Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JR98

Protein Details
Accession C4JR98    Localization Confidence Low Confidence Score 8.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
242-261STQWIYDKRRRYPRNPGYRGHydrophilic
559-578RLILTRRKWRGTKEQWERLGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 18, mito_nucl 13, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024319  ATPase_expression_mit  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
KEGG ure:UREG_04987  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12921  ATP13  
PF13812  PPR_3  
Amino Acid Sequences MRTPSKLFRPVSTVSRTPSSRKRSANSGKWAPTTSRTAASLHGFAVPQPNSNISASEPFAGEDTRSPPAPRNLEQGSAAHSINVQAILEEAQPGRILAALKSSAELQNAIQEVPAATYVELLRLLSPAYFIEPYKELHAHLHPLTAHLNRILPLTIRMAQFAEQLDAIVKLRRRAGHRLGLAEYTQLLSCSASMGYGQMASFLWTEMGEDGIEPTVECYNYLMEAKVWDRAYIAKENHRVRSTQWIYDKRRRYPRNPGYRGYRTGKDGVRDQVHQLFRAMVASGLIPNEATFINVMTAASREWDMKTVKTTLQTVWGIDVDLLENDPGSHPPVSIYATSSPLHPTPRLLHAVAHIFGSNNDFSMALKLVDFVSQSYNIPIPQRVWQELLEWSFVLSLERFGDSGDSMVGKIPRNSPVKVFEVLTSSPYNASPNFKMYNILFKVAWIKQSKDTFDHMKSGRELFRETLRTRNRLFHRLLRRHGEIASTRNLNNPLDINPSRRSNQPDDDEVLPKPAHEYRLAPLFPSITCPGDYWDLYNTVKSLNIKVARELLYIQRWIRLILTRRKWRGTKEQWERLGVPNFIEEWKEFLPYQVFYHTKTGVVEFDPSSFWPEGHRWDLASFMLPLWDAENRLLSKSEQETFLDVAPELTTDDDAPGIMTGRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.52
3 0.52
4 0.55
5 0.59
6 0.61
7 0.63
8 0.66
9 0.66
10 0.69
11 0.76
12 0.77
13 0.78
14 0.78
15 0.76
16 0.72
17 0.7
18 0.63
19 0.57
20 0.55
21 0.48
22 0.42
23 0.37
24 0.34
25 0.35
26 0.35
27 0.31
28 0.25
29 0.24
30 0.21
31 0.21
32 0.28
33 0.24
34 0.23
35 0.24
36 0.25
37 0.25
38 0.26
39 0.26
40 0.2
41 0.23
42 0.22
43 0.21
44 0.19
45 0.17
46 0.17
47 0.17
48 0.15
49 0.14
50 0.17
51 0.19
52 0.21
53 0.22
54 0.28
55 0.36
56 0.42
57 0.41
58 0.45
59 0.44
60 0.45
61 0.45
62 0.39
63 0.36
64 0.32
65 0.29
66 0.22
67 0.19
68 0.17
69 0.17
70 0.16
71 0.11
72 0.07
73 0.08
74 0.09
75 0.09
76 0.1
77 0.09
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.09
82 0.1
83 0.11
84 0.09
85 0.13
86 0.13
87 0.13
88 0.14
89 0.17
90 0.17
91 0.17
92 0.17
93 0.13
94 0.17
95 0.18
96 0.17
97 0.14
98 0.13
99 0.12
100 0.11
101 0.12
102 0.08
103 0.07
104 0.09
105 0.09
106 0.1
107 0.1
108 0.09
109 0.09
110 0.08
111 0.09
112 0.07
113 0.08
114 0.07
115 0.09
116 0.11
117 0.11
118 0.14
119 0.15
120 0.16
121 0.2
122 0.21
123 0.19
124 0.22
125 0.24
126 0.27
127 0.26
128 0.28
129 0.23
130 0.24
131 0.28
132 0.25
133 0.24
134 0.2
135 0.21
136 0.19
137 0.2
138 0.18
139 0.14
140 0.15
141 0.17
142 0.2
143 0.19
144 0.19
145 0.19
146 0.19
147 0.21
148 0.19
149 0.16
150 0.11
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.13
156 0.14
157 0.16
158 0.21
159 0.26
160 0.3
161 0.38
162 0.44
163 0.48
164 0.49
165 0.49
166 0.47
167 0.43
168 0.39
169 0.31
170 0.24
171 0.16
172 0.13
173 0.1
174 0.09
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.06
179 0.05
180 0.05
181 0.06
182 0.05
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.06
192 0.07
193 0.06
194 0.06
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.04
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.09
209 0.08
210 0.07
211 0.09
212 0.1
213 0.15
214 0.15
215 0.14
216 0.14
217 0.16
218 0.2
219 0.24
220 0.26
221 0.28
222 0.36
223 0.41
224 0.46
225 0.45
226 0.42
227 0.37
228 0.46
229 0.42
230 0.4
231 0.44
232 0.47
233 0.54
234 0.62
235 0.69
236 0.66
237 0.74
238 0.75
239 0.74
240 0.76
241 0.78
242 0.8
243 0.78
244 0.75
245 0.73
246 0.71
247 0.71
248 0.65
249 0.57
250 0.49
251 0.5
252 0.46
253 0.4
254 0.38
255 0.37
256 0.34
257 0.33
258 0.32
259 0.33
260 0.32
261 0.3
262 0.26
263 0.21
264 0.18
265 0.17
266 0.14
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.04
274 0.04
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.04
279 0.04
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.04
284 0.05
285 0.04
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.06
290 0.11
291 0.12
292 0.12
293 0.15
294 0.16
295 0.17
296 0.18
297 0.19
298 0.15
299 0.19
300 0.19
301 0.17
302 0.16
303 0.14
304 0.12
305 0.11
306 0.1
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.04
311 0.03
312 0.03
313 0.04
314 0.04
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.07
319 0.08
320 0.09
321 0.09
322 0.1
323 0.1
324 0.12
325 0.13
326 0.13
327 0.14
328 0.14
329 0.16
330 0.15
331 0.16
332 0.15
333 0.19
334 0.21
335 0.19
336 0.18
337 0.18
338 0.2
339 0.18
340 0.16
341 0.13
342 0.1
343 0.1
344 0.11
345 0.09
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.08
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.07
357 0.07
358 0.06
359 0.07
360 0.08
361 0.08
362 0.09
363 0.1
364 0.1
365 0.11
366 0.12
367 0.12
368 0.17
369 0.19
370 0.19
371 0.21
372 0.2
373 0.2
374 0.22
375 0.21
376 0.17
377 0.14
378 0.12
379 0.1
380 0.1
381 0.09
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.07
386 0.07
387 0.06
388 0.07
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.05
393 0.05
394 0.07
395 0.1
396 0.11
397 0.13
398 0.15
399 0.23
400 0.26
401 0.27
402 0.28
403 0.29
404 0.31
405 0.31
406 0.29
407 0.23
408 0.22
409 0.22
410 0.22
411 0.18
412 0.15
413 0.15
414 0.14
415 0.15
416 0.13
417 0.17
418 0.16
419 0.19
420 0.21
421 0.2
422 0.23
423 0.21
424 0.29
425 0.26
426 0.27
427 0.22
428 0.21
429 0.27
430 0.25
431 0.31
432 0.25
433 0.26
434 0.31
435 0.35
436 0.37
437 0.34
438 0.38
439 0.38
440 0.37
441 0.42
442 0.36
443 0.36
444 0.35
445 0.37
446 0.35
447 0.31
448 0.31
449 0.26
450 0.31
451 0.34
452 0.34
453 0.39
454 0.42
455 0.46
456 0.46
457 0.53
458 0.53
459 0.53
460 0.56
461 0.56
462 0.6
463 0.63
464 0.67
465 0.66
466 0.63
467 0.58
468 0.54
469 0.5
470 0.42
471 0.38
472 0.36
473 0.33
474 0.29
475 0.31
476 0.34
477 0.29
478 0.27
479 0.25
480 0.21
481 0.26
482 0.28
483 0.28
484 0.3
485 0.34
486 0.35
487 0.38
488 0.44
489 0.42
490 0.47
491 0.47
492 0.46
493 0.46
494 0.47
495 0.44
496 0.37
497 0.35
498 0.27
499 0.22
500 0.22
501 0.22
502 0.21
503 0.21
504 0.22
505 0.22
506 0.3
507 0.3
508 0.27
509 0.25
510 0.24
511 0.22
512 0.25
513 0.24
514 0.17
515 0.18
516 0.18
517 0.19
518 0.22
519 0.22
520 0.18
521 0.18
522 0.2
523 0.2
524 0.2
525 0.18
526 0.15
527 0.18
528 0.18
529 0.18
530 0.23
531 0.28
532 0.28
533 0.3
534 0.34
535 0.33
536 0.32
537 0.32
538 0.3
539 0.29
540 0.32
541 0.31
542 0.29
543 0.28
544 0.28
545 0.28
546 0.29
547 0.34
548 0.39
549 0.49
550 0.56
551 0.62
552 0.7
553 0.73
554 0.73
555 0.76
556 0.76
557 0.77
558 0.78
559 0.8
560 0.77
561 0.77
562 0.72
563 0.68
564 0.64
565 0.53
566 0.43
567 0.36
568 0.32
569 0.28
570 0.27
571 0.19
572 0.19
573 0.18
574 0.2
575 0.19
576 0.2
577 0.22
578 0.22
579 0.23
580 0.26
581 0.27
582 0.27
583 0.33
584 0.3
585 0.29
586 0.28
587 0.28
588 0.23
589 0.23
590 0.23
591 0.19
592 0.19
593 0.19
594 0.18
595 0.22
596 0.19
597 0.18
598 0.19
599 0.22
600 0.27
601 0.29
602 0.3
603 0.26
604 0.26
605 0.28
606 0.25
607 0.23
608 0.18
609 0.14
610 0.14
611 0.12
612 0.12
613 0.13
614 0.14
615 0.13
616 0.14
617 0.2
618 0.2
619 0.22
620 0.23
621 0.22
622 0.27
623 0.3
624 0.32
625 0.28
626 0.29
627 0.3
628 0.3
629 0.3
630 0.25
631 0.2
632 0.18
633 0.15
634 0.14
635 0.11
636 0.11
637 0.1
638 0.09
639 0.1
640 0.09
641 0.09
642 0.09
643 0.09