Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A060SPK3

Protein Details
Accession A0A060SPK3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
343-363HSSPSKHHRRSSSSRSQPRSHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
288-306GRRAGKERERATLRARKVR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045030  LYSM1-4  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51782  LYSM  
CDD cd00118  LysM  
Amino Acid Sequences MKRMLSHNDALDVAGARDLSPQEEGGRHTKSESQDQEMLVVLHQIQPTDSLPGVALKYGISLAELRRANQLWASDPIHLREMLYIPVDKARNVQHLRSMDGVITTNAGSSRLGNLDTQTMDGLPSSKPAADDAKDAEKYTLRRVPASQLAFFPPPTNRTSLSRSTASSAVNPLLSQTLPARRAASNRPPIPGFPRPQQEAPLKNVIDLFSTSLHATANHLRAYAQSQSSLFSSPRPVKLSQSLASRLSIDSTSASATASSEEGDWEHEMESLGRGGRPSGGESIQPNGRRAGKERERATLRARKVRSASPEEKDSLELDSAPFAGFVDCHASTGLDGASASTHSSPSKHHRRSSSSRSQPRSHSRLGSSSSSVNGHRKVVPYMALEDEAGALGGRRRVGAVTATGRGEDGAAGAVPGDAPPGAAEANAVERVVAPRLVDARSKLQRLSPSVP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.12
3 0.1
4 0.13
5 0.13
6 0.13
7 0.14
8 0.14
9 0.16
10 0.19
11 0.22
12 0.26
13 0.28
14 0.27
15 0.29
16 0.33
17 0.35
18 0.42
19 0.43
20 0.43
21 0.44
22 0.43
23 0.42
24 0.37
25 0.33
26 0.23
27 0.2
28 0.14
29 0.14
30 0.15
31 0.14
32 0.13
33 0.15
34 0.16
35 0.17
36 0.17
37 0.13
38 0.13
39 0.15
40 0.15
41 0.13
42 0.13
43 0.09
44 0.1
45 0.1
46 0.09
47 0.08
48 0.1
49 0.11
50 0.18
51 0.19
52 0.2
53 0.26
54 0.27
55 0.27
56 0.27
57 0.27
58 0.23
59 0.28
60 0.29
61 0.28
62 0.29
63 0.3
64 0.29
65 0.28
66 0.24
67 0.21
68 0.2
69 0.17
70 0.18
71 0.16
72 0.15
73 0.2
74 0.21
75 0.19
76 0.22
77 0.25
78 0.33
79 0.36
80 0.37
81 0.38
82 0.39
83 0.41
84 0.39
85 0.35
86 0.25
87 0.23
88 0.22
89 0.15
90 0.14
91 0.11
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.08
96 0.08
97 0.1
98 0.1
99 0.11
100 0.11
101 0.12
102 0.14
103 0.14
104 0.14
105 0.12
106 0.1
107 0.1
108 0.09
109 0.1
110 0.07
111 0.08
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.12
116 0.16
117 0.15
118 0.17
119 0.19
120 0.24
121 0.24
122 0.25
123 0.24
124 0.24
125 0.25
126 0.3
127 0.31
128 0.26
129 0.27
130 0.28
131 0.32
132 0.35
133 0.37
134 0.31
135 0.28
136 0.31
137 0.3
138 0.29
139 0.26
140 0.21
141 0.2
142 0.21
143 0.22
144 0.2
145 0.23
146 0.28
147 0.31
148 0.33
149 0.32
150 0.31
151 0.31
152 0.32
153 0.28
154 0.24
155 0.21
156 0.17
157 0.16
158 0.14
159 0.12
160 0.1
161 0.09
162 0.09
163 0.1
164 0.15
165 0.16
166 0.18
167 0.2
168 0.2
169 0.24
170 0.3
171 0.36
172 0.4
173 0.41
174 0.43
175 0.41
176 0.41
177 0.44
178 0.44
179 0.39
180 0.35
181 0.39
182 0.4
183 0.4
184 0.44
185 0.44
186 0.41
187 0.4
188 0.41
189 0.36
190 0.32
191 0.32
192 0.26
193 0.21
194 0.17
195 0.14
196 0.08
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.09
203 0.13
204 0.15
205 0.14
206 0.14
207 0.14
208 0.14
209 0.17
210 0.17
211 0.13
212 0.12
213 0.12
214 0.13
215 0.13
216 0.14
217 0.12
218 0.1
219 0.16
220 0.18
221 0.21
222 0.24
223 0.24
224 0.25
225 0.29
226 0.33
227 0.3
228 0.31
229 0.3
230 0.28
231 0.28
232 0.26
233 0.21
234 0.18
235 0.14
236 0.11
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.07
241 0.07
242 0.05
243 0.06
244 0.06
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.08
264 0.09
265 0.1
266 0.11
267 0.11
268 0.13
269 0.14
270 0.17
271 0.21
272 0.22
273 0.22
274 0.23
275 0.26
276 0.26
277 0.3
278 0.37
279 0.41
280 0.48
281 0.49
282 0.53
283 0.54
284 0.56
285 0.6
286 0.57
287 0.55
288 0.55
289 0.55
290 0.52
291 0.52
292 0.54
293 0.53
294 0.54
295 0.54
296 0.49
297 0.51
298 0.47
299 0.44
300 0.4
301 0.33
302 0.25
303 0.19
304 0.15
305 0.11
306 0.1
307 0.09
308 0.08
309 0.07
310 0.06
311 0.06
312 0.05
313 0.06
314 0.1
315 0.1
316 0.1
317 0.11
318 0.11
319 0.1
320 0.11
321 0.11
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.07
328 0.06
329 0.08
330 0.09
331 0.1
332 0.16
333 0.26
334 0.37
335 0.44
336 0.5
337 0.56
338 0.65
339 0.73
340 0.78
341 0.78
342 0.78
343 0.8
344 0.81
345 0.79
346 0.79
347 0.8
348 0.77
349 0.72
350 0.67
351 0.6
352 0.59
353 0.57
354 0.52
355 0.44
356 0.39
357 0.35
358 0.32
359 0.33
360 0.34
361 0.32
362 0.31
363 0.32
364 0.33
365 0.33
366 0.33
367 0.32
368 0.27
369 0.28
370 0.26
371 0.23
372 0.21
373 0.18
374 0.16
375 0.12
376 0.1
377 0.07
378 0.06
379 0.07
380 0.1
381 0.1
382 0.1
383 0.11
384 0.12
385 0.13
386 0.15
387 0.18
388 0.2
389 0.23
390 0.23
391 0.23
392 0.22
393 0.21
394 0.19
395 0.13
396 0.09
397 0.06
398 0.06
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.04
406 0.05
407 0.05
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.07
412 0.07
413 0.1
414 0.11
415 0.1
416 0.09
417 0.11
418 0.13
419 0.15
420 0.15
421 0.13
422 0.16
423 0.19
424 0.22
425 0.25
426 0.27
427 0.34
428 0.41
429 0.45
430 0.43
431 0.46
432 0.51