Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A060SHX9

Protein Details
Accession A0A060SHX9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
325-349ELEPRTPSRRKRKRAGTSTPRTPRTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
272-280RDSPRKRRR
331-354PSRRKRKRAGTSTPRTPRTPRRTA
362-391TPRRGRPPKDASLAHPTPHSKAALRKRKKT
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_mito 9, nucl 8, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR003959  ATPase_AAA_core  
IPR001025  BAH_dom  
IPR043151  BAH_sf  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003682  F:chromatin binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF00004  AAA  
PF01426  BAH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51038  BAH  
CDD cd00009  AAA  
cd04370  BAH  
Amino Acid Sequences MSEANDTPLRRSKRGQPVVAYISSPPSSSALDIVPGPLLYSRPSKSTDLFEDEAKDVDSVQSWNTYFYHSYKRGSNAPPSRAPVRTYGRVSRPRKSDTNTTAEFKVGDTVLVRTASTLPSVAVIIAVWKIEGEQYRAKAPLHVRVHWFVRPSELPKIRARRAFYENEVLYNIAACETLPPSAILAHCHVSPDPAKAIASPEDATPDVLYCRQAVDPMRGLYYDLKWDSFRLRALSQTPEQGADAGEWPNDDIWTVKSAAVIKSRTIGRESGRDSPRKRRRIAHDEDELSEFSDDASGDEFEAPLNDDSDVDEDVDNNEEDDVVAELEPRTPSRRKRKRAGTSTPRTPRTPRRTASATTTTATPRRGRPPKDASLAHPTPHSKAALRKRKKTALAVRPPDVLDAMLDEGTTAGLGADPWLRAMHVLHVAARPGALPCREAEYGRVLRAVEELLEEGSGGCIYISGVPGTGKTATVHAVVRELKRMAEQNEANPFAFVEINGLKIPEPAAAYGLLWEAVSGHDAARDGHMKISAKEALRLLSNHFSGAARVGPAGGHACVVLMDELDQLMTSKQDVVYNFFNWPTLAGSKLVVLAVANTMDLPERVMSRARAQPPRHGPHQLPAVHDAAARADRESASGQREAGLPADTPDVIAPTRSSSPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.7
3 0.67
4 0.68
5 0.69
6 0.65
7 0.56
8 0.46
9 0.42
10 0.36
11 0.3
12 0.23
13 0.2
14 0.19
15 0.18
16 0.19
17 0.14
18 0.15
19 0.15
20 0.14
21 0.13
22 0.12
23 0.12
24 0.11
25 0.11
26 0.13
27 0.19
28 0.2
29 0.22
30 0.27
31 0.3
32 0.32
33 0.37
34 0.4
35 0.41
36 0.41
37 0.4
38 0.39
39 0.36
40 0.33
41 0.28
42 0.22
43 0.15
44 0.15
45 0.14
46 0.11
47 0.12
48 0.15
49 0.15
50 0.17
51 0.17
52 0.2
53 0.21
54 0.24
55 0.33
56 0.33
57 0.36
58 0.4
59 0.44
60 0.49
61 0.51
62 0.58
63 0.57
64 0.6
65 0.61
66 0.61
67 0.62
68 0.57
69 0.54
70 0.52
71 0.51
72 0.52
73 0.52
74 0.55
75 0.59
76 0.67
77 0.7
78 0.7
79 0.7
80 0.69
81 0.7
82 0.68
83 0.69
84 0.65
85 0.68
86 0.64
87 0.6
88 0.54
89 0.47
90 0.41
91 0.31
92 0.27
93 0.19
94 0.15
95 0.12
96 0.12
97 0.14
98 0.14
99 0.14
100 0.12
101 0.13
102 0.13
103 0.13
104 0.12
105 0.09
106 0.09
107 0.1
108 0.08
109 0.07
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.09
118 0.11
119 0.14
120 0.19
121 0.21
122 0.24
123 0.27
124 0.27
125 0.29
126 0.31
127 0.36
128 0.37
129 0.39
130 0.41
131 0.43
132 0.47
133 0.44
134 0.43
135 0.34
136 0.35
137 0.35
138 0.34
139 0.39
140 0.41
141 0.42
142 0.48
143 0.56
144 0.58
145 0.59
146 0.59
147 0.56
148 0.57
149 0.57
150 0.53
151 0.53
152 0.46
153 0.42
154 0.38
155 0.32
156 0.25
157 0.21
158 0.16
159 0.07
160 0.07
161 0.05
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.1
169 0.1
170 0.11
171 0.12
172 0.14
173 0.13
174 0.15
175 0.14
176 0.16
177 0.17
178 0.17
179 0.16
180 0.16
181 0.16
182 0.15
183 0.17
184 0.16
185 0.16
186 0.15
187 0.14
188 0.15
189 0.15
190 0.15
191 0.13
192 0.11
193 0.1
194 0.11
195 0.11
196 0.09
197 0.1
198 0.1
199 0.13
200 0.15
201 0.18
202 0.2
203 0.2
204 0.21
205 0.19
206 0.21
207 0.19
208 0.18
209 0.2
210 0.17
211 0.18
212 0.17
213 0.19
214 0.2
215 0.2
216 0.21
217 0.19
218 0.18
219 0.2
220 0.22
221 0.26
222 0.25
223 0.26
224 0.24
225 0.22
226 0.21
227 0.18
228 0.16
229 0.11
230 0.11
231 0.09
232 0.08
233 0.07
234 0.08
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.08
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.13
245 0.15
246 0.19
247 0.19
248 0.18
249 0.21
250 0.22
251 0.22
252 0.22
253 0.22
254 0.2
255 0.25
256 0.28
257 0.33
258 0.37
259 0.44
260 0.46
261 0.54
262 0.62
263 0.64
264 0.65
265 0.65
266 0.69
267 0.71
268 0.75
269 0.71
270 0.68
271 0.62
272 0.58
273 0.51
274 0.42
275 0.32
276 0.24
277 0.17
278 0.09
279 0.08
280 0.06
281 0.05
282 0.06
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.05
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.07
296 0.07
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.07
302 0.07
303 0.06
304 0.05
305 0.04
306 0.04
307 0.05
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.06
314 0.06
315 0.07
316 0.11
317 0.16
318 0.26
319 0.37
320 0.47
321 0.54
322 0.63
323 0.73
324 0.79
325 0.84
326 0.86
327 0.85
328 0.83
329 0.85
330 0.83
331 0.76
332 0.69
333 0.66
334 0.65
335 0.64
336 0.64
337 0.55
338 0.53
339 0.53
340 0.52
341 0.52
342 0.48
343 0.41
344 0.33
345 0.33
346 0.3
347 0.28
348 0.3
349 0.27
350 0.26
351 0.34
352 0.42
353 0.44
354 0.51
355 0.55
356 0.58
357 0.61
358 0.58
359 0.52
360 0.53
361 0.5
362 0.42
363 0.37
364 0.32
365 0.28
366 0.29
367 0.26
368 0.19
369 0.26
370 0.36
371 0.43
372 0.5
373 0.57
374 0.62
375 0.68
376 0.71
377 0.72
378 0.72
379 0.72
380 0.73
381 0.7
382 0.65
383 0.59
384 0.54
385 0.45
386 0.35
387 0.24
388 0.14
389 0.09
390 0.08
391 0.06
392 0.05
393 0.05
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.03
398 0.02
399 0.02
400 0.02
401 0.03
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.07
409 0.08
410 0.1
411 0.11
412 0.12
413 0.13
414 0.13
415 0.13
416 0.12
417 0.1
418 0.09
419 0.11
420 0.1
421 0.1
422 0.1
423 0.16
424 0.17
425 0.16
426 0.17
427 0.22
428 0.23
429 0.23
430 0.24
431 0.19
432 0.19
433 0.19
434 0.17
435 0.1
436 0.08
437 0.08
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.05
442 0.05
443 0.04
444 0.04
445 0.03
446 0.03
447 0.03
448 0.04
449 0.05
450 0.05
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.08
455 0.08
456 0.08
457 0.08
458 0.09
459 0.1
460 0.12
461 0.13
462 0.12
463 0.16
464 0.2
465 0.21
466 0.24
467 0.23
468 0.21
469 0.24
470 0.28
471 0.26
472 0.3
473 0.31
474 0.31
475 0.37
476 0.39
477 0.36
478 0.31
479 0.28
480 0.21
481 0.2
482 0.14
483 0.12
484 0.1
485 0.11
486 0.11
487 0.12
488 0.11
489 0.11
490 0.12
491 0.1
492 0.1
493 0.09
494 0.09
495 0.09
496 0.09
497 0.09
498 0.09
499 0.07
500 0.06
501 0.06
502 0.05
503 0.05
504 0.06
505 0.06
506 0.05
507 0.06
508 0.07
509 0.08
510 0.11
511 0.14
512 0.13
513 0.15
514 0.19
515 0.2
516 0.2
517 0.24
518 0.26
519 0.25
520 0.27
521 0.27
522 0.24
523 0.25
524 0.26
525 0.26
526 0.26
527 0.25
528 0.22
529 0.22
530 0.21
531 0.19
532 0.19
533 0.16
534 0.1
535 0.1
536 0.1
537 0.09
538 0.1
539 0.11
540 0.09
541 0.08
542 0.08
543 0.08
544 0.07
545 0.08
546 0.07
547 0.05
548 0.06
549 0.06
550 0.06
551 0.06
552 0.06
553 0.05
554 0.06
555 0.06
556 0.06
557 0.08
558 0.09
559 0.13
560 0.14
561 0.19
562 0.23
563 0.24
564 0.25
565 0.24
566 0.23
567 0.2
568 0.19
569 0.18
570 0.15
571 0.15
572 0.14
573 0.14
574 0.14
575 0.15
576 0.13
577 0.1
578 0.09
579 0.08
580 0.08
581 0.08
582 0.07
583 0.06
584 0.07
585 0.08
586 0.08
587 0.09
588 0.09
589 0.1
590 0.12
591 0.16
592 0.19
593 0.25
594 0.34
595 0.41
596 0.49
597 0.51
598 0.6
599 0.67
600 0.71
601 0.71
602 0.7
603 0.64
604 0.62
605 0.67
606 0.6
607 0.53
608 0.5
609 0.45
610 0.38
611 0.36
612 0.29
613 0.24
614 0.24
615 0.21
616 0.18
617 0.19
618 0.18
619 0.2
620 0.23
621 0.23
622 0.25
623 0.26
624 0.25
625 0.25
626 0.26
627 0.24
628 0.22
629 0.19
630 0.15
631 0.15
632 0.17
633 0.15
634 0.14
635 0.14
636 0.14
637 0.13
638 0.15
639 0.14
640 0.16