FuNGI

A0A060SMD6

Protein Details

Accession

A0A060SMD6

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-21	MAPRRRCPVCGSKQWHKEATS	Hydrophilic
45-75	LGPHAVRKRTLKSGRRKKERQSKADPRLYHG	Basic
223-246	LESTPRPKAPARKRKHRTFGQYDA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
50-68	VRKRTLKSGRRKKERQSKA
228-239	RPKAPARKRKHR

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto_nucl 9.5, mito 7, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR033599 TAF1B/Rrn7
Gene Ontology	GO:0070860 C:RNA polymerase I core factor complex GO:0046872 F:metal ion binding GO:0001164 F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding

Amino Acid Sequences

MAPRRRCPVCGSKQWHKEATSGLITCSEGHVLQNYRNETREVSELGPHAVRKRTLKSGRRKKERQSKADPRLYHGERARFHYFQCLQVILRMQVSTLVRLWELPPEFEIICRDIWALNLSLLPNPPSPEPLLHEQDTVGDAKQRTKGESTSGRSPSPDEVGENDDRTDREDRDQDPAQSSSSSSSSDSESESNFGSDGPDKDSELEELMRENSETPSSEEDELESTPRPKAPARKRKHRTFGQYDAPASTVSCLVLACWTLRLPIMYMDFVKLIESYDLPYLDPLRLLPGNMTRHLRKHTVQALSPHYPPSPLHLHRLASRLARLMYAKYDIYTPEMNAAPILWKAVRNLQGTPTLYILTKRIARVISIPLTLHRSLAPALAREKKRDPAFHKQDSVVPEVALIAVVIVIMKLVYGLDGLPRHPREKDDPACALPMPSELIRAIRAAEEANEATRPPYSTDNHISALDMDEKLLDEYLTFCEKALLPREDRLPTGNVTTNYFPLSEERRLSPVLLAHDKDEPSAEPVMSAVPFDDRPDGLKPGQDYHIYNAQDILGTVPKDLELVVACAAQWSGVDRDYVLGVVERFERRVLRWLESVKRKERSERAAASSG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.82
2	0.81
3	0.71
4	0.65
5	0.58
6	0.55
7	0.51
8	0.42
9	0.36
10	0.31
11	0.3
12	0.27
13	0.24
14	0.2
15	0.14
16	0.14
17	0.2
18	0.21
19	0.25
20	0.31
21	0.36
22	0.37
23	0.38
24	0.39
25	0.35
26	0.35
27	0.34
28	0.31
29	0.26
30	0.27
31	0.27
32	0.28
33	0.29
34	0.29
35	0.31
36	0.33
37	0.37
38	0.39
39	0.44
40	0.51
41	0.59
42	0.65
43	0.71
44	0.77
45	0.83
46	0.87
47	0.9
48	0.91
49	0.91
50	0.92
51	0.91
52	0.91
53	0.91
54	0.91
55	0.9
56	0.81
57	0.76
58	0.76
59	0.69
60	0.66
61	0.62
62	0.59
63	0.54
64	0.6
65	0.6
66	0.51
67	0.48
68	0.5
69	0.46
70	0.42
71	0.42
72	0.36
73	0.3
74	0.32
75	0.35
76	0.26
77	0.25
78	0.2
79	0.17
80	0.2
81	0.21
82	0.2
83	0.18
84	0.17
85	0.16
86	0.17
87	0.18
88	0.2
89	0.2
90	0.18
91	0.18
92	0.19
93	0.19
94	0.19
95	0.21
96	0.16
97	0.15
98	0.14
99	0.14
100	0.11
101	0.13
102	0.13
103	0.11
104	0.1
105	0.12
106	0.12
107	0.13
108	0.14
109	0.16
110	0.16
111	0.18
112	0.18
113	0.19
114	0.2
115	0.2
116	0.23
117	0.27
118	0.31
119	0.3
120	0.3
121	0.27
122	0.26
123	0.26
124	0.22
125	0.16
126	0.15
127	0.15
128	0.19
129	0.25
130	0.25
131	0.26
132	0.28
133	0.29
134	0.32
135	0.39
136	0.41
137	0.44
138	0.45
139	0.44
140	0.42
141	0.42
142	0.37
143	0.32
144	0.27
145	0.2
146	0.18
147	0.23
148	0.24
149	0.23
150	0.21
151	0.2
152	0.19
153	0.21
154	0.23
155	0.19
156	0.22
157	0.27
158	0.27
159	0.32
160	0.35
161	0.34
162	0.34
163	0.33
164	0.29
165	0.24
166	0.23
167	0.19
168	0.17
169	0.16
170	0.13
171	0.13
172	0.14
173	0.14
174	0.15
175	0.14
176	0.14
177	0.14
178	0.13
179	0.12
180	0.11
181	0.1
182	0.1
183	0.11
184	0.11
185	0.14
186	0.14
187	0.14
188	0.15
189	0.16
190	0.15
191	0.13
192	0.13
193	0.1
194	0.1
195	0.1
196	0.09
197	0.09
198	0.09
199	0.09
200	0.1
201	0.11
202	0.11
203	0.13
204	0.15
205	0.16
206	0.15
207	0.14
208	0.15
209	0.14
210	0.14
211	0.13
212	0.12
213	0.12
214	0.13
215	0.15
216	0.18
217	0.28
218	0.38
219	0.47
220	0.55
221	0.65
222	0.74
223	0.82
224	0.87
225	0.85
226	0.84
227	0.81
228	0.79
229	0.76
230	0.69
231	0.6
232	0.51
233	0.43
