Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A060S6L4

Protein Details
Accession A0A060S6L4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
122-145IVPIRPGPPQRRIRQPRRESLPHTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
132-134RRI
Subcellular Location(s) extr 15, nucl 7, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002100  TF_MADSbox  
IPR036879  TF_MADSbox_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00319  SRF-TF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50066  MADS_BOX_2  
Amino Acid Sequences MGRRKIEIQPITRKNGLFKKAYELGVLCSVDVAVIIFEERPGHHAKLYQYCSTDVNAMVQRHLRFDGERDTKGPADFSNHNNKQADNAEDDDDDADDDDASQKRREGNKPGKVKVEGNSSSIVPIRPGPPQRRIRQPRRESLPHTASLGTLLNRCSQLDFRSNMRVSPTASSSSLPISSDRHTSSINSSARGVPISNTAKRPRLDIDQSHAIQSAPAHLGPGSAGFPYRLDIDLPSYPSSGSIVPALSQLHSQHPSLTALYSGSASMANLMSGPAAGLLPQPFDLSRGAGLRTVAFPQSGNSGQFSPQGQHPPPGLFSRGQSSNPGGNSNGNGGSHGHGHGHGHGGSHSHASASNLFADLLGAGAGEHGNGMGVVGSQQFPTFDWPVHAAPSGQASHQGGQGQHENATHNSPTSDSNWFDFLSAPAPPAITPLLPAPT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.64
3 0.63
4 0.57
5 0.52
6 0.53
7 0.54
8 0.53
9 0.48
10 0.4
11 0.36
12 0.37
13 0.35
14 0.26
15 0.2
16 0.18
17 0.14
18 0.13
19 0.1
20 0.04
21 0.04
22 0.05
23 0.05
24 0.06
25 0.08
26 0.08
27 0.12
28 0.17
29 0.19
30 0.2
31 0.25
32 0.31
33 0.39
34 0.44
35 0.44
36 0.41
37 0.41
38 0.41
39 0.38
40 0.34
41 0.25
42 0.25
43 0.27
44 0.25
45 0.27
46 0.31
47 0.3
48 0.31
49 0.32
50 0.28
51 0.24
52 0.27
53 0.34
54 0.34
55 0.35
56 0.34
57 0.36
58 0.36
59 0.35
60 0.33
61 0.24
62 0.24
63 0.26
64 0.31
65 0.38
66 0.4
67 0.45
68 0.45
69 0.44
70 0.43
71 0.43
72 0.39
73 0.32
74 0.3
75 0.26
76 0.25
77 0.25
78 0.2
79 0.16
80 0.13
81 0.1
82 0.08
83 0.06
84 0.06
85 0.1
86 0.12
87 0.14
88 0.16
89 0.17
90 0.25
91 0.33
92 0.4
93 0.46
94 0.54
95 0.61
96 0.69
97 0.71
98 0.7
99 0.66
100 0.63
101 0.57
102 0.55
103 0.48
104 0.41
105 0.38
106 0.32
107 0.29
108 0.27
109 0.23
110 0.15
111 0.16
112 0.16
113 0.21
114 0.29
115 0.34
116 0.42
117 0.51
118 0.57
119 0.65
120 0.74
121 0.78
122 0.81
123 0.83
124 0.83
125 0.82
126 0.83
127 0.77
128 0.76
129 0.7
130 0.6
131 0.54
132 0.44
133 0.35
134 0.29
135 0.25
136 0.17
137 0.14
138 0.14
139 0.15
140 0.15
141 0.15
142 0.15
143 0.15
144 0.18
145 0.21
146 0.23
147 0.23
148 0.31
149 0.31
150 0.3
151 0.31
152 0.29
153 0.25
154 0.25
155 0.24
156 0.18
157 0.19
158 0.18
159 0.16
160 0.16
161 0.15
162 0.13
163 0.12
164 0.12
165 0.13
166 0.16
167 0.17
168 0.17
169 0.17
170 0.18
171 0.19
172 0.25
173 0.24
174 0.22
175 0.22
176 0.21
177 0.21
178 0.2
179 0.18
180 0.1
181 0.17
182 0.2
183 0.22
184 0.27
185 0.3
186 0.35
187 0.35
188 0.37
189 0.32
190 0.34
191 0.36
192 0.33
193 0.35
194 0.36
195 0.36
196 0.34
197 0.31
198 0.25
199 0.2
200 0.18
201 0.14
202 0.08
203 0.08
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.07
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.1
220 0.11
221 0.13
222 0.13
223 0.12
224 0.12
225 0.12
226 0.13
227 0.09
228 0.09
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.09
234 0.08
235 0.09
236 0.1
237 0.13
238 0.15
239 0.15
240 0.14
241 0.15
242 0.16
243 0.15
244 0.14
245 0.1
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.06
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.07
270 0.09
271 0.09
272 0.08
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.11
277 0.12
278 0.11
279 0.12
280 0.13
281 0.12
282 0.11
283 0.1
284 0.1
285 0.14
286 0.15
287 0.14
288 0.14
289 0.15
290 0.15
291 0.18
292 0.18
293 0.16
294 0.19
295 0.25
296 0.25
297 0.28
298 0.28
299 0.27
300 0.29
301 0.29
302 0.28
303 0.21
304 0.22
305 0.24
306 0.25
307 0.25
308 0.26
309 0.27
310 0.28
311 0.28
312 0.28
313 0.24
314 0.22
315 0.22
316 0.21
317 0.19
318 0.15
319 0.15
320 0.14
321 0.14
322 0.14
323 0.14
324 0.13
325 0.12
326 0.13
327 0.13
328 0.16
329 0.15
330 0.14
331 0.13
332 0.14
333 0.14
334 0.15
335 0.14
336 0.11
337 0.12
338 0.14
339 0.15
340 0.14
341 0.14
342 0.13
343 0.13
344 0.12
345 0.11
346 0.08
347 0.07
348 0.05
349 0.04
350 0.03
351 0.04
352 0.04
353 0.03
354 0.03
355 0.03
356 0.03
357 0.03
358 0.03
359 0.03
360 0.03
361 0.04
362 0.06
363 0.07
364 0.07
365 0.08
366 0.08
367 0.09
368 0.15
369 0.16
370 0.15
371 0.17
372 0.21
373 0.21
374 0.23
375 0.23
376 0.18
377 0.17
378 0.21
379 0.2
380 0.16
381 0.2
382 0.21
383 0.22
384 0.24
385 0.27
386 0.23
387 0.26
388 0.31
389 0.28
390 0.27
391 0.28
392 0.28
393 0.27
394 0.31
395 0.27
396 0.23
397 0.22
398 0.22
399 0.23
400 0.23
401 0.27
402 0.24
403 0.26
404 0.27
405 0.26
406 0.25
407 0.23
408 0.21
409 0.18
410 0.16
411 0.14
412 0.13
413 0.13
414 0.12
415 0.14
416 0.15
417 0.12
418 0.13