKPAPTPLPAGYHPMPNTGTADPTLRSRFQTVIGSLLYIMLGTRPDIAFAVAKLSQFAANPSQEHLNKALYICCYLIGTKSYALVYNGASGLGISACTDSDWGSDPSTRRSQTGYFLKLAGGVFSWQSRAQKTIAHSSTEAEYMAISDCSRQVVWIRNLLSEIGYQLGPIPIAGDNQGSLFMGSNPVTESRSKHIDIRYHAIREYIENKQVELFFVDGSDNPADLFTKNLGHEQIYKSLLTINHYVCLYPELYSVLSSITFPDSFPYDFMHLLWENMVKNLMAFWTGTYKDLDEGSGSYHISPAIWTEVGQASAAAGGSIPYTFGPRPPNVASDNIKWTADLRSFWILHVAPVLLQGRFIQSKYYDHLVDLIKLLLACLQFEITHDELVQVKVGFARWVKKYEEYVPLEFSGPILGGAIGLLTHFRRLPPSLYYQHDIRRLSACPLTIHALLHIADSIRIAGPAWASWAFPMERYCGRLGPAIGSRRHPYTSIDRYVLDVARLDHIKSLYDAHDLLALSPPEKERGLMIPGYDSCVLLPASKYFIPPCGLMDKIVACLCTRFTATPAAIRAALPRQLQQWGKVRILGGGDTVRAADLAVNVADGRDASFVCYELLVDKNARYRNRPVILEKKTFYGQLRQILVLDLCPIPSAAPPLVQPISLVLGAVRQALIESHHNTLDIHYYKKMGALDLVDIATVHDNYQE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.22
3	0.23
4	0.25
5	0.22
6	0.23
7	0.25
8	0.26
9	0.31
10	0.38
11	0.47
12	0.49
13	0.58
14	0.66
15	0.73
16	0.83
17	0.87
18	0.9
19	0.91
20	0.91
21	0.91
22	0.91
23	0.86
24	0.79
25	0.74
26	0.69
27	0.64
28	0.54
29	0.46
30	0.41
31	0.37
32	0.33
33	0.29
34	0.25
35	0.23
36	0.23
37	0.2
38	0.15
39	0.16
40	0.17
41	0.18
42	0.21
43	0.2
44	0.26
45	0.3
46	0.32
47	0.33
48	0.38
49	0.41
50	0.39
51	0.41
52	0.44
53	0.51
54	0.56
55	0.61
56	0.63
57	0.66
58	0.69
59	0.67
60	0.61
61	0.57
62	0.54
63	0.5
64	0.45
65	0.38
66	0.35
67	0.34
68	0.37
69	0.31
70	0.29
71	0.3
72	0.31
73	0.36
74	0.37
75	0.42
76	0.47
77	0.56
78	0.62
79	0.65
80	0.66
81	0.67
82	0.68
83	0.65
84	0.64
85	0.63
86	0.64
87	0.67
88	0.69
89	0.69
90	0.71
91	0.7
92	0.66
93	0.66
94	0.66
95	0.68
96	0.7
97	0.69
98	0.73
99	0.74
100	0.74
101	0.72
102	0.72
103	0.69
104	0.69
105	0.66
106	0.61
107	0.63
108	0.63
109	0.57
110	0.49
111	0.47
112	0.41
113	0.39
114	0.4
115	0.38
116	0.38
117	0.38
118	0.45
119	0.46
120	0.49
121	0.57
122	0.54
123	0.52
124	0.47
125	0.49
126	0.44
127	0.44
128	0.39
129	0.3
130	0.31
131	0.36
132	0.37
133	0.4
134	0.41
135	0.4
136	0.45
137	0.52
138	0.56
139	0.53
140	0.55
141	0.58
142	0.63
143	0.66
144	0.66
145	0.64
146	0.63
147	0.59
148	0.57
149	0.52
150	0.47
151	0.42
152	0.4
153	0.34
154	0.29
155	0.28
156	0.28
157	0.24
158	0.21
159	0.21
160	0.18
161	0.21
162	0.23
163	0.23
164	0.24
165	0.24
166	0.24
167	0.2
168	0.2
169	0.16
170	0.14
171	0.13
172	0.11
173	0.1
174	0.09
175	0.1
176	0.1
177	0.1
178	0.09
179	0.1
180	0.09
181	0.11
182	0.12
183	0.12
184	0.12
185	0.12
186	0.12
187	0.12
188	0.13
189	0.1
190	0.09
191	0.08
192	0.08
193	0.08
194	0.08
195	0.09
196	0.08
197	0.09
198	0.11
199	0.11
200	0.12
201	0.12
202	0.12
203	0.12
204	0.12
205	0.11
206	0.09
207	0.08
208	0.07
209	0.1
210	0.09
211	0.09
212	0.08
213	0.08
214	0.08
215	0.08
216	0.07
217	0.04
218	0.04
219	0.05
220	0.07
221	0.07
222	0.08
223	0.1
224	0.11
225	0.12
226	0.13
227	0.15
228	0.14
229	0.14
230	0.14
231	0.13
232	0.15
233	0.16
234	0.16
235	0.16
236	0.17
237	0.24
238	0.29
239	0.3
240	0.31
241	0.33
242	0.34
243	0.39
244	0.41
245	0.36
246	0.35
247	0.38
248	0.42
249	0.45
250	0.45
251	0.45
252	0.43
253	0.45
254	0.44
255	0.42
256	0.39
257	0.35
258	0.34
259	0.3
260	0.35
261	0.38
262	0.41
263	0.44
264	0.46
265	0.45
266	0.45
267	0.43
268	0.43
269	0.42
270	0.43
271	0.5
272	0.5
273	0.59
274	0.62
275	0.62
276	0.61
277	0.62
278	0.58
279	0.55
280	0.58
281	0.59
282	0.63
283	0.7
284	0.68
285	0.69
286	0.68
287	0.61
288	0.54
289	0.53
290	0.48
291	0.48
292	0.51
293	0.5
294	0.5
295	0.54
296	0.52
297	0.51
298	0.54
299	0.51
300	0.51
301	0.48
302	0.48
303	0.53
304	0.51
305	0.43
306	0.37
307	0.28
308	0.25
309	0.22
310	0.17
311	0.11
312	0.11
313	0.11
314	0.1
315	0.11
316	0.1
317	0.09
318	0.09
319	0.07
320	0.08
321	0.09
322	0.09
323	0.1
324	0.16
325	0.16
326	0.16
327	0.15
328	0.14
329	0.13
330	0.13
331	0.12
332	0.06
333	0.06
334	0.05
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.07
342	0.07
343	0.09
344	0.1
345	0.1
346	0.1
347	0.1
348	0.11
349	0.1
350	0.11
351	0.1
352	0.11
353	0.11
354	0.11
355	0.1
356	0.12
357	0.11
358	0.11
359	0.1
360	0.09
361	0.09
362	0.09
363	0.09
364	0.08
365	0.07
366	0.06
367	0.07
368	0.1
369	0.15
370	0.17
371	0.19
372	0.2
373	0.21
374	0.25
375	0.25
376	0.23
377	0.22
378	0.21
379	0.19
380	0.19
381	0.19
382	0.15
383	0.18
384	0.18
385	0.14
386	0.15
387	0.14
388	0.15
389	0.16
390	0.17
391	0.12
392	0.14
393	0.14
394	0.14
395	0.18
396	0.19
397	0.18
398	0.19
399	0.2
400	0.19
401	0.21
402	0.2
403	0.22
404	0.2
405	0.18
406	0.18
407	0.18
408	0.18
409	0.16
410	0.16
411	0.12
412	0.11
413	0.12
414	0.1
415	0.1
416	0.11
417	0.1
418	0.1
419	0.09
420	0.09
421	0.09
422	0.09
423	0.07
424	0.06
425	0.06
426	0.05
427	0.05
428	0.04
429	0.04
430	0.03
431	0.03
432	0.03
433	0.03
434	0.04
435	0.05
436	0.05
437	0.07
438	0.06
439	0.1
440	0.12
441	0.12
442	0.15
443	0.17
444	0.23
445	0.3
446	0.31
447	0.33
448	0.33
