FuNGI

A0A060S617

Protein Details

Accession

A0A060S617

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
91-115	SRHGSVSPVKPKKQVKKAETPSATR	Hydrophilic
326-345	GDAKTKRKVKTSGKGKQRAE	Basic
447-468	PGGACWKRPRRVSREKKPDSFG	Basic
793-817	APPPSSESRKPRPRPVAKAKPYSSQ	Hydrophilic
885-905	GIASHAKPKPRPRPIGRSGMA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
321-343	RPRANGDAKTKRKVKTSGKGKQR
800-831	SRKPRPRPVAKAKPYSSQKPKAPVGSRARFRS
891-898	KPKPRPRP
967-987	RPKPRAVSKASHHRSPKQSVP

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

METYTRDLKTKGVTLDTDSSAATRLSERPAQRRGAAFEDFGSDFSKRSSSRASQSRWNERTNSQASSSKRTVIEISDDLSDDELDFLSSSSRHGSVSPVKPKKQVKKAETPSATRPPLSIVIDHHQSSSNYKPLDLKSMKIPKKSSSISSIAGPSRRSRNSQLSSAAAPRTSDSSGSGRNVDAASVRDSKLETHRAMRDEKTERSLRERSPKQVSTRPSESHFQSSNDRDEEQGETDKTPRASTYRGTTGRISKWQTDSDLRTRSSQTNAKNKEKNRAVDRSQSLVDVLDSLRDREHDQVSDDVDPPGPFKGKTRETVATRPRANGDAKTKRKVKTSGKGKQRAENPIDALFGEQSPPKRSARPVKRTLSEFPMPSLRSSPTTSRATSPQQQNQPKRQYIVLSSDEEGSDLGGRSVKPFPMETQLLETLNRVSPAKRTAATSDLEDPGGACWKRPRRVSREKKPDSFGLEDAESDSDPDDIFLDPSVDPSTLCPWCDERLPSNPTPYLTSLIEGARRRSYPDDRPTNPLGLRAPPMVFVTVCQRHRFERVWIPRARRRGWPTRIDWGSFRGRIEKLEDKLRAIVDDVDEDFVPGAQVRPSTSGKERARSMPRKENEFWQEVVQNVRQQGSRQTAGVRGQFLHFNKTQPGYYGELGYMIIHQTLCDLFPPASFDPAAALPLTPADFIAHVLVPEAALNLIMEDLNLSREDALKTLRDSVEYGVAMFPVDEGENGKGDEDSMIMGAGEQMIMERARVRRKELEEEERKEEEERSAHDRARQTDTEPEMDIDVDDAPPPSSESRKPRPRPVAKAKPYSSQKPKAPVGSRARFRSRAPESDCEIVPSSSDAGYRSDVSRSAPSMKRRAVRVSPLSARSDTPSENAGVHGIASHAKPKPRPRPIGRSGMASSSQSDIAGRKASKDIRHLPETSDDDGPLPLTQPRASASSRRKEVRHTNHAETEASLDATPRPKPRAVSKASHHRSPKQSVPEKAPLHMARERRHERTASSKTTHTDGWLPNLRAASVMELDSTDDDAKSGRPGPSSKLTEPRRTFSRSSKNGSERWDWLLSDDSSSSSRTPSFTHAD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.37
2	0.41
3	0.38
4	0.34
5	0.28
6	0.25
7	0.22
8	0.2
9	0.16
10	0.14
11	0.15
12	0.2
13	0.28
14	0.35
15	0.42
16	0.48
17	0.52
18	0.55
19	0.57
20	0.56
21	0.54
22	0.49
23	0.42
24	0.36
25	0.35
26	0.3
27	0.26
28	0.24
29	0.19
30	0.17
31	0.17
32	0.23
33	0.19
34	0.23
35	0.3
36	0.34
37	0.44
38	0.52
39	0.56
40	0.59
41	0.69
42	0.76
43	0.73
44	0.72
45	0.68
46	0.62
47	0.66
48	0.61
49	0.55
50	0.48
51	0.49
52	0.48
53	0.52
54	0.51
55	0.47
56	0.43
57	0.42
58	0.39
59	0.35
60	0.36
61	0.29
62	0.29
63	0.24
64	0.24
65	0.21
66	0.2
67	0.18
68	0.12
69	0.11
70	0.09
71	0.08
72	0.07
73	0.07
74	0.08
75	0.08
76	0.09
77	0.12
78	0.12
79	0.13
80	0.13
81	0.2
82	0.28
83	0.37
84	0.47
85	0.53
86	0.57
87	0.66
88	0.75
89	0.79
90	0.8
91	0.81
92	0.78
93	0.8
94	0.85
95	0.86
96	0.83
97	0.78
98	0.76
99	0.75
100	0.7
101	0.59
102	0.5
103	0.44
104	0.43
105	0.39
106	0.33
107	0.28
108	0.31
109	0.35
110	0.35
111	0.32
112	0.3
113	0.3
114	0.33
115	0.34
116	0.34
117	0.3
118	0.31
119	0.35
120	0.33
121	0.43
122	0.39
123	0.36
124	0.4
125	0.5
126	0.54
127	0.56
128	0.58
129	0.52
130	0.59
131	0.6
132	0.55
133	0.51
134	0.49
135	0.43
136	0.43
137	0.43
138	0.39
139	0.39
140	0.37
141	0.37
142	0.42
143	0.44
144	0.47
145	0.49
146	0.55
147	0.56
148	0.59
149	0.57
150	0.51
151	0.5
152	0.49
153	0.43
154	0.34
155	0.29
156	0.25
157	0.24
158	0.22
159	0.19
160	0.18
161	0.2
162	0.24
163	0.25
164	0.26
165	0.22
166	0.23
167	0.23
168	0.2
169	0.17
170	0.15
171	0.17
172	0.19
173	0.19
174	0.19
175	0.19
176	0.22
177	0.27
178	0.33
179	0.31
180	0.34
181	0.39
182	0.42
183	0.46
184	0.45
185	0.47
186	0.46
187	0.47
188	0.48
189	0.48
190	0.47
191	0.5
192	0.54
193	0.53
194	0.57
195	0.6
196	0.6
197	0.64
198	0.67
199	0.67
200	0.68
201	0.66
202	0.64
203	0.65
204	0.6
205	0.54
206	0.54
207	0.51
208	0.51
209	0.47
210	0.42
211	0.43
212	0.44
213	0.46
214	0.42
215	0.39
216	0.32
217	0.31
218	0.31
219	0.26
220	0.26
221	0.21
222	0.2
223	0.22
224	0.25
225	0.24
226	0.22
227	0.22
228	0.21
229	0.22
230	0.25
231	0.29
232	0.34
233	0.36
234	0.38
235	0.41
236	0.44
237	0.46
238	0.49
239	0.47
240	0.43
241	0.45
242	0.44
243	0.44
244	0.44
245	0.45
246	0.45
247	0.47
248	0.43
249	0.43
250	0.44
251	0.42
252	0.43
253	0.43
254	0.44
255	0.49
256	0.56
257	0.62
258	0.66
259	0.67
260	0.71
261	0.72
262	0.71
263	0.69
264	0.69
265	0.64
266	0.65
267	0.65
268	0.58
269	0.51
270	0.43
271	0.36
272	0.28
273	0.23
274	0.15
275	0.11
276	0.11
277	0.11
278	0.12
279	0.12
280	0.13
281	0.15
282	0.18
283	0.21
284	0.18
285	0.19
286	0.21
287	0.22
288	0.23
289	0.22
290	0.18
291	0.18
292	0.16
293	0.15
294	0.15
295	0.15
296	0.13
297	0.17
298	0.25
299	0.27
300	0.31
301	0.36
302	0.41
303	0.45
304	0.54
305	0.57
306	0.57
307	0.55
308	0.53
309	0.49
310	0.46
311	0.44
312	0.41
313	0.43
314	0.45
315	0.49
316	0.56
317	0.61
318	0.6
319	0.64
320	0.67
321	0.66
322	0.66
323	0.71
324	0.71
325	0.75
326	0.81
327	0.78
328	0.76
329	0.73
330	0.71
331	0.64
332	0.59
333	0.51
334	0.42
335	0.39
336	0.32
337	0.26
338	0.17
339	0.13
340	0.11
341	0.11
342	0.13
343	0.16
344	0.19
345	0.2
346	0.23
347	0.31
348	0.4
349	0.49
350	0.56
351	0.62
352	0.66
353	0.69
354	0.7
355	0.66
356	0.62
357	0.56
358	0.47
359	0.4
360	0.38
361	0.34
362	0.31
363	0.29
364	0.23
365	0.22
366	0.24
367	0.25
368	0.26
369	0.29
370	0.29
371	0.29
372	0.33
373	0.35
374	0.4
375	0.46
376	0.47
377	0.52
378	0.61
379	0.66
380	0.71
381	0.74
382	0.68
383	0.62
384	0.57
385	0.49
386	0.43
387	0.41
388	0.34
389	0.28
390	0.26
391	0.25
392	0.23
393	0.2
394	0.17
395	0.11
396	0.09
397	0.06
398	0.06
399	0.07
400	0.07
401	0.09
402	0.11
403	0.12
404	0.12
405	0.13
406	0.14
407	0.19
408	0.2
409	0.18
410	0.2
411	0.21
412	0.2
413	0.19
414	0.18
415	0.14
416	0.14
417	0.15
418	0.12
419	0.1
420	0.13
421	0.16
422	0.18
423	0.17
424	0.18
425	0.19
426	0.21
427	0.22
428	0.21
429	0.21
430	0.19
431	0.17
432	0.15
433	0.13
434	0.11
435	0.16
436	0.14
437	0.12
438	0.19
439	0.26
440	0.33
441	0.4
442	0.48
443	0.52
444	0.64
445	0.74
446	0.77
447	0.81
448	0.83
449	0.81
450	0.76
451	0.7
452	0.63
453	0.55
454	0.44
455	0.35
456	0.27
457	0.22
458	0.19
459	0.16
460	0.11
461	0.09
462	0.08
463	0.06
464	0.05
465	0.05
466	0.05
467	0.05
468	0.05
469	0.05
470	0.06
471	0.06
472	0.07
473	0.08
474	0.07
475	0.07
476	0.08
477	0.12
478	0.11
479	0.12
480	0.12
481	0.13
482	0.14
483	0.17
484	0.18
485	0.17
486	0.23
487	0.28
488	0.28
489	0.3
490	0.29
491	0.28
492	0.28
493	0.26
494	0.23
495	0.17
496	0.16
497	0.14
498	0.14
499	0.18
500	0.17
501	0.19
502	0.18
503	0.18
504	0.2
505	0.24
506	0.29
507	0.33
508	0.41
509	0.47
510	0.46
511	0.51
512	0.51
513	0.49
514	0.44
515	0.38
516	0.3
517	0.23
518	0.22
519	0.18
520	0.16
521	0.13
522	0.14
523	0.12
524	0.1
525	0.09
526	0.14
527	0.19
528	0.21
529	0.23
530	0.24
531	0.25
532	0.3
533	0.31
534	0.29
535	0.32
536	0.38
537	0.44
538	0.47
539	0.53
540	0.53
541	0.59
542	0.57
543	0.55
544	0.54
545	0.56
546	0.59
547	0.59
548	0.57
549	0.59
550	0.58
551	0.51
552	0.45
553	0.4
554	0.37
555	0.31
556	0.29
557	0.24
558	0.22
559	0.22
560	0.26
561	0.27
562	0.25
563	0.31
564	0.31
565	0.28
566	0.29
567	0.28
568	0.23
569	0.18
570	0.16
571	0.1
572	0.1
573	0.09
574	0.08
575	0.08
576	0.08
577	0.07
578	0.06
579	0.05
580	0.04
581	0.05
582	0.04
583	0.05
584	0.06
585	0.1
586	0.11
587	0.15
588	0.17
589	0.27
590	0.29
591	0.33
592	0.35
593	0.38
594	0.47
595	0.52
596	0.57
597	0.56
598	0.58
599	0.6
600	0.59
601	0.59
602	0.54
603	0.49
604	0.42
605	0.35
606	0.32
607	0.26
608	0.28
609	0.22
610	0.19
611	0.18
612	0.18
613	0.17
614	0.17
615	0.21
616	0.23
617	0.22
618	0.21
619	0.21
620	0.23
621	0.26
622	0.27
623	0.22
624	0.18
625	0.18
626	0.23
627	0.23
628	0.24
629	0.22
630	0.21
631	0.23
632	0.24
633	0.23
634	0.2
635	0.22
636	0.2
637	0.19
638	0.18
639	0.15
640	0.14
641	0.14
642	0.12
643	0.09
644	0.06
645	0.06
646	0.05
647	0.05
648	0.05
649	0.05
650	0.05
651	0.05
652	0.07
653	0.06
654	0.07
655	0.12
656	0.11
657	0.12
658	0.12
659	0.12
660	0.12
661	0.12
662	0.12
663	0.07
664	0.07
665	0.05
666	0.06
667	0.07
668	0.05
669	0.05
670	0.05
671	0.05
672	0.06
673	0.07
674	0.06
675	0.06
676	0.06
677	0.06
678	0.06
679	0.05
680	0.05
681	0.04
682	0.04
683	0.03
684	0.03
685	0.03
686	0.03
687	0.03
688	0.03
689	0.04
690	0.05
691	0.05
692	0.05
693	0.05
694	0.07
695	0.08
696	0.09
697	0.11
698	0.12
699	0.12
700	0.17
701	0.16
702	0.16
703	0.16
704	0.16
705	0.18
706	0.16
707	0.15
708	0.11
709	0.11
710	0.1
711	0.08
712	0.07
713	0.05
714	0.05
715	0.04
716	0.06
717	0.07
718	0.08
719	0.08
720	0.08
721	0.07
722	0.07
723	0.07
724	0.06
725	0.05
726	0.04
727	0.04
728	0.04
729	0.04
730	0.04
731	0.03
732	0.03
733	0.03
734	0.03
735	0.04
736	0.04
737	0.05
738	0.09
739	0.14
740	0.22
741	0.25
742	0.3
743	0.36
744	0.41
745	0.5
746	0.53
747	0.59
748	0.61
749	0.64
750	0.64
751	0.58
752	0.54
753	0.46
754	0.4
755	0.33
756	0.26
757	0.25
758	0.25
759	0.28
760	0.28
761	0.32
762	0.36
763	0.37
764	0.41
765	0.38
766	0.35
767	0.38
768	0.39
769	0.36
770	0.32
771	0.28
772	0.22
773	0.21
774	0.18
775	0.12
776	0.09
777	0.07
778	0.07
779	0.07
780	0.07
781	0.07
782	0.09
783	0.11
784	0.14
785	0.21
786	0.3
787	0.4
788	0.5
789	0.57
790	0.65
791	0.74
792	0.79
793	0.83
794	0.85
795	0.86
796	0.84
797	0.87
798	0.8
799	0.79
800	0.77
801	0.76
802	0.75
803	0.73
804	0.69
805	0.67
806	0.69
807	0.68
808	0.65
809	0.65
810	0.65
811	0.66
812	0.68
813	0.67
814	0.69
815	0.65
816	0.62
817	0.62
818	0.58
819	0.58
820	0.57
821	0.55
822	0.52
823	0.52
824	0.51
825	0.43
826	0.39
827	0.3
828	0.24
829	0.19
830	0.16
831	0.13
832	0.14
833	0.11
834	0.11
835	0.14
836	0.15
837	0.15
838	0.15
839	0.16
840	0.18
841	0.2
842	0.21
843	0.27
844	0.31
845	0.37
846	0.44
847	0.5
848	0.52
849	0.54
850	0.59
851	0.57
852	0.6
853	0.59
854	0.59
855	0.59
856	0.58
857	0.57
858	0.51
859	0.46
860	0.4
861	0.37
862	0.31
863	0.26
864	0.24
865	0.21
866	0.19
867	0.18
868	0.15
869	0.12
870	0.1
871	0.09
872	0.08
873	0.09
874	0.1
875	0.16
876	0.19
877	0.24
878	0.32
879	0.42
880	0.52
881	0.6
882	0.7
883	0.73
884	0.79
885	0.81
886	0.84
887	0.76
888	0.71
889	0.63
890	0.56
891	0.49
892	0.4
893	0.34
894	0.25
895	0.24
896	0.18
897	0.17
898	0.15
899	0.15
900	0.21
901	0.2
902	0.2
903	0.26
904	0.32
905	0.36
906	0.44
907	0.51
908	0.52
909	0.57
910	0.55
911	0.51
912	0.53
913	0.52
914	0.47
915	0.39
916	0.32
917	0.27
918	0.26
919	0.25
920	0.17
921	0.14
922	0.12
923	0.14
924	0.14
925	0.15
926	0.16
927	0.19
928	0.22
929	0.3
930	0.38
931	0.45
932	0.53
933	0.58
934	0.58
935	0.64
936	0.72
937	0.73
938	0.74
939	0.72
940	0.71
941	0.7
942	0.7
943	0.61
944	0.51
945	0.43
946	0.33
947	0.27
948	0.2
949	0.15
950	0.16
951	0.19
952	0.24
953	0.27
954	0.31
955	0.34
956	0.39
957	0.47
958	0.54
959	0.57
960	0.6
961	0.63
962	0.7
963	0.73
964	0.76
965	0.74
966	0.73
967	0.75
968	0.74
969	0.73
970	0.72
971	0.75
972	0.73
973	0.74
974	0.74
975	0.68
976	0.62
977	0.63
978	0.54
979	0.52
980	0.51
981	0.51
982	0.48
983	0.57
984	0.63
985	0.6
986	0.64
987	0.6
988	0.6
989	0.63
990	0.64
991	0.62
992	0.58
993	0.57
994	0.53
995	0.53
996	0.49
997	0.42
998	0.41
999	0.35
1000	0.4
1001	0.44
1002	0.43
1003	0.42
1004	0.42
1005	0.39
1006	0.32
1007	0.3
1008	0.24
1009	0.17
1010	0.16
1011	0.13
1012	0.12
1013	0.14
1014	0.14
1015	0.15
1016	0.13
1017	0.11
1018	0.11
1019	0.12
1020	0.13
1021	0.16
1022	0.2
1023	0.2
1024	0.24
1025	0.26
1026	0.33
1027	0.41
1028	0.48
1029	0.5
1030	0.55
1031	0.61
1032	0.67
1033	0.7
1034	0.7
1035	0.67
1036	0.66
1037	0.66
1038	0.66
1039	0.69
1040	0.67
1041	0.7
1042	0.73
1043	0.74
1044	0.72
1045	0.73
1046	0.68
1047	0.61
1048	0.59
1049	0.54
1050	0.44
1051	0.39
1052	0.39
1053	0.33
1054	0.3
1055	0.26
1056	0.23
1057	0.21
1058	0.23
1059	0.21
1060	0.19
1061	0.2
1062	0.19
1063	0.22

A0A060S617

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer