Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A060SQU4

Protein Details
Accession A0A060SQU4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
371-409SDEEGGEDRRKRKRKPEKDPLNVTKRKKGRNELVAEPSFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
379-400RRKRKRKPEKDPLNVTKRKKGR
Subcellular Location(s) cyto 17, nucl 6, pero 3, mito_nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MPDIPVGAQIFDLAFHPDRPVVFTGLLTGHVKAFRYDDQGNHEAKFSVRPSKKSCRTLAMSADGRHLWAAGKAKAIHTLDVGSGEVVETRAGAHDAPINRMKRLTANLLASGDDDGVIKLWDPRKPDAVRKYTQHFDFISDFLWLEDKKQLVATSGDGTLSVMDVRSKKFEPIAQSEDQEDELLSILAIKGGQKIVVGTQLGILSIFNRKSGWGDCVDRIPGHPQSIDALCSIPSHYPNAHSTILTGSSDGLLRAVQLLPTKLLGVVADHGEFPIERIAVDMNGEGRWVGSAGHEEVLKLTDLKEVFEDDENDKDAEGDSDAAGTEGALNDGSNDEDELEDKEGESSSGALAAKAESSDEDEVEGDPREDSDEEGGEDRRKRKRKPEKDPLNVTKRKKGRNELVAEPSFFADL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.17
4 0.18
5 0.19
6 0.22
7 0.23
8 0.21
9 0.2
10 0.19
11 0.19
12 0.18
13 0.21
14 0.18
15 0.17
16 0.17
17 0.19
18 0.2
19 0.19
20 0.22
21 0.22
22 0.28
23 0.3
24 0.31
25 0.37
26 0.43
27 0.43
28 0.4
29 0.38
30 0.32
31 0.3
32 0.33
33 0.29
34 0.33
35 0.36
36 0.43
37 0.5
38 0.6
39 0.69
40 0.71
41 0.72
42 0.7
43 0.7
44 0.68
45 0.65
46 0.62
47 0.58
48 0.51
49 0.5
50 0.41
51 0.36
52 0.3
53 0.25
54 0.17
55 0.16
56 0.2
57 0.18
58 0.23
59 0.24
60 0.25
61 0.31
62 0.32
63 0.28
64 0.24
65 0.23
66 0.19
67 0.18
68 0.17
69 0.1
70 0.08
71 0.07
72 0.07
73 0.06
74 0.06
75 0.05
76 0.05
77 0.06
78 0.07
79 0.06
80 0.07
81 0.12
82 0.13
83 0.18
84 0.25
85 0.26
86 0.26
87 0.27
88 0.27
89 0.27
90 0.3
91 0.31
92 0.29
93 0.29
94 0.3
95 0.3
96 0.29
97 0.25
98 0.21
99 0.15
100 0.1
101 0.08
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.1
107 0.14
108 0.16
109 0.2
110 0.23
111 0.31
112 0.35
113 0.43
114 0.48
115 0.52
116 0.55
117 0.56
118 0.6
119 0.58
120 0.55
121 0.51
122 0.42
123 0.38
124 0.34
125 0.29
126 0.24
127 0.17
128 0.16
129 0.12
130 0.14
131 0.1
132 0.1
133 0.13
134 0.12
135 0.12
136 0.13
137 0.13
138 0.12
139 0.13
140 0.13
141 0.12
142 0.12
143 0.11
144 0.1
145 0.1
146 0.08
147 0.07
148 0.06
149 0.04
150 0.07
151 0.09
152 0.1
153 0.14
154 0.14
155 0.16
156 0.18
157 0.2
158 0.23
159 0.27
160 0.31
161 0.29
162 0.29
163 0.29
164 0.27
165 0.25
166 0.2
167 0.13
168 0.08
169 0.07
170 0.06
171 0.04
172 0.04
173 0.03
174 0.03
175 0.04
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.08
184 0.07
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.06
191 0.05
192 0.09
193 0.09
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.11
198 0.12
199 0.14
200 0.13
201 0.16
202 0.16
203 0.18
204 0.18
205 0.17
206 0.16
207 0.18
208 0.17
209 0.15
210 0.14
211 0.13
212 0.15
213 0.15
214 0.15
215 0.11
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.1
220 0.09
221 0.09
222 0.11
223 0.11
224 0.13
225 0.15
226 0.19
227 0.19
228 0.17
229 0.16
230 0.15
231 0.16
232 0.13
233 0.12
234 0.08
235 0.07
236 0.08
237 0.07
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.08
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.1
249 0.08
250 0.08
251 0.07
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.07
279 0.08
280 0.1
281 0.1
282 0.09
283 0.1
284 0.11
285 0.1
286 0.09
287 0.08
288 0.11
289 0.11
290 0.12
291 0.12
292 0.12
293 0.14
294 0.15
295 0.18
296 0.16
297 0.17
298 0.19
299 0.18
300 0.16
301 0.15
302 0.13
303 0.11
304 0.1
305 0.08
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.06
310 0.06
311 0.05
312 0.05
313 0.04
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.09
326 0.11
327 0.1
328 0.1
329 0.11
330 0.11
331 0.11
332 0.1
333 0.09
334 0.06
335 0.1
336 0.09
337 0.09
338 0.09
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.07
344 0.11
345 0.12
346 0.12
347 0.12
348 0.12
349 0.13
350 0.14
351 0.14
352 0.11
353 0.1
354 0.1
355 0.12
356 0.12
357 0.13
358 0.13
359 0.13
360 0.14
361 0.17
362 0.2
363 0.23
364 0.3
365 0.36
366 0.45
367 0.53
368 0.6
369 0.69
370 0.77
371 0.82
372 0.87
373 0.91
374 0.92
375 0.93
376 0.95
377 0.94
378 0.94
379 0.92
380 0.87
381 0.86
382 0.84
383 0.83
384 0.82
385 0.82
386 0.81
387 0.82
388 0.82
389 0.8
390 0.8
391 0.75
392 0.66
393 0.57