449	0.34
450	0.35
451	0.4
452	0.45
453	0.39
454	0.44
455	0.42
456	0.42
457	0.41
458	0.42
459	0.38
460	0.34
461	0.35
462	0.3
463	0.27
464	0.35
465	0.34
466	0.3
467	0.36
468	0.34
469	0.35
470	0.41
471	0.43
472	0.35
473	0.4
474	0.43
475	0.36
476	0.34
477	0.32
478	0.27
479	0.27
480	0.26
481	0.21
482	0.17
483	0.19
484	0.17
485	0.14
486	0.15
487	0.15
488	0.18
489	0.19
490	0.2
491	0.17
492	0.17
493	0.22
494	0.25
495	0.23
496	0.28
497	0.3
498	0.3
499	0.3
500	0.3
501	0.27
502	0.23
503	0.24
504	0.18
505	0.18
506	0.16
507	0.21
508	0.21
509	0.23
510	0.22
511	0.22
512	0.22
513	0.19
514	0.21
515	0.16
516	0.15
517	0.12
518	0.13
519	0.12
520	0.15
521	0.17
522	0.15
523	0.16
524	0.17
525	0.17
526	0.18
527	0.2
528	0.17
529	0.16
530	0.15
531	0.13
532	0.12
533	0.11
534	0.08
535	0.05
536	0.05
537	0.03
538	0.03
539	0.04
540	0.05
541	0.05
542	0.05
543	0.06
544	0.06
545	0.06
546	0.06
547	0.08
548	0.08
549	0.08
550	0.08
551	0.09
552	0.09
553	0.09
554	0.1
555	0.11
556	0.11
557	0.12
558	0.13
559	0.17
560	0.17
561	0.19
562	0.18
563	0.16
564	0.16
565	0.16
566	0.16
567	0.12
568	0.12
569	0.11
570	0.09
571	0.09
572	0.08
573	0.09
574	0.08
575	0.08
576	0.07
577	0.08
578	0.08
579	0.09
580	0.09
581	0.09
582	0.08
583	0.08
584	0.08
585	0.07
586	0.06
587	0.05
588	0.05
589	0.04
590	0.03
591	0.03
592	0.03
593	0.03
594	0.03
595	0.04
596	0.04
597	0.04
598	0.07
599	0.07
600	0.08
601	0.11
602	0.12
603	0.16
604	0.22
605	0.22
606	0.2
607	0.22
608	0.22
609	0.27
610	0.33
611	0.31
612	0.26
613	0.26
614	0.25
615	0.25
616	0.23
617	0.16
618	0.1
619	0.07
620	0.07
621	0.07
622	0.08
623	0.08
624	0.11
625	0.11
626	0.13
627	0.13
628	0.16
629	0.18
630	0.25
631	0.25
632	0.25
633	0.24
634	0.24
635	0.24
636	0.21
637	0.19
638	0.09
639	0.08
640	0.07
641	0.07
642	0.06
643	0.05
644	0.05
645	0.05
646	0.06
647	0.06
648	0.06
649	0.09
650	0.16
651	0.18
652	0.22
653	0.22
654	0.22
655	0.22
656	0.22
657	0.2
658	0.13
659	0.11
660	0.08
661	0.07
662	0.06
663	0.06
664	0.06
665	0.05
666	0.05
667	0.06
668	0.05
669	0.05
670	0.06
671	0.05
672	0.05
673	0.05
674	0.06
675	0.05
676	0.05
677	0.05
678	0.04
679	0.07
680	0.07
681	0.07
682	0.07
683	0.08
684	0.1
685	0.11
686	0.13
687	0.15
688	0.19
689	0.2
690	0.24
691	0.28
692	0.31
693	0.33
694	0.38
695	0.38
696	0.35
697	0.34
698	0.31
699	0.27
700	0.25
701	0.26
702	0.23
703	0.24
704	0.23
705	0.23
706	0.23
707	0.23
708	0.2
709	0.17
710	0.13
711	0.08
712	0.08
713	0.08
714	0.06
715	0.09
716	0.09
717	0.08
718	0.07
719	0.08
720	0.08
721	0.07
722	0.09
723	0.07
724	0.09
725	0.1
726	0.12
727	0.12
728	0.13
729	0.17
730	0.17
731	0.2
732	0.19
733	0.19
734	0.17
735	0.19
736	0.19
737	0.18
738	0.21
739	0.18
740	0.18
741	0.18
742	0.18
743	0.15
744	0.16
745	0.13
746	0.09
747	0.09
748	0.08
749	0.09
750	0.09
751	0.09
752	0.07
753	0.07
754	0.06
755	0.07
756	0.08
757	0.08
758	0.08
759	0.09
760	0.1
761	0.11
762	0.11
763	0.12
764	0.12
765	0.12
766	0.12
767	0.15
768	0.13
769	0.13
770	0.13
771	0.14
772	0.12
773	0.12
774	0.13
775	0.08
776	0.08
777	0.08
778	0.07
779	0.06
780	0.05
781	0.06
782	0.09
783	0.1
784	0.11
785	0.11
786	0.11
787	0.12
788	0.12
789	0.12
790	0.09
791	0.08
792	0.09
793	0.1
794	0.1
795	0.08
796	0.09
797	0.08
798	0.08
799	0.07
800	0.07
801	0.08
802	0.07
803	0.07
804	0.09
805	0.1
806	0.1
807	0.1
808	0.09
809	0.07
810	0.07
811	0.07
812	0.04
813	0.03
814	0.03
815	0.03
816	0.03
817	0.04
818	0.04
819	0.07
820	0.08
821	0.11
822	0.16
823	0.17
824	0.22
825	0.23
826	0.27
827	0.26
828	0.31
829	0.32
830	0.3
831	0.35
832	0.31
833	0.3
834	0.26
835	0.26
836	0.24
837	0.22
838	0.19
839	0.18
840	0.21
841	0.21
842	0.21
843	0.24
844	0.2
845	0.18
846	0.19
847	0.15
848	0.1
849	0.14
850	0.15
851	0.1
852	0.11
853	0.11
854	0.14
855	0.15
856	0.15
857	0.15
858	0.15
859	0.18
860	0.21
861	0.24
862	0.21
863	0.2
864	0.24
865	0.22
866	0.21
867	0.19
868	0.16
869	0.13
870	0.12
871	0.12
872	0.1
873	0.09
874	0.08
875	0.07
876	0.08
877	0.07
878	0.09
879	0.14
880	0.12
881	0.13
882	0.12
883	0.13
884	0.14
885	0.15
886	0.16
887	0.1
888	0.1
889	0.1
890	0.11
891	0.13
892	0.14
893	0.2
894	0.21
895	0.25
896	0.28
897	0.3
898	0.34
899	0.36
900	0.43
901	0.41
902	0.4
903	0.39
904	0.37
905	0.34
906	0.3
907	0.24
908	0.16
909	0.11
910	0.09
911	0.07
912	0.05
913	0.04
914	0.04
915	0.04
916	0.03
917	0.03
918	0.05
919	0.05
920	0.07
921	0.08
922	0.09
923	0.13
924	0.15
925	0.18
926	0.21
927	0.28
928	0.32
929	0.36
930	0.4
931	0.41
932	0.45
933	0.49
934	0.46
935	0.41
936	0.38
937	0.35
938	0.35
939	0.33
940	0.28
941	0.23
942	0.24
943	0.25
944	0.23
945	0.22
946	0.18
947	0.17
948	0.16
949	0.15
950	0.13
951	0.09
952	0.09
953	0.09
954	0.09
955	0.07
956	0.07
957	0.07
958	0.07
959	0.07
960	0.07
961	0.1
962	0.1
963	0.09
964	0.1
965	0.13
966	0.12
967	0.14
968	0.15
969	0.16
970	0.18
971	0.21
972	0.23
973	0.21
974	0.22
975	0.24
976	0.23
977	0.23
978	0.28
979	0.31
980	0.33
981	0.36
982	0.38
983	0.38
984	0.39
985	0.36
986	0.35
987	0.38
988	0.43
989	0.44
990	0.42
991	0.39
992	0.4
993	0.42
994	0.38
995	0.29
996	0.22
997	0.18
998	0.21
999	0.21
1000	0.2
1001	0.19
1002	0.19
1003	0.19
1004	0.18
1005	0.2
1006	0.16
1007	0.18
1008	0.18
1009	0.15
1010	0.17
1011	0.16
1012	0.16
1013	0.18
1014	0.17
1015	0.15
1016	0.17
1017	0.18
1018	0.18
1019	0.18
1020	0.18
1021	0.15
1022	0.18
1023	0.21
1024	0.2
1025	0.19
1026	0.2
1027	0.2
1028	0.24
1029	0.22
1030	0.19
1031	0.15
1032	0.16
1033	0.16
1034	0.13
1035	0.14
1036	0.12
1037	0.16
1038	0.17
1039	0.19
1040	0.18
1041	0.21
1042	0.22
1043	0.21
1044	0.23
1045	0.22
1046	0.22
1047	0.21
1048	0.22
1049	0.19
1050	0.2
1051	0.21
1052	0.19
1053	0.15
1054	0.16
1055	0.17
1056	0.16
1057	0.18
1058	0.15
1059	0.16
1060	0.22
1061	0.22
1062	0.26
1063	0.27
1064	0.26
1065	0.25
1066	0.24
1067	0.26
1068	0.25
1069	0.29
1070	0.26
1071	0.27
1072	0.28
1073	0.35
1074	0.37
1075	0.4
1076	0.45
1077	0.45
1078	0.45
1079	0.45
1080	0.43
1081	0.37
1082	0.36
1083	0.29
1084	0.23
1085	0.19
1086	0.17
1087	0.15
1088	0.14
1089	0.12
1090	0.1
1091	0.1
1092	0.07
1093	0.07
1094	0.08
1095	0.07
1096	0.08
1097	0.08
1098	0.08
1099	0.08
1100	0.07
1101	0.07
1102	0.07
1103	0.07
1104	0.09
1105	0.1
1106	0.1
1107	0.11
1108	0.11
1109	0.1
1110	0.11
1111	0.13
1112	0.14
1113	0.15
1114	0.18
1115	0.25
1116	0.32
1117	0.37
1118	0.4
1119	0.46
1120	0.54
1121	0.58
1122	0.61
1123	0.63
1124	0.67
1125	0.7
1126	0.72
1127	0.66
1128	0.6
1129	0.56
1130	0.55
1131	0.49
1132	0.48
1133	0.46
1134	0.46
1135	0.47
1136	0.43
1137	0.41
1138	0.39
1139	0.36
1140	0.27
1141	0.24
1142	0.17
1143	0.14
1144	0.13
1145	0.13
1146	0.1
1147	0.11
1148	0.15
1149	0.13
1150	0.14
1151	0.15
1152	0.21
1153	0.21
1154	0.21
1155	0.19
1156	0.17
1157	0.19
1158	0.17
1159	0.16
1160	0.1
1161	0.11
1162	0.11
1163	0.12
1164	0.1
1165	0.07
1166	0.08
1167	0.08
1168	0.12
1169	0.17
1170	0.2
1171	0.22
1172	0.23
1173	0.23
1174	0.23
1175	0.25
1176	0.3
1177	0.27
1178	0.27
1179	0.26
1180	0.28
1181	0.28
1182	0.31
1183	0.31
1184	0.23
1185	0.23
1186	0.21
1187	0.21
1188	0.21
1189	0.2
1190	0.16
1191	0.15
1192	0.15
1193	0.15
1194	0.13

A0A060SIA2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer