Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JDT9

Protein Details
Accession C4JDT9    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-28HRRAHESKKTVSRKAAKRDTDRLSSBasic
388-408DQQISKKSKRALHKHFKAILTHydrophilic
485-509VVETERERPRRPKGKAWKRAGDSGIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
491-505ERPRRPKGKAWKRAG
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 11, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR039777  IFRD  
IPR007701  Interferon-rel_develop_reg_N  
KEGG ure:UREG_00566  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05004  IFRD  
Amino Acid Sequences MLEHRRAHESKKTVSRKAAKRDTDRLSSLLYSSPGAISAHRTHSQDVSRDISRVASREASRNVSRINSRVVSRDVSLSPSRDQSDDEYDSGSESDETSPSTISFDDRMGEDFEGGIKQDRPLAAVIDDLIDRKHSTVPAREENLAAYGRILARHYAAGEMEDCVEDLLPVFLQSIKQDSTENETNLALKAVALTAMTTLDGSIYDGASSAVRRKITGYSSLLTKATAVRCLGACAFFGGATEEDMVDEMEFLMEIITSDGHFVEAPDDPEVVTAALQEWGLLATGIEDLEYQSEDAIEAFADQLDSSEADVQIAAGQNIALLYEKSFSPREENEEIDEFEYNLQIDQDDISKSDYKDDNGVLLVQRYNPYHNTPAIEQKIQDLTKVSDQQISKKSKRALHKHFKAILTTVENPRHGPRYKQFSESEAYGTRLGVKFHRTASLNLNRWWKWLRMVALQQWLAGGIVEHYRAKSRAIVENIPGFSVVVETERERPRRPKGKAWKRAGDSGIPTGRRGEMNMLYDTLQG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.8
3 0.8
4 0.84
5 0.84
6 0.83
7 0.83
8 0.85
9 0.82
10 0.79
11 0.72
12 0.63
13 0.57
14 0.48
15 0.41
16 0.34
17 0.28
18 0.21
19 0.19
20 0.17
21 0.15
22 0.14
23 0.14
24 0.17
25 0.21
26 0.26
27 0.3
28 0.32
29 0.33
30 0.39
31 0.44
32 0.42
33 0.42
34 0.41
35 0.39
36 0.37
37 0.35
38 0.34
39 0.31
40 0.29
41 0.28
42 0.29
43 0.3
44 0.36
45 0.4
46 0.43
47 0.43
48 0.44
49 0.43
50 0.43
51 0.44
52 0.4
53 0.43
54 0.4
55 0.39
56 0.4
57 0.4
58 0.37
59 0.34
60 0.34
61 0.28
62 0.3
63 0.32
64 0.3
65 0.3
66 0.32
67 0.32
68 0.29
69 0.3
70 0.29
71 0.32
72 0.32
73 0.3
74 0.26
75 0.24
76 0.24
77 0.22
78 0.18
79 0.11
80 0.1
81 0.1
82 0.09
83 0.1
84 0.1
85 0.11
86 0.1
87 0.11
88 0.1
89 0.11
90 0.12
91 0.11
92 0.12
93 0.12
94 0.14
95 0.15
96 0.15
97 0.13
98 0.11
99 0.11
100 0.11
101 0.11
102 0.12
103 0.11
104 0.11
105 0.14
106 0.14
107 0.14
108 0.15
109 0.15
110 0.13
111 0.12
112 0.12
113 0.1
114 0.1
115 0.09
116 0.08
117 0.09
118 0.09
119 0.1
120 0.13
121 0.15
122 0.19
123 0.26
124 0.33
125 0.38
126 0.41
127 0.41
128 0.38
129 0.35
130 0.34
131 0.27
132 0.2
133 0.13
134 0.12
135 0.11
136 0.12
137 0.12
138 0.1
139 0.11
140 0.12
141 0.12
142 0.11
143 0.1
144 0.1
145 0.1
146 0.09
147 0.09
148 0.08
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.09
162 0.1
163 0.11
164 0.12
165 0.13
166 0.2
167 0.23
168 0.23
169 0.22
170 0.21
171 0.21
172 0.2
173 0.19
174 0.11
175 0.07
176 0.06
177 0.05
178 0.05
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.03
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.09
197 0.12
198 0.12
199 0.13
200 0.14
201 0.17
202 0.19
203 0.23
204 0.22
205 0.2
206 0.22
207 0.23
208 0.22
209 0.18
210 0.17
211 0.15
212 0.14
213 0.15
214 0.13
215 0.13
216 0.13
217 0.14
218 0.14
219 0.1
220 0.1
221 0.08
222 0.07
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.05
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.04
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.02
240 0.02
241 0.02
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.05
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.05
259 0.05
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.05
299 0.06
300 0.07
301 0.06
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.05
311 0.06
312 0.09
313 0.1
314 0.11
315 0.15
316 0.17
317 0.23
318 0.24
319 0.25
320 0.26
321 0.26
322 0.26
323 0.22
324 0.21
325 0.15
326 0.12
327 0.12
328 0.08
329 0.07
330 0.06
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.1
338 0.13
339 0.14
340 0.19
341 0.2
342 0.2
343 0.22
344 0.22
345 0.2
346 0.17
347 0.18
348 0.13
349 0.13
350 0.13
351 0.12
352 0.14
353 0.15
354 0.18
355 0.19
356 0.23
357 0.25
358 0.26
359 0.27
360 0.26
361 0.34
362 0.35
363 0.34
364 0.3
365 0.29
366 0.34
367 0.31
368 0.3
369 0.23
370 0.22
371 0.26
372 0.31
373 0.29
374 0.28
375 0.29
376 0.35
377 0.41
378 0.48
379 0.46
380 0.49
381 0.55
382 0.56
383 0.65
384 0.69
385 0.71
386 0.74
387 0.78
388 0.81
389 0.8
390 0.75
391 0.67
392 0.58
393 0.52
394 0.46
395 0.43
396 0.41
397 0.39
398 0.38
399 0.38
400 0.4
401 0.43
402 0.4
403 0.43
404 0.44
405 0.49
406 0.51
407 0.55
408 0.52
409 0.48
410 0.5
411 0.44
412 0.4
413 0.31
414 0.31
415 0.25
416 0.23
417 0.25
418 0.22
419 0.23
420 0.22
421 0.25
422 0.26
423 0.27
424 0.33
425 0.3
426 0.32
427 0.4
428 0.46
429 0.47
430 0.49
431 0.56
432 0.5
433 0.53
434 0.53
435 0.46
436 0.41
437 0.42
438 0.4
439 0.39
440 0.45
441 0.46
442 0.5
443 0.48
444 0.43
445 0.37
446 0.32
447 0.25
448 0.18
449 0.13
450 0.06
451 0.08
452 0.1
453 0.12
454 0.13
455 0.18
456 0.19
457 0.2
458 0.24
459 0.27
460 0.33
461 0.37
462 0.4
463 0.4
464 0.46
465 0.44
466 0.4
467 0.35
468 0.27
469 0.21
470 0.17
471 0.13
472 0.08
473 0.1
474 0.12
475 0.2
476 0.29
477 0.34
478 0.41
479 0.49
480 0.58
481 0.66
482 0.71
483 0.74
484 0.77
485 0.84
486 0.87
487 0.88
488 0.88
489 0.83
490 0.84
491 0.77
492 0.73
493 0.66
494 0.64
495 0.61
496 0.53
497 0.48
498 0.42
499 0.41
500 0.35
501 0.33
502 0.31
503 0.29
504 0.31
505 0.32
506 0.31