FuNGI

A0A060SHJ3

Protein Details

Accession

A0A060SHJ3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
108-128	DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
407-408	RR
416-422	HAAKRRK
961-973	RRGGPGRGRGGHH

Subcellular Location(s)

mito 11, cyto 8, nucl 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSKKYPKIILPVVEAEEVKIPDADGNEVSVPVNIADPNPNGVEFDNLYLDMNAIVHPCTHPDGKPAPETEEEMMIEIFNYTERVVSMVRPRKLLFMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAKEKEEARKESIVLWESMGKTLSEEEKSKKPWDSNAITPGTPFMELLAASLRYWVVMKMNTDPGWRDLQVIISDASVPGEGEHKIMDWIRRQRSNSGHDPNTRHVIYGLDADLIMLSLATHEPHFRVLREDVFHQEGSRTACRICGQEGHYAAQCTGTKAEIIKPPPEKKPFIWLDVAILREYLEAELNVPNVPFPFNIEQAIDDWVFLIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDTLLKIWRAELPRMGGYITNHGQLELSRAQIILEGLARREDEIFRRRREAEERQDHAAKRRKLEKDIRDGNAAPSSALNLTAAPAAPASLPSRPDFAAKADSIGLGGPQNAESASHAPTAARALAGSNRDIVANRHAIRLANMSAAEVLKAEMGVPLIPLKPSKSSLTSTPAVPPAAPTTETTDIEPSVSNGTVADGDDEPEIPGLGGASAAPAASSVETSASVEPVLLVENDVNPSATGEVEPPTVEPEDLLMGDDTTPRGVKRTIDEVEAEDAELDAEADEDVIVEDLGSDDDEDSAPTNTSLKLKVNPDGTVEQEDVVKLWEPGYKERYYRQKFGVDYHNKEFRKEITKHYIEGMAWVLQYYYQGTPSWQWYYPHHFAPFAADFEDLDKMELKFTLGQPFKPFEQLMGVFPAASRQHIPATFHDLMTDESSPIKDFYPSTFEIDMNGKRMAWQGVALLPFIDEKRLLDAMNPRYSNLSEEEKRRNTWGNNVLFVFEANKLYPSLEALYGKRKKDEPMPIDVKLSKGISGSLLPNPDCIPDSTYYNPLPTQDLPDIKNDRSLSAFYFFPKQLSPHRSVLLPGVRRPKPILNSSDIEIARRGGPGRGRGGHHDRGGRGGYGGSQYNSSGRDYSGRSNGNWQNDSQYGQQSYGGNQQSYSSYQSYQRGRGGFFQPNSGARGQYNDLTAPTRGRGGPSPSRGGGYSGGQNSHGGYGNQGGYGGGGRGGYGGQSQGGYVPGGYGQGAYNQRGGYNQGGGQRQGGYNQSGGYNQGGYQGSGGAPQNGYAQSSYGGYGGNSYGNSRGGYNNGGRGRGRGGHY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.61
3	0.65
4	0.67
5	0.62
6	0.58
7	0.54
8	0.5
9	0.44
10	0.39
11	0.32
12	0.3
13	0.26
14	0.22
15	0.18
16	0.15
17	0.15
18	0.16
19	0.17
20	0.13
21	0.15
22	0.14
23	0.15
24	0.15
25	0.13
26	0.12
27	0.1
28	0.11
29	0.1
30	0.11
31	0.15
32	0.16
33	0.19
34	0.19
35	0.19
36	0.19
37	0.18
38	0.21
39	0.17
40	0.18
41	0.16
42	0.15
43	0.16
44	0.15
45	0.14
46	0.11
47	0.1
48	0.09
49	0.09
50	0.09
51	0.09
52	0.1
53	0.13
54	0.17
55	0.2
56	0.2
57	0.27
58	0.33
59	0.36
60	0.41
61	0.4
62	0.4
63	0.39
64	0.42
65	0.36
66	0.33
67	0.28
68	0.24
69	0.22
70	0.17
71	0.15
72	0.11
73	0.09
74	0.07
75	0.08
76	0.06
77	0.07
78	0.07
79	0.09
80	0.1
81	0.15
82	0.25
83	0.33
84	0.36
85	0.4
86	0.41
87	0.43
88	0.44
89	0.43
90	0.34
91	0.29
92	0.29
93	0.25
94	0.26
95	0.21
96	0.21
97	0.18
98	0.16
99	0.12
100	0.14
101	0.2
102	0.27
103	0.37
104	0.45
105	0.55
106	0.66
107	0.75
108	0.8
109	0.82
110	0.79
111	0.76
112	0.77
113	0.77
114	0.75
115	0.78
116	0.72
117	0.69
118	0.72
119	0.68
120	0.62
121	0.61
122	0.56
123	0.5
124	0.48
125	0.44
126	0.39
127	0.43
128	0.39
129	0.3
130	0.28
131	0.27
132	0.25
133	0.26
134	0.23
135	0.17
136	0.15
137	0.18
138	0.2
139	0.2
140	0.24
141	0.28
142	0.35
143	0.4
144	0.44
145	0.47
146	0.46
147	0.5
148	0.54
149	0.55
150	0.54
151	0.57
152	0.54
153	0.48
154	0.45
155	0.39
156	0.31
157	0.25
158	0.19
159	0.11
160	0.1
161	0.09
162	0.1
163	0.11
164	0.1
165	0.1
166	0.11
167	0.1
168	0.1
169	0.1
170	0.11
171	0.12
172	0.14
173	0.16
174	0.19
175	0.26
176	0.27
177	0.28
178	0.29
179	0.29
180	0.31
181	0.29
182	0.27
183	0.21
184	0.23
185	0.21
186	0.21
187	0.18
188	0.13
189	0.13
190	0.11
191	0.11
192	0.08
193	0.07
194	0.06
195	0.08
196	0.08
197	0.08
198	0.08
199	0.08
200	0.11
201	0.14
202	0.18
203	0.25
204	0.34
205	0.42
206	0.48
207	0.5
208	0.55
209	0.61
210	0.64
211	0.65
212	0.65
213	0.64
214	0.65
215	0.67
216	0.64
217	0.63
218	0.56
219	0.46
220	0.38
221	0.31
222	0.25
223	0.23
224	0.19
225	0.12
226	0.11
227	0.1
228	0.1
229	0.08
230	0.07
231	0.04
232	0.03
233	0.04
234	0.04
235	0.05
236	0.06
237	0.08
238	0.09
239	0.14
240	0.16
241	0.16
242	0.2
243	0.23
244	0.26
245	0.28
246	0.3
247	0.29
248	0.31
249	0.3
250	0.26
251	0.24
252	0.23
253	0.25
254	0.25
255	0.22
256	0.18
257	0.21
258	0.23
259	0.24
260	0.23
261	0.24
262	0.24
263	0.29
264	0.31
265	0.3
266	0.3
267	0.29
268	0.26
269	0.25
270	0.23
271	0.19
272	0.18
273	0.15
274	0.15
275	0.15
276	0.21
277	0.22
278	0.25
279	0.3
280	0.37
281	0.43
282	0.5
283	0.55
284	0.54
285	0.5
286	0.56
287	0.53
288	0.48
289	0.46
290	0.37
291	0.35
292	0.33
293	0.33
294	0.23
295	0.19
296	0.16
297	0.13
298	0.13
299	0.09
300	0.07
301	0.06
302	0.08
303	0.09
304	0.09
305	0.1
306	0.09
307	0.09
308	0.08
309	0.1
310	0.08
311	0.12
312	0.14
313	0.15
314	0.16
315	0.16
316	0.16
317	0.16
318	0.19
319	0.14
320	0.11
321	0.1
322	0.09
323	0.08
324	0.07
325	0.07
326	0.04
327	0.04
328	0.05
329	0.05
330	0.05
331	0.06
332	0.07
333	0.07
334	0.08
335	0.08
336	0.08
337	0.08
338	0.09
339	0.12
340	0.13
341	0.13
342	0.12
343	0.13
344	0.12
345	0.12
346	0.11
347	0.08
348	0.06
349	0.09
350	0.09
351	0.09
352	0.09
353	0.1
354	0.14
355	0.17
356	0.19
357	0.18
358	0.21
359	0.21
360	0.22
361	0.22
362	0.19
363	0.17
364	0.21
365	0.2
366	0.19
367	0.18
368	0.17
369	0.17
370	0.15
371	0.19
372	0.14
373	0.14
374	0.11
375	0.12
376	0.11
377	0.12
378	0.12
379	0.08
380	0.09
381	0.09
382	0.09
383	0.1
384	0.1
385	0.1
386	0.11
387	0.12
388	0.17
389	0.25
390	0.32
391	0.35
392	0.4
393	0.41
394	0.44
395	0.5
396	0.53
397	0.55
398	0.57
399	0.57
400	0.57
401	0.61
402	0.58
403	0.59
404	0.59
405	0.52
406	0.49
407	0.55
408	0.54
409	0.58
410	0.66
411	0.64
412	0.66
413	0.7
414	0.65
415	0.6
416	0.56
417	0.49
418	0.42
419	0.34
420	0.24
421	0.16
422	0.15
423	0.11
424	0.1
425	0.08
426	0.06
427	0.06
428	0.06
429	0.06
430	0.05
431	0.05
432	0.05
433	0.05
434	0.06
435	0.07
436	0.09
437	0.11
438	0.11
439	0.14
440	0.14
441	0.15
442	0.15
443	0.15
444	0.17
445	0.15
446	0.16
447	0.14
448	0.13
449	0.12
450	0.11
451	0.09
452	0.06
453	0.06
454	0.05
455	0.05
456	0.05
457	0.05
458	0.06
459	0.06
460	0.08
461	0.09
462	0.09
463	0.09
464	0.08
465	0.09
466	0.1
467	0.09
468	0.07
469	0.05
470	0.06
471	0.09
472	0.1
473	0.1
474	0.1
475	0.1
476	0.11
477	0.11
478	0.12
479	0.13
480	0.18
481	0.18
482	0.18
483	0.19
484	0.19
485	0.19
486	0.21
487	0.17
488	0.12
489	0.11
490	0.1
491	0.1
492	0.1
493	0.09
494	0.06
495	0.06
496	0.04
497	0.04
498	0.04
499	0.04
500	0.04
501	0.04
502	0.04
503	0.05
504	0.06
505	0.06
506	0.07
507	0.08
508	0.1
509	0.12
510	0.14
511	0.16
512	0.18
513	0.2
514	0.25
515	0.25
516	0.24
517	0.24
518	0.23
519	0.21
520	0.18
521	0.16
522	0.13
523	0.12
524	0.12
525	0.11
526	0.14
527	0.17
528	0.17
529	0.17
530	0.16
531	0.15
532	0.15
533	0.14
534	0.1
535	0.08
536	0.08
537	0.07
538	0.06
539	0.06
540	0.06
541	0.06
542	0.07
543	0.05
544	0.06
545	0.06
546	0.07
547	0.06
548	0.06
549	0.06
550	0.04
551	0.04
552	0.03
553	0.03
554	0.02
555	0.02
556	0.02
557	0.02
558	0.02
559	0.02
560	0.02
561	0.03
562	0.03
563	0.03
564	0.03
565	0.03
566	0.04
567	0.05
568	0.05
569	0.05
570	0.05
571	0.05
572	0.04
573	0.04
574	0.05
575	0.03
576	0.04
577	0.04
578	0.04
579	0.05
580	0.05
581	0.05
582	0.05
583	0.05
584	0.05
585	0.05
586	0.05
587	0.05
588	0.06
589	0.06
590	0.06
591	0.06
592	0.07
593	0.07
594	0.07
595	0.06
596	0.06
597	0.06
598	0.06
599	0.06
600	0.04
601	0.04
602	0.05
603	0.05
604	0.05
605	0.05
606	0.06
607	0.05
608	0.07
609	0.08
610	0.1
611	0.12
612	0.18
613	0.18
614	0.19
615	0.2
616	0.19
617	0.19
618	0.18
619	0.15
620	0.09
621	0.08
622	0.06
623	0.05
624	0.04
625	0.02
626	0.03
627	0.02
628	0.02
629	0.02
630	0.02
631	0.03
632	0.03
633	0.02
634	0.02
635	0.02
636	0.03
637	0.03
638	0.03
639	0.03
640	0.03
641	0.04
642	0.04
643	0.04
644	0.05
645	0.05
646	0.06
647	0.06
648	0.07
649	0.07
650	0.09
651	0.11
652	0.12
653	0.16
654	0.18
655	0.23
656	0.24
657	0.24
658	0.25
659	0.24
660	0.24
661	0.21
662	0.19
663	0.15
664	0.13
665	0.13
666	0.1
667	0.09
668	0.08
669	0.06
670	0.06
671	0.08
672	0.1
673	0.14
674	0.19
675	0.2
676	0.22
677	0.28
678	0.38
679	0.42
680	0.45
681	0.44
682	0.45
683	0.44
684	0.46
685	0.51
686	0.48
687	0.48
688	0.49
689	0.54
690	0.49
691	0.49
692	0.46
693	0.4
694	0.41
695	0.38
696	0.39
697	0.41
698	0.42
699	0.42
700	0.42
701	0.39
702	0.3
703	0.29
704	0.23
705	0.14
706	0.12
707	0.11
708	0.09
709	0.07
710	0.07
711	0.08
712	0.07
713	0.07
714	0.08
715	0.09
716	0.11
717	0.14
718	0.17
719	0.18
720	0.19
721	0.22
722	0.31
723	0.33
724	0.35
725	0.32
726	0.29
727	0.27
728	0.3
729	0.28
730	0.2
731	0.18
732	0.14
733	0.13
734	0.14
735	0.15
736	0.1
737	0.09
738	0.1
739	0.09
740	0.1
741	0.1
742	0.09
743	0.11
744	0.12
745	0.21
746	0.2
747	0.22
748	0.25
749	0.27
750	0.27
751	0.28
752	0.26
753	0.18
754	0.2
755	0.2
756	0.18
757	0.18
758	0.17
759	0.13
760	0.13
761	0.17
762	0.13
763	0.13
764	0.13
765	0.12
766	0.16
767	0.18
768	0.21
769	0.19
770	0.27
771	0.27
772	0.25
773	0.24
774	0.22
775	0.21
776	0.21
777	0.19
778	0.11
779	0.1
780	0.11
781	0.12
782	0.12
783	0.11
784	0.1
785	0.1
786	0.12
787	0.16
788	0.17
789	0.21
790	0.21
791	0.2
792	0.21
793	0.25
794	0.25
795	0.22
796	0.21
797	0.17
798	0.17
799	0.19
800	0.18
801	0.13
802	0.12
803	0.11
804	0.13
805	0.13
806	0.12
807	0.1
808	0.09
809	0.1
810	0.1
811	0.1
812	0.08
813	0.08
814	0.11
815	0.12
816	0.12
817	0.14
818	0.22
819	0.27
820	0.33
821	0.33
822	0.31
823	0.32
824	0.32
825	0.31
826	0.27
827	0.29
828	0.26
829	0.33
830	0.42
831	0.43
832	0.44
833	0.46
834	0.49
835	0.43
836	0.47
837	0.49
838	0.43
839	0.43
840	0.41
841	0.38
842	0.31
843	0.29
844	0.22
845	0.15
846	0.13
847	0.1
848	0.11
849	0.11
850	0.11
851	0.11
852	0.1
853	0.11
854	0.12
855	0.14
856	0.15
857	0.25
858	0.31
859	0.32
860	0.35
861	0.36
862	0.37
863	0.43
864	0.51
865	0.45
866	0.49
867	0.52
868	0.49
869	0.52
870	0.48
871	0.41
872	0.34
873	0.31
874	0.22
875	0.17
876	0.16
877	0.13
878	0.15
879	0.16
880	0.15
881	0.19
882	0.18
883	0.19
884	0.19
885	0.19
886	0.18
887	0.17
888	0.17
889	0.15
890	0.19
891	0.2
892	0.25
893	0.24
894	0.25
895	0.25
896	0.23
897	0.25
898	0.21
899	0.24
900	0.24
901	0.28
902	0.27
903	0.34
904	0.38
905	0.34
906	0.4
907	0.35
908	0.31
909	0.29
910	0.29
911	0.24
912	0.22
913	0.22
914	0.18
915	0.23
916	0.22
917	0.21
918	0.22
919	0.23
920	0.3
921	0.35
922	0.39
923	0.38
924	0.39
925	0.38
926	0.37
927	0.41
928	0.4
929	0.37
930	0.38
931	0.43
932	0.44
933	0.46
934	0.49
935	0.49
936	0.48
937	0.51
938	0.5
939	0.46
940	0.46
941	0.45
942	0.49
943	0.42
944	0.36
945	0.3
946	0.26
947	0.22
948	0.21
949	0.2
950	0.17
951	0.21
952	0.25
953	0.31
954	0.34
955	0.36
956	0.42
957	0.49
958	0.52
959	0.52
960	0.52
961	0.46
962	0.46
963	0.45
964	0.37
965	0.29
966	0.23
967	0.2
968	0.18
969	0.19
970	0.16
971	0.15
972	0.15
973	0.17
974	0.18
975	0.18
976	0.16
977	0.15
978	0.19
979	0.21
980	0.26
981	0.32
982	0.33
983	0.32
984	0.41
985	0.45
986	0.48
987	0.47
988	0.42
989	0.39
990	0.38
991	0.4
992	0.34
993	0.34
994	0.28
995	0.27
996	0.3
997	0.26
998	0.27
999	0.32
1000	0.32
1001	0.26
1002	0.25
1003	0.26
1004	0.25
1005	0.26
1006	0.28
1007	0.22
1008	0.21
1009	0.26
1010	0.34
1011	0.38
1012	0.41
1013	0.44
1014	0.42
1015	0.42
1016	0.46
1017	0.47
1018	0.47
1019	0.43
1020	0.43
1021	0.41
1022	0.4
1023	0.41
1024	0.36
1025	0.32
1026	0.24
1027	0.27
1028	0.25
1029	0.24
1030	0.24
1031	0.22
1032	0.22
1033	0.23
1034	0.24
1035	0.22
1036	0.2
1037	0.22
1038	0.21
1039	0.23
1040	0.27
1041	0.32
1042	0.39
1043	0.43
1044	0.47
1045	0.44
1046	0.45
1047	0.42
1048	0.39
1049	0.34
1050	0.28
1051	0.29
1052	0.26
1053	0.26
1054	0.25
1055	0.25
1056	0.24
1057	0.24
1058	0.23
1059	0.17
1060	0.15
1061	0.18
1062	0.18
1063	0.17
1064	0.16
1065	0.13
1066	0.11
1067	0.12
1068	0.11
1069	0.07
1070	0.06
1071	0.06
1072	0.07
1073	0.07
1074	0.07
1075	0.07
1076	0.07
1077	0.08
1078	0.08
1079	0.08
1080	0.09
1081	0.1
1082	0.09
1083	0.08
1084	0.08
1085	0.07
1086	0.08
1087	0.08
1088	0.08
1089	0.07
1090	0.14
1091	0.18
1092	0.19
1093	0.22
1094	0.22
1095	0.23
1096	0.23
1097	0.27
1098	0.23
1099	0.22
1100	0.24
1101	0.27
1102	0.3
1103	0.31
1104	0.32
1105	0.31
1106	0.29
1107	0.28
1108	0.29
1109	0.25
1110	0.23
1111	0.23
1112	0.22
1113	0.2
1114	0.21
1115	0.2
1116	0.17
1117	0.14
1118	0.2
1119	0.19
1120	0.18
1121	0.17
1122	0.17
1123	0.15
1124	0.18
1125	0.19
1126	0.16
1127	0.15
1128	0.16
1129	0.19
1130	0.19
1131	0.2
1132	0.17
1133	0.16
1134	0.15
1135	0.15
1136	0.15
1137	0.12
1138	0.12
1139	0.1
1140	0.11
1141	0.11
1142	0.12
1143	0.12
1144	0.13
1145	0.15
1146	0.17
1147	0.18
1148	0.18
1149	0.19
1150	0.2
1151	0.26
1152	0.28
1153	0.34
1154	0.35
1155	0.38
1156	0.38
1157	0.38
1158	0.4

A0A060SHJ3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer