Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A060SRS2

Protein Details
Accession A0A060SRS2    Localization Confidence High Confidence Score 25.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-28ATAVAKPAKLSKKKSEQDLKADAPHydrophilic
40-63APAAKAPSTKSKKEQKGKAPAMGSHydrophilic
65-84VVPPSAKEKRGKKKEGEAVSHydrophilic
223-242VVKRKLEKAKRKPTEDRGVVBasic
266-285VTRLRLSRNKKTGKSKHYAFHydrophilic
354-379EQEKAERRLLKRQEQRKRKLQESGIDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-103KPAKLSKKKSEQDLKADAPVKAKKAKQTEDAPAAKAPSTKSKKEQKGKAPAMGSEVVPPSAKEKRGKKKEGEAVSAKTEVGDEKKRKAAAVEKE
108-116EKSTKKRRG
225-234KRKLEKAKRK
332-372KWRPVPRDRVARVAHNKPRTEEEQEKAERRLLKRQEQRKRK
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAKTATAVAKPAKLSKKKSEQDLKADAPVKAKKAKQTEDAPAAKAPSTKSKKEQKGKAPAMGSEVVPPSAKEKRGKKKEGEAVSAKTEVGDEKKRKAAAVEKETESTEKSTKKRRGSVVVHSAPALQSKAARKGKAAVSAAVESEQTEKAGKKTQSKPAAKAPSPDPEEESAHEGDAAEEQEQEEQFYGFESDDDDSSDDEMPDEIPGIDIKKLPTISKDDEVVKRKLEKAKRKPTEDRGVVYLGRIPHGFYEDEMRAYFSQFGTVTRLRLSRNKKTGKSKHYAFIEFDSSSVAQIVAETMDNYLLMGHILTCKVIPKDQVHPELWVGANRKWRPVPRDRVARVAHNKPRTEEEQEKAERRLLKRQEQRKRKLQESGIDYDFEAVAYKKKPKPTEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.62
3 0.7
4 0.73
5 0.8
6 0.83
7 0.8
8 0.81
9 0.81
10 0.73
11 0.7
12 0.68
13 0.59
14 0.56
15 0.54
16 0.51
17 0.5
18 0.52
19 0.52
20 0.57
21 0.61
22 0.62
23 0.64
24 0.67
25 0.68
26 0.67
27 0.61
28 0.54
29 0.49
30 0.43
31 0.38
32 0.32
33 0.34
34 0.38
35 0.42
36 0.49
37 0.58
38 0.67
39 0.74
40 0.81
41 0.8
42 0.84
43 0.84
44 0.81
45 0.73
46 0.63
47 0.58
48 0.5
49 0.4
50 0.33
51 0.28
52 0.22
53 0.2
54 0.19
55 0.2
56 0.24
57 0.29
58 0.34
59 0.43
60 0.53
61 0.63
62 0.71
63 0.73
64 0.77
65 0.8
66 0.78
67 0.76
68 0.7
69 0.63
70 0.58
71 0.52
72 0.41
73 0.32
74 0.26
75 0.21
76 0.21
77 0.27
78 0.28
79 0.32
80 0.38
81 0.38
82 0.38
83 0.4
84 0.43
85 0.43
86 0.47
87 0.48
88 0.45
89 0.45
90 0.46
91 0.43
92 0.36
93 0.29
94 0.27
95 0.28
96 0.32
97 0.41
98 0.48
99 0.55
100 0.61
101 0.64
102 0.68
103 0.67
104 0.7
105 0.7
106 0.65
107 0.57
108 0.5
109 0.45
110 0.35
111 0.31
112 0.23
113 0.12
114 0.14
115 0.17
116 0.27
117 0.31
118 0.32
119 0.31
120 0.36
121 0.39
122 0.42
123 0.39
124 0.3
125 0.28
126 0.27
127 0.26
128 0.21
129 0.18
130 0.11
131 0.12
132 0.1
133 0.08
134 0.1
135 0.11
136 0.12
137 0.2
138 0.23
139 0.31
140 0.37
141 0.46
142 0.54
143 0.58
144 0.6
145 0.62
146 0.66
147 0.59
148 0.56
149 0.5
150 0.47
151 0.46
152 0.43
153 0.36
154 0.3
155 0.3
156 0.27
157 0.27
158 0.19
159 0.15
160 0.15
161 0.12
162 0.1
163 0.09
164 0.09
165 0.06
166 0.05
167 0.06
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.06
172 0.06
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.06
184 0.08
185 0.08
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.05
191 0.05
192 0.04
193 0.04
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.07
198 0.08
199 0.1
200 0.11
201 0.12
202 0.14
203 0.18
204 0.21
205 0.21
206 0.23
207 0.25
208 0.31
209 0.36
210 0.35
211 0.33
212 0.33
213 0.36
214 0.42
215 0.46
216 0.51
217 0.57
218 0.66
219 0.71
220 0.76
221 0.79
222 0.8
223 0.81
224 0.74
225 0.65
226 0.56
227 0.5
228 0.43
229 0.35
230 0.28
231 0.18
232 0.16
233 0.14
234 0.12
235 0.1
236 0.12
237 0.12
238 0.1
239 0.14
240 0.14
241 0.15
242 0.14
243 0.16
244 0.14
245 0.15
246 0.16
247 0.11
248 0.13
249 0.12
250 0.13
251 0.16
252 0.17
253 0.17
254 0.18
255 0.21
256 0.22
257 0.3
258 0.38
259 0.42
260 0.51
261 0.59
262 0.64
263 0.73
264 0.79
265 0.8
266 0.8
267 0.75
268 0.73
269 0.7
270 0.65
271 0.56
272 0.49
273 0.45
274 0.36
275 0.31
276 0.26
277 0.2
278 0.17
279 0.15
280 0.11
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.05
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.11
301 0.13
302 0.16
303 0.21
304 0.24
305 0.32
306 0.4
307 0.45
308 0.42
309 0.42
310 0.4
311 0.38
312 0.35
313 0.32
314 0.28
315 0.26
316 0.35
317 0.34
318 0.4
319 0.44
320 0.51
321 0.54
322 0.61
323 0.67
324 0.67
325 0.76
326 0.73
327 0.75
328 0.72
329 0.73
330 0.71
331 0.71
332 0.71
333 0.69
334 0.69
335 0.63
336 0.66
337 0.61
338 0.62
339 0.58
340 0.53
341 0.55
342 0.59
343 0.6
344 0.56
345 0.56
346 0.54
347 0.51
348 0.57
349 0.57
350 0.59
351 0.65
352 0.73
353 0.79
354 0.82
355 0.88
356 0.88
357 0.88
358 0.85
359 0.85
360 0.81
361 0.79
362 0.75
363 0.72
364 0.64
365 0.56
366 0.48
367 0.4
368 0.32
369 0.23
370 0.18
371 0.12
372 0.16
373 0.21
374 0.3
375 0.34
376 0.44