Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A060SJI3

Protein Details
Accession A0A060SJI3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-34ESCLKRPSGNTPRRRTDSEEHydrophilic
228-252TSSTTTPTRPTRRSRSRPRSSGTPSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12, cyto 4, extr 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001781  Znf_LIM  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50023  LIM_DOMAIN_2  
CDD cd08368  LIM  
Amino Acid Sequences MVDLLGRPSCADCFESCLKRPSGNTPRRRTDSEEECSNLGGFKRTNKEREGSPALEELEMRLGIRSRDSTPAAEGRGTRFMNSPSTFPTSPSPHSPLSQRHTAVLAGDASPTAERLASRARANSSGSVGSPSARDAPSRSDGDNSSPTRNGSPRSRRSYSRLKSPDPNAGEGSPITARLTGTGSPRYGSPSPARPPTADAIEEMKQRFLRQASPGPPSAPGQALKTSTSSTTTPTRPTRRSRSRPRSSGTPSSVLDESVSGDLDELQVTLDVVAPLRIVRRNNTGGIGSLHNTGASGSIRSDVTGGTGRLRRDLTGNTDLVRGDMTGNSQYTLKADRTGDAEVESLLGAFPSVPTGDLIDFGPDTSISSIASSISGTSASRIPRRTHGPSSPDAGRIGLGIGVGLRKSLSGTSLATDYISSVPPTPDLAGDFSDAATQSSGPSTPTSLSPPSRRVQAEKANGPHHSGMGDSPAGKADVTTPTPKSRTLPHDISIPTPLSPDARCARCHLPLFSRRDGGKFVTVPEQPSSTGVPPKTYHASCFRCTVCDQLFQDSEGGRAVFVRSPKGACHVQCAPPEKVITRTYTSTMPKSVPVTQSASRTATATYHPASTSRYQPPPKTAPASQQKFTFPQPRFGSSSSCPGCHKSVSPMERGVVPGPQGSRWHAACLVCGGKEAKVRRKEDGKPGCGKKLDSAAKTDKDGGVWCRECLLLLPSTHRNSPSPTRGTPIAPIYTGSRGPFNGVAPQFTGTTTLARQFTGLGGSDPALMRQLTGGGLSPTRQLTSSPTKMFDGPSRPASRYPRPKSAIGFAARTKSEGGQGRGMFLVRQLTGGRNKEHA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.35
3 0.38
4 0.44
5 0.44
6 0.46
7 0.48
8 0.53
9 0.55
10 0.59
11 0.66
12 0.69
13 0.76
14 0.79
15 0.81
16 0.78
17 0.76
18 0.75
19 0.72
20 0.68
21 0.61
22 0.55
23 0.51
24 0.43
25 0.36
26 0.28
27 0.26
28 0.22
29 0.27
30 0.36
31 0.43
32 0.49
33 0.52
34 0.54
35 0.53
36 0.59
37 0.59
38 0.51
39 0.46
40 0.43
41 0.4
42 0.36
43 0.32
44 0.24
45 0.2
46 0.18
47 0.15
48 0.14
49 0.14
50 0.15
51 0.19
52 0.21
53 0.2
54 0.26
55 0.28
56 0.28
57 0.31
58 0.35
59 0.33
60 0.33
61 0.32
62 0.3
63 0.36
64 0.34
65 0.31
66 0.3
67 0.31
68 0.36
69 0.36
70 0.34
71 0.3
72 0.37
73 0.36
74 0.35
75 0.4
76 0.37
77 0.4
78 0.44
79 0.45
80 0.4
81 0.43
82 0.48
83 0.49
84 0.5
85 0.53
86 0.48
87 0.44
88 0.43
89 0.4
90 0.34
91 0.28
92 0.22
93 0.14
94 0.13
95 0.12
96 0.11
97 0.1
98 0.1
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.1
103 0.17
104 0.21
105 0.24
106 0.28
107 0.31
108 0.33
109 0.36
110 0.35
111 0.31
112 0.28
113 0.25
114 0.24
115 0.21
116 0.19
117 0.16
118 0.16
119 0.18
120 0.17
121 0.18
122 0.18
123 0.23
124 0.28
125 0.3
126 0.3
127 0.28
128 0.29
129 0.33
130 0.39
131 0.36
132 0.35
133 0.34
134 0.35
135 0.36
136 0.39
137 0.4
138 0.42
139 0.5
140 0.55
141 0.62
142 0.66
143 0.66
144 0.69
145 0.74
146 0.7
147 0.7
148 0.69
149 0.66
150 0.7
151 0.69
152 0.71
153 0.63
154 0.6
155 0.51
156 0.43
157 0.38
158 0.3
159 0.28
160 0.18
161 0.16
162 0.13
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.13
167 0.14
168 0.17
169 0.2
170 0.2
171 0.2
172 0.21
173 0.26
174 0.24
175 0.27
176 0.28