234	0.33
235	0.25
236	0.18
237	0.11
238	0.07
239	0.06
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.06
244	0.05
245	0.06
246	0.06
247	0.06
248	0.07
249	0.07
250	0.07
251	0.08
252	0.09
253	0.09
254	0.1
255	0.1
256	0.1
257	0.09
258	0.09
259	0.07
260	0.06
261	0.06
262	0.06
263	0.07
264	0.08
265	0.08
266	0.08
267	0.08
268	0.09
269	0.08
270	0.08
271	0.07
272	0.08
273	0.08
274	0.08
275	0.09
276	0.14
277	0.17
278	0.19
279	0.23
280	0.22
281	0.26
282	0.29
283	0.32
284	0.27
285	0.32
286	0.35
287	0.35
288	0.35
289	0.37
290	0.39
291	0.38
292	0.37
293	0.32
294	0.26
295	0.24
296	0.22
297	0.21
298	0.23
299	0.22
300	0.26
301	0.27
302	0.28
303	0.29
304	0.32
305	0.3
306	0.23
307	0.22
308	0.2
309	0.17
310	0.17
311	0.15
312	0.14
313	0.13
314	0.13
315	0.12
316	0.11
317	0.11
318	0.1
319	0.13
320	0.12
321	0.11
322	0.12
323	0.12
324	0.11
325	0.11
326	0.1
327	0.08
328	0.07
329	0.09
330	0.06
331	0.07
332	0.08
333	0.14
334	0.2
335	0.2
336	0.21
337	0.22
338	0.27
339	0.27
340	0.27
341	0.22
342	0.17
343	0.16
344	0.16
345	0.15
346	0.13
347	0.15
348	0.14
349	0.17
350	0.16
351	0.16
352	0.18
353	0.21
354	0.2
355	0.18
356	0.18
357	0.17
358	0.21
359	0.2
360	0.19
361	0.15
362	0.14
363	0.13
364	0.15
365	0.15
366	0.13
367	0.18
368	0.25
369	0.27
370	0.31
371	0.34
372	0.39
373	0.43
374	0.49
375	0.51
376	0.54
377	0.6
378	0.61
379	0.61
380	0.55
381	0.54
382	0.49
383	0.45
384	0.35
385	0.25
386	0.2
387	0.17
388	0.15
389	0.11
390	0.07
391	0.03
392	0.02
393	0.02
394	0.02
395	0.02
396	0.02
397	0.02
398	0.02
399	0.02
400	0.02
401	0.02
402	0.03
403	0.03
404	0.06
405	0.07
406	0.09
407	0.16
408	0.19
409	0.22
410	0.23
411	0.27
412	0.31
413	0.41
414	0.45
415	0.43
416	0.44
417	0.43
418	0.43
419	0.39
420	0.32
421	0.23
422	0.18
423	0.14
424	0.11
425	0.11
426	0.1
427	0.11
428	0.11
429	0.11
430	0.11
431	0.09
432	0.1
433	0.09
434	0.09
435	0.11
436	0.11
437	0.11
438	0.11
439	0.11
440	0.11
441	0.12
442	0.12
443	0.12
444	0.17
445	0.18
446	0.24
447	0.29
448	0.32
449	0.32
450	0.31
451	0.29
452	0.24
453	0.24
454	0.2
455	0.15
456	0.12
457	0.11
458	0.11
459	0.11
460	0.1
461	0.08
462	0.05
463	0.07
464	0.1
465	0.12
466	0.12
467	0.11
468	0.13
469	0.15
470	0.19
471	0.26
472	0.28
473	0.28
474	0.32
475	0.37
476	0.37
477	0.37
478	0.35
479	0.3
480	0.27
481	0.29
482	0.3
483	0.26
484	0.28
485	0.29
486	0.27
487	0.25
488	0.24
489	0.2
490	0.2
491	0.25
492	0.26
493	0.27
494	0.28
495	0.3
496	0.31
497	0.31
498	0.28
499	0.26
500	0.28
501	0.3
502	0.29
503	0.28
504	0.32
505	0.31
506	0.29
507	0.27
508	0.21
509	0.19
510	0.2
511	0.17
512	0.13
513	0.13
514	0.14
515	0.12
516	0.11
517	0.09
518	0.1
519	0.1
520	0.12
521	0.15
522	0.13
523	0.16
524	0.2
525	0.24
526	0.22
527	0.25
528	0.26
529	0.27
530	0.31
531	0.32
532	0.31
533	0.32
534	0.38
535	0.35
536	0.33
537	0.3
538	0.26
539	0.22
540	0.2
541	0.17
542	0.14
543	0.14
544	0.14
545	0.13
546	0.13
547	0.13
548	0.13
549	0.12
550	0.08
551	0.09
552	0.1
553	0.1
554	0.1
555	0.1
556	0.1
557	0.08
558	0.07
559	0.09
560	0.1
561	0.11
562	0.12
563	0.11
564	0.13
565	0.13
566	0.13
567	0.11
568	0.11
569	0.1
570	0.12
571	0.17
572	0.18
573	0.19
574	0.22
575	0.25
576	0.25
577	0.34
578	0.36
579	0.36
580	0.41
581	0.47
582	0.54
583	0.61
584	0.68
585	0.68
586	0.73
587	0.73
588	0.76
589	0.78
590	0.76
591	0.76
592	0.74

A0A060SMD6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer