Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JVI5

Protein Details
Accession C4JVI5    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
445-473LSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDIGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-26KDKGG
106-112KAKSKEP
319-340RKSTKAKKASAKEKKIARKAAK
451-466KGFTKEKNKKKRGSYR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 10, mito 3, extr 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
KEGG ure:UREG_06577  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MAPSKASKASSKAKDVSSKNSKDKGGKDAAKGDSAPKRTISPVILAMIGSFLSAYGLYLTKSAFDSEVASKGVAEKSKSKQVKDHPSMDELIENWERSNQSAKSAKAKSKEPKKSSAMEDDMGDGSSSSESDSSESDQESDSDVSMQDAASVSSSSSSSDSSSSEDETDSTGSSSKGKRNERISGPSNQPLKRKYESSPSPSSSSSTSDSPDTKRPKLDTGKAKKPGELTSSSESEASSDSDASSSSQSSPSGDSESESESESESESESDSSSASSSSSSCSSSSSSASSSSSSSSSSSSSSSSSSSDGSSNSSSSDARKSTKAKKASAKEKKIARKAAKIPLPESDSDSDSGDSSSAESSGSDSEDKSPFLAATSRELSASSGTTVRATSSDSSSAKVENGAGTGRKHTGAKSTPLAIASELPHNHPSNAYVPYAYAERAHQDLSVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGPIDIGPGKSFKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.64
3 0.67
4 0.68
5 0.7
6 0.7
7 0.71
8 0.72
9 0.7
10 0.7
11 0.69
12 0.68
13 0.65
14 0.62
15 0.63
16 0.59
17 0.55
18 0.51
19 0.5
20 0.48
21 0.46
22 0.44
23 0.38
24 0.38
25 0.37
26 0.41
27 0.35
28 0.31
29 0.29
30 0.28
31 0.26
32 0.23
33 0.2
34 0.16
35 0.13
36 0.09
37 0.06
38 0.04
39 0.04
40 0.04
41 0.05
42 0.06
43 0.06
44 0.07
45 0.08
46 0.08
47 0.09
48 0.1
49 0.11
50 0.1
51 0.1
52 0.14
53 0.15
54 0.18
55 0.17
56 0.16
57 0.15
58 0.18
59 0.21
60 0.21
61 0.22
62 0.26
63 0.31
64 0.41
65 0.47
66 0.47
67 0.51
68 0.58
69 0.66
70 0.67
71 0.69
72 0.62
73 0.6
74 0.58
75 0.51
76 0.42
77 0.31
78 0.3
79 0.24
80 0.22
81 0.19
82 0.21
83 0.2
84 0.2
85 0.26
86 0.21
87 0.26
88 0.32
89 0.34
90 0.4
91 0.46
92 0.5
93 0.49
94 0.57
95 0.6
96 0.65
97 0.73
98 0.69
99 0.71
100 0.71
101 0.71
102 0.68
103 0.66
104 0.59
105 0.49
106 0.44
107 0.37
108 0.32
109 0.26
110 0.21
111 0.12
112 0.09
113 0.08
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.07
119 0.08
120 0.1
121 0.11
122 0.11
123 0.12
124 0.12
125 0.12
126 0.13
127 0.13
128 0.1
129 0.1
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.05
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.08
146 0.09
147 0.1
148 0.11
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.09
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.13
161 0.16
162 0.2
163 0.28
164 0.34
165 0.41
166 0.46
167 0.53
168 0.53
169 0.57
170 0.56
171 0.54
172 0.53
173 0.53
174 0.55
175 0.51
176 0.51
177 0.47
178 0.49
179 0.45
180 0.44
181 0.4
182 0.42
183 0.45
184 0.47
185 0.5
186 0.47
187 0.47
188 0.44
189 0.43
190 0.34
191 0.3
192 0.25
193 0.2
194 0.18
195 0.18
196 0.2
197 0.22
198 0.28
199 0.32
200 0.32
201 0.35
202 0.35
203 0.41
204 0.45
205 0.5
206 0.52
207 0.55
208 0.61
209 0.66
210 0.65
211 0.59
212 0.55
213 0.5
214 0.43
215 0.37
216 0.32
217 0.27
218 0.27
219 0.26
220 0.23
221 0.2
222 0.16
223 0.14
224 0.11
225 0.08
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.07
234 0.08
235 0.08
236 0.09
237 0.1
238 0.1
239 0.11
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.11
244 0.11
245 0.11
246 0.1
247 0.08
248 0.09
249 0.08
250 0.08
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.07
265 0.08
266 0.09
267 0.09
268 0.1
269 0.11
270 0.12
271 0.13
272 0.13
273 0.12
274 0.12
275 0.13
276 0.13
277 0.12
278 0.12
279 0.11
280 0.11
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.11
287 0.11
288 0.12
289 0.12
290 0.12
291 0.12
292 0.12
293 0.12
294 0.12
295 0.12
296 0.14
297 0.13
298 0.13
299 0.12
300 0.13
301 0.13
302 0.14
303 0.18
304 0.18
305 0.2
306 0.26
307 0.32
308 0.4
309 0.47
310 0.52
311 0.55
312 0.61
313 0.68
314 0.74
315 0.77
316 0.76
317 0.75
318 0.77
319 0.79
320 0.78
321 0.79
322 0.74
323 0.72
324 0.72
325 0.73
326 0.7
327 0.64
328 0.57
329 0.53
330 0.5
331 0.41
332 0.38
333 0.31
334 0.27
335 0.25
336 0.24
337 0.19
338 0.16
339 0.15
340 0.11
341 0.09
342 0.08
343 0.07
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.07
349 0.09
350 0.09
351 0.1
352 0.14
353 0.15
354 0.15
355 0.15
356 0.15
357 0.13
358 0.13
359 0.16
360 0.13
361 0.16
362 0.18
363 0.18
364 0.18
365 0.18
366 0.18
367 0.16
368 0.16
369 0.12
370 0.11
371 0.11
372 0.12
373 0.12
374 0.11
375 0.11
376 0.13
377 0.13
378 0.15
379 0.21
380 0.2
381 0.22
382 0.23
383 0.23
384 0.21
385 0.2
386 0.18
387 0.12
388 0.13
389 0.14
390 0.16
391 0.16
392 0.19
393 0.2
394 0.22
395 0.23
396 0.23
397 0.29
398 0.31
399 0.35
400 0.36
401 0.37
402 0.36
403 0.35
404 0.35
405 0.27
406 0.25
407 0.21
408 0.24
409 0.22
410 0.24
411 0.29
412 0.3
413 0.3
414 0.28
415 0.29
416 0.27
417 0.28
418 0.26
419 0.2
420 0.19
421 0.2
422 0.21
423 0.19
424 0.16
425 0.15
426 0.17
427 0.19
428 0.19
429 0.17
430 0.18
431 0.19
432 0.23
433 0.28
434 0.26
435 0.25
436 0.28
437 0.29
438 0.34
439 0.4
440 0.44
441 0.49
442 0.59
443 0.69
444 0.77
445 0.85
446 0.87
447 0.9
448 0.91
449 0.9
450 0.9
451 0.89
452 0.89
453 0.88
454 0.82
455 0.72
456 0.62
457 0.61
458 0.54
459 0.47
460 0.37
461 0.3
462 0.28