177 0.32
178 0.38
179 0.44
180 0.45
181 0.4
182 0.43
183 0.41
184 0.39
185 0.31
186 0.26
187 0.25
188 0.26
189 0.3
190 0.27
191 0.27
192 0.25
193 0.25
194 0.28
195 0.26
196 0.27
197 0.28
198 0.35
199 0.36
200 0.4
201 0.41
202 0.37
203 0.37
204 0.34
205 0.3
206 0.25
207 0.21
208 0.19
209 0.21
210 0.21
211 0.21
212 0.2
213 0.19
214 0.18
215 0.19
216 0.17
217 0.18
218 0.22
219 0.24
220 0.3
221 0.38
222 0.45
223 0.5
224 0.58
225 0.66
226 0.71
227 0.79
228 0.83
229 0.85
230 0.87
231 0.87
232 0.84
233 0.83
234 0.79
235 0.77
236 0.7
237 0.64
238 0.54
239 0.5
240 0.44
241 0.35
242 0.27
243 0.18
244 0.15
245 0.11
246 0.1
247 0.07
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.05
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.06
263 0.09
264 0.12
265 0.14
266 0.17
267 0.23
268 0.26
269 0.27
270 0.28
271 0.26
272 0.23
273 0.23
274 0.22
275 0.16
276 0.15
277 0.14
278 0.12
279 0.11
280 0.1
281 0.09
282 0.08
283 0.08
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.09
289 0.07
290 0.08
291 0.1
292 0.11
293 0.13
294 0.17
295 0.17
296 0.2
297 0.21
298 0.19
299 0.2
300 0.22
301 0.24
302 0.25
303 0.25
304 0.23
305 0.23
306 0.22
307 0.2
308 0.18
309 0.11
310 0.08
311 0.07
312 0.08
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.1
317 0.09
318 0.1
319 0.13
320 0.12
321 0.14
322 0.14
323 0.15
324 0.17
325 0.17
326 0.16
327 0.14
328 0.13
329 0.09
330 0.09
331 0.08
332 0.05
333 0.04
334 0.04
335 0.03
336 0.03
337 0.03
338 0.03
339 0.03
340 0.04
341 0.04
342 0.05
343 0.05
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.04
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.04
361 0.04
362 0.05
363 0.04
364 0.06
365 0.09
366 0.12
367 0.16
368 0.2
369 0.21
370 0.26
371 0.32
372 0.37
373 0.39
374 0.41
375 0.42
376 0.4
377 0.43
378 0.4
379 0.34
380 0.29
381 0.23
382 0.18
383 0.14
384 0.12
385 0.07
386 0.05
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.03
394 0.04
395 0.04
396 0.05
397 0.06
398 0.06
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.07
405 0.07
406 0.07
407 0.07
408 0.07
409 0.07
410 0.07
411 0.08
412 0.07
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.08
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.06
423 0.06
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.07
432 0.08
433 0.11
434 0.14
435 0.18
436 0.21
437 0.25
438 0.26
439 0.31
440 0.31
441 0.32
442 0.35
443 0.39
444 0.42
445 0.43
446 0.46
447 0.43
448 0.43
449 0.42
450 0.35
451 0.27
452 0.21
453 0.16
454 0.11
455 0.1
456 0.1
457 0.08
458 0.08
459 0.08
460 0.08
461 0.07
462 0.07
463 0.07
464 0.1
465 0.12
466 0.15
467 0.17
468 0.2
469 0.22
470 0.23
471 0.23
472 0.26
473 0.3
474 0.35
475 0.36
476 0.33
477 0.37
478 0.37
479 0.36
480 0.33
481 0.27
482 0.19
483 0.17
484 0.16
485 0.13
486 0.12
487 0.16
488 0.2
489 0.21
490 0.22
491 0.26
492 0.29
493 0.33
494 0.35
495 0.33
496 0.34
497 0.4
498 0.45
499 0.43
500 0.45
501 0.4
502 0.39
503 0.38
504 0.33
505 0.29
506 0.24
507 0.23
508 0.23
509 0.24
510 0.24
511 0.23
512 0.22
513 0.18
514 0.19
515 0.19
516 0.16
517 0.2
518 0.18
519 0.21
520 0.2
521 0.24
522 0.29
523 0.27
524 0.29
525 0.33
526 0.37
527 0.35
528 0.4
529 0.36
530 0.33
531 0.33
532 0.36
533 0.28
534 0.3
535 0.29
536 0.29
537 0.29
538 0.27
539 0.28
540 0.22
541 0.2
542 0.14
543 0.13
544 0.08
545 0.08
546 0.09
547 0.1
548 0.11
549 0.13
550 0.14
551 0.15
552 0.15
553 0.2
554 0.24
555 0.22
556 0.27
557 0.29
558 0.33
559 0.38
560 0.43
561 0.39
562 0.36
563 0.38
564 0.33
565 0.33
566 0.3
567 0.28
568 0.26
569 0.26
570 0.26
571 0.3
572 0.33
573 0.3
574 0.31
575 0.28
576 0.27
577 0.29
578 0.31
579 0.28
580 0.27
581 0.29
582 0.3
583 0.32
584 0.32
585 0.31
586 0.26
587 0.25
588 0.22
589 0.19
590 0.18
591 0.19
592 0.17
593 0.16
594 0.16
595 0.17
596 0.2
597 0.22
598 0.27
599 0.31
600 0.38
601 0.43
602 0.47
603 0.53
604 0.55
605 0.58
606 0.56
607 0.51
608 0.52
609 0.56
610 0.58
611 0.54
612 0.52
613 0.49
614 0.47
615 0.51
616 0.51
617 0.41
618 0.45
619 0.46
620 0.47
621 0.47
622 0.46
623 0.45
624 0.38
625 0.46
626 0.38
627 0.37
628 0.35
629 0.34
630 0.35
631 0.32
632 0.31
633 0.29
634 0.36
635 0.37
636 0.39
637 0.37
638 0.36
639 0.35
640 0.35
641 0.29
642 0.21
643 0.19
644 0.18
645 0.17
646 0.18
647 0.19
648 0.21
649 0.26
650 0.24
651 0.26
652 0.27
653 0.26
654 0.24
655 0.26
656 0.24
657 0.18
658 0.2
659 0.19
660 0.18
661 0.24
662 0.31
663 0.36
664 0.43
665 0.47
666 0.52
667 0.59
668 0.63
669 0.68
670 0.71
671 0.69
672 0.71
673 0.73
674 0.72
675 0.67
676 0.61
677 0.54
678 0.54
679 0.54
680 0.46
681 0.48
682 0.48
683 0.48
684 0.49
685 0.48
686 0.38
687 0.32
688 0.34
689 0.31
690 0.33
691 0.31
692 0.29
693 0.27
694 0.27
695 0.25
696 0.23
697 0.22
698 0.16
699 0.16
700 0.22
701 0.27
702 0.31
703 0.34
704 0.35
705 0.34
706 0.37
707 0.45
708 0.48
709 0.48
710 0.46
711 0.48
712 0.48
713 0.48
714 0.46
715 0.42
716 0.35
717 0.29
718 0.29
719 0.27
720 0.27
721 0.28
722 0.24
723 0.22
724 0.2
725 0.23
726 0.24
727 0.22
728 0.27
729 0.25
730 0.26
731 0.24
732 0.25
733 0.22
734 0.2
735 0.22
736 0.15
737 0.17
738 0.17
739 0.21
740 0.21
741 0.2
742 0.2
743 0.18
744 0.18
745 0.17
746 0.16
747 0.11
748 0.12
749 0.12
750 0.14
751 0.14
752 0.14
753 0.14
754 0.13
755 0.12
756 0.11
757 0.11
758 0.09
759 0.1
760 0.1
761 0.1
762 0.12
763 0.12
764 0.15
765 0.16
766 0.17
767 0.17
768 0.16
769 0.22
770 0.31
771 0.38
772 0.38
773 0.39
774 0.41
775 0.43
776 0.46
777 0.45
778 0.42
779 0.4
780 0.46
781 0.48
782 0.48
783 0.54
784 0.58
785 0.62
786 0.66
787 0.68
788 0.69
789 0.7
790 0.73
791 0.7
792 0.68
793 0.66
794 0.6
795 0.57
796 0.51
797 0.53
798 0.48
799 0.44
800 0.39
801 0.32
802 0.35
803 0.37
804 0.37
805 0.38
806 0.38
807 0.38
808 0.37
809 0.37
810 0.29
811 0.24
812 0.25
813 0.17
814 0.19
815 0.19
816 0.24
817 0.33
818 0.38