Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A060SHC1

Protein Details
Accession A0A060SHC1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
707-736KEKAKGTTNKAPKTKNKKKAEKSRAAASQNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
123-141RRAEPKKFGGHGARARRQK
634-645KKRGRPGATGKR
699-731KTKSQVKAKEKAKGTTNKAPKTKNKKKAEKSRA
Subcellular Location(s) mito 14, cyto 8, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001357  BRCT_dom  
IPR036420  BRCT_dom_sf  
IPR020568  Ribosomal_S5_D2-typ_fold  
IPR014721  Ribosomal_S5_D2-typ_fold_subgr  
IPR000754  Ribosomal_S9  
IPR020574  Ribosomal_S9_CS  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF16589  BRCT_2  
PF00380  Ribosomal_S9  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50172  BRCT  
PS00360  RIBOSOMAL_S9  
CDD cd00027  BRCT  
Amino Acid Sequences MAPATQAVQTFGKKKTATAVAHAKEGRGLIHINGSPITLLRPEILRFKVYEPVLVAGEDAFSAIDIRLRVKGGGHTSQVYAIRQAIAKAVVAYYAKYFDAASALELKKKLVAYDRTLLIADPRRAEPKKFGGHGARARRQKSASMSEPQASGRVFVDSAGHPLRVFVEAAELEYRPTVIRTLKNNGAQIRHSPQEASVIIVDPETPSGAQFTQDWGSEPGKVVLDVAWVQKSVERRKALLGDENWGGYCTHTPNESASLQNPLPTPRETPPDAPTNQAHAGMQNQQPYHLPDGSQFSSGNIPNAFPYPQPHVIPQLPGGLPNGVHVPMASMQANPNAQVTLPAHLVAQLVGLVSQQGLNPASLGIGQMGSQMPMNMMQGPAMSQGYSQQGMPFMSQPSMFAQQPFPMSQQAPSYSGQPQMMNPPPIQYQHPTFATPDTNASISQMRGQSGMSDAMGGSPMEGLRSPSSKRKSASVDRPLSSSSARYPSLARTENERFAKYRRTSYPPDEPPLPYADTSPISNQTRRDVSRAHSKQLFTKQDGEPCKFFVQIDIRPRTKIADAIKKNGGRLVPDIADADYVILGAPSTRTFEERLKQAISYDKQAVRPQWVFECVEQNTIVDLDDFAFEGMKVEKKRGRPGATGKRLIVTGPGAPKPNAGKSDGFFLQDEDYVMDDDDDESDEEEEEEEEEEEGASGSPKTKSQVKAKEKAKGTTNKAPKTKNKKKAEKSRAAASQNEGSSRGPVQQRTASSKAFWRPSPPPPTRVVEHYRGKNLYTKEDLDYVDEYVPILFFRDPEMTLHAVSEKLHAKVRMWWSSSLCILLTFARQMPHHTPKSWSTFISHATRREKVEKMRRQAQIARRKASASGQETSQRIDPTAVPHAGPANQNPPTHVAPEDYDPFTILAKFFAGGGADNLADAEVWRVLSQQHPEMSAEAWEAYWIKHNEAISVAVAELSGVQGDPEGGTNAPTQTGDGQGAVKTEPE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.42
3 0.46
4 0.43
5 0.46
6 0.53
7 0.47
8 0.54
9 0.54
10 0.47
11 0.4
12 0.38
13 0.31
14 0.23
15 0.23
16 0.16
17 0.22
18 0.23
19 0.22
20 0.22
21 0.21
22 0.19
23 0.17
24 0.18
25 0.13
26 0.12
27 0.13
28 0.16
29 0.18
30 0.25
31 0.27
32 0.28
33 0.29
34 0.3
35 0.36
36 0.33
37 0.34
38 0.28
39 0.28
40 0.26
41 0.24
42 0.21
43 0.14
44 0.13
45 0.1
46 0.08
47 0.06
48 0.05
49 0.06
50 0.06
51 0.08
52 0.09
53 0.11
54 0.13
55 0.15
56 0.16
57 0.17
58 0.23
59 0.27
60 0.31
61 0.32
62 0.32
63 0.32
64 0.36
65 0.37
66 0.32
67 0.28
68 0.24
69 0.23
70 0.22
71 0.22
72 0.19
73 0.17
74 0.17
75 0.15
76 0.13
77 0.14
78 0.14
79 0.14
80 0.13
81 0.14
82 0.13
83 0.13
84 0.13
85 0.11
86 0.12
87 0.11
88 0.11
89 0.17
90 0.19
91 0.22
92 0.23
93 0.23
94 0.25
95 0.25
96 0.27
97 0.28
98 0.33
99 0.34
100 0.4
101 0.41
102 0.39
103 0.38
104 0.35
105 0.34
106 0.35
107 0.33
108 0.3
109 0.32
110 0.4
111 0.43
112 0.46
113 0.47
114 0.48
115 0.53
116 0.51
117 0.56
118 0.54
119 0.6
120 0.65
121 0.68
122 0.67
123 0.67
124 0.68
125 0.66
126 0.61
127 0.58
128 0.57
129 0.56
130 0.53
131 0.52
132 0.53
133 0.49
134 0.48
135 0.42
136 0.39
137 0.3
138 0.26
139 0.19
140 0.17
141 0.14
142 0.13
143 0.16
144 0.12
145 0.18
146 0.19
147 0.18
148 0.17
149 0.17
150 0.18
151 0.16
152 0.16
153 0.1
154 0.12
155 0.11
156 0.13
157 0.14
158 0.13
159 0.12
160 0.12
161 0.13
162 0.09
163 0.1
164 0.12
165 0.16
166 0.22
167 0.27
168 0.35
169 0.41
170 0.45
171 0.5
172 0.51
173 0.49
174 0.45
175 0.46
176 0.45
177 0.4
178 0.36
179 0.32
180 0.28
181 0.3
182 0.27
183 0.23
184 0.18
185 0.16
186 0.15
187 0.15
188 0.14
189 0.09
190 0.09
191 0.08
192 0.07
193 0.06
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.09
198 0.12
199 0.14
200 0.14
201 0.16
202 0.17
203 0.18
204 0.18
205 0.19
206 0.18
207 0.16
208 0.16
209 0.14
210 0.1
211 0.12
212 0.12
213 0.14
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.14
218 0.22
219 0.28
220 0.34
221 0.34
222 0.35
223 0.39
224 0.43
225 0.44
226 0.44
227 0.37
228 0.33
229 0.31
230 0.3
231 0.26
232 0.22
233 0.2
234 0.13
235 0.14
236 0.12
237 0.13
238 0.13
239 0.14
240 0.14
241 0.18
242 0.19
243 0.18
244 0.17
245 0.21
246 0.2
247 0.22
248 0.22
249 0.21
250 0.23
251 0.23
252 0.26
253 0.24
254 0.29
255 0.3
256 0.32
257 0.34
258 0.38
259 0.37
260 0.37
261 0.35
262 0.35
263 0.32
264 0.3
265 0.26
266 0.2
267 0.21
268 0.24
269 0.25
270 0.24
271 0.23
272 0.23
273 0.25
274 0.26
275 0.28
276 0.22
277 0.2
278 0.18
279 0.24
280 0.24
281 0.24
282 0.21
283 0.18
284 0.22
285 0.22
286 0.22
287 0.17
288 0.16
289 0.15
290 0.17
291 0.17
292 0.13
293 0.15
294 0.19
295 0.23
296 0.24
297 0.24
298 0.28
299 0.29
300 0.29
301 0.27
302 0.26
303 0.21
304 0.21
305 0.2
306 0.15
307 0.14
308 0.13
309 0.14
310 0.09
311 0.09
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.11
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.14
320 0.14
321 0.13
322 0.12
323 0.1
324 0.1
325 0.12
326 0.12
327 0.11
328 0.12
329 0.11
330 0.11
331 0.11
332 0.11
333 0.08
334 0.07
335 0.05
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.03
340 0.03
341 0.04
342 0.04
343 0.06
344 0.07
345 0.06
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.06
350 0.06
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.05
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.07
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.07
368 0.07
369 0.06
370 0.05
371 0.08
372 0.09
373 0.1
374 0.1
375 0.09
376 0.1
377 0.11
378 0.12
379 0.11
380 0.1
381 0.11
382 0.1
383 0.11
384 0.12
385 0.15
386 0.14
387 0.14
388 0.14
389 0.15
390 0.17
391 0.17
392 0.16
393 0.15
394 0.16
395 0.16
396 0.17
397 0.17
398 0.18
399 0.17
400 0.18
401 0.17
402 0.19
403 0.19
404 0.18
405 0.17
406 0.21
407 0.25
408 0.24
409 0.22
410 0.22
411 0.22
412 0.23
413 0.25
414 0.21
415 0.2
416 0.22
417 0.23
418 0.22
419 0.21
420 0.21
421 0.2
422 0.17
423 0.16
424 0.13
425 0.13
426 0.12
427 0.12
428 0.12
429 0.11
430 0.14
431 0.13
432 0.13
433 0.12
434 0.12
435 0.11
436 0.11
437 0.11
438 0.07
439 0.06
440 0.06
441 0.05
442 0.06
443 0.05
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.04
449 0.06
450 0.07
451 0.09
452 0.12
453 0.19
454 0.24
455 0.28
456 0.29
457 0.32
458 0.38
459 0.44
460 0.52
461 0.54
462 0.55
463 0.51
464 0.52
465 0.47
466 0.42
467 0.34
468 0.25
469 0.18
470 0.16
471 0.16
472 0.15
473 0.16
474 0.17
475 0.22
476 0.24
477 0.22
478 0.25
479 0.28
480 0.33
481 0.35
482 0.33
483 0.29
484 0.29
485 0.38
486 0.33
487 0.37
488 0.35
489 0.39
490 0.43
491 0.48
492 0.55
493 0.49
494 0.5
495 0.46
496 0.42
497 0.37
498 0.34
499 0.29
500 0.2
501 0.17
502 0.15
503 0.14
504 0.14
505 0.13
506 0.17
507 0.19
508 0.21
509 0.22
510 0.23
511 0.28
512 0.28
513 0.3
514 0.26
515 0.27
516 0.36
517 0.37
518 0.38
519 0.37
520 0.37
521 0.4
522 0.47
523 0.47
524 0.39
525 0.42
526 0.39
527 0.42
528 0.45
529 0.43
530 0.34
531 0.33
532 0.31
533 0.26
534 0.24
535 0.22
536 0.22
537 0.24
538 0.32
539 0.36
540 0.36
541 0.36
542 0.36
543 0.33
544 0.29
545 0.29
546 0.27
547 0.31
548 0.32
549 0.37
550 0.43
551 0.42
552 0.41
553 0.39
554 0.33
555 0.24
556 0.23
557 0.21
558 0.15
559 0.15
560 0.15
561 0.12
562 0.12
563 0.1
564 0.08
565 0.05
566 0.04
567 0.04
568 0.03
569 0.03
570 0.03
571 0.03
572 0.04
573 0.06
574 0.06
575 0.08
576 0.11
577 0.15
578 0.19
579 0.22
580 0.24
581 0.24
582 0.23
583 0.24
584 0.29
585 0.26
586 0.26
587 0.29
588 0.29
589 0.31
590 0.35
591 0.35
592 0.34
593 0.33
594 0.31
595 0.27
596 0.27
597 0.25
598 0.23
599 0.27
600 0.21
601 0.22
602 0.2
603 0.18
604 0.15
605 0.14
606 0.13
607 0.07
608 0.06
609 0.05
610 0.05
611 0.05
612 0.05
613 0.05
614 0.04
615 0.05
616 0.07
617 0.11
618 0.12
619 0.18
620 0.22
621 0.26
622 0.35
623 0.42
624 0.46
625 0.47
626 0.57
627 0.63
628 0.67
629 0.67
630 0.58
631 0.52
632 0.47
633 0.4
634 0.32
635 0.22
636 0.17
637 0.17
638 0.19
639 0.2
640 0.2
641 0.23
642 0.24
643 0.27
644 0.26
645 0.25
646 0.24
647 0.22
648 0.28
649 0.26
650 0.25
651 0.2
652 0.19
653 0.17
654 0.16
655 0.16
656 0.1
657 0.1
658 0.09
659 0.08
660 0.07
661 0.06
662 0.06
663 0.06
664 0.06
665 0.06
666 0.06
667 0.06
668 0.06
669 0.06
670 0.06
671 0.06
672 0.06
673 0.06
674 0.06
675 0.06
676 0.06
677 0.05
678 0.05
679 0.05
680 0.05
681 0.05
682 0.05
683 0.07
684 0.08
685 0.1
686 0.13
687 0.2
688 0.26
689 0.35
690 0.46
691 0.52
692 0.61
693 0.66
694 0.71
695 0.68
696 0.67
697 0.66
698 0.64
699 0.63
700 0.64
701 0.67
702 0.67
703 0.7
704 0.73
705 0.74
706 0.77
707 0.8
708 0.81
709 0.82
710 0.85
711 0.89
712 0.92
713 0.93
714 0.91
715 0.85
716 0.83
717 0.8
718 0.73
719 0.65
720 0.58
721 0.52
722 0.43
723 0.4
724 0.33
725 0.25
726 0.24
727 0.22
728 0.24
729 0.23
730 0.23
731 0.27
732 0.3
733 0.34
734 0.39
735 0.42
736 0.38
737 0.35
738 0.4
739 0.43
740 0.44
741 0.41
742 0.41
743 0.42
744 0.5
745 0.58
746 0.56
747 0.52
748 0.52
749 0.56
750 0.52
751 0.53
752 0.51
753 0.5
754 0.55
755 0.56
756 0.58
757 0.54
758 0.53
759 0.52
760 0.48
761 0.45
762 0.41
763 0.38
764 0.33
765 0.35
766 0.33
767 0.3
768 0.28
769 0.24
770 0.19
771 0.17
772 0.15
773 0.11
774 0.11
775 0.08
776 0.09
777 0.07
778 0.07
779 0.1
780 0.12
781 0.12
782 0.14
783 0.18
784 0.17
785 0.17
786 0.18
787 0.16
788 0.15
789 0.14
790 0.18
791 0.18
792 0.19
793 0.23
794 0.24
795 0.25
796 0.32
797 0.39
798 0.41
799 0.41
800 0.42
801 0.41
802 0.42
803 0.42
804 0.35
805 0.27
806 0.2
807 0.18
808 0.15
809 0.14
810 0.13
811 0.14
812 0.17
813 0.17
814 0.23
815 0.31
816 0.39
817 0.42
818 0.42
819 0.45
820 0.48
821 0.56
822 0.53
823 0.45
824 0.39
825 0.37
826 0.41
827 0.45
828 0.44
829 0.44
830 0.48
831 0.51
832 0.54
833 0.57
834 0.58
835 0.6
836 0.66
837 0.67
838 0.7
839 0.74
840 0.73
841 0.74
842 0.76
843 0.75
844 0.75
845 0.74
846 0.69
847 0.62
848 0.59
849 0.54
850 0.52
851 0.51
852 0.46
853 0.39
854 0.38
855 0.43
856 0.42
857 0.43
858 0.4
859 0.32
860 0.28
861 0.27
862 0.25
863 0.24
864 0.3
865 0.28
866 0.24
867 0.24
868 0.26
869 0.27
870 0.29
871 0.28
872 0.29
873 0.34
874 0.34
875 0.35
876 0.37
877 0.36
878 0.35
879 0.32
880 0.26
881 0.23
882 0.28
883 0.31
884 0.27
885 0.25
886 0.24
887 0.24
888 0.22
889 0.21
890 0.16
891 0.12
892 0.11
893 0.11
894 0.1
895 0.1
896 0.09
897 0.08
898 0.09
899 0.1
900 0.09
901 0.08
902 0.08
903 0.07
904 0.07
905 0.06
906 0.07
907 0.07
908 0.07
909 0.08
910 0.09
911 0.1
912 0.16
913 0.21
914 0.25
915 0.26
916 0.27
917 0.28
918 0.28
919 0.27
920 0.24
921 0.2
922 0.15
923 0.12
924 0.13
925 0.13
926 0.12
927 0.2
928 0.2
929 0.21
930 0.24
931 0.25
932 0.24
933 0.25
934 0.25
935 0.18
936 0.17
937 0.15
938 0.11
939 0.1
940 0.09
941 0.07
942 0.06
943 0.05
944 0.04
945 0.04
946 0.05
947 0.05
948 0.06
949 0.07
950 0.08
951 0.08
952 0.1
953 0.12
954 0.13
955 0.14
956 0.13
957 0.14
958 0.14
959 0.17
960 0.16
961 0.15
962 0.16
963 0.16
964 0.17